Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_15819
- Subject:
- NM_001371912.1
- Aligned Length:
- 1011
- Identities:
- 891
- Gaps:
- 120
Alignment
Query 1 ATGTCCAACCGAGTGGTCTGCCGAGAAGCCAGTCACGCCGGGAGCTGGTACACAGCCT---------------- 58
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTCCAACCGAGTGGTCTGCCGAGAAGCCAGTCACGCCGGGAGCTGGTACACAGCCTCAGATGGAGTCTCACT 74
Query 59 -------------------------------------------------------------------------- 58
Sbjct 75 GTGTCACCCAGGCTGGAGTACAGTGTCGTTATCTCAGCTCACTGCAACCTCCGCTTCCCAGGTTCAAGCGATTC 148
Query 59 ------------------------------CAGGACCGCAGCTGAATGCACAGCTAGAAGGTTGGCTTTCACAA 102
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TCGTGCCTCAGCCTCCCAAATCTGGGATTACAGGACCGCAGCTGAATGCACAGCTAGAAGGTTGGCTTTCACAA 222
Query 103 GTACAGTCTACAAAAAGACCTGCTAGAGCCATTATTGCCCCCCATGCAGGATATACGTACTGTGGGTCTTGTGC 176
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GTACAGTCTACAAAAAGACCTGCTAGAGCCATTATTGCCCCCCATGCAGGATATACGTACTGTGGGTCTTGTGC 296
Query 177 TGCCCATGCTTATAAACAAGTGGATCCGTCTATTACCCGGAGAATTTTCATCCTTGGGCCTTCTCATCATGTGC 250
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TGCCCATGCTTATAAACAAGTGGATCCGTCTATTACCCGGAGAATTTTCATCCTTGGGCCTTCTCATCATGTGC 370
Query 251 CCCTCTCTCGATGTGCACTTTCCAGTGTGGATATATATAGGACACCTCTGTATGACCTTCGTATTGACCAAAAG 324
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CCCTCTCTCGATGTGCACTTTCCAGTGTGGATATATATAGGACACCTCTGTATGACCTTCGTATTGACCAAAAG 444
Query 325 ATTTACGGAGAACTGTGGAAGACAGGAATGTTTGAACGCATGTCTCTGCAGACAGATGAAGATGAACACAGTAT 398
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 ATTTACGGAGAACTGTGGAAGACAGGAATGTTTGAACGCATGTCTCTGCAGACAGATGAAGATGAACACAGTAT 518
Query 399 TGAAATGCATTTGCCTTATACAGCTAAAGCCATGGAAAGCCATAAGGATGAGTTTACCATTATTCCTGTACTGG 472
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TGAAATGCATTTGCCTTATACAGCTAAAGCCATGGAAAGCCATAAGGATGAGTTTACCATTATTCCTGTACTGG 592
Query 473 TTGGAGCTCTGAGTGAGTCAAAAGAACAGGAATTCGGAAAACTCTTCAGTAAATATCTAGCGGATCCTAGTAAT 546
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TTGGAGCTCTGAGTGAGTCAAAAGAACAGGAATTCGGAAAACTCTTCAGTAAATATCTAGCGGATCCTAGTAAT 666
Query 547 CTCTTTGTGGTTTCTTCTGATTTCTGCCATTGGGGTCAAAGGTTCCGTTACAGTTACTATGATGAATCCCAGGG 620
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CTCTTTGTGGTTTCTTCTGATTTCTGCCATTGGGGTCAAAGGTTCCGTTACAGTTACTATGATGAATCCCAGGG 740
Query 621 GGAGATTTATAGATCCATTGAACATCTAGATAAAATGGGTATGAGTATTATAGAACAATTAGACCCTGTATCTT 694
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GGAGATTTATAGATCCATTGAACATCTAGATAAAATGGGTATGAGTATTATAGAACAATTAGACCCTGTATCTT 814
Query 695 TTAGCAATTACTTGAAGAAATACCATAATACTATATGTGGAAGACATCCCATTGGGGTGTTATTAAATGCTATC 768
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TTAGCAATTACTTGAAGAAATACCATAATACTATATGTGGAAGACATCCCATTGGGGTGTTATTAAATGCTATC 888
Query 769 ACAGAGCTCCAGAAGAATGGAATGAATATGAGTTTTTCGTTTTTGAATTATGCCCAGTCGAGCCAGTGTAGAAA 842
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 ACAGAGCTCCAGAAGAATGGAATGAATATGAGTTTTTCGTTTTTGAATTATGCCCAGTCGAGCCAGTGTAGAAA 962
Query 843 CTGGCAAGACAGTTCAGTGAGTTATGCAGCTGGAGCACTCACGGTCCAC 891
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CTGGCAAGACAGTTCAGTGAGTTATGCAGCTGGAGCACTCACGGTCCAC 1011