Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
TRCN0000466165
Subject:
NM_001351020.2
Aligned Length:
1788
Identities:
1466
Gaps:
321

Alignment

Query    1  ATGGCGGCTCACCTGTCCTACGGCCGAGTGAACCTAAACGTGTTGCGCGAGGCGGTGCGTCGCGAGCTGCGCGA  74
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGGCTCATCTGTCCTACGGCCGAGTGAACCTAAACGTGTTGCGCGAGGCGGTGCGTCGCGAGCTGCGCGA  74

Query   75  GTTCCTGGACAAGTGCGCAGGAAGCAAGGCAATAGTTTGGGATGAATACCTAACTGGACCCTTTGGCCTGATTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GTTCCTGGACAAGTGCGCAGGAAGCAAGGCAATAGTTTGGGATGAATACCTAACTGGACCCTTTGGCCTGATTG  148

Query  149  CACAGTATTCACTATTGAAGGAACATGAAGTGGAAAAAATGTTCACACTTAAAGGAAATCGTTTGCCGGCAGCT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CACAGTATTCACTATTGAAGGAACATGAAGTGGAAAAAATGTTCACACTTAAAGGAAATCGTTTGCCGGCAGCT  222

Query  223  GATGTGAAGAATATAATTTTTTTTGTCAGACCCAGGCTAGAGTTGATGGATATAATCGCTGAAAACGTGCTCAG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GATGTGAAGAATATAATTTTTTTTGTCAGACCCAGGCTAGAGTTGATGGATATAATCGCTGAAAACGTGCTCAG  296

Query  297  TGAAGATAGACGAGGCCCAACGAGAGATTTTCATATTCTGTTTGTGCCACGCCGTAGCCTGTTGTGCGAACAGC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGAAGATAGACGAGGCCCAACGAGAGATTTTCATATTCTGTTTGTGCCACGCCGTAGCCTGTTGTGCGAACAGC  370

Query  371  GGTTGAAGGATCTGGGTGTCTTGGGATCCTTTATTCACAGGGAGGAGTACAGCTTAGATCTCATTCCATTCGAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGTTGAAGGATCTGGGTGTCTTGGGATCCTTTATTCACAGGGAGGAGTACAGCTTAGATCTCATTCCATTCGAT  444

Query  445  GGGGATCTCTTATCCATGGAATCAGAGGGTGCATTCAAAGAGTGCTACCTGGAGGGTGACCAGACGAGCCTGTA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGGGATCTCTTATCCATGGAATCAGAGGGTGCATTCAAAGAGTGCTACCTGGAGGGTGACCAGACGAGCCTGTA  518

Query  519  CCACGCAGCCAAGGGGCTGATGACCCTGCAAGCTCTGTATGGAACGATCCCCCAGATCTTTGGGAAAGGAGAAT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CCACGCAGCCAAGGGGCTGATGACCCTGCAAGCTCTGTATGGAACGATCCCCCAGATCTTTGGGAAAGGAGAAT  592

Query  593  GCGCTCGGCAAGTGGCCAATATGATGATCAGGATGAAGAGAGAGTTTACAGGAAGCCAGAATTCAATATTTCCT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GCGCTCGGCAAGTGGCCAATATGATGATCAGGATGAAGAGAGAGTTTACAGGAAGCCAGAATTCAATATTTCCT  666

Query  667  GTTTTTGATAATCTCTTGTTGCTTGATCGGAATGTGGATTTATTAACACCTCTTGCCACTCAGCTGACATATGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GTTTTTGATAATCTCTTGTTGCTTGATCGGAATGTGGATTTATTAACACCTCTTGCCACTCAGCTGACATATGA  740

Query  741  AGGACTCATTGATGAAATTTATGGCATTCAGAACAGTTATGTGAAATTACCTCCAGAGAAATTTGCACCTAAGA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||                                        
Sbjct  741  AGGACTCATTGATGAAATTTATGGCATTCAGAAC----------------------------------------  774

Query  815  AACAGGGCGATGGTGGTAAGGACCTCCCCACGGAAGCAAAGAAGCTGCAGCTGAATTCTGCAGAGGAGCTCTAT  888
                                                                                      
Sbjct  775  --------------------------------------------------------------------------  774

