Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000466541
- Subject:
- XM_011238603.2
- Aligned Length:
- 2609
- Identities:
- 2224
- Gaps:
- 34
Alignment
Query 1 ------------------------ATGATGAGCATCAAAGCCTTTACGCTT-GTCTCTGCTGTGGAGCGGGAGC 49
|||||||.||||||.|||||.|| ||| ||||||||.|||||.|||||.|
Sbjct 1 ATGATCTCAGATCACCCGGTAGACATGATGAACATCAAGGCCTTCAC-CTTGGTCTCTGCAGTGGAACGGGAAC 73
Query 50 TGCTGATGGGCGACAAGGAGCGCGTCAACATAGAGTGCGTGGAGTGCTGCGGCAGGGACCTCTACGTGGGCACC 123
|||||||||||||||..||.|.|.|||.|||.|||||.|||||||||||.||||||.|.||.||.||.||||||
Sbjct 74 TGCTGATGGGCGACAGAGACCACATCAGCATTGAGTGTGTGGAGTGCTGTGGCAGGAATCTTTATGTCGGCACC 147
Query 124 AACGACTGCTTCGTCTACCACTTCCTGTTGGAGGAG-AGGCCAGTGCCTGCTGGGCCAGCCACGTTCACTGCCA 196
||.|||||||||.|.|||||.||||||.|||||||| |||||| |||||.|.|||.||||.||.|||..|||||
Sbjct 148 AATGACTGCTTCATTTACCATTTCCTGCTGGAGGAGAAGGCCA-TGCCTACAGGGACAGCTACATTCGTTGCCA 220
Query 197 CCAAACAGCTGCAGAGACACTTGGGCTTCAAGAAGCCCGTGAACGAGCTGCGCGCGGCCTCAGCACTCAACAGG 270
||||||||||.||.||||||.|||||||||||||.||.||||||||||||.|.|||||||||||.|||||.|||
Sbjct 221 CCAAACAGCTACACAGACACCTGGGCTTCAAGAAACCTGTGAACGAGCTGTGTGCGGCCTCAGCTCTCAATAGG 294
Query 271 CTGCTGGTGCTGTGTGACAACTCCATCAGCCTGGTCAACATGCTGAACCTCGAGCCAGTGCCTTCGGGGGCCCG 344
|||||||||||.|||||||||||.||.|.||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||.||.|||||
Sbjct 295 CTGCTGGTGCTCTGTGACAACTCTATAACCCTGGTTAACATGCTGAACCTGGAGCCAGTCCCCTCAGGAGCCCG 368
Query 345 CATCAAGGGGGCAGCCACGTTTGCACTGAACGAGAACCCTGTGAGTGGGGACCCCTTCTGTGTAGAAGTTTGCA 418
||||||.|||||..|.||.||||||.|||||||||.|||.||||.|||||||||.|||||.||.||.||.||||
Sbjct 369 CATCAAAGGGGCTACAACATTTGCAGTGAACGAGAGCCCCGTGAATGGGGACCCGTTCTGCGTGGAGGTGTGCA 442
Query 419 TCATCTCTGTCAAACGCAGAACCATCCAGATGTTTCTGGTGTACGAGGACCGGGTGCAGATCGTCAAGGAGGTG 492
||||.||.||.||.|||||.||..||||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||
Sbjct 443 TCATTTCCGTGAAGCGCAGGACTGTCCAAATGTTTCTGGTGTATGAGGACCGAGTGCAGATTGTCAAGGAAGTG 516
Query 493 TCGACTGCCGAACAGCCCCTCGCTGTGGCTGTGGACGGCCACTTCCTGTGTCTGGCTCTGACCACTCAGTACAT 566
||.||..|.||.|||||.||.||||||||||||||.|||.|.|||.||||.|||||..|||||||.||.|||||
Sbjct 517 TCCACCCCAGAGCAGCCTCTTGCTGTGGCTGTGGATGGCTATTTCTTGTGCCTGGCCTTGACCACACAATACAT 590
Query 567 CATCCACAATTACAGCACAGGCGTCTCCCAGGACCTTTTTCCCTACTGCAGTGAGGAGAGGCCGCCGATCGTCA 640
|||||..||.||||||||||||.|.|||||||||||.||||||||||||||||||||||.|||.||.|||||||
Sbjct 591 CATCCTGAACTACAGCACAGGCCTTTCCCAGGACCTGTTTCCCTACTGCAGTGAGGAGAAGCCACCCATCGTCA 664
Query 641 AGAGGATAGGGAGACAGGAGTTCCTGCTGGCGGGCCCCGGAGGGCTGGGCATGTTTGCCACAGTCGCAGGGATA 714
||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||..||||||||||||||||.||.||.|||||.
