Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000465900
- Subject:
- XM_006715572.4
- Aligned Length:
- 1776
- Identities:
- 1553
- Gaps:
- 219
Alignment
Query 1 ATGAGAGGGCGGGACCTGTGTTCCTCCACACAAAGCCAGGCGCTGGGATCTTTGAGAACCACCACCCCAGCCTT 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 TACCCTTAACATTCCATCCGAGGCAAACCACACTGAGCAGCCGCCTGCAGGCCTGGGAGCAAGGCTACAGGAAG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 CAGGTGTTTCCATCCCTCCCAGGCGAGGCCGCCCAACACCAACACTGGAGAAGAAGAAAAAACCTCATTTGATG 222
|||
Sbjct 1 -----------------------------------------------------------------------ATG 3
Query 223 GCGGAAGATGAACCTTCAGGGGCCCTCTTGAAGCCGCTGGTTTTTCGCGTTGACGAGACCACCCCGGCTGTGGT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 4 GCGGAAGATGAACCTTCAGGGGCCCTCTTGAAGCCGCTGGTTTTTCGCGTTGACGAGACCACCCCGGCTGTGGT 77
Query 297 GCAAAGTGTCCTCCTGGAGAGGGGGTGGAATAAGTTTGATAAGCAGGAGCAGAACGCGGAGGACTGGAACCTGT 370
||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 78 GCAAAGCGTCCTCCTGGAGAGGGGGTGGAATAAGTTTGATAAGCAGGAGCAGAACGCGGAGGACTGGAACCTGT 151
Query 371 ACTGGAGGGCATCCTCTTTCCGAATGACCGAACACAACAGTGTTAAACCGTGGCAGCAGCTAAACCACCACCCT 444
||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 152 ACTGGAGGACATCCTCTTTCCGAATGACCGAACACAACAGTGTTAAACCGTGGCAGCAGCTAAACCACCACCCT 225
Query 445 GGAACCACCAAGCTTACCAGGAAAGACTGTTTGGCCAAACACCTGAAGCACATGAGGAGGATGTATGGCACTTC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 226 GGAACCACCAAGCTTACCAGGAAAGACTGTTTGGCCAAACACCTGAAGCACATGAGGAGGATGTATGGCACTTC 299
Query 519 CCTGTACCAGTTCATCCCCCTGACGTTCGTCATGCCCAATGACTATACCAAGTTCGTGGCTGAATACTTTCAGG 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 300 CCTGTACCAGTTCATCCCCCTGACGTTCGTCATGCCCAATGACTATACCAAGTTCGTGGCTGAATACTTTCAGG 373
Query 593 AGAGGCAGATGCTGGGCACCAAGCATAGCTATTGGATTTGCAAGCCTGCTGAGTTATCTCGTGGGAGGGGGATA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 374 AGAGGCAGATGCTGGGCACCAAGCATAGCTATTGGATTTGCAAGCCTGCTGAGTTATCTCGTGGGAGGGGGATA 447
Query 667 CTAATTTTCAGTGACTTTAAAGACTTCATCTTTGATGATATGTACATAGTGCAGAAATATATCTCCAATCCTTT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 448 CTAATTTTCAGTGACTTTAAAGACTTCATCTTTGATGATATGTACATAGTGCAGAAATATATCTCCAATCCTTT 521
Query 741 ACTTATTGGCAGATATAAATGTGATCTCCGCATCTATGTTTGTGTTACTGGCTTTAAGCCTTTGACCATTTATG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 522 ACTTATTGGCAGATATAAATGTGATCTCCGCATCTATGTTTGTGTTACTGGCTTTAAGCCTTTGACCATTTATG 595
Query 815 TTTATCAGGAAGGGTTGGTTCGGTTTGCCACGGAAAAGTTTGACCTCAGTAATTTGCAAAACAATTATGCCCAT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 596 TTTATCAGGAAGGGTTGGTTCGGTTTGCCACGGAAAAGTTTGACCTCAGTAATTTGCAAAACAATTATGCCCAT 669
