Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000466300
- Subject:
- NM_080927.4
- Aligned Length:
- 2367
- Identities:
- 2185
- Gaps:
- 180
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGCGAGCCGGGCGGTGGTGAGAGCCAGGCGCTGCCCGCAGTGTCCCCAAGTCCGGGCCGCGGCCGCCGCCCC 74
Query 1 ----------------------------------------------------------------ATGCCTCTGT 10
||||||||||
Sbjct 75 CGCCTGGGCCGCGCTCCCCCTCTCCCGCTCCCTCCCTCCCTGCTCCAACTCCTCCTCCTTCTCCATGCCTCTGT 148
Query 11 TCCTCCTGCTCTTACTTGTCCTGCTGCTGCTGCTCGAGGACGCTGGAGCCCAGCAAGGTGATGGATGTGGACAC 84
|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 TCCTCCTGCTCTTACTTGTCCTGCTCCTGCTGCTCGAGGACGCTGGAGCCCAGCAAGGTGATGGATGTGGACAC 222
Query 85 ACTGTACTAGGCCCTGAGAGTGGAACCCTTACATCCATAAACTACCCACAGACCTATCCCAACAGCACTGTTTG 158
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 ACTGTACTAGGCCCTGAGAGTGGAACCCTTACATCCATAAACTACCCACAGACCTATCCCAACAGCACTGTTTG 296
Query 159 TGAATGGGAGATCCGTGTAAAGATGGGAGAGAGAGTTCGCATCAAATTTGGTGACTTTGACATTGAAGATTCTG 232
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TGAATGGGAGATCCGTGTAAAGATGGGAGAGAGAGTTCGCATCAAATTTGGTGACTTTGACATTGAAGATTCTG 370
Query 233 ATTCTTGTCACTTTAATTACTTGAGAATTTATAATGGAATTGGAGTCAGCAGAACTGAAATAGGCAAATACTGT 306
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ATTCTTGTCACTTTAATTACTTGAGAATTTATAATGGAATTGGAGTCAGCAGAACTGAAATAGGCAAATACTGT 444
Query 307 GGTCTGGGGTTGCAAATGAACCATTCAATTGAATCAAAAGGCAATGAAATCACATTGCTGTTCATGAGTGGAAT 380
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GGTCTGGGGTTGCAAATGAACCATTCAATTGAATCAAAAGGCAATGAAATCACATTGCTGTTCATGAGTGGAAT 518
Query 381 CCATGTTTCTGGACGCGGATTTTTGGCCTCATACTCTGTTATAGATAAACAAGATCTAATTACTTGTTTGGACA 454
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CCATGTTTCTGGACGCGGATTTTTGGCCTCATACTCTGTTATAGATAAACAAGATCTAATTACTTGTTTGGACA 592
Query 455 CTGCATCCAATTTTTTGGAACCTGAGTTCAGTAAGTACTGCCCAGCTGGTTGTCTGCTTCCTTTTGCTGAGATA 528
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CTGCATCCAATTTTTTGGAACCTGAGTTCAGTAAGTACTGCCCAGCTGGTTGTCTGCTTCCTTTTGCTGAGATA 666
Query 529 TCTGGAACAATTCCTCATGGATATAGAGATTCCTCGCCATTGTGCATGGCTGGTGTGCATGCAGGAGTAGTGTC 602
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TCTGGAACAATTCCTCATGGATATAGAGATTCCTCGCCATTGTGCATGGCTGGTGTGCATGCAGGAGTAGTGTC 740
Query 603 AAACACGTTGGGCGGCCAAATCAGTGTTGTAATTAGTAAAGGTATCCCCTATTATGAAAGTTCTTTGGCTAACA 676
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AAACACGTTGGGCGGCCAAATCAGTGTTGTAATTAGTAAAGGTATCCCCTATTATGAAAGTTCTTTGGCTAACA 814
Query 677 ACGTCACATCTGTGGTGGGACACTTATCTACAAGTCTTTTTACATTTAAGACAAGTGGATGTTATGGAACACTG 750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 ACGTCACATCTGTGGTGGGACACTTATCTACAAGTCTTTTTACATTTAAGACAAGTGGATGTTATGGAACACTG 888
Query 751 GGGATGGAGTCTGGTGTGATCGCGGATCCTCAAATAACAGCATCATCTGTGCTGGAGTGGACTGACCACACAGG 824
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GGGATGGAGTCTGGTGTGATCGCGGATCCTCAAATAACAGCATCATCTGTGCTGGAGTGGACTGACCACACAGG 962
Query 825 GCAAGAGAACAGTTGGAAACCCAAAAAAGCCAGGCTGAAAAAACCTGGACCGCCTTGGGCTGCTTTTGCCACTG 898
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GCAAGAGAACAGTTGGAAACCCAAAAAAGCCAGGCTGAAAAAACCTGGACCGCCTTGGGCTGCTTTTGCCACTG 1036
Query 899 ATGAATACCAGTGGTTACAAATAGATTTGAATAAGGAAAAGAAAATAACAGGCATTATAACCACTGGATCCACC 972
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 ATGAATACCAGTGGTTACAAATAGATTTGAATAAGGAAAAGAAAATAACAGGCATTATAACCACTGGATCCACC 1110
Query 973 ATGGTGGAGCACAATTACTATGTGTCTGCCTACAGAATCCTGTACAGTGATGATGGGCAGAAATGGACTGTGTA 1046
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 ATGGTGGAGCACAATTACTATGTGTCTGCCTACAGAATCCTGTACAGTGATGATGGGCAGAAATGGACTGTGTA 1184
