Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000465498
- Subject:
- XM_006537661.2
- Aligned Length:
- 2644
- Identities:
- 2068
- Gaps:
- 299
Alignment
Query 1 ATGAGAGAGCTCGTCAACATTCCACTGGTACATATTCTTACTCTGGTTGCCTTCAGCGGAACTGAGAAACTTCC 74
|||||||||||.|||||||||||||||.||||.||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAGAGAGCTTGTCAACATTCCACTGTTACAGATGCTCACCCTGGTTGCCTTCAGCGGGACTGAGAAACTTCC 74
Query 75 AAAAGCTCCTGTCATCACCACTCCTCTTGAAACAGTGGATGCCTTAGTTGAAGAAGTGGCTACTTTCATGTGTG 148
||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct 75 AAAAGCCCCTGTCATCACCACGCCTCTTGAAACTGTAGATGCCTTGGTTGAAGAAGTAGCGACTTTCATGTGTG 148
Query 149 CAGTGGAATCCTACCCCCAGCCTGAGATTTCCTGGACTAGAAATAAAATTCTCATTAAACTCTTTGACACCCGG 222
|.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.
Sbjct 149 CCGTGGAATCCTACCCTCAGCCCGAGATTTCTTGGACCAGAAATAAAATTCTCATTAAGCTGTTTGACACCCGC 222
Query 223 TACAGCATCCGGGAGAATGGGCAGCTCCTCACCATCCTGAGTGTGGAAGACAGTGATGATGGCATTTACTGCTG 296
||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 223 TACAGCATCCGGGAGAATGGTCAGCTCCTCACCATTCTGAGCGTGGAAGACAGTGATGATGGCATCTACTGCTG 296
Query 297 CACGGCCAACAATGGTGTGGGAGGAGCTGTGGAGAGTTGTGGAGCCCTGCAAGTGAAGATGAAACCTAAAATAA 370
||..|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CATAGCCAACAATGGAGTGGGAGGAGCCGTGGAGAGTTGTGGTGCCCTGCAAGTGAAGATGAAACCTAAAATAA 370
Query 371 CTCGTCCTCCCATAAATGTGAAAATAATAGAAGGATTAAAAGCAGTCCTACCATGTACTACAATGGGTAATCCC 444
|||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.|||||.||.||.||.|||||.||||||||.|||
Sbjct 371 CTCGTCCTCCCATTAATGTAAAAATAATAGAGGGATTGAAGGCAGTTCTGCCGTGCACTACGATGGGTAACCCC 444
Query 445 AAACCATCAGTGTCTTGGATAAAGGGAGACAGCCCTCTCAGGGAAAATTCCCGAATTGCAGTTCTTGAATCTGG 518
||||||||.|||||.|||||.|||||.||||...|||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||
Sbjct 445 AAACCATCTGTGTCCTGGATCAAGGGGGACAATGCTCTCAGGGAAAATTCCAGAATCGCAGTTCTTGAATCTGG 518
Query 519 GAGCTTGAGGATTCATAACGTACAAAAGGAAGATGCAGGACAGTATCGATGTGTGGCAAAAAACAGCCTCGGGA 592
||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.|
Sbjct 519 GAGCTTAAGGATCCATAATGTGCAAAAGGAAGATGCAGGACAGTACCGCTGTGTGGCCAAAAACAGCCTGGGCA 592
Query 593 CAGCATATTCCAAAGTGGTGAAGCTGGAAGTTGAG------------------------------GAAGAAAGT 636
||||.||.||||||.||||||||||||||||.||| |||||.||.
