Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroadEn_16025
• Subject: XM_006715572.4
• Aligned Length: 1776
• Identities: 1553
• Gaps: 219

Alignment

Query    1  ATGAGAGGGCGGGACCTGTGTTCCTCCACACAAAGCCAGGCGCTGGGATCTTTGAGAACCACCACCCCAGCCTT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TACCCTTAACATTCCATCCGAGGCAAACCACACTGAGCAGCCGCCTGCAGGCCTGGGAGCAAGGCTACAGGAAG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  CAGGTGTTTCCATCCCTCCCAGGCGAGGCCGCCCAACACCAACACTGGAGAAGAAGAAAAAACCTCATTTGATG  222
                                                                                   |||
Sbjct    1  -----------------------------------------------------------------------ATG  3

Query  223  GCGGAAGATGAACCTTCAGGGGCCCTCTTGAAGCCGCTGGTTTTTCGCGTTGACGAGACCACCCCGGCTGTGGT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    4  GCGGAAGATGAACCTTCAGGGGCCCTCTTGAAGCCGCTGGTTTTTCGCGTTGACGAGACCACCCCGGCTGTGGT  77

Query  297  GCAAAGTGTCCTCCTGGAGAGGGGGTGGAATAAGTTTGATAAGCAGGAGCAGAACGCGGAGGACTGGAACCTGT  370
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   78  GCAAAGCGTCCTCCTGGAGAGGGGGTGGAATAAGTTTGATAAGCAGGAGCAGAACGCGGAGGACTGGAACCTGT  151

Query  371  ACTGGAGGGCATCCTCTTTCCGAATGACCGAACACAACAGTGTTAAACCGTGGCAGCAGCTAAACCACCACCCT  444
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  152  ACTGGAGGACATCCTCTTTCCGAATGACCGAACACAACAGTGTTAAACCGTGGCAGCAGCTAAACCACCACCCT  225

Query  445  GGAACCACCAAGCTTACCAGGAAAGACTGTTTGGCCAAACACCTGAAGCACATGAGGAGGATGTATGGCACTTC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  226  GGAACCACCAAGCTTACCAGGAAAGACTGTTTGGCCAAACACCTGAAGCACATGAGGAGGATGTATGGCACTTC  299

Query  519  CCTGTACCAGTTCATCCCCCTGACGTTCGTCATGCCCAATGACTATACCAAGTTCGTGGCTGAATACTTTCAGG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  300  CCTGTACCAGTTCATCCCCCTGACGTTCGTCATGCCCAATGACTATACCAAGTTCGTGGCTGAATACTTTCAGG  373

Query  593  AGAGGCAGATGCTGGGCACCAAGCATAGCTATTGGATTTGCAAGCCTGCTGAGTTATCTCGTGGGAGGGGGATA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  374  AGAGGCAGATGCTGGGCACCAAGCATAGCTATTGGATTTGCAAGCCTGCTGAGTTATCTCGTGGGAGGGGGATA  447

Query  667  CTAATTTTCAGTGACTTTAAAGACTTCATCTTTGATGATATGTACATAGTGCAGAAATATATCTCCAATCCTTT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  448  CTAATTTTCAGTGACTTTAAAGACTTCATCTTTGATGATATGTACATAGTGCAGAAATATATCTCCAATCCTTT  521

Query  741  ACTTATTGGCAGATATAAATGTGATCTCCGCATCTATGTTTGTGTTACTGGCTTTAAGCCTTTGACCATTTATG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  522  ACTTATTGGCAGATATAAATGTGATCTCCGCATCTATGTTTGTGTTACTGGCTTTAAGCCTTTGACCATTTATG  595

Query  815  TTTATCAGGAAGGGTTGGTTCGGTTTGCCACGGAAAAGTTTGACCTCAGTAATTTGCAAAACAATTATGCCCAT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  596  TTTATCAGGAAGGGTTGGTTCGGTTTGCCACGGAAAAGTTTGACCTCAGTAATTTGCAAAACAATTATGCCCAT  669

Query  889  TTGACCAACAGCAGCATCAATAAATCCGGGGCCTCTTATGAGAAGATCAAAGAAGTGATTGGTCATGGTTGTAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  670  TTGACCAACAGCAGCATCAATAAATCCGGGGCCTCTTATGAGAAGATCAAAGAAGTGATTGGTCATGGTTGTAA  743

