Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_15687
- Subject:
- XM_011522269.3
- Aligned Length:
- 3006
- Identities:
- 1863
- Gaps:
- 1143
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGCATCCTCCAGAAACCACCACCAAGATGGCTTCAGTTCGGTTCATGGTGACACCGACAAAGATCGATGACAT 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 TCCAGGTTTGTCAGACACCAGTCCGGACCTCAGCTCTCGATCTAGTTCCCGAGTAAGATTTAGCTCCCGGGAAA 148
Query 1 -----------------------------ATGAGTGAGATGTCTGGGGCCACCACTTCGCTGGCAACTGTTGCA 45
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GCGTGCCTGAAACAAGCCGGAGTGAGCCTATGAGTGAGATGTCTGGGGCCACCACTTCGCTGGCAACTGTTGCA 222
Query 46 CTGGATCCACCCAGTGACCGGACTTCTCACCCCCAGGATGTCATCGAGGACCTGAGTCAGAACTCCATCACAGG 119
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CTGGATCCACCCAGTGACCGGACTTCTCACCCCCAGGATGTCATCGAGGACCTGAGTCAGAACTCCATCACAGG 296
Query 120 GGAACACAGCCAACTGTTAGACGACGGACATAAGAAAGCTCGAAATGCTTATCTCAATAATTCCAATTATGAAG 193
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 GGAACACAGCCAACTGTTAGACGACGGACATAAGAAAGCTCGAAATGCTTATCTCAATAATTCCAATTATGAAG 370
Query 194 AAGGAGATGAATATTTTGATAAAAATTTGGCACTCTTTGAGGAAGAAATGGACACCAGACCGAAGGTGTCTTCC 267
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AAGGAGATGAATATTTTGATAAAAATTTGGCACTCTTTGAGGAAGAAATGGACACCAGACCGAAGGTGTCTTCC 444
Query 268 CTCCTCAACCGCATGGCCAATTACACTAATCTGACTCAAGGAGCAAAGGAACATGAAGAGGCAGAAAACATCAC 341
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CTCCTCAACCGCATGGCCAATTACACTAATCTGACTCAAGGAGCAAAGGAACATGAAGAGGCAGAAAACATCAC 518
Query 342 TGAAGGGAAAAAGAAGCCCACCAAGACCCCCCAAATGGGTACCTTCATGGGTGTCTACCTCCCATGTCTACAAA 415
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TGAAGGGAAAAAGAAGCCCACCAAGACCCCCCAAATGGGTACCTTCATGGGTGTCTACCTCCCATGTCTACAAA 592
Query 416 ATATTTTTGGAGTGATCCTTTTTTTACGCCTTACATGGGTGGTGGGCACAGCTGGAGTTCTTCAGGCTTTTGCA 489
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ATATTTTTGGAGTGATCCTTTTTTTACGCCTTACATGGGTGGTGGGCACAGCTGGAGTTCTTCAGGCTTTTGCA 666
Query 490 ATTGTCCTTATCTGCTGCTGCTGTACAATGTTGACTGCTATCTCCATGAGTGCCATTGCCACTAATGGAGTGGT 563
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 ATTGTCCTTATCTGCTGCTGCTGTACAATGTTGACTGCTATCTCCATGAGTGCCATTGCCACTAATGGAGTGGT 740
Query 564 GCCAGCTGGGGGCTCATACTTTATGATTTCCCGGGCACTGGGCCCAGAGTTTGGTGGGGCTGTTGGCCTCTGCT 637
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GCCAGCTGGGGGCTCATACTTTATGATTTCCCGGGCACTGGGCCCAGAGTTTGGTGGGGCTGTTGGCCTCTGCT 814
Query 638 TTTATCTTGGTACCACATTTGCAGCAGCCATGTACATCCTTGGTGCCATTGAAATCTTTCTGGTCTATATCGTC 711
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TTTATCTTGGTACCACATTTGCAGCAGCCATGTACATCCTTGGTGCCATTGAAATCTTTCTGGTCTATATCGTC 888
Query 712 CCCCGAGCTGCCATCTTTCACAGTGATGACGCACTCAAGGAATCAGCAGCCATGCTAAATAACATGCGTGTCTA 785
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CCCCGAGCTGCCATCTTTCACAGTGATGACGCACTCAAGGAATCAGCAGCCATGCTAAATAACATGCGTGTCTA 962
