Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroadEn_16073
- Subject:
- NM_001145427.2
- Aligned Length:
- 1898
- Identities:
- 1718
- Gaps:
- 151
Alignment
Query 1 ATGGCGCTGCGCGCCCGGGCGCTGTACGACTTCAGGTCGGAGAACCCAGGAGAGATCTCGCTGCGAGAGCACGA 74
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Sbjct 1 ATGGCGCTGCGCGCCCGGGCGCTGTACGACTTCAGGTCGGAGAACCCAGGAGAGATCTCGCTGCGAGAGCACGA 74
Query 75 GGTGCTGAGCCTGTGCAGCGAGCAGGACATCGAGGGCTGGCTCGAGGGGGTCAACAGCCGCGGCGACCGCGGCC 148
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Sbjct 75 GGTGCTGAGCCTGTGCAGCGAGCAGGACATCGAGGGCTGGCTCGAGGGGGTCAACAGCCGCGGCGACCGCGGCC 148
Query 149 TCTTCCCGGCCTCCTATGTGCAGGTGATCCGCGCCCCCGAGCCTGGCCCGGCGGGAGACGGCGGCCCGGGCGCC 222
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Sbjct 149 TCTTCCCGGCCTCCTATGTGCAGGTGATCCGCGCCCCCGAGCCTGGCCCGGCGGGAGACGGCGGCCCGGGCGCC 222
Query 223 CCGGCCCGCTACGCCAATGTGCCCCCCGGGGGCTTCGAGCCCCTGCCCGTCGCGCCCCCCGCCTCCTTCAAGCC 296
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Sbjct 223 CCGGCCCGCTACGCCAATGTGCCCCCCGGGGGCTTCGAGCCCCTGCCTGTCGCGCCCCCCGCCTCCTTCAAGCC 296
Query 297 GCCGCCTGACGCCTTCCAGGCGCTGCTGCAGCCACAGCAGGCGCCGCCTCCGAGCACCTTCCAGCCGCCCGGCG 370
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Sbjct 297 GCCGCCTGACGCCTTCCAGGCGCTGCTGCAGCCACAGCAGGCGCCGCCTCCGAGCACCTTCCAGCCGCCCGGCG 370
Query 371 CGGGCTTCCCGTACGGCGGGGGCGCCCTGCAGCCGTCGCCTCAGCAGCTCTACGGCGGCTACCAGGCCAGCCAA 444
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Sbjct 371 CGGGCTTCCCGTACGGCGGGGGCGCCCTGCAGCCGTCGCCTCAGCAGCTCTACGGCGGCTACCAGGCCAGCCAA 444
Query 445 GGCAGCGATGATGACTGGGACGACGAGTGGGACGACAGCTCCACGGTGGCGGACGAGCCGGGCGCTCTGGGCAG 518
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Sbjct 445 GGCAGCGATGATGACTGGGACGACGAGTGGGACGACAGCTCCACGGTGGCGGACGAGCCGGGCGCTCTGGGCAG 518
Query 519 CGGAGCATACCCGGACCTCGACGGCTCGTCTTCGGCGGGTGTGGGCGCAGCCGGCCGCTACCGCCTGTCCACGC 592
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Sbjct 519 CGGAGCATACCCGGACCTCGACGGCTCGTCTTCGGCGGGTGTGGGCGCAGCCGGCCGCTACCGCCTGTCCACGC 592
Query 593 GCTCCGACCTGTCCCTGGGCTCCCGCGGCGGCTCGGTCCCCCCGCAGCACCACCCGTCGGGGCCCAAGAGCTCG 666
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Sbjct 593 GCTCCGACCTGTCCCTGGGTTCCCGCGGCGGCTCGGTCCCCCCGCAGCACCACCCGTCGGGGCCCAAGAGCTCG 666
Query 667 GCCACCGTGAGCCGCAACCTCAATCGCTTCTCCACCTTCGTCAAGTCCGGCGGGGAGGCCTTCGTGCTGGGGGA 740
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Sbjct 667 GCCACCGTGAGCCGCAACCTCAATCGCTTCTCCACCTTCGTCAAGTCCGGCGGGGAGGCCTTCGTGCTGGGGGA 740
Query 741 GGCGTCAGGCTTCGTGAAGGACGGGGACAAGCTGTGCGTGGTGCTGGGGCCCTATGGCCCCGAGTGGCAGGAGA 814
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Sbjct 741 GGCGTCAGGCTTCGTGAAGGACGGGGACAAGCTGTGCGTGGTGCTGGGGCCCTATGGCCCCGAGTGGCAGGAGA 814
Query 815 ACCCCTACCCGTTCCAGTGCACCATCGACGACCCCACCAAGCAGACCAAGTTCAAGGGCATGAAGAGCTACATC 888
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Sbjct 815 ACCCCTACCCGTTCCAGTGCACCATCGACGACCCCACCAAGCAGACCAAGTTCAAGGGCATGAAGAGCTACATC 888
Query 889 TCCTACAAGCTGGTGCCCACGCACACGCAGGTGCCGGTGCATCGGCGCTACAAGCACTTCGACTGGCTGTACGC 962