Query  889  GCTGAGATCCGAGATAAGAACTTCAACGCAGTTGGCTCTGTGCTCAGCAAGAAAGCAAAGATCATCTCTGCAGC  962
                                                                                      
Sbjct  775  --------------------------------------------------------------------------  774

Query  963  ATTCGAGGAAAGACACAATGCTAAGACCGTGGGGGAGATCAAGCAGTTTGTTTCCCAGTTGCCCCACATGCAGG  1036
                                                                                      
Sbjct  775  --------------------------------------------------------------------------  774

Query 1037  CAGCAAGGGGCTCGCTTGCAAACCATACCTCAATTGCAGAATTGATCAAAGATGTCACTACTTCTGAAGACTTT  1110
                                                                       |||||||||||||||
Sbjct  775  -----------------------------------------------------------ACTTCTGAAGACTTT  789

Query 1111  TTTGATAAATTAACCGTGGAACAGGAGTTTATGTCTGGAATAGACACTGATAAGGTCAACAATTACATTGAGGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  790  TTTGATAAATTAACCGTGGAACAGGAGTTTATGTCTGGAATAGACACTGATAAGGTCAACAATTACATTGAGGA  863

Query 1185  TTGTATCGCCCAAAAGCACTCGTTGATCAAGGTGTTAAGACTAGTTTGCCTCCAATCCGTGTGTAATAGTGGGC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  864  TTGTATCGCCCAAAAGCACTCGTTGATCAAGGTGTTAAGACTAGTTTGCCTCCAATCCGTGTGTAATAGTGGGC  937

Query 1259  TCAAACAAAAAGTTTTGGATTATTACAAAAGAGAGATTCTCCAGACATACGGCTATGAGCACATATTGACCTTA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  938  TCAAACAAAAAGTTTTGGATTATTACAAAAGAGAGATTCTCCAGACATACGGCTATGAGCACATATTGACCTTA  1011

Query 1333  CACAACCTGGAGAAGGCCGGCCTGCTGAAACCGCAGACGGGGGGCAGAAACAATTACCCAACTATACGGAAAAC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1012  CACAACCTGGAGAAGGCCGGCCTGCTGAAACCGCAGACGGGGGGCAGAAACAATTACCCAACTATACGGAAAAC  1085

Query 1407  ATTACGCCTCTGGATGGATGATGTTAATGAGCAAAACCCCACGGACATATCGTATGTGTACAGTGGGTATGCCC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1086  ATTACGCCTCTGGATGGATGATGTTAATGAGCAAAACCCCACGGACATATCGTATGTGTACAGTGGGTATGCCC  1159

Query 1481  CGCTCAGTGTGCGGCTGGCCCAGCTGCTTTCCCGGCCTGGCTGGCGGAGCATCGAGGAGGTCCTCCGCATCCTC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1160  CGCTCAGTGTGCGGCTGGCCCAGCTGCTTTCCCGGCCTGGCTGGCGGAGCATCGAGGAGGTCCTCCGCATCCTC  1233

Query 1555  CCAGGGCCCCACTTTGAGGAGCGGCAGCCACTGCCCACAGGACTGCAGAAGAAACGTCAACCGGGAGAAAACCG  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1234  CCAGGGCCCCACTTTGAGGAGCGGCAGCCACTGCCCACAGGACTGCAGAAGAAACGTCAACCGGGAGAAAACCG  1307

Query 1629  AGTGACTCTGATATTTTTCCTTGGGGGCGTAACCTTCGCTGAAATTGCTGCCCTGCGATTTCTCTCCCAGTTGG  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1308  AGTGACTCTGATATTTTTCCTTGGGGGCGTAACCTTCGCTGAAATTGCTGCCCTGCGATTTCTCTCCCAGTTGG  1381

Query 1703  AAGATGGAGGTACAGAATATGTCATTGCCACCACTAAACTAATGAATGGAACCAGTTGGATAGAGGCTCTGATG  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1382  AAGATGGAGGTACAGAATATGTCATTGCCACCACTAAACTAATGAATGGAACCAGTTGGATAGAGGCTCTGATG  1455

Query 1777  GAAAAACCTTTC  1788
            ||||||||||||
Sbjct 1456  GAAAAACCTTTC  1467