Construct: sgRNA BRDN0001146321

Construct Description:

Construct Type:
sgRNA
Other Identifiers:
n/a
DNA Barcode:
AGTCACATGTGGTGGAATGG

Original Target:

Taxon:
Homo sapiens (human)
Gene:
CSNK2A1 (1457)
Gene Description:
n/a
CRISPR Mechanism
CRISPRko

Vector Information:

Vector Backbone:
pXPR_003
Pol II Cassette 1:
EF1A-PuroR
Pol II Cassette 2:
n/a
Selection Marker:
PuroR
Visible Reporter:
n/a
Epitope Tag:
n/a

Additional Information:

Addgene ID:
76675

Gene matches for this target sequence (CRISPRko, PAM=NGG, human):

Reference Sequence Chromosome Cut Position Match Strand Match Gene Match Sequence PAM Seq. Mismatches[?] CFD Score[?] Match Tier[?]
1 NC_000020.11 20 508456 - CSNK2A1 NNNCACATGTGGTGGAATGG NGG 0 1.0 Tier I
2 NC_000011.10 11 11353024 - CSNK2A3 NNNCACATGTGGTGGAATGG NGA 1 0.0694 Tier I
3 NC_000012.12 12 112240002 - HECTD4 NNNCACATGTGGTGGGATGG NCG 2 0.0206 Tier I
4 NC_000006.12 6 45385287 - RUNX2 NNNCAAATGAGGTGGAATGG NGG 2 0.7959 Tier II
5 NC_000018.10 18 23275919 + TMEM241 NNNCACAGGTGGTAGAATGG NGG 2 0.55 Tier II
6 NC_000006.12 6 2748378 + MYLK4 NNNCACATGTGCTGGAATGA NGG 2 0.4963 Tier II
7 NC_000009.12 9 121112633 + CNTRL NNNCACATGGGATGGAATGG NGG 2 0.4667 Tier II
8 NC_000001.11 1 18126388 - IGSF21 NNNCACATGTGGAGGAAAGG NGG 2 0.4615 Tier II
9 NC_000006.12 6 157502185 + ZDHHC14 NNNCACATCTGGTGGAAAGG NGG 2 0.359 Tier II
10 NC_000010.11 10 103771163 - SH3PXD2A NNNCACTTGTGGTGGAATAG NGG 2 0.3125 Tier II
11 NC_000012.12 12 56551277 + RBMS2 NNNCTCATGAGGTGGAATGG NGG 2 0.3117 Tier II
12 NC_000016.10 16 12509795 - SNX29 NNNCTCATGTGGCGGAATGG NGG 2 0.2871 Tier II
13 NC_000009.12 9 35365803 + UNC13B NNNCAGATGGGGTGGAATGG NGG 2 0.25 Tier II
14 NC_000014.9 14 50460214 - MAP4K5 NNNCACATGTGATGGAATGG NAG 2 0.242 Tier II
15 NC_000003.12 3 76313522 + ROBO2 NNNCACATGAGGTGGGATGG NGG 2 0.1648 Tier II
16 NC_000005.10 5 130154407 + CHSY3 NNNCACATGTCTTGGAATGG NGG 2 0.1648 Tier II
17 NC_000014.9 14 61904211 - SYT16 NNNCACATGTGGTATAATGG NGG 2 0.1071 Tier II
18 NC_000011.10 11 11353024 - GALNT18 NNNCACATGTGGTGGAATGG NGA 1 0.0694 Tier II
19 NC_000014.9 14 94312323 - SERPINA6 NNNCACATGTGGTGGAATGG NTG 1 0.039 Tier II
20 NC_000017.11 17 73462316 + SDK2 NNNCATATGTGGTGGAATGG NTG 2 0.0362 Tier II
21 NC_000005.10 5 31802117 + PDZD2 NNNCACATGTGGTGTGATGG NGG 2 0.0275 Tier II
22 NC_000020.11 20 62279044 + OSBPL2 NNNCACATGTTGTGGCATGG NGG 2 0.0 Tier II
23 NC_000011.10 11 97273575 - LOC105369450 NNNCATATGTGGTGGAAAGG NGG 2 0.619 Tier III
24 NC_000015.10 15 93170819 + LOC101927025 NNNGACATGTGGTGGAATGT NGG 2 0.35 Tier III
25 NC_000008.11 8 11384704 + FAM167A-AS1 NNNAACATGTGGTGGAATGG NAG 2 0.2183 Tier III
26 NC_000005.10 5 174932857 + LINC01951 NNNCTCATGTGGTGGAAGGG NGG 2 0.1212 Tier III
27 NC_000005.10 5 117838020 + LINC02147 NNNCACATCTGGTGGAATGG NTG 2 0.021 Tier III
28 NC_000014.9 14 81661554 + EEF1A1P2 NNNCAGATGTGGTGGTATGG NGG 2 0.0 Tier III
Download CSV

