Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000466090
• Subject: NM_023320.2
• Aligned Length: 1234
• Identities: 1086
• Gaps: 17

Alignment

Query    1  ATGATGAAGAAGAACAATTCCGCCAAGCGGGGACCTCAGGATGGAAACCAGCAGCCTGCACCGCCCGAGAAGGT  74
               ||||||||||.|...||||.|||||||||.||||.||||||||||||.|||.||||..|||||||||||||
Sbjct    1  ---ATGAAGAAGAGCGGCTCCGGCAAGCGGGGGCCTCCGGATGGAAACCATCAGTCTGCGGCGCCCGAGAAGGT  71

Query   75  CGGCTGGGTCCGGAAATTCTGCGGGAAAGGGATTTTCAGGGAGATTTGGAAAAACCGCTATGTGGTGCTGAAAG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   72  CGGCTGGGTCCGGAAATTCTGCGGGAAAGGGATTTTCAGGGAGATTTGGAAAAACCGCTATGTGGTGCTGAAAG  145

Query  149  GGGACCAGCTCTACATCTCTGAGAAGGAGGTAAAAGATGAGAAAAATATTCAAGAGGTATTTGACCTGAGTGAC  222
            |.||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||.|.|||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct  146  GCGACCAGCTCTACGTCTCCGAGAAGGAGGTAAAAGATGAGAAAAACAGTCAGGAGGTGTTTGACCTGAGTGAC  219

Query  223  TATGAGAAGTGTGAAGAGCTCCGGAAGTCCAAGAGCAGGAGCAAGAAAAATCATAGCAAGTTTACTCTTGCCCA  296
            |||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||||.
Sbjct  220  TATGAGAAGTGCGAAGAGCTCCGGAAATCCAAGAGCAGGAGCAAGAAAAATCACAGCAAGTTCACCCTGGCCCG  293

Query  297  CTCCAAACAGCCCGGTAACACGGCACCCAACCTGATCTTCCTGGCAGTGAGTCCAGAAGAGAAGGAATCGTGGA  370
            .|.||.||||||.||.|.|||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.||||
Sbjct  294  GTGCAGACAGCCGGGCACCACGGCACCCAACCTCATCTTCCTGGCCGTGAGTCCTGAAGAGAAGGAGTCATGGA  367

Query  371  TCAATGCCCTCAACTCTGCCATCACCCGAGCCAAGAACCGTATCTTGGATGAGGTCACCGTTGAGGAGGACAGC  444
            ||||.|||||.|..||||||||.|||.||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  368  TCAACGCCCTGAGTTCTGCCATTACCAGAGCTAAAAACCGTATCTTGGATGAGGTCACCGTTGAGGAGGACAGC  441

Query  445  TATCTTGCCCATCCCACTCGAGACAGGGCAAAAATCCAGCACTCCCGCCGCCCCCCAACAAGGGGACACCTAAT  518
            |||||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||..||||||||||.||
Sbjct  442  TATCTTGCCCACCCTACTCGAGACAGAGCAAAAATCCAACACTCCCGCCGTCCTCCAACCCGGGGACACCTCAT  515

Query  519  GGCTGTGGCTTCCACCTCTACCTCGGATGGGATGCTGACCTTGGACTTGATCCAAGAGGAAGACCCTTCCCCTG  592
            ||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||.|||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  516  GGCTGTGGCTTCGACCTCTACCTCAGATGGGATGCTAACATTAGACCTGATCCAAGAGGAAGACCCTTCCCCTG  589

Query  593  AGGAACCAACCTCTTGTGCTGAGAGCTTTCGGGTTGACCTGGACAAGTCTGTGGCCCAGCTGGCAGGGAGCCGG  666
            ||||.|||.|||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.
Sbjct  590  AGGAGCCAGCCTCTTGTGCTGAGAGCTTCCGGGTCGATCTGGACAAGTCTGTGGCCCAGCTGGCTGGCAGTCGA  663

Query  667  CGGAGAGCGGACTCAGACCGCATCCAGCCCTC--CGCAGACCGGGCAAGCAGTCTCTCCCGACCTTGGGAAAAA  738
            ||||||||||||||||||.|.|||||||||||  |||||  |||||||||||.||.||.||.||||||||||||
Sbjct  664  CGGAGAGCGGACTCAGACAGGATCCAGCCCTCTTCGCAG--CGGGCAAGCAGCCTTTCTCGGCCTTGGGAAAAA  735

Query  739  ACAGACAAAGGGGCCACCTACACCCCCCAGGCACCCAAGAAGTTGACGCCC----ACAGAGAAAGGCCGCTGCG  808
            .|||||||.||.|||.||||||||||.||.||||..||||||||    |||    ||||||||..||||.||.|
Sbjct  736  CCAGACAAGGGAGCCCCCTACACCCCACAAGCACTGAAGAAGTT----CCCCAGTACAGAGAAGAGCCGATGTG  805

Query  809  CCTCCCTGGAGGAGATCCTATCTCAGCGGGATGCTGCCTCTGCCCGCACCCTCCAGCTGCGGGCTGAGGAACCC  882
            ||||||||||||||||||||||.|||.||||..|||||.|.||||||.||||.||.||.|..|||||||||.||
Sbjct  806  CCTCCCTGGAGGAGATCCTATCCCAGAGGGACACTGCCCCAGCCCGCCCCCTTCACCTTCAAGCTGAGGAATCC  879

Query  883  CCAACCCCTG-CCCTCCCCAACCCGGGGCAGCTGTCCCGGATCCAGGACCTGGTAGCAAGGAAACTGGAGGAGA  955
            |.|.|||||| ||||.||| |.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  880  CTACCCCCTGTCCCTGCCC-AGCCAGGGCAGCTGTCCCGGATCCAGGACCTGGTAGCAAGGAAACTGGAGAAGA  952

Query  956  CTCAGGAGCTTCTGGCAGAGGTTCAGGGACTGGGAGATGGGAAGCGAAAGGCCAAGGACCCCCCTCGGTCTCCG  1029
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||.|.||||||.
Sbjct  953  CTCAGGAGCTGCTGGCAGAGGTTCAGGGACTGGGTGACGGCAAGCGGAAGGCCAAGGACCCCCCACAGTCTCCA  1026

Query 1030  CCGGATTCTGAGTCAGAGCAGCTGCTGCTGGAGACGGAACGGCTGCTGGGAGAGGCATCATCGAATTGGAGCCA  1103
            ||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||..||||||||||||||||.||.||.||.||||||||
Sbjct 1027  CCCGACTCGGAGTCGGAGCAGCTGCTGCTGGAGACAGAGAGGCTGCTGGGAGAGGCTTCCTCCAACTGGAGCCA  1100

Query 1104  GGCAAAGAGGGTGCTGCAGGAGGTCAGGGAGCTGAGAGACCTGTACAGACAGATGGACCTGCAGACCCCGGACT  1177
            |||||||||.|||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1101  GGCAAAGAGAGTGCTGCAGGAAGTCCGGGAGCTGAGAGACCTGTACAGGCAGATGGACCTGCAGACCCCGGACT  1174

Query 1178  CCCACCTCAGACAGACCACCCCGCACAGTCAGTACCGGAAGAGCCTGATG  1227
            |||||||||||||||||.|||.|||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1175  CCCACCTCAGACAGACCTCCCAGCACAGTCAATACCGGAAGAGCCTGATG  1224