Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000466090
• Subject: XM_024447478.1
• Aligned Length: 1234
• Identities: 818
• Gaps: 413

Alignment

Query    1  ATGATGAAGAAGAACAATTCCGCCAAGCGGGGACCTCAGGATGGAAACCAGCAGCCTGCACCGCCCGAGAAGGT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CGGCTGGGTCCGGAAATTCTGCGGGAAAGGGATTTTCAGGGAGATTTGGAAAAACCGCTATGTGGTGCTGAAAG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  GGGACCAGCTCTACATCTCTGAGAAGGAGGTAAAAGATGAGAAAAATATTCAAGAGGTATTTGACCTGAGTGAC  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  TATGAGAAGTGTGAAGAGCTCCGGAAGTCCAAGAGCAGGAGCAAGAAAAATCATAGCAAGTTTACTCTTGCCCA  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  CTCCAAACAGCCCGGTAACACGGCACCCAACCTGATCTTCCTGGCAGTGAGTCCAGAAGAGAAGGAATCGTGGA  370
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  371  TCAATGCCCTCAACTCTGCCATCACCCGAGCCAAGA---ACCGTA----TCTTGGATGAGGTCACCGTTGAGGA  437
                                            |.||   ||.|||    |||    |.||||||||||||||||
Sbjct    1  --------------------------------ATGATTCACAGTACATCTCT----TCAGGTCACCGTTGAGGA  38

Query  438  GGACAGCTATCTTGCCCATCCCACTCGAGACAGGGCAAAAATCCAGCACTCCCGCCGCCCCCCAACAAGGGGAC  511
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   39  GGACAGCTATCTTGCCCATCCCACTCGAGACAGGGCAAAAATCCAGCACTCCCGCCGCCCCCCAACAAGGGGAC  112

Query  512  ACCTAATGGCTGTGGCTTCCACCTCTACCTCGGATGGGATGCTGACCTTGGACTTGATCCAAGAGGAAGACCCT  585
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  113  ACCTAATGGCTGTGGCTTCCACCTCTACCTCGGATGGGATGCTGACCTTGGACTTGATCCAAGAGGAAGACCCT  186

Query  586  TCCCCTGAGGAACCAACCTCTTGTGCTGAGAGCTTTCGGGTTGACCTGGACAAGTCTGTGGCCCAGCTGGCAGG  659
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  187  TCCCCTGAGGAACCAACCTCTTGTGCTGAGAGCTTTCGGGTTGACCTGGACAAGTCTGTGGCCCAGCTGGCAGG  260

Query  660  GAGCCGGCGGAGAGCGGACTCAGACCGCATCCAGCCCTCCGCAGACCGGGCAAGCAGTCTCTCCCGACCTTGGG  733
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  261  GAGCCGGCGGAGAGCGGACTCAGACCGCATCCAGCCCTCCGCAGACCGGGCAAGCAGTCTCTCCCGACCTTGGG  334

Query  734  AAAAAACAGACAAAGGGGCCACCTACACCCCCCAGGCACCCAAGAAGTTGACGCCCACAGAGAAAGGCCGCTGC  807
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  335  AAAAAACAGACAAAGGGGCCACCTACACCCCCCAGGCACCCAAGAAGTTGACGCCCACAGAGAAAGGCCGCTGC  408

Query  808  GCCTCCCTGGAGGAGATCCTATCTCAGCGGGATGCTGCCTCTGCCCGCACCCTCCAGCTGCGGGCTGAGGAACC  881
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  409  GCCTCCCTGGAGGAGATCCTATCTCAGCGGGATGCTGCCTCTGCCCGCACCCTCCAGCTGCGGGCTGAGGAACC  482

Query  882  CCCAACCCCTGCCCTCCCCAACCCGGGGCAGCTGTCCCGGATCCAGGACCTGGTAGCAAGGAAACTGGAGGAGA  955
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  483  CCCAACCCCTGCCCTCCCCAACCCGGGGCAGCTGTCCCGGATCCAGGACCTGGTAGCAAGGAAACTGGAGGAGA  556

Query  956  CTCAGGAGCTTCTGGCAGAGGTTCAGGGACTGGGAGATGGGAAGCGAAAGGCCAAGGACCCCCCTCGGTCTCCG  1029
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  557  CTCAGGAGCTTCTGGCAGAGGTTCAGGGACTGGGAGATGGGAAGCGAAAGGCCAAGGACCCCCCTCGGTCTCCG  630

Query 1030  CCGGATTCTGAGTCAGAGCAGCTGCTGCTGGAGACGGAACGGCTGCTGGGAGAGGCATCATCGAATTGGAGCCA  1103
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  631  CCGGATTCTGAGTCAGAGCAGCTGCTGCTGGAGACGGAACGGCTGCTGGGAGAGGCATCATCGAATTGGAGCCA  704

Query 1104  GGCAAAGAGGGTGCTGCAGGAGGTCAGGGAGCTGAGAGACCTGTACAGACAGATGGACCTGCAGACCCCGGACT  1177
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  705  GGCAAAGAGGGTGCTGCAGGAGGTCAGGGAGCTGAGAGACCTGTACAGACAGATGGACCTGCAGACCCCGGACT  778

Query 1178  CCCACCTCAGACAGACCACCCCGCACAGTCAGTACCGGAAGAGCCTGATG  1227
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  779  CCCACCTCAGACAGACCACCCCGCACAGTCAGTACCGGAAGAGCCTGATG  828