Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_15907
• Subject: NM_153065.3
• Aligned Length: 2305
• Identities: 2019
• Gaps: 35

Alignment

Query    1  ATGCTTGCGGACCTCGGCTTAATCGGAACCATAGGCGAGGATGACGAGGTGCCGGTGGAGCCCGAGTCTGACTC  74
            |||||.|||||.||||||||.|||.|.|||||.||||||.||||||||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct    1  ATGCTGGCGGAGCTCGGCTTCATCCGGACCATCGGCGAGAATGACGAGGTGCCGGTTGAGCCCGAGTCGGACTC  74

Query   75  CGGGGACGAGGAAGAGGAGGGGCCCATTGTGCTGGGCAGACGA-CAAAAAGCTTTGGGGAAGAACCGCAGTGCT  147
            |||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||.| |.| ||.|||||.|||..||||||||||||||||
Sbjct   75  CGGAGACGAGGAGGAGGAGGGACCCATTGTGCTGGGCCG-CAAGCAGAAAGCCTTGCAGAAGAACCGCAGTGCT  147

Query  148  GATTTCAACCCTGATTTCGTTTTCACTGAGAAGGAGGGGACGTACGATGGCAGCTGGGCCCTGGCTGATGTCAT  221
            ||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|.|||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  148  GACTTCAACCCTGACTTTGTTTTCACTGAGAAGGAGGGCATGTATGATGGCAGCTGGGCCCTGGCTGATGTCAT  221

Query  222  GAGCCAACTCAAGAAGAAGAGGGCAGCCACTACATTAGATGAGAAGATTGAGAAAGTTCGAAAGAAAAGGAAAA  295
            ||||||.||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||.||||.||||||..
Sbjct  222  GAGCCAGCTCAAGAAGAAGCGGGCAGCCACTACACTAGATGAGAAGATTGAGAAAGTCCGGAAGAGAAGGAAGG  295

Query  296  CAGAGGATAAAGAAGCCAAGTCTGGGAAGTTGGAAAAGGAGAAAGAAGCAAAGGAAGGCTCTGAACCAAAGGAG  369
            |||||||.||.||||||||||||||||||.|||   ||||||||||||...|||.||.||||||.|..||||.|
Sbjct  296  CAGAGGACAAGGAAGCCAAGTCTGGGAAGGTGG---AGGAGAAAGAAGGCCAGGCAGACTCTGACCTGAAGGGG  366

Query  370  CAGGAAGACCTTCAAGAGAAT---------GATGAGGAAGGCTCAGAAGATGAAGCCTCGGAGACTGACTACTC  434
            |||            ||||||         |||||||.||||||..|.|||||||.|||.||||||||||||||
Sbjct  367  CAG------------GAGAATCCGGGTGAGGATGAGGCAGGCTCCAAGGATGAAGACTCTGAGACTGACTACTC  428

Query  435  ATCAGCTGATGAGAACATCCTCACCAAAGCAGATACACTCAAAGTAAAGGATCGGAAGAAGAAGAAGAAGAAAG  508
            .||.|..||||||.|.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||   ||||||||||||||||||.|
Sbjct  429  CTCTGAGGATGAGGAAATCCTCACCAAAGCAGACACACTCAAAGTGAAGGA---GAAGAAGAAGAAGAAGAAGG  499

Query  509  GACAGGAAGCAGGAGGATTTTTTGAAGATGCATCTCAGTACGATGAAAACCTCTCGTTCCAGGACATGAACCTT  582
            |.||||.||||||||||||.||||||||||||||..||||.||..|||.|||.||.|||||||||||||||||.
Sbjct  500  GCCAGGCAGCAGGAGGATTCTTTGAAGATGCATCCGAGTATGACAAAAGCCTGTCCTTCCAGGACATGAACCTC  573

Query  583  TCCCGCCCTCTTCTGAAGGCCATTACAGCCATGGGCTTCAAGCAGCCCACCCCGATCCAGAAGGCGTGCATACC  656
            |||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.||
Sbjct  574  TCCCGGCCCCTCCTGAAGGCCATTACAGCCATGGGCTTCAAGCAGCCCACGCCAATCCAGAAGGCGTGTATCCC  647

Query  657  TGTGGGTCTATTGGGGAAGGACATCTGTGCCTGTGCAGCCACTGGGACAGGTAAAACTGCCGCCTTTGCCCTGC  730
            |||||||||..||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||
Sbjct  648  TGTGGGTCTGCTGGGGAAGGACATCTGCGCCTGTGCAGCCACTGGGACAGGCAAAACTGCAGCCTTTGCACTGC  721

