Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_15990
• Subject: XM_024450949.1
• Aligned Length: 1000
• Identities: 869
• Gaps: 95

Alignment

Query    1  ATGGGCACCGAGAAAGAAAGCCCAGAGCCCGACTGCCAGAAACAGTTCCAGGCTGCAGTGAGCGTCATCCAGAA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGGCACCGAGAAAGAAAGCCCAGAGCCCGACTGCCAGAAACAGTTCCAGGCTGCAGTGAGCGTCATCCAGAA  74

Query   75  CCTGCCCAAGAACGGTTCTTACCGCCCCTCCTATGAAGAGATGCTGCGATTCTACAGTTACTACAAGCAGGCCA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCTGCCCAAGAACGGTTCTTACCGCCCCTCCTATGAAGAGATGCTGCGATTCTACAGTTACTACAAGCAGGCCA  148

Query  149  CCATGGGGCCCTGCCTGGTCCCCCGGCCCGGGTTCTGGGACCCCATTGGACGATATAAGTGGGACGCCTGGAAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCATGGGGCCCTGCCTGGTCCCCCGGCCCGGGTTCTGGGACCCCATTGGACGATATAAGTGGGACGCCTGGAAC  222

Query  223  AGTCTGGGCAAGATGAGCAGGGAGGAGGCCATGTCTGCCTACATCACTGAAATGAAACTGGTGGCACAGAAGGT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGTCTGGGCAAGATGAGCAGGGAGGAGGCCATGTCTGCCTACATCACTGAAATGAAACTGGTGGCACAGAAGGT  296

Query  297  GATCGACACAGTGCCCCTGGGTGAGGTGGCAGAGGACATGTTTGGTTACTTCGAGCCCCTGTACCAGGTGATCC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GATCGACACAGTGCCCCTGGGTGAGGTGGCAGAGGACATGTTTGGTTACTTCGAGCCCCTGTACCAGGTGATCC  370

Query  371  CTGACATGCCGAGGCCCCCAGAGACCTTCCTGAGAAGGGTCACAGGTTGGAAAGAGCAGGTTGTGAATGGAGAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CTGACATGCCGAGGCCCCCAGAGACCTTCCTGAGAAGGGTCACAGGTTGGAAAGAGCAGGTTGTGAATGGAGAT  444

Query  445  GTTGGGGCTGTTTCAGAGCCTCCCTGCCTCCCCAAGGAACCGGCACCCCCAAGCCCAGAGTCCCATTCACCCAG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GTTGGGGCTGTTTCAGAGCCTCCCTGCCTCCCCAAGGAACCGGCACCCCCAAGCCCAGAGTCCCATTCACCCAG  518

Query  519  GGACCTGGACTCCGAGGTTTTCTGTGATTCCCTGGAGCAGCTGGAGCCTGAGCTGGTTTGGACAGAGCAGCGGG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGACCTGGACTCCGAGGTTTTCTGTGATTCCCTGGAGCAGCTGGAGCCTGAGCTGGTTTGGACAGAGCAGCGGG  592

Query  593  CAGCATCTGGAGGAAAGCGTGATCCCAGGAACAGCCCCGTGCCCCCCACAAAGAAAGAGGGGTTGCGGGGCAGC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CAGCATCTGGAGGAAAGCGTGATCCCAGGAACAGCCCCGTGCCCCCCACAAAGAAAGAGGGGTTGCGGGGCAGC  666

Query  667  CCGCCGGGGCCCCAGGAGTTGGACGTGTGGCTGCTGGGGACAGTTCGAGCACTACAGGAGAGCATGCAGGAGGT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CCGCCGGGGCCCCAGGAGTTGGACGTGTGGCTGCTGGGGACAGTTCGAGCACTACAGGAGAGCATGCAGGAGGT  740

Query  741  GCAGGCGAGGGTGCAGAGCCTGGAGAGCATGCCCCGGCCCCCTGAGCAGAGGCCG---------------CAGC  799
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|               |||.
Sbjct  741  GCAGGCGAGGGTGCAGAGCCTGGAGAGCATGCCCCGGCCCCCTGAGCAGATGCAGTCTCACTCTGTCGGTCAGA  814

Query  800  CCAGGCCCAGTG------------CTCGGC-CA-TGGCCCCTTGGGCTCCCGGGG--CCCGCGCTGCTCT---T  854
            |..|    ||||            |||.|| || ||...|||..|.|||||.|||  |..||..|.||||   |
Sbjct  815  CTGG----AGTGAAGTGGCGTGAACTCAGCTCACTGCAACCTCCGCCTCCCCGGGTTCAAGCAATTCTCTGCCT  884

Query  855  CTTCCTCCTG------TGGCCCTTC-GTCGTCCA-----GTGGC---------TCTTCCGAATGTTTCG----G  903
            |..|||||.|      |||...|.| |.||.|||     .||.|         |.||..|.||.|||.|    |
Sbjct  885  CAGCCTCCCGAGTAGCTGGGATTACAGGCGCCCACCACCATGCCCGGCTAATTTTTTTTGTATTTTTAGTAGAG  958

Query  904  ACCCAAAAGAGG--------------------------  915
            ||      |.||                          
Sbjct  959  AC------GGGGTTTCACCATCTTGGCCACGCTGGTCT  990