Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000465958
- Subject:
- XM_011526256.1
- Aligned Length:
- 1047
- Identities:
- 725
- Gaps:
- 312
Alignment
Query 1 ATGCCGCGCTCACTGTTCAAGGGAAACTTTTGGAGTGCAGACATCCTCAGCACCATCGGCTATGACAACATTAT 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CCAACATCTGAACAATGGCCGCAAGAACTGCAAAGAGTTTGAAGACTTTCTAAAAGAAAGGGCAGCAATTGAAG 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 AGAGGTATGGCAAAGATCTGCT-CAACCTCTCTAGGA---AG--AAGCCGTGTGGACAGTCT-GAAATCAA--- 212
.|||| |||.|.| |||| || ||.||.|.| .|||.|| |.||||.|
Sbjct 1 -----------------ATGCTCCAAGCAC---AGGATCCAGCTAAACCATAT--TCAGACTGGCAATCCACAG 52
Query 213 ----CACCCTGAAGCGGGCCCTTGAAGTCTTCAAGCAGCAAGTAGACAATGTGGCACAATGTCACATTCAGCTT 282
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 53 AACTCACCCTGAAGCGGGCCCTTGAAGTCTTCAAGCAGCAAGTAGACAATGTGGCACAATGTCACATTCAGCTT 126
Query 283 GCACAGAGTTTAAGAGAAGAGGCCAGGAAGATGGAAGAATTCAGGGAAAAGCAAAAACTACAACGAAAAAAGAC 356
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 127 GCACAGAGTTTAAGAGAAGAGGCCAGGAAGATGGAAGAATTCAGGGAAAAGCAAAAACTACAACGAAAAAAGAC 200
Query 357 AGAGCTCATAATGGATGCTATCCATAAACAAAAGAGCTTACAATTCAAGAAAACCATGGATGCAAAGAAGAACT 430
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 201 AGAGCTCATAATGGATGCTATCCATAAACAAAAGAGCTTACAATTCAAGAAAACCATGGATGCAAAGAAGAACT 274
Query 431 ATGAGCAGAAATGCCGGGACAAAGATGAGGCAGAACAGGCCGTCAGCCGGAGTGCCAACCTGGTGAACCCGAAG 504
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 275 ATGAGCAGAAATGCCGGGACAAAGATGAGGCAGAACAGGCCGTCAGCCGGAGTGCCAACCTGGTGAACCCGAAG 348
Query 505 CAACAAGAAAAGCTTTTTGTGAAACTGGCAACTTCAAAGACCGCAGTAGAGGACTCAGACAAAGCATACATGCT 578
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 349 CAACAAGAAAAGCTTTTTGTGAAACTGGCAACTTCAAAGACCGCAGTAGAGGACTCAGACAAAGCATACATGCT 422
Query 579 GCACATCGGCACCCTGGATAAGGTCCGAGAAGAGTGGCAGAGTGAGCACATCAAGGCCTGCGAGGCATTTGAGG 652
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 423 GCACATCGGCACCCTGGATAAGGTCCGAGAAGAGTGGCAGAGTGAGCACATCAAGGCCTGCGAGGCATTTGAGG 496
Query 653 CTCAAGAATGTGAACGAATAAACTTCTTCCGGAATGCATTGTGGTTACATGTGAATCAGCTGTCACAACAATGT 726
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 497 CTCAAGAATGTGAACGAATAAACTTCTTCCGGAATGCATTGTGGTTACATGTGAATCAGCTGTCACAACAATGT 570
Query 727 GTCACCAGTGATGAA----------------------------------------------------------- 741
|||||||||||||||
Sbjct 571 GTCACCAGTGATGAAATGTACGAACAAGTCCGAAAGAGTTTAGAAATGTGCAGCATTCAGAGGGACATTGAATA 644
Query 742 --------------------------------------CACCCATCATGTATGAGAATTTCTACTCCTCCCAGA 777
||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 645 CTTTGTGAATCAACGCAAAACTGGACAGATTCCACCAGCACCCATCATGTATGAGAATTTCTACTCCTCCCAGA 718
Query 778 AGAATGCAGTCCCAGCAGGAAAGGCTACAGGGCCTAACTTGGCAAGGAGAGGACCCCTCCCAATTCCTAAAAGC 851
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 719 AGAATGCAGTCCCAGCAGGAAAGGCTACAGGGCCTAACTTGGCAAGGAGAGGACCCCTCCCAATTCCTAAAAGC 792
Query 852 TCACCAGATGATCCCAATTACTCTTTGGTTGATGACTACAGTTTGCTCTATCAGTAAAATCAATGAAACCAGAG 925
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 793 TCACCAGATGATCCCAATTACTCTTTGGTTGATGACTACAGTTTGCTCTATCAG-------------------- 846
Query 926 CTTTTTCCGGC 936
Sbjct 847 ----------- 846