Sbjct 665 AGAGGATAGGCAGACAGGAGTTCCTGCTGGCTGGCCCAGGAGGCTTGGGCATGTTTGCCACCGTGGCCGGGATT 738
Query 715 TCCCAGCGTGCCCCCGTGCACTGGTCGGAGAATGTGATTGGGGCGGCTGTGTCCTTTCCATACGTCATAGCGCT 788
||||||||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||.|.|||.||.||.|||||||||||
Sbjct 739 TCCCAGCGTGCCCCTGTGCACTGGTCAGAAAATGTGATTGGGGCAGCTGTTTGCTTCCCCTATGTCATAGCGCT 812
Query 789 CGATGACGAATTCATCACAGTCCACAGCATGTTGGATCAGCAACAGAAGCAGACGCTGCCCTTTAAGGAGGGCC 862
|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 813 CGATGACGAATTCATCACAGTTCACAGCATGTTGGATCAGCAGCAGAAACAGACCCTGCCCTTTAAGGAGGGGC 886
Query 863 ATATCCTACAGGACTTTGAAGGAAGAGTGATCGTTGCCACAAGTAAAGGAGTTTACATCTTGGTTCCATTACCT 936
|.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 887 ACATCCTGCAGGACTTTGAAGGAAGAGTGATTGTTGCCACAAGTAAAGGAGTTTACATCTTGGTTCCATTACCT 960
Query 937 TTGGAAAAACAAATACAGGATCTTCTAGCAAGCCGCAGAGTAGAAGAGGCTTTGGTTTTAGCAAAAGGAGCCCG 1010
.||||||||||||||||||||||..||||||.|||.|||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 961 CTGGAAAAACAAATACAGGATCTGTTAGCAAACCGGAGAGTGGAGGAGGCTTTGGTCTTGGCAAAAGGAGCCCG 1034
Query 1011 GAGGAACATTCCAAAGGAAAAATTTCAGGTAATGTACAGAAGGATTCTGCAGCAGGCGGGATTTATACAGTTTG 1084
||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct 1035 GAGGAACATTCCAAAGGAGAAATTTCAGGTAATGTACAGGAGGATTCTGCAGCAGGCAGGCTTTATACAGTTTG 1108
Query 1085 CACAACTTCAGTTCCTGGAAGCTAAAGAGCTCTTCAGAAGCGGCCAGCTTGATGTCCGGGAGCTGATCTCTCTC 1158
|||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1109 CACAACTCCAGTTCCTGGAAGCCAAAGAGCTCTTCAGAAGCAGCCAGCTGGATGTCCGGGAGCTGATCTCTCTC 1182
Query 1159 TACCCCTTCCTGTTGCCCACCTCCTCCTCCTTCACCCGGTCCCACCCTCCTCTTCATGAGTACGCAGACCTGAA 1232
||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1183 TACCCCTTTCTGCTGCCCACCTCCTCCTCCTTCACCCGCTCTCACCCTCCTCTTCATGAGTACGCAGACCTGAA 1256
Query 1233 CCAGCTGACCCAGGGGGACCAGGAGAAGATGGCCAAGTGCAAACGCTTCCTCATGAGCTACCTGAACGAGGTCC 1306
||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||..|||
Sbjct 1257 CCAGCTGACCCAAGGTGACCAGGAGAAGATGGCCAAGTGCAAGCGCTTCCTCATGAGCTACCTGAATGAAATCC 1330
Query 1307 GCAGCACAGAGGTAGCAAATGGCTACAAGGAGGACATCGACACAGCCTTGCTCAAACTGTATGCAGAGGCTGAC 1380
