Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000465220
• Subject: XM_006511546.2
• Aligned Length: 1124
• Identities: 896
• Gaps: 109

Alignment

Query    1  ATG-ATC-TCAGATCCCCCCTCAAACAACAGCTGGAACTCTGTTCTCTATCTTC--------------TAGAGG  58
            ||| ||| ||.|||||       ||....|||.||               ||.|              .|||||
Sbjct    1  ATGAATCGTCCGATCC-------AAGTGAAGCCGG---------------CTGCCAGTGAGGGCCGAGGAGAGG  52

Query   59  ACCGAAAGCTGTTTGTGGGGATGCTGGGCAAGCAGCAGGGTGAGGAGGACGTCAGACGCCTGTTCCAGCCCTTT  132
            ||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.
Sbjct   53  ACCGGAAGCTGTTTGTGGGGATGTTGGGCAAGCAGCAGGGTGAGGAGGATGTCAGACGTCTGTTCCAGCCCTTC  126

Query  133  GGCCACATCGAGGAGTGCACGGTCCTGCGGAGTCCTGACGGCACCAGTAAAGGCTGTGCCTTTGTGAAGTTCGG  206
            |||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  127  GGCCATATCGAGGAGTGCACTGTCCTGCGGAGTCCGGACGGTACCAGTAAAGGCTGTGCCTTTGTGAAATTCGG  200

Query  207  GAGTCAAGGGGAAGCTCAGGCGGCCATCCGGGGTCTGCACGGCAGCCGGACCATGGCGGGCGCCTCGTCCAGCC  280
            .||||||||||||||.||.||.|||||||.|||.||.|||||.||||||||.|||.||||.|||||.|||||||
Sbjct  201  AAGTCAAGGGGAAGCCCAAGCTGCCATCCAGGGACTACACGGTAGCCGGACAATGACGGGTGCCTCCTCCAGCC  274

Query  281  TCGTGGTCAAGCTGGCGGACACCGACCGGGAGCGCGCGCTGCGGCGGATGCAGCAGATGGCCGGCCACCTGGGC  354
            |.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||..||||||||||.|||||.|||||.|||||.
Sbjct  275  TGGTGGTTAAGCTGGCAGACACCGACCGGGAGCGCGCGCTGCGAAGGATGCAGCAAATGGCTGGCCAGCTGGGT  348

Query  355  GCCTTCCACCCCGCGCCACTGCCGCTAGGGGCCTGCGGCGCCTACACCACGGCGATCCTGCAGCACCAGGCGGC  428
            |||||||||||.||.||.|||||.||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||
Sbjct  349  GCCTTCCACCCGGCACCGCTGCCCCTCGGGGCCTGTGGCGCCTATACCACTGCGATCCTACAGCACCAGGCAGC  422

Query  429  CCTGCTGGCGGCGGCACAGGGCCCAGGCCTAGGCCCGGTGGCGGCAGTGGCGGCCCAGATGCAACACGTGGCGG  502
            ..|||||||.||.||.|||||.||.||..||||||.||||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||
Sbjct  423  GTTGCTGGCCGCAGCGCAGGGTCCGGGGTTAGGCCAGGTGGCCGCGGTGGCCGCCCAGATGCAGCACGTGGCGG  496

Query  503  CCTTTAGCCTGGTAGCTGCGCCTCTGTTGCCCGCGGCAGCAGCCAA---CTCCCCGCCTGGCAGCGGCCCTGGC  573
            ||||.|||.||||.|||||.||.||||||||||||   ||||||||   .|||||...|||||..||||||||.
Sbjct  497  CCTTCAGCTTGGTGGCTGCACCGCTGTTGCCCGCG---GCAGCCAATACATCCCCTGGTGGCAATGGCCCTGGT  567

Query  574  ACCCTCCCAGGTCTTCCGGCGCCCATCGGGGTCAATGGATTCGGC-CCTCTGACCCCCCAGACCAATGGCCAGC  646
            .|.|||||.||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||| ||| ||||||||||||.|||.||.||||
Sbjct  568  GCACTCCCTGGCCTTCCAGCGCCCATGGGAGTCAATGGATTCGGCTCCT-TGACCCCCCAGAGCAACGGACAGC  640

Query  647  CGGGCTCCGACACGCTCTACAATAACGGGCTCTCCCCTTATCCAGCCCAGAGCCCCGGCGTGGCTGACCCCCTG  720
            |.|||||||||||||||||.||.||||||.|.||||||                                    
Sbjct  641  CAGGCTCCGACACGCTCTATAACAACGGGGTTTCCCCT------------------------------------  678

Query  721  CAGCAGGCCTACGCTGGGATGCACCACTACGCAGCAGCCTATCCGTCGGCCTATGCCCCAGTGAGCACAGCTTT  794
                                       |||.|||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  679  ---------------------------TACCCAGCAGCCTATCCCTCGGCCTATGCCCCAGCGAGCACAGCTTT  725

Query  795  TCCCCAGCAGCCTTCAGCCCTGCCCCAGCAGCAGAGAGAAGGCCCCGAAGGCTGTAACCTCTTCATCTATCACC  868
            |.||||.|||||||||||.|||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  726  TTCCCAACAGCCTTCAGCTCTGCCTCAACAACAAAGAGAAGGCCCCGAAGGCTGTAACCTCTTCATCTATCACC  799

Query  869  TGCCTCAGGAGTTTGGTGATGCGGAACTCATACAGACATTCCTGCCCTTTGGAGCCGTTGTCTCTGCTAAAGTC  942
            ||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.
Sbjct  800  TGCCTCAGGAGTTTGGGGATGCAGAACTCATACAGACATTCCTGCCCTTCGGAGCTGTTGTCTCTGCCAAAGTT  873

Query  943  TTTGTGGATCGAGCCACCAACCAGAGCAAGTGTTTTGGGTTTGTTAGTTTTGACAATCCAACTAGTGCCCAGAC  1016
            ||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  874  TTTGTGGACCGTGCCACCAATCAGAGCAAGTGTTTTGGGTTTGTTAGTTTTGACAATCCAACCAGTGCCCAGAC  947

Query 1017  TGCTATTCAGGCGATGAATGGCTTTCAAATTGGCATGAAGAGGCTCAAGGTCCAGCTAAAGCGGCCCAAGGATG  1090
            .||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|.||.|||||||
Sbjct  948  CGCCATCCAGGCCATGAATGGCTTTCAAATCGGCATGAAGAGGCTCAAGGTCCAGCTAAAGAGACCTAAGGATG  1021

Query 1091  CCAACCGGCCTTAC  1104
            |||||.||||||||
Sbjct 1022  CCAACAGGCCTTAC  1035