Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000466194
• Subject: NM_175124.5
• Aligned Length: 1104
• Identities: 972
• Gaps: 6

Alignment

Query    1  ATGGCGTCCGAACTTTGTAAGACGATCTCTGTGGCAAGGCTAGAAAAGCACAAGAATTTGTTCTTAAATTATAG  74
            |||||.||||||.|.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct    1  ATGGCATCCGAAATCTGTAAGACGATCTCTGTGGCCAGGCTTGAAAAGCACAAGAATTTGTTCTTAAATTACAG  74

Query   75  GAATCTGCACCATTTTCCATTGGAGTTACTGAAAGATGAGGGACTGCAGTACTTGGAGAGACTCTATATGAAAA  148
            |||||||||||||||||||.|||||||.|||||.||||||||.||||||.||.|||||||.|||||||||||||
Sbjct   75  GAATCTGCACCATTTTCCACTGGAGTTGCTGAAGGATGAGGGGCTGCAGCACCTGGAGAGGCTCTATATGAAAA  148

Query  149  GGAACTCCCTGACATCCTTGCCAGAAAACCTTGCTCAGAAGCTTCCAAACCTTGTGGAACTATACCTGCACTCA  222
            ||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct  149  GGAACTCCCTCACAACCTTGCCAGAAAACCTTGCTCAGAAGCTTCCAAACCTTGTGGAACTGTACCTTCACTCA  222

Query  223  AATAACATAGTTGTGGTTCCGGAAGCCATTGGGTCTCTTGTAAAACTCCAATGTCTGGATCTTAGTGACAATGC  296
            ||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct  223  AATAACATAGTTGTGGTTCCAGAAGCCATCGGGTCCCTCGTGAAACTCCAGTGTCTGGATCTCAGTGACAATGC  296

Query  297  CTTAGAAATTGTTTGCCCAGAAATTGGTCGTCTGAGAGCTTTACGTCATCTTCGATTAGCTAATAACCAACTGC  370
            ||||||.||.||||||||||||||.|||.||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct  297  CTTAGAGATCGTTTGCCCAGAAATCGGTGGTCTGAGAGCGTTGCGTCATCTTCGATTAGCTAATAACCAGCTAC  370

Query  371  AATTCCTACCTCCAGAGGTTGGCGATTTGAAGGAGCTGCAGACACTAGACATTTCTACCAATCGTTTGCTAACT  444
            |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||.||
Sbjct  371  AGTTCCTACCTCCAGAGGTTGGCGATTTGAAGGAGCTGCAGACACTAGACATTTCTAGCAATCGCTTGCTAGCT  444

Query  445  TTACCCGAGAGGCTTCACATGTGCCTTTCTCTGCAGTACCTCACTGTGGACCGAAATCGTCTATGGTATGTGCC  518
            ||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|.||||||
Sbjct  445  TTACCCGAGAGGCTTCACCTGTGCCTTTCTCTGCAGTACCTCACTGTGGACCGCAATCGGCTATGCTGTGTGCC  518

Query  519  GCGCCATCTCTGCCAGCTGCCCAGCCTCAATGAGCTCTCCATGGCTGGAAACCGTCTTGCATTTTTGCCACTTG  592
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||..|||
Sbjct  519  GCGCCATCTCTGCCAGCTGCCCAGCCTCAATGAGCTCTCCATGGCTGGAAACCATCTTGCATCTTTGCCCATTG  592

Query  593  ATTTAGGTCGATCTCGAGAACTACAGTATGTATACGTGGATAACAACATTCACCTGAAAGGCTTGCCATCTTAT  666
            ||||||||||.||.||||||||.|||||.||.||.||||||||||||||.||.|||||.|||.||||.||.||.
Sbjct  593  ATTTAGGTCGCTCCCGAGAACTGCAGTACGTGTATGTGGATAACAACATCCAGCTGAAGGGCCTGCCCTCATAC  666

Query  667  CTGTACAATAAAGTCATCGGGTGCAGTGGCTGTGGTGCTCCCATTCAAGTTTCCGAGGTGAAGCTGCTTTCCTT  740
            ||.|||||.|||||||||||.||||..||||||||....|||||.|||.|.||.|||||||.||||||..|.||
Sbjct  667  CTCTACAACAAAGTCATCGGCTGCAACGGCTGTGGCATCCCCATCCAATTGTCAGAGGTGAGGCTGCTGACATT  740

Query  741  TTCATCAGGGCAGCGAACCGTTTTCCTCCCAGCTGAGGTGAAGGCCATAGGGACGGAGCATGATCACGTCCTCC  814
            ||||||.|||||||..||.||.|||||||||||.|||||||||.|.|||||.||.|||.|.|||||.|||||.|
Sbjct  741  TTCATCTGGGCAGCTGACAGTCTTCCTCCCAGCAGAGGTGAAGACAATAGGCACAGAGAAGGATCATGTCCTGC  814

Query  815  CTCTGCAGGAATTGGCTATGAGAGGGCTGTATCATACCTACCACAGCTTGCT---GAAAGATTTGAACTTTCTG  885
            |||||||.|||.||.|.|||.|..|.||.||.|..|||||||||.|   |||   |||||||.||||||||.||
Sbjct  815  CTCTGCAAGAACTGACCATGCGGAGTCTCTACCGCACCTACCACGG---GCTTTGGAAAGATCTGAACTTTTTG  885

Query  886  TCTCCAATCTCATTACCCAGAAGTCTCCTAGAGCTGCTGCACTGCCCTCTGGGGCACTGTCATCGGTGTAGTGA  959
            |||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|.|||||||||
Sbjct  886  TCTCCAATCTCATTACCCAGAAGTCTCCTGGAGCTGCTGCACTGCCCCCTGGGGCACTGTCACCTGTGTAGTGA  959

Query  960  GCCTATGTTTACCATCGTCTACCCCAAGCTCTTTCCCTTGAGAGAGACGCCAATGGCAGGGCTGCACCAGTGGA  1033
            |||.|||||||||.|||||||.||.|||.||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||.|||
Sbjct  960  GCCCATGTTTACCTTCGTCTATCCTAAGATCTTCCCCTTGAGAGAGACGCCGATGGCAGGCCTGCACCAGAGGA  1033

Query 1034  AGACAACTGTTAGTTTTGTGGCTTACTGCTGCTCCACCCAGTGTCTGCAGACTTTTGACCTGCTGAGT  1101
            .|||||.|.||.|.||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||||||||.||
Sbjct 1034  GGACAAGTATTGGCTTCGTGGCTTACTGCTGCTCCACCCAGTGTCTGCGGACTTTTAACCTGCTGTGT  1101