Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_15907
- Subject:
- XM_006499422.1
- Aligned Length:
- 2386
- Identities:
- 2021
- Gaps:
- 113
Alignment
Query 1 ATGCTTGCGGACCTCGGCTTAATCGGAACCATAGGCGAGGATGACGAGGTGCCGGTGGAGCCCGAGTCTGACTC 74
|||||.|||||.||||||||.|||.|.|||||.||||||.||||||||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1 ATGCTGGCGGAGCTCGGCTTCATCCGGACCATCGGCGAGAATGACGAGGTGCCGGTTGAGCCCGAGTCGGACTC 74
Query 75 CGGGGACGAGGAAGAGGAGGGGCCCATTGTGCTGGGCAGACGA-CAAAAAGCTTTGGGGAAGAACCGCAGTGCT 147
|||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||.| |.| ||.|||||.|||..||||||||||||||||
Sbjct 75 CGGAGACGAGGAGGAGGAGGGACCCATTGTGCTGGGCCG-CAAGCAGAAAGCCTTGCAGAAGAACCGCAGTGCT 147
Query 148 GATTTCAACCCTGATTTCGTTTTCACTGAGAAGGAGGGGACGTACGATGGCAGCTGGGCCCTGGCTGATGTCAT 221
||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|.|||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 148 GACTTCAACCCTGACTTTGTTTTCACTGAGAAGGAGGGCATGTATGATGGCAGCTGGGCCCTGGCTGATGTCAT 221
Query 222 GAGCCAACTCAAGAAGAAGAGGGCAGCCACTACATTAGATGAGAAGATTGAGAAAGTTCGAAAGAAAAGGAAAA 295
||||||.||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||.||||.||||||..
Sbjct 222 GAGCCAGCTCAAGAAGAAGCGGGCAGCCACTACACTAGATGAGAAGATTGAGAAAGTCCGGAAGAGAAGGAAGG 295
Query 296 CAGAGGATAAAGAAGCCAAGTCTGGGAAGTTGGAAAAGGAGAAAGAAGCAAAGGAAGGCTCTGAACCAAAGGAG 369
|||||||.||.||||||||||||||||||.||| ||||||||||||...|||.||.||||||.|..||||.|
Sbjct 296 CAGAGGACAAGGAAGCCAAGTCTGGGAAGGTGG---AGGAGAAAGAAGGCCAGGCAGACTCTGACCTGAAGGGG 366
Query 370 CAGGAAGACCTTCAAGAGAAT---------GATGAGGAAGGCTCAGAAGATGAAGCCTCGGAGACTGACTACTC 434
||| |||||| |||||||.||||||..|.|||||||.|||.||||||||||||||
Sbjct 367 CAG------------GAGAATCCGGGTGAGGATGAGGCAGGCTCCAAGGATGAAGACTCTGAGACTGACTACTC 428
Query 435 ATCAGCTGATGAGAACATCCTCACCAAAGCAGATACACTCAAAGTAAAGGATCGGAAGAAGAAGAAGAA----- 503
.||.|..||||||.|.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||...|||||||||||||||
Sbjct 429 CTCTGAGGATGAGGAAATCCTCACCAAAGCAGACACACTCAAAGTGAAGGAGAAGAAGAAGAAGAAGAAGGGCC 502
Query 504 -------------------------GAAAGGA------------------------------------------ 510
|||||||
Sbjct 503 AGGTGAGCCTGGGTCTGAGGTTGCTGAAAGGACATGCAGGCTTGCTTGCTTTGCTGAGTTCTTTCCTGTCGTCT 576
Query 511 ---------CAGGAAGCAGGAGGATTTTTTGAAGATGCATCTCAGTACGATGAAAACCTCTCGTTCCAGGACAT 575
||||.||||||||||||.||||||||||||||..||||.||..|||.|||.||.|||||||||||
Sbjct 577 GATCTGTTGCAGGCAGCAGGAGGATTCTTTGAAGATGCATCCGAGTATGACAAAAGCCTGTCCTTCCAGGACAT 650
Query 576 GAACCTTTCCCGCCCTCTTCTGAAGGCCATTACAGCCATGGGCTTCAAGCAGCCCACCCCGATCCAGAAGGCGT 649
||||||.|||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct 651 GAACCTCTCCCGGCCCCTCCTGAAGGCCATTACAGCCATGGGCTTCAAGCAGCCCACGCCAATCCAGAAGGCGT 724
Query 650 GCATACCTGTGGGTCTATTGGGGAAGGACATCTGTGCCTGTGCAGCCACTGGGACAGGTAAAACTGCCGCCTTT 723
|.||.|||||||||||..||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||
Sbjct 725 GTATCCCTGTGGGTCTGCTGGGGAAGGACATCTGCGCCTGTGCAGCCACTGGGACAGGCAAAACTGCAGCCTTT 798
Query 724 GCCCTGCCTGTTTTGGAGCGTCTGATTTATAAACCCCGCCAGGCTCCAGTCACCCGCGTGCTGGTGCTAGTGCC 797
||.|||||.||.||||||||||||||.||.||.||||||||||||.|||||||.||||||||||||||.||.||
Sbjct 799 GCACTGCCCGTCTTGGAGCGTCTGATCTACAAGCCCCGCCAGGCTGCAGTCACTCGCGTGCTGGTGCTGGTCCC 872
Query 798 CACCCGAGAGCTGGGCATCCAGGTGCACTCTGTCACCAGACAGCTGGCCCAGTTCTGCAACATCACCACCTGCC 871
|||..||||||||||||||||.||||||||||||||||..|||||||||||||||||||.||||||.|||||||
Sbjct 873 CACGAGAGAGCTGGGCATCCAAGTGCACTCTGTCACCAAGCAGCTGGCCCAGTTCTGCAGCATCACTACCTGCC 946
Query 872 TGGCTGTGGGCGGCTTGGATGTGAAGTCTCAGGAAGCAGCTCTTCGGGCAGCGCCTGACATCCTCATCGCCACC 945
||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.