Gene matches for this target sequence (CRISPRko, PAM=NGG, mouse):

Reference Sequence Chromosome Cut Position Match Strand Match Gene Match Sequence PAM Seq. Mismatches[?] CFD Score[?] Match Tier[?]
1 NC_000068.7 2 152250607 + Csnk2a1 NNNCACATGTGGTGGAATGG NGG 0 1.0 Tier I
2 NC_000071.6 5 121310567 + Hectd4 NNNCACCTGTGGTGGGATGG NGG 2 0.0841 Tier I
3 NC_000074.6 8 38577263 + Sgcz NNNAACATGTGGTGGAATTG NGG 2 0.5614 Tier II
4 NC_000086.7 X 157901840 + Cnksr2 NNNAACATGTGCTGGAATGG NGG 2 0.4458 Tier II
5 NC_000072.6 6 18017789 + Wnt2 NNNTACATGTGCTGGAATGG NGG 2 0.4235 Tier II
6 NC_000069.6 3 30348093 - Mecom NNNCACATCTGGTGGAAAGG NGG 2 0.359 Tier II
7 NC_000086.7 X 164346586 + Pir NNNCACATGTGCTCGAATGG NGG 2 0.2269 Tier II
8 NC_000068.7 2 42527628 - Lrp1b NNNCACAGGTGGTTGAATGG NGG 2 0.1956 Tier II
9 NC_000069.6 3 30259213 + Mecom NNNCACATGTGGAGGAATGG NAG 2 0.1795 Tier II
10 NC_000076.6 10 90533318 + Anks1b NNNCACATGTGTTGGAATGG NAG 2 0.0997 Tier II
11 NC_000070.6 4 118377854 + Szt2 NNNAACATGTGGTGGAATGG NGA 2 0.0585 Tier II
12 NC_000068.7 2 24734219 - Cacna1b NNNCACAGGTGGTGGAATGG NGT 2 0.0118 Tier II
13 NC_000068.7 2 24734256 - Cacna1b NNNCACAGGTGGTGGAATGG NGT 2 0.0118 Tier II
14 NC_000068.7 2 24734444 - Cacna1b NNNCACAGGTGGTGGAATGG NGT 2 0.0118 Tier II
15 NC_000068.7 2 24734863 - Cacna1b NNNCACAGGTGGTGGAATGG NGT 2 0.0118 Tier II
16 NC_000067.6 1 156524327 + Csnk2a3 NNNCACATGTGGTGGAATGG NGG 0 1.0 Tier III
17 NC_000082.6 16 5449713 - Gm41414 NNNGACATGTGGAGGAATGG NGG 2 0.3462 Tier III
18 NC_000075.6 9 47183223 + Gm31698 NNNCACATGTGGTGGACTGA NGG 2 0.1654 Tier III
19 NC_000074.6 8 99536411 + A330008L17Rik NNNCACATGTGCTGGAGTGG NGG 2 0.0934 Tier III
20 NC_000070.6 4 75324597 + Gm11255 NNNCACATGTGATGGAATGG NGA 2 0.0648 Tier III
21 NC_000086.7 X 16610348 + Csnk2a1-ps NNNCACATGAGGTGGAATGG NGA 2 0.0595 Tier III
22 NC_000080.6 14 14197400 + Csnk2a1-ps1 NNNCACAGGTGGTGGAATGG NGA 2 0.0509 Tier III
Download CSV

Other clones with same target sequence:

(none)