Sbjct 593 CAGCTTACTCCAAACTGGTGAAGCTGGAAGTGGAGGCTCTTAATATGACAAATGCCACAGAGAGAGAAGACAGA 666
Query 637 GAACCCGAACAAGATACTAAAGTTTTTGCCAGGATCCTGCGGGCTCCTGAATCCCACAATGTCACCTTTGGCTC 710
|||||.||.||.||..|||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 667 GAACCTGAGCAGGACGCTAAAGTTTTTGCAAGAATCCTGCGTGCTCCTGAATCCCACAATGTCACCTTTGGTTC 740
Query 711 CTTTGTGACCCTGCACTGTACAGCAACAGGCATTCCTGTCCCCACCATCACCTGGATTGAAAACGGAAATGCTG 784
||||||.|||||.|.|||.|||||||.||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CTTTGTAACCCTACGCTGCACAGCAATAGGCATCCCTGTCCCCACCATCAGCTGGATTGAAAACGGAAATGCTG 814
Query 785 TTTCTTCTGGGTCCATTCAAGAGAGTGTGAAAGACCGAGTGATTGACTCAAGACTGCAGCTGTTTATCACCAAG 858
|||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||
Sbjct 815 TTTCTTCAGGTTCCATTCAAGAGAGTGTGAAAGACCGAGTGATTGACTCAAGACTCCAGCTCTTCATCACAAAG 888
Query 859 CCAGGACTCTACACATGCATAGCTACCAATAAGCATGGGGAGAAGTTCAGTACTGCCAAGGCTGCAGCCACCAT 932
|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||..|
Sbjct 889 CCAGGACTCTACACATGCATAGCTACCAATAAGCACGGAGAAAAGTTCAGTACCGCAAAGGCTGCAGCCACTGT 962
Query 933 CAGCATAGCAGAATGG---------------------------------------------------------- 948
||||||||||||||||
Sbjct 963 CAGCATAGCAGAATGGAGTAAGTCACAGAAAGACAGCCAAGGCTACTGTGCCCAGTACAGAGGGGAGGTGTGTG 1036
Query 949 -------------------------------------------------------------------------- 948
Sbjct 1037 ATGCAGTCCTGGCGAAAGATGCTCTTGTCTTCTTCAACACCTCCTACCGGGACCCCGAGGACGCCCAGGAGCTG 1110
Query 949 -------------------------------------------------------------------------- 948
Sbjct 1111 CTGATCCACACTGCGTGGAATGAGCTGAAGGCTGTGAGTCCACTGTGCCGGCCAGCTGCTGAGGCTCTGCTGTG 1184
Query 949 ----------------------------------------------------------AGAGAGTACTGCTTGG 964
||||||||||||.|||
Sbjct 1185 TAACCACCTCTTCCAAGAGTGCAGCCCTGGAGTGGTACCTACTCCCATGCCCATTTGCAGAGAGTACTGCCTGG 1258
Query 965 CAGTAAAGGAGCTCTTCTGCGCAAAAGAATGGCTGGTAATGGAAGAGAAGACCCACAGAGGACTCTACAGATCC 1038
|.|||||||||||||||||.|||||.|||||||.||.||||||||..|||.|||||.|.||.|||||||||||.
Sbjct 1259 CGGTAAAGGAGCTCTTCTGTGCAAAGGAATGGCAGGCAATGGAAGGAAAGGCCCACCGGGGCCTCTACAGATCT 1332
Query 1039 GAGATGCATTTGCTGTCC-GTGCCAGAATGCAGCAAGCTTCCCAGCATGCATTGGGACCCCACGGCCTGTGCCA 1111
|.|||||||.|.|| ||| ||.|||||.|||||||||||||||||||||||..||||||||||.|||||..|.|
Sbjct 1333 GGGATGCATCTCCT-TCCGGTACCAGAGTGCAGCAAGCTTCCCAGCATGCACCGGGACCCCACAGCCTGCACAA 1405
Query 1112 GACTGCCACATCTAGCATTCCCACCAATGACGTCCTCAAAGCCAAGTGTGGACATTCCAAATCTGCCTTCCTCC 1185
||||||||.||.||||||||||..||||.||||||||.|.|||.||.|.||||||||||||.||||||.|||||
Sbjct 1406 GACTGCCATATTTAGCATTCCCGTCAATAACGTCCTCCAGGCCGAGCGCGGACATTCCAAACCTGCCTGCCTCC 1479
Query 1186 TCCTCTTCTTCCTTCTCTGTCTCACCTACATACTCCATGACTGTAATAATCTCCATCATGTCCAGCTTTGCAAT 1259
.|| ||||||||..|.|||||.|||.|.|||||||||||.||.||.|||||||||.|||||||||||||..|
Sbjct 1480 ACC---TCTTCCTTTGCCGTCTCGCCTGCGTACTCCATGACCGTCATCATCTCCATCGTGTCCAGCTTTGCCCT 1550
Query 1260 ATTTGTGCTTCTTACCATAACTACTCTCTATTGCTGCCGAAGAAGAAAACAATGGAAAAATAAGAAAAGAGAAT 1333
.||||..|||||.|||||..||||||||||||||||||||||.||.|||.||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 1551 GTTTGCTCTTCTCACCATCGCTACTCTCTATTGCTGCCGAAGGAGGAAAGAATGGAAAAATAAGAAAAGAGAGT 1624
Query 1334 CAGCAGCAGTAACCCTCACCACACTGCCTTCTGAGCTCTTACTAGATAGACTTCATCCCAACCCCATGTACCAG 1407
|..|.||.||.|||||||||||..|||||||.||||||.|.||.|||||.||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1625 CGACCGCGGTGACCCTCACCACGTTGCCTTCCGAGCTCCTGCTGGATAGGCTCCATCCCAACCCCATGTACCAG 1698
