Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000465313
- Subject:
- XM_017022584.1
- Aligned Length:
- 2036
- Identities:
- 1459
- Gaps:
- 574
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGTTTGTCAGCTACCTGATATTAACATTGCTCCACGTTCAAACAGCAGTGTTAGCAAGACCTGGGGGAGAGGA 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 GGAGCTTCAAAGTCACATTTCCACAGGAATTGATATGGAAAGGCATGAACAGAGCATTGGCTGTGATGACTACT 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 TAGGCTCCGACAAAGTCGTGGACAAATGTGGGGTGTGTGGAGGAGACAACACGGGCTGTCAGGTTGTGTCGGGC 222
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 223 GTGTTTAAGCATGCCCTCACCAGCCTGGGCTACCACCGCGTCGTGGAGATTCCCGAGGGAGCCACGAAAATCAA 296
Query 1 ----------ATGTACAAGAGCAACAACTATTTGGCCCTGAGAAGTCGTTCTGGACGCTCCATCATCAATGGGA 64
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CATCACGGAGATGTACAAGAGCAACAACTATTTGGCCCTGAGAAGTCGTTCTGGACGCTCCATCATCAATGGGA 370
Query 65 ACTGGGCAATTGATCGACCAGGAAAATACGAGGGCGGAGGGACCATGTTCACCTACAAGCGTCCAAATGAGATT 138
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ACTGGGCAATTGATCGACCAGGAAAATACGAGGGCGGAGGGACCATGTTCACCTACAAGCGTCCAAATGAGATT 444
Query 139 TCGAGCACTGCCGGAGAGTCCTTTTTGGCGGAAGGTCCCACCAACGAGATCTTGGATGTCTACATGATACACCA 212
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TCGAGCACTGCCGGAGAGTCCTTTTTGGCGGAAGGTCCCACCAACGAGATCTTGGATGTCTACATGATACACCA 518
Query 213 GCAGCCAAACCCAGGCGTGCACTACGAGTACGTGATCATGGGGACCAACGCCATCAGCCCCCAGGTGCCACCCC 286
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GCAGCCAAACCCAGGCGTGCACTACGAGTACGTGATCATGGGGACCAACGCCATCAGCCCCCAGGTGCCACCCC 592
Query 287 ACAGGAGACCAGGGGAACCCTTCAATGGCCAGATGGTGACAGAAGGCAGGAGCCAGGAGGAGGGAGAACAGAAA 360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ACAGGAGACCAGGGGAACCCTTCAATGGCCAGATGGTGACAGAAGGCAGGAGCCAGGAGGAGGGAGAACAGAAA 666
Query 361 GGGAGGAACGAGGAGAAGGAAGACTTGCGTGGGGAGGCCCCTGAGATGTTCACCTCAGAATCGGCACAGACCTT 434
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GGGAGGAACGAGGAGAAGGAAGACTTGCGTGGGGAGGCCCCTGAGATGTTCACCTCAGAATCGGCACAGACCTT 740
Query 435 CCCAGTCAGGCATCCAGACAGATTTTCTCCCCATCGACCGGACAACTTGGTGCCACCAGCACCGCAGCCCCCAC 508
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CCCAGTCAGGCATCCAGACAGATTTTCTCCCCATCGACCGGACAACTTGGTGCCACCAGCACCGCAGCCCCCAC 814
Query 509 GGCGCAGCCGGGATCACAACTGGAAGCAGCTTGGGACAACAGAATGTTCCACGACCTGTGGGAAAGGATCGCAG 582
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GGCGCAGCCGGGATCACAACTGGAAGCAGCTTGGGACAACAGAATGTTCCACGACCTGTGGGAAAGGATCGCAG 888
Query 583 TACCCTATTTTCCGCTGTGTGCACAGAAGCACTCATGAAGAGGCTCCTGAGAGTTACTGTGACTCCAGCATGAA 656
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TACCCTATTTTCCGCTGTGTGCACAGAAGCACTCATGAAGAGGCTCCTGAGAGTTACTGTGACTCCAGCATGAA 962
Query 657 GCCGACCCCCGAGGAGGAGCCCTGCAACATCTTCCCTTGCCCAGCCTTCTGGGACATCGGGGAGTGGTCTGAGT 730
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GCCGACCCCCGAGGAGGAGCCCTGCAACATCTTCCCTTGCCCAGCCTTCTGGGACATCGGGGAGTGGTCTGAGT 1036
