Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000465338
• Subject: XM_005257015.3
• Aligned Length: 1054
• Identities: 961
• Gaps: 86

Alignment

Query    1  ATGGANGCAAATGGGAGCCAAGGCACCTCGGGCAGCGCCAACGACTCCCAGCACGACCCCGGTAAAATGTTTAT  74
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGGCAAATGGGAGCCAAGGCACCTCGGGCAGCGCCAACGACTCCCAGCACGACCCCGGTAAAATGTTTAT  74

Query   75  CGGTGGACTGAGCTGGCAGACCTCACCAGATAGCCTTAGAGACTATTTTAGCAAATTTGGAGAAATTAGAGAAT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CGGTGGACTGAGCTGGCAGACCTCACCAGATAGCCTTAGAGACTATTTTAGCAAATTTGGAGAAATTAGAGAAT  148

Query  149  GTATGGTCATGAGAGATCCCACTACGAAACGCTCCAGAGGCTTCGGTTTCGTCACGTTCGCAGACCCAGCAAGT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GTATGGTCATGAGAGATCCCACTACGAAACGCTCCAGAGGCTTCGGTTTCGTCACGTTCGCAGACCCAGCAAGT  222

Query  223  GTAGATAAAGTATTAGGTCAGCCCCACCATGAGTTAGATTCCAAGACGATTGACCCCAAAGTTGCATTTCCTCG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GTAGATAAAGTATTAGGTCAGCCCCACCATGAGTTAGATTCCAAGACGATTGACCCCAAAGTTGCATTTCCTCG  296

Query  297  TCGAGCGCAACCCAAGATGGTCACGAGAACAAAGAAAATATTTGTAGGCGGGTTATCTGCGAACACAGTAGTGG  370
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCGAGCGCAACCCAAGATGGTCACAAGAACAAAGAAAATATTTGTAGGCGGGTTATCTGCGAACACAGTAGTGG  370

Query  371  AAGATGTAAAGCAATATTTCGAGCAGTTTGGCAAGGTGGAAGATGCAATGCTGATGTTTGATAAAACTACCAAC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AAGATGTAAAGCAATATTTCGAGCAGTTTGGCAAGGTGGAAGATGCAATGCTGATGTTTGATAAAACTACCAAC  444

Query  445  AGGCACAGAGGGTTTGGCTTTGTCACTTTTGAGAATGAAGATGTTGTGGAGAAAGTCTGTGAGATTCATTTCCA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AGGCACAGAGGGTTTGGCTTTGTCACTTTTGAGAATGAAGATGTTGTGGAGAAAGTCTGTGAGATTCATTTCCA  518

Query  519  TGAAATCAATAATAAAATGGTAGAATGTAAGAAAGCTCAGCCGAAAGAAGTCATGTTCCCACCTGGGACAAGAG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGAAATCAATAATAAAATGGTAGAATGTAAGAAAGCTCAGCCGAAAGAAGTCATGTTCCCACCTGGGACAAGAG  592

Query  593  GCCGGGCCCGGGGACTGCCTTACACCATGGACGCGTTCATGCTTGGCATGGGGATGCTGGGATATCCCAACTTC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GCCGGGCCCGGGGACTGCCTTACACCATGGACGCGTTCATGCTTGGCATGGGGATGCTGGGATATCCCAACTTC  666

Query  667  GTGGCGACCTATGGCCGTGGCTACCCCGGATTTGCTCCAAGCTATGGCTATCAGTTCCCAGGCTTCCCAGCAGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GTGGCGACCTATGGCCGTGGCTACCCCGGATTTGCTCCAAGCTATGGCTATCAGTTCCCAGGCTTCCCAGCAGC  740

Query  741  GGCTTATGGACCAGTGGCAGCAGCGGCGGTGGCGGCAGCAAGAGGAT---------------------------  787
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                           
Sbjct  741  GGCTTATGGACCAGTGGCAGCAGCGGCGGTGGCGGCAGCAAGAGGATCAGTCCTGAATAGCTACAGTGCTCAAC  814

Query  788  ---------------------------CAGGCTCCAACCCGGCGCGGCCCGGAGGCTTCCCGGGGGCCAACAGC  834
                                       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CGAATTTTGGCGCGCCCGCTTCCCCGGCAGGCTCCAACCCGGCGCGGCCCGGAGGCTTCCCGGGGGCCAACAGC  888

Query  835  CCAGGACCTGTCGCCGATCTCTACGGCCCTGCCAGCCAGGACTCCGGAGTGGGGAATTACATAAGTGCGGCCAG  908
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CCAGGACCTGTCGCCGATCTCTACGGCCCTGCCAGCCAGGACTCCGGAGTGGGGAATTACATAAGTGCGGCCAG  962

Query  909  CCCACAGCCGGGCTCGGGCTTCGGCCACGGCATAGCTGG---ACCTTTGAT-----TGCAACGGCCT-------  967
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|   ||| |.|||     .||||  |.||       
Sbjct  963  CCCACAGCCGGGCTCGGGCTTCGGCCACGGCATAGCTAGCATACC-TGGATGTCCAGGCAA--GACTGGGCGAA  1033

Query  968  -TTACAAATGGATACCAT  984
             ||.|             
Sbjct 1034  GTTTC-------------  1038