Query 1408 AGGATGCCGCTCCTTCTGAACCCCAAATTGCTCAGCCTGGAGTATCCAAGGAATAACATTGAATATGTGAGAGA 1481
||||||||.|||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||..||||
Sbjct 1699 AGGATGCCACTCCTTCTGAATCCTAAGTTGCTCAGCCTGGAGTATCCGAGGAATAACATTGAGTATGTCCGAGA 1772
Query 1482 CATCGGAGAGGGAGCGTTTGGAAGGGTGTTTCAAGCAAGGGCACCAGGCTTACTTCCCTATGAACCTTTCACTA 1555
||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||.||.|||||.||.||.||||||||||||||||
Sbjct 1773 CATCGGAGAGGGGGCGTTTGGAAGAGTCTTCCAAGCAAGGGCCCCTGGCTTGCTGCCTTATGAACCTTTCACTA 1846
Query 1556 TGGTGGCAGTAAAGATGCTCAAAGAAGAAGCCTCGGCAGATATGCAAGCGGACTTTCAGAGGGAGGCAGCCCTC 1629
|||||||.||.||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1847 TGGTGGCCGTGAAGATGCTTAAGGAAGAGGCCTCTGCAGACATGCAAGCGGACTTTCAGAGGGAGGCGGCCCTC 1920
Query 1630 ATGGCAGAATTTGACAACCCTAACATTGTGAAGCTATTAGGAGTGTGTGCTGTCGGGAAGCCAATGTGCCTGCT 1703
||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.||.||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1921 ATGGCAGAGTTTGACAACCCCAACATTGTGAAACTCTTAGGTGTGTGTGCCGTTGGGAAGCCGATGTGTCTGCT 1994
Query 1704 CTTTGAATACATGGCCTATGGTGACCTCAATGAGTTCCTCCGCAGCATGTCCCCTCACACCGTGTGCAGCCTCA 1777
|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||.||||||||||
Sbjct 1995 CTTTGAATATATGGCCTATGGTGACCTCAATGAGTTCCTCCGAAGTATGTCCCCGCACACTGTTTGCAGCCTCA 2068
Query 1778 GTCACAGTGACTTGTCTATGAGGGCTCAGGTCTCCAGCCCTGGGCCCCCACCCCTCTCCTGTGCTGAGCAGCTT 1851
|.|||||||||.||||.|.||||||||.|||.||.||||||||.||.|||||.||.||||||||.||.|||||.
Sbjct 2069 GCCACAGTGACCTGTCCACGAGGGCTCGGGTGTCTAGCCCTGGTCCTCCACCACTGTCCTGTGCAGAACAGCTC 2142
Query 1852 TGCATTGCCAGGCAGGTGGCAGCTGGCATGGCTTACCTCTCAGAACGTAAGTTTGTTCACCGAGATTTAGCCAC 1925
||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||.|||||.||.|||||.||
Sbjct 2143 TGCATTGCCAGGCAGGTGGCAGCTGGCATGGCCTACCTTTCAGAGCGCAAGTTTGTCCACCGGGACTTAGCTAC 2216
Query 1926 CAGGAACTGCCTGGTGGGCGAGAACATGGTGGTGAAAATTGCCGACTTTGGCCTCTCCAGGAACATCTACTCAG 1999
|||||||||||||||.||.||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 2217 CAGGAACTGCCTGGTTGGGGAGACCATGGTGGTGAAAATTGCAGACTTTGGCCTCTCCAGGAACATCTATTCCG 2290
Query 2000 CAGACTACTACAAAGCTAATGAAAACGACGCTATCCCTATCCGTTGGATGCCACCAGAGTCCATTTTTTATAAC 2073
|||||||||||||||||.|||.|||.|||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.||.||.||.|||
Sbjct 2291 CAGACTACTACAAAGCTGATGGAAATGACGCCATCCCTATCCGCTGGATGCCGCCCGAGTCTATCTTCTACAAC 2364
Query 2074 CGCTACACTACAGAGTCTGATGTGTGGGCCTATGGCGTGGTCCTCTGGGAGATCTTCTCCTATGGCCTGCAGCC 2147
||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 2365 CGCTACACCACTGAGTCGGATGTATGGGCCTATGGTGTGGTCCTCTGGGAGATCTTCTCCTATGGGCTGCAGCC 2438
Query 2148 CTACTATGGGATGGCCCATGAGGAGGTCATTTACTACGTGCGAGATGGCAACATCCTCTCCTGCCCTGAGAACT 2221
|||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 2439 CTACTATGGAATGGCCCACGAGGAGGTCATTTACTATGTGAGAGATGGCAACATCCTCGCCTGCCCTGAGAACT 2512
Query 2222 GCCCCGTGGAGCTGTACAATCTCATGCGTCTATGTTGGAGCAAGCTGCCTGCAGACAGACCCAGTTTCACCAGT 2295
|||||.||||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||..||||
Sbjct 2513 GCCCCTTGGAACTGTACAACCTCATGCGCCTGTGTTGGAGCAAGCTGCCTGCTGATAGACCCAGCTTCTGCAGT 2586
Query 2296 ATTCACCGAATTCTGGAACGCATGTGTGAGAGGGCAGAGGGAACTGTGAGTGTC 2349
||.|||.|.||.|||.|.||||||||.|||||.|||||||||||.|||.|||||
Sbjct 2587 ATCCACAGGATCCTGCAGCGCATGTGCGAGAGAGCAGAGGGAACGGTGGGTGTC 2640