Query 786 CGGCACAGCTTTCTTGGTCCTTATGGTATTAGTGGTATTTATCGGCGTACGCTATGTGAACAAGTTTGCCTCAC 859
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CGGCACAGCTTTCTTGGTCCTTATGGTATTAGTGGTATTTATCGGCGTACGCTATGTGAACAAGTTTGCCTCAC 1036
Query 860 TTTTCCTGGCCTGTGTCATTGTGTCCATCTTGGCCATCTATGCTGGAGCCATCAAGTCTTCTTTTGCTCCTCCA 933
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TTTTCCTGGCCTGTGTCATTGTGTCCATCTTGGCCATCTATGCTGGAGCCATCAAGTCTTCTTTTGCTCCTCCA 1110
Query 934 CACTTCCCGGTCTGCATGCTGGGTAACCGCACCCTTTCATCAAGACACATTGACGTTTGCTCTAAGACCAAGGA 1007
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CACTTCCCGGTCTGCATGCTGGGTAACCGCACCCTTTCATCAAGACACATTGACGTTTGCTCTAAGACCAAGGA 1184
Query 1008 AATTAACAACATGACAGTCCCATCAAAGTTATGGGGATTCTTCTGTAACTCGAGTCAATTTTTCAATGCCACCT 1081
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 AATTAACAACATGACAGTCCCATCAAAGTTATGGGGATTCTTCTGTAACTCGAGTCAATTTTTCAATGCCACCT 1258
Query 1082 GTGATGAATACTTTGTTCACAATAACGTCACTTCAATCCAGGGCATTCCTGGATTGGCTAGTGGTATAATTACA 1155
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 GTGATGAATACTTTGTTCACAATAACGTCACTTCAATCCAGGGCATTCCTGGATTGGCTAGTGGTATAATTACA 1332
Query 1156 GAGAATCTTTGGAGTAATTACCTACCCAAGGGAGAGATCATCGAAAAGCCTTCAGCCAAATCTTCTGATGTCTT 1229
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GAGAATCTTTGGAGTAATTACCTACCCAAGGGAGAGATCATCGAAAAGCCTTCAGCCAAATCTTCTGATGTCTT 1406
Query 1230 AGGCAGCTTAAACCATGAATATGTTCTTGTTGACATCACCACCTCCTTCACGCTTCTGGTGGGAATCTTCTTTC 1303
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 AGGCAGCTTAAACCATGAATATGTTCTTGTTGACATCACCACCTCCTTCACGCTTCTGGTGGGAATCTTCTTTC 1480
Query 1304 CCTCTGTTACAGGTATCATGGCTGGATCAAACAGATCTGGAGATCTGAAAGATGCTCAGAAGTCTATTCCGATT 1377
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 CCTCTGTTACAGGTATCATGGCTGGATCAAACAGATCTGGAGATCTGAAAGATGCTCAGAAGTCTATTCCGATT 1554
Query 1378 GGTACTATCCTTGCCATCCTGACCACCTCCTTTGTTTTAGATTTAAGCAATGTTGTCCTTTTTGGTGCATGTAT 1451
||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 GGTACTATCCTTGCCATCCTGACCACCTCCTTTGTTT---ATTTAAGCAATGTTGTCCTTTTTGGTGCATGTAT 1625
Query 1452 TGAAGGGGTTGTTCTCAGAGACAAGTTCGGTGATGCTGTGAAAGGTAATTTGGTGGTAGGCACCTTATCTTGGC 1525
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1626 TGAAGGGGTTGTTCTCAGAGACAAGTTCGGTGATGCTGTGAAAGGTAATTTGGTGGTAGGCACCTTATCTTGGC 1699
Query 1526 CATCCCCATGGGTGATTGTTATTGGCTCCTTCTTTTCAACATGTGGGGCTGGACTTCAGAGCCTCACAGGTGCA 1599
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1700 CATCCCCATGGGTGATTGTTATTGGCTCCTTCTTTTCAACATGTGGGGCTGGACTTCAGAGCCTCACAGGTGCA 1773
Query 1600 CCGAGGCTGCTACAAGCTATTGCCAAGGATAACATCATACCGTTTCTGAGGGTTTTTGGCCACAGCAAAGCCAA 1673
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1774 CCGAGGCTGCTACAAGCTATTGCCAAGGATAACATCATACCGTTTCTGAGGGTTTTTGGCCACAGCAAAGCCAA 1847
Query 1674 TGGGGAACCTACCTGGGCTTTACTTCTAACTGCTGCCATTGCAGAGCTTGGAATACTCATTGCCTCCCTGGATC 1747