Query  963  ATGGACGCTCAGCAGATTTTTTTCCTACCTTCGTAGCTGGGATGTGGACGATCTGCTTTTGTGGAAGAAAATCC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  744  ATGGACGCTCAGCAGATTTTTTTCCTACCTTCGTAGCTGGGATGTGGACGATCTGCTTTTGTGGAAGAAAATCC  817

Query 1037  ACCGCATGGTTATTCTCACCATTCTCGCCATTGCACCATCTGTCCCCTTTGCTGCCAATTGCTTTGAGCTCTTT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  818  ACCGCATGGTTATTCTCACCATTCTCGCCATTGCACCATCTGTCCCCTTTGCTGCCAATTGCTTTGAGCTCTTT  891

Query 1111  GGGTTTGATATTTTGATTGATGACAACTTGAAACCATGGCTTTTAGAGGTCAACTACAGCCCAGCCTTGACCTT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  892  GGGTTTGATATTTTGATTGATGACAACTTGAAACCATGGCTTTTAGAGGTCAACTACAGCCCAGCCTTGACCTT  965

Query 1185  GGATTGTTCAACAGATGTGTTGGTGAAGAGAAAACTTGTCCATGATATTATTGACCTGATTTACTTAAATGGTC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  966  GGATTGTTCAACAGATGTGTTGGTGAAGAGAAAACTTGTCCATGATATTATTGACCTGATTTACTTAAATGGTC  1039

Query 1259  TAAGAAATGAGGGGGGAGAAGCCAGTAATGCCACACATGGAAATTCCAACATCGATGCTGCAAAAAGTGACAGA  1332
            ||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1040  TAAGAAATGAGGGGAGAGAAGCCAGTAATGCCACACATGGAAATTCCAACATCGACGCTGCAAAAAGTGACAGA  1113

Query 1333  GGTGGGCTTGATGCTCCTGACTGTCTTCCTTATGATTCTCTTTCGTTCACAAGCAGAATGTACAACGAGGATGA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1114  GGTGGGCTTGATGCTCCTGACTGTCTTCCTTATGATTCTCTTTCGTTCACAAGCAGAATGTACAACGAGGATGA  1187

Query 1407  CTCTGTGGTGGAGAAAGCTGTGAGTGTGCGTCCTGAAGCTGCACCTGCCTCCCAGCTGGAAGGAGAGATGAGTG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1188  CTCTGTGGTGGAGAAAGCTGTGAGTGTGCGTCCTGAAGCTGCACCTGCCTCCCAGCTGGAAGGAGAGATGAGTG  1261

Query 1481  GGCAGGATTTTCATCTGTCAACAAGGGAGATGCCACAAAGCAAGCCCAAGTTACGGAGCAGGCACACGCCTCAC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1262  GGCAGGATTTTCATCTGTCAACAAGGGAGATGCCACAAAGCAAGCCCAAGTTACGGAGCAGGCACACGCCTCAC  1335

Query 1555  AAGACACTCATGCCCTACGCGTCCCTCTTCCAGTCGCACTCCTGCAAGACCAAGACCTCCCCGTGTGTCCTGTC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1336  AAGACACTCATGCCCTACGCGTCCCTCTTCCAGTCGCACTCCTGCAAGACCAAGACCTCCCCGTGTGTCCTGTC  1409

Query 1629  AGACCGTGGCAAAGCTCCAGATCCCCAAGCAGGCAACTTTGTTCTTGTTTTTCCTTTCAATGAAGCAACTCTCG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1410  AGACCGTGGCAAAGCTCCAGATCCCCAAGCAGGCAACTTTGTTCTTGTTTTTCCTTTCAATGAAGCAACTCTCG  1483

Query 1703  GAGCTTCCAGGAATGGATTAAATGTCAAAAGAATAATCCAAGAGCTCCAGAAACTAATGAATAAGCAACATTCC  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1484  GAGCTTCCAGGAATGGATTAAATGTCAAAAGAATAATCCAAGAGCTCCAGAAACTAATGAATAAGCAACATTCC  1557