Sbjct 947 TGGCTGTGGGTGGCCTGGATGTGAAGTCTCAGGAAGCCGCTCTTCGGGCAGCACCAGACATCCTCATTGCCACA 1020
Query 946 CCAGGCCGGCTCATCGATCACCTCCACAACTGCCCTTCCTTCCACCTGAGCAGCATCGAGGTGCTCATCCTGGA 1019
||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||.||||
Sbjct 1021 CCTGGCCGGCTCATCGACCACCTCCATAACTGCCCCTCCTTCCACCTGAGCAGCATTGAAGTGCTCATCTTGGA 1094
Query 1020 CGAGGCTGACAGGATGCTGGATGAGTACTTTGAGGAGCAGATGAAGGAGATCATCCGAATGTGTTCCCACCACC 1093
.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1095 TGAGGCTGACAGGATGCTGGATGAGTATTTCGAGGAGCAGATGAAGGAGATTATCCGAATGTGTTCCCACCACC 1168
Query 1094 GCCAGACCATGCTCTTCTCGGCCACCATGACAGACGAGGTGAAAGATCTGGCTTCTGTCTCCTTGAAGAATCCT 1167
||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct 1169 GCCAGACCATGCTCTTCTCGGCCACCATGACAGATGAGGTGAAAGATCTGGCTTCGGTCTCCTTAAAGAATCCT 1242
Query 1168 GTCCGGATATTTGTGAACAGCAACACAGATGTGGCTCCCTTTCTGCGGCAGGAGTTCATCCGGATCCGGCCTAA 1241
||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1243 GTGCGGATATTTGTGAACAGCAACACAGATGTCGCTCCCTTCCTGCGGCAAGAGTTCATACGGATCCGGCCTAA 1316
Query 1242 TCGTGAAGGAGACCGGGAAGCCATCGTGGCAGCTTTGTTGACGAGGACCTTCACTGACCATGTGATGCTGTTCA 1315
|.|.|||||.||||||||.|||||.|||||||||.||.|||.|||.||||||||||||||.||||||||.||||
Sbjct 1317 TAGGGAAGGGGACCGGGAGGCCATTGTGGCAGCTCTGCTGATGAGAACCTTCACTGACCACGTGATGCTCTTCA 1390
Query 1316 CGCAAACCAAGAAGCAGGCCCACCGCATGCACATCCTCCTGGGGCTCATGGGGCTGCAGGTGGGTGAGCTCCAT 1389
|.||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 1391 CCCAGACCAAGAAGCAGGCCCATCGCATGCACATCCTCCTGGGGCTGCTGGGGCTGCAGGTGGGCGAGCTCCAC 1464
Query 1390 GGCAACTTGTCACAGACGCAGCGGCTGGAGGCCCTCCGGCGTTTTAAGGATGAACAGATTGACATCCTCGTGGC 1463
|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1465 GGCAACTTGTCACAGACCCAGCGCCTGGAGGCCCTCCGGCGCTTTAAGGACGAACAGATTGACATCCTGGTGGC 1538
Query 1464 CACTGATGTGGCAGCCCGTGGACTTGACATTGAGGGGGTCAAAACGGTAATCAACTTCACAATGCCTAATACCA 1537
|||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||.|||||.||.|||||||||||.|||||.||.||..