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Sbjct 889 TCCTACAAGCTGGTGCCCACGCACACGCAGGTGCCGGTGCATCGGCGCTACAAGCACTTCGACTGGCTGTACGC 962
Query 963 GCGCCTGGCGGAGAAGTTCCCGGTCATCTCCGTGCCCCACCTGCCCGAGAAGCAGGCCACCGGCCGCTTCGAGG 1036
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Sbjct 963 GCGCCTGGCGGAGAAGTTCCCGGTCATCTCCGTGCCCCACCTGCCCGAGAAGCAGGCCACCGGCCGCTTCGAGG 1036
Query 1037 AGGACTTCATCTCTAAGCGCAGGAAGGGCCTGATCTGGTGGATGAACCACATGGCCAGCCACCCAGTGCTGGCG 1110
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Sbjct 1037 AGGACTTCATCTCTAAGCGCAGGAAGGGCCTGATCTGGTGGATGAACCACATGGCCAGCCACCCAGTGCTGGCG 1110
Query 1111 CAGTGCGACGTCTTCCAGCACTTCCTGACGTGCCCCAGCAGCACCGACGAGAAAGCCTGGAAGCAGGGCAAGAG 1184
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Sbjct 1111 CAGTGCGACGTCTTCCAGCACTTCCTGACGTGCCCCAGCAGCACCGACGAGAAAGCCTGGAAGCAGGGCAAGAG 1184
Query 1185 GAAGGCCGAGAAGGACGAGATGGTGGGCGCCAACTTCTTCCTGACCCTTAGCACGCCCCCCGCCGCTGCCCTTG 1258
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Sbjct 1185 GAAGGCCGAGAAGGACGAGATGGTGGGCGCCAACTTCTTCCTGACCCTTAGCACGCCCCCCGCCGCTGCCCTTG 1258
Query 1259 ACCTGCAGGAGGTGGAGAGCAAGATCGACGGCTTCAAGTGCTTCACCAAGAAGATGGACGACAGCGCGCTGCAG 1332
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Sbjct 1259 ACCTGCAGGAGGTGGAGAGCAAGATCGACGGCTTCAAGTGCTTCACCAAGAAGATGGACGACAGCGCGCTGCAG 1332
Query 1333 CTCAACCACACGGCCAACGAGTTCGCGCGCAAGCAGGTGACCGGCTTCAAAAAGGAGTATCAGAAGGTGGGCCA 1406
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Sbjct 1333 CTCAACCACACGGCCAACGAGTTCGCGCGCAAGCAGGTGACCGGCTTCAAAAAGGAGTATCAGAAGGTGGGCCA 1406
Query 1407 GTCCTTCCGCGGCCTCAGCCAGGCCTTTGAGCTGGACCAGCAGGCCTTCTCGGTGGGCCTGAACCAGGCTATCG 1480
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Sbjct 1407 GTCCTTCCGCGGCCTCAGCCAGGCCTTTGAGCTGGACCAGCAGGCCTTCTCGGTGGGCCTGAACCAGGCTATCG 1480
Query 1481 CCTTCACCGGAGATGCCTATGACGCCATTGGCGAGCTCTTCGCGGAGCAGCCCAGGCAGGACCTGGATCCCGTC 1554
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Sbjct 1481 CCTTCACCGGAGATGCCTATGACGCCATTGGCGAGCTCTTCGCGGAGCAGCCCAGGCAGGACCTGGATCCCGTC 1554
Query 1555 ATGGACCTATTAGCGCTGTATCAGGGGCATCTGGCTAACTTCCCGGACATCATCCACGTTCAGAAAGG------ 1622
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Sbjct 1555 ATGGACCTATTAGCGCTGTATCAGGGGCATCTGGCTAACTTCCCGGACATCATCCACGTTCAGAAAGGTAAAGC 1628
Query 1623 --AGCTCTTACCAAAGTCAAGGAGAGTAGGCGACACGTGGAGGAAGGGAAGATGGA-GGTGCAGAAGGCTGA-- 1691
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Sbjct 1629 CTGGCCCTT-------------AGAGCAGGTGATA--TGGAG----------TGTATTGTGC---AGGCTGAAA 1674
Query 1692 ----CGGCATTCAGGATCGCTGTAACACTATTTCTTTTGCCACTTTGGCTGAAATTCACCACTTCCATCAAATT 1761
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Sbjct 1675 GGGGCGACTTT---GACAGCAGTA---------------CCACTGTGGGT----TTCA------GAATCATATT 1720
Query 1762 CGA---GTGAGAGACTTTAA---ATCACAGA--TGCA-GCAT--TTCTTACAACAACAAATAATATTTTTCCAA 1824
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Sbjct 1721 CTACAGGTGAG------GAAGCGAGCAGAGACGTGGACGCCTGGGTC-------------------TTTTCCCT 1769
Query 1825 AAAGTTACCCAGAAGTTGGAAGAAGCTCTTCACAAATATGATAGTGTT 1872
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Sbjct 1770 AGAG-------------------------------------------- 1773