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1848 TGGGGAACCTACCTGGGCTTTACTTCTAACTGCTGCCATTGCAGAGCTTGGAATACTCATTGCCTCCCTGGATC 1921
Query 1748 TTGTGGCCCCAATTCTTTCCATGTTTTTTCTCATGTGTTACCTCTTTGTAAACTTGGCATGTGCCTTGCAAACA 1821
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1922 TTGTGGCCCCAATTCTTTCCATGTTTTTTCTCATGTGTTACCTCTTTGTAAACTTGGCATGTGCCTTGCAAACA 1995
Query 1822 TTACTTCGAACACCCAACTGGAGACCCCGATTCCGCTACTACCATTGGGCCCTTTCTTTCATGGGAATGAGTAT 1895
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1996 TTACTTCGAACACCCAACTGGAGACCCCGATTCCGCTACTACCAT----------------------------- 2040
Query 1896 CTGTCTGGCTCTGATGTTCATTTCTTCCTGGTATTATGCCATTGTAGCCATGGTAATAGCTGGTATGATCTACA 1969
Sbjct 2041 -------------------------------------------------------------------------- 2040
Query 1970 AGTACATTGAATACCAAGGAGCTGAGAAAGAATGGGGTGATGGTATCCGTGGGCTGTCCCTCAGTGCAGCCCGG 2043
Sbjct 2041 -------------------------------------------------------------------------- 2040
Query 2044 TTTGCTTTGCTTCGATTGGAGGAAGGACCTCCACACACTAAAAACTGGAGGCCTCAGTTGCTTGTATTACTGAA 2117
Sbjct 2041 -------------------------------------------------------------------------- 2040
Query 2118 ACTAGATGAAGACTTACATGTCAAGCATCCTCGCCTCCTCACCTTTGCCTCACAGCTCAAAGCAGGAAAAGGTC 2191
Sbjct 2041 -------------------------------------------------------------------------- 2040
Query 2192 TCACTATTGTGGGCTCTGTCATCGTGGGGAACTTCCTAGAGAACTACGGTGAAGCTTTAGCTGCTGAGCAGACC 2265
Sbjct 2041 -------------------------------------------------------------------------- 2040
Query 2266 ATAAAGCACCTAATGGAGGCAGAGAAGGTAAAAGGATTCTGCCAGCTGGTGGTGGCCGCCAAGCTGAGGGAGGG 2339
Sbjct 2041 -------------------------------------------------------------------------- 2040
Query 2340 CATTTCCCACCTCATCCAGTCATGTGGCCTTGGGGGCATGAAGCACAACACGGTGGTGATGGGCTGGCCTAATG 2413
Sbjct 2041 -------------------------------------------------------------------------- 2040
Query 2414 GCTGGCGTCAAAGCGAAGATGCCCGCGCTTGGAAGACTTTTATTGGCACAGTTCGAGTGACAACTGCTGCCCAT 2487
Sbjct 2041 -------------------------------------------------------------------------- 2040
Query 2488 CTTGCACTGCTGGTGGCTAAAAACATCTCCTTCTTTCCCAGCAATGTGGAGCAATTTTCTGAGGGCAACATTGA 2561
Sbjct 2041 -------------------------------------------------------------------------- 2040
Query 2562 TGTGTGGTGGATTGTGCATGATGGGGGGATGCTTATGCTACTACCATTCCTACTGAAACAGCACAAGGTGTGGC 2635
Sbjct 2041 -------------------------------------------------------------------------- 2040
Query 2636 GAAAGTGCAGCATACGGATCTTCACAGTAGCCCAATTAGAAGACAACAGTATCCAAATGAAGAAGGACCTAGCC 2709
Sbjct 2041 -------------------------------------------------------------------------- 2040
Query 2710 ACCTTCCTATATCACTTACGCATTGAGGCGGAGGTAGAAGTGGTGGAGATGGTGAGAAAGCTGAGTTTGAGATA 2783
Sbjct 2041 -------------------------------------------------------------------------- 2040
Query 2784 CAAGAGCATGACAGTGATATATCAGCATATACTTACGAGCGCACTT 2829
Sbjct 2041 ---------------------------------------------- 2040