Query 731 GCAGCAAGACCTGTGGCCTGGGCATGCAGCACCGCCAGGTTCTGTGCCGCCAGGTGTACGCCAACCGCAGCCTG 804
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GCAGCAAGACCTGTGGCCTGGGCATGCAGCACCGCCAGGTTCTGTGCCGCCAGGTGTACGCCAACCGCAGCCTG 1110
Query 805 ACGGTGCAGCCCTACCGCTGCCAGCACCTGGAGAAACCTGAGACCACCAGCACCTGCCAACTCAAGATCTGCAG 878
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 ACGGTGCAGCCCTACCGCTGCCAGCACCTGGAGAAACCTGAGACCACCAGCACCTGCCAACTCAAGATCTGCAG 1184
Query 879 CGAGTGGCAGATCCGGACCGACTGGACCTCGTGCTCGGTGCCCTGCGGCGTGGGACAGAGGACCCGTGATGTGA 952
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CGAGTGGCAGATCCGGACCGACTGGACCTCGTGCTCGGTGCCCTGCGGCGTGGGACAGAGGACCCGTGATGTGA 1258
Query 953 AGTGTGTGAGCAACATTGGGGATGTGGTTGACGATGAGGAATGCAACATGAAGCTCCGGCCGAATGACATTGAG 1026
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AGTGTGTGAGCAACATTGGGGATGTGGTTGACGATGAGGAATGCAACATGAAGCTCCGGCCGAATGACATTGAG 1332
Query 1027 AACTGCGACATGGGACCCTGTGCCAAGAGCTGGTTCCTCACCGAGTGGAGCGAAAGGTGCTCAGCGGAGTGTGG 1100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 AACTGCGACATGGGACCCTGTGCCAAGAGCTGGTTCCTCACCGAGTGGAGCGAAAGGTGCTCAGCGGAGTGTGG 1406
Query 1101 GGCCGGAGTGCGGACACGCTCGGTGGTGTGCATGACCAACCATGTCAGCAGCCTGCCCCTGGAGGGCTGTGGGA 1174
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GGCCGGAGTGCGGACACGCTCGGTGGTGTGCATGACCAACCATGTCAGCAGCCTGCCCCTGGAGGGCTGTGGGA 1480
Query 1175 ACAACCGGCCGGCAGAGGCCACCCCATGTGACAACGGACCCTGCACGGGCAAGGTGGAGTGGTTTGCCGGGAGC 1248
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 ACAACCGGCCGGCAGAGGCCACCCCATGTGACAACGGACCCTGCACGGGCAAGGTGGAGTGGTTTGCCGGGAGC 1554
Query 1249 TGGAGTCAGTGTTCCATCGAGTGTGGGAGCGGGACGCAACAGAGGGAGGTGATTTGTGTTAGAAAGAATGCAGA 1322
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 TGGAGTCAGTGTTCCATCGAGTGTGGGAGCGGGACGCAACAGAGGGAGGTGATTTGTGTTAGAAAGAATGCAGA 1628
Query 1323 CACCTTTGAAGTGTTGGACCCCTCTGAATGTTCTTTCCTGGAGAAACCCCCCAGCCAGCAATCCTGCCACCTCA 1396
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 CACCTTTGAAGTGTTGGACCCCTCTGAATGTTCTTTCCTGGAGAAACCCCCCAGCCAGCAATCCTGCCACCTCA 1702
Query 1397 AGCCTTGCGGAGCCAAATGGTTTAGCACCGAATGGAGCATGAGTCTACAAAGAGCCATGCTCACCAGG------ 1464
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||.|.|.|||||| || |||||
Sbjct 1703 AGCCTTGCGGAGCCAAATGGTTTAGCACCGAATGGAGCAT--GTGTTCCAAGAGC--TG----CCAGGGTGGCT 1768
Query 1465 -------CC---AAGT---------------------------------------------------------- 1470
|| ||||
Sbjct 1769 TTCGGGTCCGGGAAGTGCGGTGTCTGTCTGATGACATGACTCTAAGTAACCTCTGTGACCCTCAGTTGAAACCA 1842
Query 1471 -------------------------------------------------------------------------- 1470
Sbjct 1843 GAAGAGAGAGAATCTTGTAACCCTCAGGACTGTGTCCCTGAAGTTGATGAAAACTGCAAGGACAAGTACTACAA 1916
Query 1471 -------------------------------------------------------------------------- 1470
Sbjct 1917 CTGCAACGTGGTGGTCCAGGCAAGACTCTGTGTCTACAACTACTACAAGACCGCCTGCTGTGCCTCCTGCACCC 1990
Query 1471 -------------------------------------- 1470
Sbjct 1991 GTGTGGCCAACAGGCAGACGGGCTTCCTGGGGAGCAGA 2028