Query  731  CTGTTTTGGAGCGTCTGATTTATAAACCCCGCCAGGCTCCAGTCACCCGCGTGCTGGTGCTAGTGCCCACCCGA  804
            |.||.||||||||||||||.||.||.||||||||||||.|||||||.||||||||||||||.||.|||||..||
Sbjct  722  CCGTCTTGGAGCGTCTGATCTACAAGCCCCGCCAGGCTGCAGTCACTCGCGTGCTGGTGCTGGTCCCCACGAGA  795

Query  805  GAGCTGGGCATCCAGGTGCACTCTGTCACCAGACAGCTGGCCCAGTTCTGCAACATCACCACCTGCCTGGCTGT  878
            ||||||||||||||.||||||||||||||||..|||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||
Sbjct  796  GAGCTGGGCATCCAAGTGCACTCTGTCACCAAGCAGCTGGCCCAGTTCTGCAGCATCACTACCTGCCTGGCTGT  869

Query  879  GGGCGGCTTGGATGTGAAGTCTCAGGAAGCAGCTCTTCGGGCAGCGCCTGACATCCTCATCGCCACCCCAGGCC  952
            |||.|||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.||.||||
Sbjct  870  GGGTGGCCTGGATGTGAAGTCTCAGGAAGCCGCTCTTCGGGCAGCACCAGACATCCTCATTGCCACACCTGGCC  943

Query  953  GGCTCATCGATCACCTCCACAACTGCCCTTCCTTCCACCTGAGCAGCATCGAGGTGCTCATCCTGGACGAGGCT  1026
            ||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||.||||.||||||
Sbjct  944  GGCTCATCGACCACCTCCATAACTGCCCCTCCTTCCACCTGAGCAGCATTGAAGTGCTCATCTTGGATGAGGCT  1017

Query 1027  GACAGGATGCTGGATGAGTACTTTGAGGAGCAGATGAAGGAGATCATCCGAATGTGTTCCCACCACCGCCAGAC  1100
            ||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1018  GACAGGATGCTGGATGAGTATTTCGAGGAGCAGATGAAGGAGATTATCCGAATGTGTTCCCACCACCGCCAGAC  1091

Query 1101  CATGCTCTTCTCGGCCACCATGACAGACGAGGTGAAAGATCTGGCTTCTGTCTCCTTGAAGAATCCTGTCCGGA  1174
            |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct 1092  CATGCTCTTCTCGGCCACCATGACAGATGAGGTGAAAGATCTGGCTTCGGTCTCCTTAAAGAATCCTGTGCGGA  1165

Query 1175  TATTTGTGAACAGCAACACAGATGTGGCTCCCTTTCTGCGGCAGGAGTTCATCCGGATCCGGCCTAATCGTGAA  1248
            |||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||.|.|||
Sbjct 1166  TATTTGTGAACAGCAACACAGATGTCGCTCCCTTCCTGCGGCAAGAGTTCATACGGATCCGGCCTAATAGGGAA  1239

Query 1249  GGAGACCGGGAAGCCATCGTGGCAGCTTTGTTGACGAGGACCTTCACTGACCATGTGATGCTGTTCACGCAAAC  1322
            ||.||||||||.|||||.|||||||||.||.|||.|||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||.||
Sbjct 1240  GGGGACCGGGAGGCCATTGTGGCAGCTCTGCTGATGAGAACCTTCACTGACCACGTGATGCTCTTCACCCAGAC  1313

Query 1323  CAAGAAGCAGGCCCACCGCATGCACATCCTCCTGGGGCTCATGGGGCTGCAGGTGGGTGAGCTCCATGGCAACT  1396
            |||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct 1314  CAAGAAGCAGGCCCATCGCATGCACATCCTCCTGGGGCTGCTGGGGCTGCAGGTGGGCGAGCTCCACGGCAACT  1387

Query 1397  TGTCACAGACGCAGCGGCTGGAGGCCCTCCGGCGTTTTAAGGATGAACAGATTGACATCCTCGTGGCCACTGAT  1470
            ||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 1388  TGTCACAGACCCAGCGCCTGGAGGCCCTCCGGCGCTTTAAGGACGAACAGATTGACATCCTGGTGGCCACAGAT  1461

Query 1471  GTGGCAGCCCGTGGACTTGACATTGAGGGGGTCAAAACGGTAATCAACTTCACAATGCCTAATACCATCAAACA  1544
            |||||||||||.||.|||||||||||.||.||.|||||.||.|||||||||||.|||||.||.||..|.|||||
Sbjct 1462  GTGGCAGCCCGCGGTCTTGACATTGAAGGAGTGAAAACAGTGATCAACTTCACCATGCCCAACACTGTTAAACA  1535

