Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000465915
• Subject: NM_001347144.1
• Aligned Length: 1200
• Identities: 1047
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGCTGGCCCGGAGGAAGCCGGTGCTGCCGGCGCTCACCATCAACCCTACCATCGCCGAGGGCCCATCCCCTAC  74
            ||||||||||||||||||||||||.|.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct    1  ATGCTGGCCCGGAGGAAGCCGGTGTTACCGGCACTCACTATCAACCCTACCATCGCCGAGGGCCCGTCCCCCAC  74

Query   75  CAGCGAGGGCGCCTCCGAGGCAAACCTGGTGGACCTGCAGAAGAAGCTGGAGGAGCTGGAACTTGACGAGCAGC  148
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||||
Sbjct   75  CAGCGAGGGCGCCTCTGAGGCAAACCTGGTGGACCTCCAGAAGAAGCTGGAAGAGCTGGACCTGGATGAGCAGC  148

Query  149  AGAAGAAGCGGCTGGAAGCCTTTCTCACCCAGAAAGCCAAGGTCGGCGAACTCAAAGACGATGACTTCGAAAGG  222
            |.|.||||||||||||.|||||.||.||||||||.||.||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||.|||
Sbjct  149  AAAGGAAGCGGCTGGAGGCCTTCCTTACCCAGAAGGCTAAGGTCGGTGAGCTCAAGGACGACGACTTTGAGAGG  222

Query  223  ATCTCAGAGCTGGGCGCGGGCAACGGCGGGGTGGTCACCAAAGTCCAGCACAGACCCTCGGGCCTCATCATGGC  296
            ||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||.|.||.|||.||.||.||.||||||||||||||
Sbjct  223  ATCTCAGAGCTGGGTGCCGGCAATGGCGGAGTGGTCACCAAGGCCCGGCATAGGCCGTCAGGCCTCATCATGGC  296

Query  297  CAGGAAGCTGATCCACCTTGAGATCAAGCCGGCCATCCGGAACCAGATCATCCGCGAGCTGCAGGTCCTGCACG  370
            |||.||||||||||||||.||||||||.||||||.|.||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct  297  CAGAAAGCTGATCCACCTGGAGATCAAACCGGCCGTGCGCAACCAGATCATCCGGGAGCTGCAGGTGCTGCACG  370

Query  371  AATGCAACTCGCCGTACATCGTGGGCTTCTACGGGGCCTTCTACAGTGACGGGGAGATCAGCATTTGCATGGAA  444
            |.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.
Sbjct  371  AGTGCAACTCGCCCTACATCGTGGGCTTCTATGGGGCCTTCTACAGCGACGGCGAGATCAGCATCTGCATGGAG  444

Query  445  CACATGGATGGCGGCTCCCTGGACCAGGTGCTGAAAGAGGCCAAGAGGATTCCCGAGGAGATCCTGGGGAAAGT  518
            |||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||.|||||||.||.||.|||.|||||||.||
Sbjct  445  CACATGGATGGTGGCTCACTGGACCAGGTACTGAAGGAGGCCAAGCGGATTCCTGAAGACATCTTGGGGAAGGT  518

Query  519  CAGCATCGCGGTTCTCCGGGGCTTGGCGTACCTCCGAGAGAAGCACCAGATCATGCACCGAGATGTGAAGCCCT  592
            ||||||.|||||.|||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  519  CAGCATTGCGGTGCTCCGGGGCCTGGCCTACCTCCGAGAGAAGCACCAGATCATGCACAGAGATGTGAAGCCCT  592

Query  593  CCAACATCCTCGTGAACTCTAGAGGGGAGATCAAGCTGTGTGACTTCGGGGTGAGCGGCCAGCTCATAGACTCC  666
            ||||||||||.|||||||||.|.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct  593  CCAACATCCTGGTGAACTCTCGCGGGGAGATTAAGCTGTGTGACTTCGGGGTGAGCGGCCAGCTGATCGACTCC  666

Query  667  ATGGCCAACTCCTTCGTGGGCACGCGCTCCTACATGGCTCCGGAGCGGTTGCAGGGCACACATTACTCGGTGCA  740
            |||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||.|.||.||||||.||||||||||.||.|||||.|||||
Sbjct  667  ATGGCCAACTCGTTTGTAGGGACGCGCTCCTACATGTCCCCAGAGCGGCTGCAGGGCACCCACTACTCTGTGCA  740

Query  741  GTCGGACATCTGGAGCATGGGCCTGTCCCTGGTGGAGCTGGCCGTCGGAAGGTACCCCATCCCCCCGCCCGACG  814
            |||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||.||||.|||||.|||||.|||||.||.||.|
Sbjct  741  GTCGGACATCTGGAGCATGGGGCTGTCGCTGGTGGAGCTGGCCATCGGGAGGTATCCCATTCCCCCACCTGATG  814

Query  815  CCAAAGAGCTGGAGGCCATCTTTGGCCGGCCCGTGGTCGACGGGGAAGAAGGAGAGCCTCACAGCATCTCGCCT  888
            ||||.||.||.|||||||.||||||||||||.|||||.|||||||.|||.|||||.||.||.||..||||.||.
Sbjct  815  CCAAGGAACTAGAGGCCAGCTTTGGCCGGCCTGTGGTGGACGGGGCAGACGGAGAACCCCATAGTGTCTCCCCG  888

Query  889  CGGCCGAGGCCCCCCGGGCGCCCCGTCAGCGGTCACGGGATGGATAGCCGGCCTGCCATGGCCATCTTTGAACT  962
            .||||.||||||||.||.||||||.||||.|||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||
Sbjct  889  AGGCCCAGGCCCCCTGGACGCCCCATCAGTGGTCATGGGATGGACAGCCGACCGGCCATGGCCATCTTTGAGCT  962

Query  963  CCTGGACTATATTGTGAACGAGCCACCTCCTAAGCTGCCCAACGGTGTGTTCACCCCCGACTTCCAGGAGTTTG  1036
            .||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||..||||||||||.|.|.||||||||||||||||
Sbjct  963  GCTGGACTACATAGTGAACGAGCCACCTCCCAAGCTGCCCAGTGGTGTGTTCAGCTCAGACTTCCAGGAGTTTG  1036

Query 1037  TCAATAAATGCCTCATCAAGAACCCAGCGGAGCGGGCGGACCTGAAGATGCTCACAAACCACACCTTCATCAAG  1110
            |.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.||.||||||.||||.|..||||||.|||||||||||
Sbjct 1037  TGAATAAATGTCTCATTAAGAACCCAGCAGAGCGAGCAGATCTGAAGCTGCTGATGAACCACGCCTTCATCAAG  1110

Query 1111  CGGTCCGAGGTGGAAGAAGTGGATTTTGCCGGCTGGTTGTGTAAAACCCTGCGGCTGAACCAGCCCGGCACACC  1184
            ||.||.||||.|||.||||||||.||.|||||||||.||||.|.|||||||||||||||.||||||.|||||||
Sbjct 1111  CGCTCTGAGGGGGAGGAAGTGGACTTCGCCGGCTGGCTGTGCAGAACCCTGCGGCTGAAGCAGCCCAGCACACC  1184

Query 1185  CACGCGCACCGCCGTG  1200
            ||||||.||.||.|||
Sbjct 1185  CACGCGGACTGCAGTG  1200