Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_15980
• Subject: XM_011542113.3
• Aligned Length: 734
• Identities: 580
• Gaps: 145

Alignment

Query   1  ATGGATGACAAAAAGAAGAAACGGAGTCCCAAGCCCTGCCTGGCCCAGCCAGCCCAGGCCCCAGGCACACTACG  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGGATGACAAAAAGAAGAAACGGAGTCCCAAGCCCTGCCTGGCCCAGCCAGCCCAGGCCCCAGGCACACTACG  74

Query  75  GAGGGTCCCTGTGCCTACCAGCCACAGCGGCTCCTTGGCCCTAGGACTTCCTCATCTGCCATCCCCCAAGCAGC  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  GAGGGTCCCTGTGCCTACCAGCCACAGCGGCTCCTTGGCCCTAGGACTTCCTCATCTGCCATCCCCCAAGCAGC  148

Query 149  GGGCCAAGTTCAAGAGAGTAGGCAAAGAGAAGTGCCGCCCAGTCCTGGCTGGAGGTGGAAGCGGCTCTGCAGGC  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  GGGCCAAGTTCAAGAGAGTAGGCAAAGAGAAGTGCCGCCCAGTCCTGGCTGGAGGTGGAAGCGGCTCTGCAGGC  222

Query 223  ACGCCCCTGCAGCACTCCTTCCTGACCGAGGTGACTGATGTCTATGAGATGGAGGGGGGACTCCTGAACCTGCT  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  ACGCCCCTGCAGCACTCCTTCCTGACCGAGGTGACTGATGTCTATGAGATGGAGGGGGGACTCCTGAACCTGCT  296

Query 297  CAATGATTTCCACTCTGGCCGGCTGCAGGCCTTCGGGAAGGAATGCTCCTTTGAGCAGCTGGAGCACGTTCGGG  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  CAATGATTTCCACTCTGGCCGGCTGCAGGCCTTCGGGAAGGAATGCTCCTTTGAGCAGCTGGAGCACGTTCGGG  370

Query 371  AGATGCAGGAGAAGCTAGCCCGGCTGCACTTCAGCCTGGATGTGTGTGGGGAGGAGGAGGACGATGAAGAGGAA  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371  AGATGCAGGAGAAGCTAGCCCGGCTGCACTTCAGCCTGGATGTGTGTGGGGAGGAGGAGGACGATGAAGAGGAA  444

Query 445  GAGGATGGGGTCACTGAGGGGCTGCCAGAGGAGCAGAAGAAGACAATGGCTGACCGTAACCTGGACCAGCTGCT  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445  GAGGATGGGGTCACTGAGGGGCTGCCAGAGGAGCAGAAGAAGACAATGGCTGACCGTAACCTGGACCAGCTGCT  518

Query 519  TAGCAATCTGGAAGACCTCAGTAATTCTATCCAGAAGCTGCA-CCTGGCCGA-GAACGCC--------------  576
           |||||||||||||||||||||||||||||         ||.| |||..||.| |||| ||              
Sbjct 519  TAGCAATCTGGAAGACCTCAGTAATTCTA---------TGTATCCTTTCCAAGGAAC-CCGTCTATGTGTGTGT  582

Query 577  GAGCCTGAGGAG--CAG-----TCCGCTGCG-------------------------------------------  600
           |..||||| |||  |||     |||.||.|.                                           
Sbjct 583  GTTCCTGA-GAGGTCAGTTTCCTCCTCTCCAGCCCTCCAGGAGTATTCACACACAACCAACTTCCCCACCTCTT  655

Query 601  --------------------------------------------------------------------  600
                                                                               
Sbjct 656  GCAGTCCTGTCAGATTTAGCCACAGACTGCCCAAACCCAGGTACAGGAATTTAGAATTTCCCCAAAAT  723