Protein Global Alignment

Description

Query:
TRCN0000465554
Subject:
NM_001290428.1
Aligned Length:
1322
Identities:
1160
Gaps:
42

Alignment

Query    1  MDVFSFVTIAKLSSHRTKSSGWPPPSGTWGLSQVPPYGWEMTANRDGRDYFINHMTQAIPFDDPRLESCQIIPP  74
                                                    |..||||||||||||||||||||||..|||||||
Sbjct    1  ----------------------------------------MMTNRDGRDYFINHMTQAIPFDDPRFDSCQIIPP  34

Query   75  APRKVEMRRDPVLGFGFVAGSEKPVVVRSVTPGGPSEGKLIPGDQIVMINDEPVSAAPRERVIDLVRSCKESIL  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct   35  APRKVEMRRDPVLGFGFVAGSEKPVVVRSVTPGGPSEGKLIPGDQIVMINDEAVSAAPRERVIDLVRSCKESIL  108

Query  149  LTVIQPYPSPKSAFISAAKKARLKSNPVKVRFSEEVIINGQVSETVKDNSLLFMPNVLKVYLENGQTKSFRFDC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  109  LTVIQPYPSPKSAFISAAKKARLKSNPVKVRFSEEVIINGQVSETVKDNSLLFMPNVLKVYLENGQTKSFRFDC  182

Query  223  STSIKDVILTLQEKLSIKGIEHFSLMLEQRTEGAGTKLLLLHEQETLTQVTQRPSSHKMRCLFRISFVPKDPID  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  183  STSIKDVILTLQEKLSIKGIEHFSLMLEQRIEGAGTKLLLLHEQETLTQVTQRPSSHKMRCLFRISFVPKDPID  256

Query  297  LLRRDPVAFEYLYVQSCNDVVQERFGPELKYDIALRLAALQMYIATVTTKQTQKISLKYIEKEWGLETFLPSAV  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  257  LLRRDPVAFEYLYVQSCNDVVQERFGPELKYDIALRLAALQMYIATVTTKQTQKISLKYIEKEWGLETFLPSAV  330

Query  371  LQSMKEKNIKKALSHLVKANQNLVPPGKKLSALQAKVHYLKFLSDLRLYGGRVFKATLVQAEKRSEVTLLVGPR  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  331  LQSMKEKNIKKALSHLVKANQNLVPPGKKLSALQAKVHYLKFLSDLRLYGGRVFKATLVQAEKRSEVTLLVGPR  404

Query  445  YGISHVINTKTNLVALLADFSHVNRIEMFSEEESLVRVELHVLDVKPITLLMESSDAMNLACLTAGYYRLLVDS  518
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  405  YGISHVINTKTNLVALLADFSHVNRIEMFTEEESLVRVELHVLDVKPITLLMESSDAMNLACLTAGYYRLLVDS  478

Query  519  RRSIFNMANKKNTATQETGPENKGKHNLLGPDWNCIPQMTTFIGEGEQEAQITYIDSKQKTVEITDSTMCPKEH  592
            ||||||||||||..||.||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||
Sbjct  479  RRSIFNMANKKNAGTQDTGSENKGKHNLLGPDWNCMPQMTTFIGEGEQEAQITYIDSKQKTVEMTDSTLCPKEH  552

Query  593  RHLYIDNAYSSDGLNQQLSQPGEAPCEADYRSLAQRSLLTLSGPETLKKAQESPRGAKVSFIFGDFALDDGISP  666
            |||||||.||||.|||.|.|||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct  553  RHLYIDNSYSSDELNQPLTQPGDAPCEADYRSLAQRSLLTLSGPDTLKKAQESPRGAKVSFIFGDLALDDGMSP  626