Query 1047 CAGAGAGCCTGGTGTGGAGCAAGATAAGATATTTCAAGGAAACAAAGATTATCACCAGGATGTGCGTAATAACT 1120
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CAGAGAGCCTGGTGTGGAGCAAGATAAGATATTTCAAGGAAACAAAGATTATCACCAGGATGTGCGTAATAACT 1258
Query 1121 TTTTGCCACCAATTATTGCACGTTTTATTAGAGTGAATCCTACCCAATGGCAGCAGAAAATTGCCATGAAAATG 1194
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TTTTGCCACCAATTATTGCACGTTTTATTAGAGTGAATCCTACCCAATGGCAGCAGAAAATTGCCATGAAAATG 1332
Query 1195 GAGCTGCTCGGATGTCAGTTTATTCCTAAAGGTCGTCCTCCAAAACTTACTCAACCTCCACCTCCTCGGAACAG 1268
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GAGCTGCTCGGATGTCAGTTTATTCCTAAAGGTCGTCCTCCAAAACTTACTCAACCTCCACCTCCTCGGAACAG 1406
Query 1269 CAATGACCTCAAAAACACTACAGCCCCTCCAAAAATAGCCAAAGGTCGTGCCCCAAAATTTACGCAACCACTAC 1342
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 CAATGACCTCAAAAACACTACAGCCCCTCCAAAAATAGCCAAAGGTCGTGCCCCAAAATTTACGCAACCACTAC 1480
Query 1343 AACCTCGCAGTAGCAATGAATTTCCTGCACAGACAGAACAAACAACTGCCAGTCCTGATATCAGAAATACTACC 1416
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 AACCTCGCAGTAGCAATGAATTTCCTGCACAGACAGAACAAACAACTGCCAGTCCTGATATCAGAAATACTACC 1554
Query 1417 GTAACTCCAAATGTAACCAAAGATGTAGCGCTGGCTGCAGTTCTTGTCCCTGTGCTGGTCATGGTCCTCACTAC 1490
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 GTAACTCCAAATGTAACCAAAGATGTAGCGCTGGCTGCAGTTCTTGTCCCTGTGCTGGTCATGGTCCTCACTAC 1628
Query 1491 TCTCATTCTCATATTAGTGTGTGCTTGGCACTGGAGAAACAGAAAGAAAAAAACTGAAGGCACCTATGACTTAC 1564
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 TCTCATTCTCATATTAGTGTGTGCTTGGCACTGGAGAAACAGAAAGAAAAAAACTGAAGGCACCTATGACTTAC 1702
Query 1565 CTTACTGGGACCGGGCAGGTTTTTATTTAATGGTCTCTTTGGCTTGCCGTCACAATGAAGGTTGGTGGAAAGGA 1638
|||||||||||||||| ||||||||||||||||
Sbjct 1703 CTTACTGGGACCGGGC------------------------------------------AGGTTGGTGGAAAGGA 1734
Query 1639 ATGAAGCAGTTTCTTCCTGCAAAAGCAGTGGACCATGAGGAAACCCCAGTTCGCTATAGCAGCAGTGAAGTTAA 1712
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1735 ATGAAGCAGTTTCTTCCTGCAAAAGCAGTGGACCATGAGGAAACCCCAGTTCGCTATAGCAGCAGCGAAGTTAA 1808
Query 1713 TCACCTGAGTCCAAGAGAAGTCACCACAGTGCTGCAGGCTGACTCTGCAGAGTATGCTCAGCCACTGGTAGGAG 1786
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1809 TCACCTGAGTCCAAGAGAAGTCACCACAGTGCTGCAGGCTGACTCTGCAGAGTATGCTCAGCCACTGGTAGGAG 1882
Query 1787 GAATTGTTGGTACACTTCATCAAAGATCTACCTTTAAACCAGAAGAAGGAAAAGAAGCAGGCTATGCAGACCTA 1860
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1883 GAATTGTTGGTACACTTCATCAAAGATCTACCTTTAAACCAGAAGAAGGAAAAGAAGCAGGCTATGCAGACCTA 1956
Query 1861 GATCCTTACAACTCACCAGGGCAGGAAGTTTATCATGCCTATGCTGAACCACTCCCAATTACGGGGCCTGAGTA 1934
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1957 GATCCTTACAACTCACCAGGGCAGGAAGTTTATCATGCCTATGCTGAACCACTCCCAATTACGGGGCCTGAGTA 2030
Query 1935 TGCAACCCCAATCATCATGGACATGTCAGGGCACCCCACAACTTCAGTTGGTCAGCCCTCCACATCCACTTTCA 2008
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2031 TGCAACCCCAATCATCATGGACATGTCAGGGCACCCCACAACTTCAGTTGGTCAGCCCTCCACATCCACTTTCA 2104
Query 2009 AGGCTACGGGGAACCAACCTCCCCCACTAGTGGGAACTTACAATACACTTCTCTCCAGGACTGACAGCTGCTCC 2082
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2105 AGGCTACGGGGAACCAACCTCCCCCACTAGTGGGAACTTACAATACACTTCTCTCCAGGACTGACAGCTGCTCC 2178
Query 2083 TCAGCCCAGGCCCAGTATGATACCCCGAAAGCTGGGAAGCCAGGTCTACCTGCCCCAGACGAATTGGTGTACCA 2156
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2179 TCAGCCCAGGCCCAGTATGATACCCCGAAAGCTGGGAAGCCAGGTCTACCTGCCCCAGACGAATTGGTGTACCA 2252
Query 2157 GGTGCCACAGAGCACACAAGAAGTATCAGGAGCAGGAAGGGATGGGGAATGTGATGTTTTTAAAGAAATCCTT 2229
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2253 GGTGCCACAGAGCACACAAGAAGTATCAGGAGCAGGAAGGGATGGGGAATGTGATGTTTTTAAAGAAATCCTT 2325