Query 1545  TTATGTCCACCGGGTGGGGCGAACAGCACGTGCTGGCAGGGCTGGGCGCTCAGTCTCTCTGGTGGGAGAAGATG  1618
            .|||||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||.||.|
Sbjct 1536  CTATGTGCACCGGGTGGGGCGGACGGCCCGTGCTGGCAGGGCTGGACGCTCTGTCTCCCTAGTGGGAGAGGAGG  1609

Query 1619  AGCGGAAGATGCTGAAGGAGATTGTAAAAGCTGCCAAGGCCCCTGTGAAGGCCAGGATACTTCCCCAAGATGTC  1692
            ||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||.||||||||..||||.||||||||.|||||.
Sbjct 1610  AGCGGAAGATGCTGAAGGAGATCGTGAAGGCTGCCAAGGCGCCAGTGAAGGCTCGGATCCTTCCCCAGGATGTT  1683

Query 1693  ATCCTCAAATTCCGGGACAAGATTGAGAAAATGGAGAAAGATGTGTATGCAGTTCTGCAGCTAGAGGCGGAGGA  1766
            ||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 1684  ATCCTCAAGTTCCGGGACAAGATTGAGAAATTGGAGAAAGATGTGTATGCAGTGCTGCAGCTGGAGGCGGAGGA  1757

Query 1767  AAAAGAGATGCAGCAGTCAGAAGCCCAGATCAATACAGCAAAGCGGCTCCTGGAGAAGGGGAAGGAGGCAGTGG  1840
            ||||||||||||||||||.|||||||||||..|.||||||.||||.|||.|.|..||.|||||.|||.|||..|
Sbjct 1758  AAAAGAGATGCAGCAGTCGGAAGCCCAGATTGACACAGCACAGCGACTCTTAGCCAAAGGGAAAGAGACAGCAG  1831

Query 1841  TCCAAGAGCCCGAGAGGAGCTGGTTCCAGACCAAAGAAGAGAGGAAGAAGGAGAAAATTGCCAAAGCTCTGCAG  1914
            .|||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||
Sbjct 1832  ACCAGGAGCCTGAGAGGAGCTGGTTCCAGACCAAAGAAGAGAGGAAGAAGGAGAAGATTGCTAAGGCTCTACAG  1905

Query 1915  GAATTTGACTTGGCCTTAAGAGGAAAGAAGAAAAGGAAGAAGTTTATGAAGGATGCCAAAAAAAAGGGGGAGAT  1988
            ||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1906  GAGTTTGACTTGGCCTTAAGAGGAAAGAAGAAAAGGAAGAAGTTTATGAAGGATGCCAAGAAAAAGGGGGAGAT  1979

Query 1989  GACAGCAGAGGAAAGGTCTCAGTTTGAAATCCTCAAGGCGCAGATGTTTGCTGAACGGCTAGCGAAGAGGAATC  2062
            |||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.||||||||||
Sbjct 1980  GACGGCAGAGGAGAGGTCCCAGTTTGAAATCCTCAAGGCACAGATGTTTGCAGAGCGGCTGGCCAAGAGGAATC  2053

Query 2063  GCAGAGCCAAGCGGGCCCGAGCAATGCCCGAGGAGGAGCCAGTGAGAGGTCCTGCCAAGAAGCAAAAGCAGGGG  2136
            |||||.|||||||.||.||.||||||||.|||||.|||||   .|.|||.|||||.||.|||||.||||||..|
Sbjct 2054  GCAGAACCAAGCGAGCACGGGCAATGCCTGAGGACGAGCC---TACAGGCCCTGCTAAAAAGCAGAAGCAGCAG  2124

Query 2137  AAGAAATCTGTATTTGATGAAGAACTCACCAACACAAGCAAGAAGGCCCTGAAACAGTATCGAGCTAGCCCTTC  2210
            .||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||
Sbjct 2125  CAGAAGTCTGTGTTTGATGAAGAACTCACCAACACAAGCAAGAAGGCCCTGAAACAGTATCGGGCTGGCCCTTC  2198

Query 2211  CTTTGAAGAAAGGAAACAGTTGGGCTTGCCCCACCAGAGACGAGGAGGAAACTTTAAATCTAAATCCAGATACA  2284
            |||||||||.||||||||||..||..||||||.||||||  || ||||.|||||.||||||||.|||||.||||
Sbjct 2199  CTTTGAAGAGAGGAAACAGTCAGGTCTGCCCCGCCAGAG--GA-GAGGGAACTTCAAATCTAAGTCCAGGTACA  2269

Query 2285  AGAGGAGGAAG  2295
            ||||.|.||||
Sbjct 2270  AGAGAAAGAAG  2280