Sbjct 1539 CACAGATGTGGCAGCCCGCGGTCTTGACATTGAAGGAGTGAAAACAGTGATCAACTTCACCATGCCCAACACTG 1612
Query 1538 TCAAACATTATGTCCACCGGGTGGGGCGAACAGCACGTGCTGGCAGGGCTGGGCGCTCAGTCTCTCTGGTGGGA 1611
|.|||||.|||||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||||||
Sbjct 1613 TTAAACACTATGTGCACCGGGTGGGGCGGACGGCCCGTGCTGGCAGGGCTGGACGCTCTGTCTCCCTAGTGGGA 1686
Query 1612 GAAGATGAGCGGAAGATGCTGAAGGAGATTGTAAAAGCTGCCAAGGCCCCTGTGAAGGCCAGGATACTTCCCCA 1685
||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||.||||||||..||||.||||||||
Sbjct 1687 GAGGAGGAGCGGAAGATGCTGAAGGAGATCGTGAAGGCTGCCAAGGCGCCAGTGAAGGCTCGGATCCTTCCCCA 1760
Query 1686 AGATGTCATCCTCAAATTCCGGGACAAGATTGAGAAAATGGAGAAAGATGTGTATGCAGTTCTGCAGCTAGAGG 1759
.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||.||||
Sbjct 1761 GGATGTTATCCTCAAGTTCCGGGACAAGATTGAGAAATTGGAGAAAGATGTGTATGCAGTGCTGCAGCTGGAGG 1834
Query 1760 CGGAGGAAAAAGAGATGCAGCAGTCAGAAGCCCAGATCAATACAGCAAAGCGGCTCCTGGAGAAGGGGAAGGAG 1833
|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||..|.||||||.||||.|||.|.|..||.|||||.|||
Sbjct 1835 CGGAGGAAAAAGAGATGCAGCAGTCGGAAGCCCAGATTGACACAGCACAGCGACTCTTAGCCAAAGGGAAAGAG 1908
Query 1834 GCAGTGGTCCAAGAGCCCGAGAGGAGCTGGTTCCAGACCAAAGAAGAGAGGAAGAAGGAGAAAATTGCCAAAGC 1907
.|||..|.|||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||
Sbjct 1909 ACAGCAGACCAGGAGCCTGAGAGGAGCTGGTTCCAGACCAAAGAAGAGAGGAAGAAGGAGAAGATTGCTAAGGC 1982
Query 1908 TCTGCAGGAATTTGACTTGGCCTTAAGAGGAAAGAAGAAAAGGAAGAAGTTTATGAAGGATGCCAAAAAAAAGG 1981
|||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1983 TCTACAGGAGTTTGACTTGGCCTTAAGAGGAAAGAAGAAAAGGAAGAAGTTTATGAAGGATGCCAAGAAAAAGG 2056
Query 1982 GGGAGATGACAGCAGAGGAAAGGTCTCAGTTTGAAATCCTCAAGGCGCAGATGTTTGCTGAACGGCTAGCGAAG 2055
||||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.|||
Sbjct 2057 GGGAGATGACGGCAGAGGAGAGGTCCCAGTTTGAAATCCTCAAGGCACAGATGTTTGCAGAGCGGCTGGCCAAG 2130
Query 2056 AGGAATCGCAGAGCCAAGCGGGCCCGAGCAATGCCCGAGGAGGAGCCAGTGAGAGGTCCTGCCAAGAAGCAAAA 2129
||||||||||||.|||||||.||.||.||||||||.|||||.||||| .|.|||.|||||.||.|||||.||
Sbjct 2131 AGGAATCGCAGAACCAAGCGAGCACGGGCAATGCCTGAGGACGAGCC---TACAGGCCCTGCTAAAAAGCAGAA 2201
Query 2130 GCAGGGGAAGAAATCTGTATTTGATGAAGAACTCACCAACACAAGCAAGAAGGCCCTGAAACAGTATCGAGCTA 2203
||||..|.||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.
Sbjct 2202 GCAGCAGCAGAAGTCTGTGTTTGATGAAGAACTCACCAACACAAGCAAGAAGGCCCTGAAACAGTATCGGGCTG 2275
Query 2204 GCCCTTCCTTTGAAGAAAGGAAACAGTTGGGCTTGCCCCACCAGAGACGAGGAGGAAACTTTAAATCTAAATCC 2277
||||||||||||||||.||||||||||..||..||||||.|||||| || ||||.|||||.||||||||.|||
Sbjct 2276 GCCCTTCCTTTGAAGAGAGGAAACAGTCAGGTCTGCCCCGCCAGAG--GA-GAGGGAACTTCAAATCTAAGTCC 2346
Query 2278 AGATACAAGAGGAGGAAG 2295
||.||||||||.|.||||
Sbjct 2347 AGGTACAAGAGAAAGAAG 2364