||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1331 GCAGCACAGAGGTAGCTAATGGCTACAAGGAAGACATCGACACGGCCTTGCTCAAGCTGTATGCAGAGGCTGAC 1404
Query 1381 CACGACAGCCTGCTGGACCTCCTGGTCACTGAGAACTTCTGTCTT-CTGACGGACAGTGCTGCCTGGCTAGAGA 1453
|||||||||||.|||||||||.|||||||||||||.||||| ||| |||||.|||||||||||||||||.||||
Sbjct 1405 CACGACAGCCTCCTGGACCTCTTGGTCACTGAGAATTTCTG-CTTGCTGACAGACAGTGCTGCCTGGCTGGAGA 1477
Query 1454 AGCACAAAAAGTATTTTGCACTTGGACTGCTCTATCATTATAATAACCAAGATGCTGCTGCAGTTCAGTTGTGG 1527
|||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.||.||.||||||||..||||.||||||||||||
Sbjct 1478 AGCACAAAAAGTACTTTGCACTGGGGCTGCTCTATCATTACAACAAACAAGATGCCTCTGCGGTTCAGTTGTGG 1551
Query 1528 GTGAACATTGTGAATGGCGATGTCCAGGACTCCACACGCTCAGACCTGTATGAATACATCGTGGATTTTCTTAC 1601
|||||||||||||||||.||..||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1552 GTGAACATTGTGAATGGGGACATCCAGGACTCTACACGCTCGGACCTGTATGAATACATCGTTGATTTCCTTAC 1625
Query 1602 CTACTGCTTAGACGAGGAACTAGTGTGGGCCTATGCTGATTGGGTCCTGCAGAAAAGTGAAGAGGTCGGAGTTC 1675
|||||||.|||||.|.||.||.||||||.||.|||||||.|||.|.||||||||||||||.|||.|.|||||||
Sbjct 1626 CTACTGCCTAGACCAAGAGCTGGTGTGGACCCATGCTGACTGGCTGCTGCAGAAAAGTGAGGAGATTGGAGTTC 1699
Query 1676 AGGTTTTCACCAAGAGACCTTTGGATGAACAGCAGAAGAACAGTTTTAATCCAGACGACATTATCAATTGCCTT 1749
|..||||||||||||||||||||||.||.||||||.|||..|||||||||||||||.|||||||.|.||.||||
Sbjct 1700 AAATTTTCACCAAGAGACCTTTGGACGAGCAGCAGCAGACTAGTTTTAATCCAGACAACATTATTAGTTCCCTT 1773
Query 1750 AAAAAATACCCTAAAGCCCTTGTGAAGTATCTGGAACATCTTGTGATAGACAAGAGACTGCAGAAAGAAGAGTA 1823
||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||.||||.||||||||||||||||
Sbjct 1774 AAGAAATACCCTAAAGCCCTGGTTAAGTATCTGGAACATCTCGTGATCGACAGGAGATTGCAGAAAGAAGAGTA 1847
Query 1824 TCACACCCACTTAGCTGTGCTGTACCTGGAAGAGGTGCTGCTGCAGAGGGCCTCCGCCAGTGGCAAGGGTGCAG 1897
.|||||||||.|.||..|.||.||||||||.||.|||||||.||||||||..|||.|..|.|||||.|.||.||
Sbjct 1848 CCACACCCACCTTGCCATCCTCTACCTGGAGGAAGTGCTGCGGCAGAGGGTATCCACTGGGGGCAAAGATGTAG 1921
Query 1898 AGGCCACCGAGACGCAGGCCAAGCTGCGGCGGCTGCTCCAGAAATCTGATTTATACCGAGTCCACTTTCTTCTC 1971
|.|||||.|||||.||||||||.||.|||.|.||.||||||||.|||||.||.|||||.||||||||..|....