Query 889 TTGACCAACAGCAGCATCAATAAATCCGGGGCCTCTTATGAGAAGATCAAAGAAGTGATTGGTCATGGTTGTAA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 670 TTGACCAACAGCAGCATCAATAAATCCGGGGCCTCTTATGAGAAGATCAAAGAAGTGATTGGTCATGGTTGTAA 743
Query 963 ATGGACGCTCAGCAGATTTTTTTCCTACCTTCGTAGCTGGGATGTGGACGATCTGCTTTTGTGGAAGAAAATCC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 744 ATGGACGCTCAGCAGATTTTTTTCCTACCTTCGTAGCTGGGATGTGGACGATCTGCTTTTGTGGAAGAAAATCC 817
Query 1037 ACCGCATGGTTATTCTCACCATTCTCGCCATTGCACCATCTGTCCCCTTTGCTGCCAATTGCTTTGAGCTCTTT 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 818 ACCGCATGGTTATTCTCACCATTCTCGCCATTGCACCATCTGTCCCCTTTGCTGCCAATTGCTTTGAGCTCTTT 891
Query 1111 GGGTTTGATATTTTGATTGATGACAACTTGAAACCATGGCTTTTAGAGGTCAACTACAGCCCAGCCTTGACCTT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 892 GGGTTTGATATTTTGATTGATGACAACTTGAAACCATGGCTTTTAGAGGTCAACTACAGCCCAGCCTTGACCTT 965
Query 1185 GGATTGTTCAACAGATGTGTTGGTGAAGAGAAAACTTGTCCATGATATTATTGACCTGATTTACTTAAATGGTC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 966 GGATTGTTCAACAGATGTGTTGGTGAAGAGAAAACTTGTCCATGATATTATTGACCTGATTTACTTAAATGGTC 1039
Query 1259 TAAGAAATGAGGGGGGAGAAGCCAGTAATGCCACACATGGAAATTCCAACATCGATGCTGCAAAAAGTGACAGA 1332
||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1040 TAAGAAATGAGGGGAGAGAAGCCAGTAATGCCACACATGGAAATTCCAACATCGACGCTGCAAAAAGTGACAGA 1113
Query 1333 GGTGGGCTTGATGCTCCTGACTGTCTTCCTTATGATTCTCTTTCGTTCACAAGCAGAATGTACAACGAGGATGA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1114 GGTGGGCTTGATGCTCCTGACTGTCTTCCTTATGATTCTCTTTCGTTCACAAGCAGAATGTACAACGAGGATGA 1187
Query 1407 CTCTGTGGTGGAGAAAGCTGTGAGTGTGCGTCCTGAAGCTGCACCTGCCTCCCAGCTGGAAGGAGAGATGAGTG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1188 CTCTGTGGTGGAGAAAGCTGTGAGTGTGCGTCCTGAAGCTGCACCTGCCTCCCAGCTGGAAGGAGAGATGAGTG 1261
Query 1481 GGCAGGATTTTCATCTGTCAACAAGGGAGATGCCACAAAGCAAGCCCAAGTTACGGAGCAGGCACACGCCTCAC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1262 GGCAGGATTTTCATCTGTCAACAAGGGAGATGCCACAAAGCAAGCCCAAGTTACGGAGCAGGCACACGCCTCAC 1335
Query 1555 AAGACACTCATGCCCTACGCGTCCCTCTTCCAGTCGCACTCCTGCAAGACCAAGACCTCCCCGTGTGTCCTGTC 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1336 AAGACACTCATGCCCTACGCGTCCCTCTTCCAGTCGCACTCCTGCAAGACCAAGACCTCCCCGTGTGTCCTGTC 1409
Query 1629 AGACCGTGGCAAAGCTCCAGATCCCCAAGCAGGCAACTTTGTTCTTGTTTTTCCTTTCAATGAAGCAACTCTCG 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1410 AGACCGTGGCAAAGCTCCAGATCCCCAAGCAGGCAACTTTGTTCTTGTTTTTCCTTTCAATGAAGCAACTCTCG 1483
Query 1703 GAGCTTCCAGGAATGGATTAAATGTCAAAAGAATAATCCAAGAGCTCCAGAAACTAATGAATAAGCAACATTCC 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1484 GAGCTTCCAGGAATGGATTAAATGTCAAAAGAATAATCCAAGAGCTCCAGAAACTAATGAATAAGCAACATTCC 1557