Query  667  PTLGYETLLDEGPEMLEKQRNLYIGSANDMKGLDLTPEAEGIQFVENSVYANIGDVKSFQAAEGIEEPLLHDIC  740
            ||.|||..|.|.||||||||||||.||||||.|||||....||||.|||||||||||.|.|.||||||||||||
Sbjct  627  PTIGYERMLEENPEMLEKQRNLYISSANDMKNLDLTPDTDSIQFVANSVYANIGDVKNFEAPEGIEEPLLHDIC  700

Query  741  YAENTDDAEDEDEVSCEEDLVVGEMNQPAILNLSGSSDDIIDLTSLPPPEGDDNEDDFLLRSLNMAIAAPPPGF  814
            |||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  701  YAENTDDAEDEDEVSCEEDLVVGEMNQPAILDLSGSSDDIIDLTTLPPPEGDDNEDDFLLRSLNMAIAAPPPGF  774

Query  815  RDSSDEEDSQSQAASFPEDKEKGSSLQNDEIPVSLIDAVPTSAEGKCEKGLDNAVVSTLGALEALSVSEEQQTS  888
            ||||||||.||||.||.||||.||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||.|||||  |||||.|
Sbjct  775  RDSSDEEDTQSQATSFHEDKEQGSSLQNEEIPVSLIDAVPTSAEGKCEKGLDPAVVSTLEALEAL--SEEQQKS  846

Query  889  DNSGVAILRAYSPESSSDSGNETNSSEMTESSELATAQKQSENLSRMFLATHEGYHPLAEEQTEFPASKTPAGG  962
            .|||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|..|
Sbjct  847  ENSGVAILRAYSPESSSDSGNETNSSEMTEGSELAAAQKQSESLSRMFLATHEGYHPLAEEQTEFPTSKAPSVG  920

Query  963  LPPKSSHALAARPATDLPPKVVPSKQLLHSDHMEMEPETMETKSVTDYFSKLHMGSVAYSCTSKRKSKLADGEG  1036
            |||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||
Sbjct  921  LPPKSSHGLAARPATDLPPKVVPSKQILHSDHMEMEPETMETKSVTDYFSKLHMGSVAYSCTSKRKSKLPEGEG  994

Query 1037  KAPPNGNTTGKKQQGTKTAEMEEEASGKFGTVSSRDSQHLSTFNLERTAFRKDSQRWYVATEGGMAEKSGLEAA  1110
            |.|..||..||||||||.||.||...||.|||||||..||||||||||||||||||||||..||..||||.||.
Sbjct  995  KSPLSGNIPGKKQQGTKIAEIEEDTKGKAGTVSSRDNPHLSTFNLERTAFRKDSQRWYVASDGGVVEKSGMEAP  1068

Query 1111  TGKTFPRASGLGAREAEGKEEGAPDGETSDGSGLGQGDRFLTDVTCASSAKDLDNPEDADSSTCDHPSKLPEAD  1184
            ..|.|||..|||.|||||||.|...|...|.|.||||||||||..|..||||||||||.||..|||..||.||.
Sbjct 1069  AMKVFPRGPGLGNREAEGKEDGTVEGGADDASVLGQGDRFLTDMACVASAKDLDNPEDTDSPSCDHATKLSEAE  1142

Query 1185  ESVAQLCDYHLAKRMSSLQSEGHFSLQSSQGSSVDAGCGTGSSGSACATPVESPLCPSLGKHLIPDASGKGVNY  1258
            ..||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||.||||||||||||||.|||.||||||||..|
Sbjct 1143  DNVARLCDYHLAKRMSSLQSEGHFSLQSSQGSSVDTGCGPGSSSSACATPVESPLCPSMGKHMIPDASGKGGRY  1216

Query 1259  IPSEERAPGLPNHGATFKELHPQTEGMCPRMTVPALHTAINTEPLFGTLRDGCHRLPKIKETTV  1322
            |..||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||
Sbjct 1217  ISPEERAPGHPNHGATFEELHPQTEGMCPRMTVPALHTAINADPLFGTLRDGCHRLPKIKETTV  1280