Sbjct 1922 AAGCCACTGAGACACAGGCCAAACTCCGGAGACTACTCCAGAAGTCTGACTTGTACCGCGTCCACTTGTTGAAA 1995
Query 1972 GAGAGGCTGCAGGGAGCTGGCCTGCCCATGGAGAGCGCCATCCTGCACGGGAAGCTGGGCGAGCATGAGAAGGC 2045
||||...|.|||||.||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1996 GAGAAAGTCCAGGGTGCCGGCCTGCCCATGGAAAGTGCCATCCTCCACGGGAAGCTGGGCGAGCACGAGAAGGC 2069
Query 2046 GCTGCATATCCTGGTGCACGAGCTGCAGGACTTTGCAGCGGCCGAGGACTACTGCCTGTGGTGCTCCGAGGGCC 2119
.|||||.|||||||||||||||.||..||||||..|.||.||.||||||||||||||||||.||||||||||.|
Sbjct 2070 CCTGCACATCCTGGTGCACGAGATGGGGGACTTCTCTGCAGCTGAGGACTACTGCCTGTGGAGCTCCGAGGGTC 2143
Query 2120 GAGACCCACCCCACCGCCAGCAACTCTTTCACACGCTGCTGGCCATCTACCTGCATGCTGGCCCCACTGCCCAC 2193
..|...||.||..|||.||||..|||||.||||||.||||.|||||.|||||.|.|||.||||||.|||||||.
Sbjct 2144 AGGGTGCAGCCTGCCGTCAGCGCCTCTTCCACACGTTGCTCGCCATGTACCTCCGTGCAGGCCCCTCTGCCCAG 2217
Query 2194 GAGCTGGCCGTGGCTGCCGTGGACCTGCTGAACCGCCACGCCACCGAATTTGATG-CAGCCCAGGTGCTGCAGA 2266
||.|||.|.|||||.||.||||||.|||||||||..||.||||..|||||||||| || |||||||.||.|||.
Sbjct 2218 GATCTGACAGTGGCCGCTGTGGACTTGCTGAACCATCATGCCAGGGAATTTGATGTCA-CCCAGGTCCTACAGC 2290
Query 2267 TGCTGCCTGACACCTGGTCAGTGCAGCTCCTCTGCCCATTCCTGATGGGGGCCATGAGGGACAGCATCCATGCC 2340
|||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct 2291 TGCTGCCAGACACCTGGTCCGTGCAGCTTCTCTGCCCATTCCTCATGGGGGCTATGAGGGACAGTATCCATGCC 2364
Query 2341 AGGAGGACCATGCAGGTGGCTCTCGGCCTGGCCAGGTCCGAAAACTTAATCTACACCTACGATAAGATGAAGTT 2414
||||||||||..||||||||.||.||||||||||..||.||||||.|.||.||||..||.||||||||||||.|
Sbjct 2365 AGGAGGACCACACAGGTGGCCCTTGGCCTGGCCAAATCAGAAAACCTGATTTACATGTATGATAAGATGAAGCT 2438
Query 2415 GAAAGGAAGCTCAATCCAACTCTCAGACAAAAAGCTTTGTCAGATATGCCAAAATCCCTTT-TGTGAGCCTGTG 2487
|||.||.|...||.|||..||||||||...|.|||||||.|||.|.|||||.|| |||||| .||||.||||||
Sbjct 2439 GAAGGGCAATGCAGTCCGGCTCTCAGAACGAGAGCTTTGCCAGCTCTGCCAGAA-CCCTTTCGGTGAACCTGTG 2511
Query 2488 TTTGTTAGATACCCAAATGGTGGTCTTGTGCACACCCACTGTGCCGCCAGCAGACACACAAACCCCAGCTCATC 2561
|||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||...|||||||||..|
Sbjct 2512 TTTGTCAGATACCCAAATGGAGGGCTTGTGCACACCCACTGTGCCGCCAGCAGACACACGGCCCCCAGCTCGCC 2585
Query 2562 CAGTCCTGGCACTCGGACT 2580
|||.|||||||||||||||
Sbjct 2586 CAGCCCTGGCACTCGGACT 2604