Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000466607
• Subject: XM_017028596.2
• Aligned Length: 1365
• Identities: 1157
• Gaps: 207

Alignment

Query    1  ATGAATCCACAGATCAGAAATCCGATGGAGCGGATGTATCGAGACACATTCTACGACAACTTTGAAAACGAACC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAATCCACAGATCAGAAATCCGATGGAGCGGATGTATCGAGACACATTCTACGACAACTTTGAAAACGAACC  74

Query   75  CATCCTCTATGGTCGGAGCTACACTTGGCTGTGCTATGAAGTGAAAATAAAGAGGGGCCGCTCAAATCTCCTTT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CATCCTCTATGGTCGGAGCTACACTTGGCTGTGCTATGAAGTGAAAATAAAGAGGGGCCGCTCAAATCTCCTTT  148

Query  149  GGGACACAGGGGTCTTTCGAGGCCCGGTACTACCCAAACGTCAGTCGAATCACAGGCAGGAGGTGTATTTCCGG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GGGACACAGGGGTCTTTCGAGGCCCGGTACTACCCAAACGTCAGTCGAATCACAGGCAGGAGGTGTATTTCCGG  222

Query  223  TTTGAGAACCACGCAGAAATGTGCTTCTTATCTTGGTTCTGTGGCAACCGACTGCCTGCTAACAGGCGCTTCCA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TTTGAGAACCACGCAGAAATGTGCTTCTTATCTTGGTTCTGTGGCAACCGACTGCCTGCTAACAGGCGCTTCCA  296

Query  297  GATCACCTGGTTTGTATCATGGAACCCCTGCCTGCCCTGTGTGGTGAAGGTGACCAAATTCTTGGCTGAGCACC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GATCACCTGGTTTGTATCATGGAACCCCTGCCTGCCCTGTGTGGTGAAGGTGACCAAATTCTTGGCTGAGCACC  370

Query  371  CCAATGTCACCCTGACCATCTCTGCCGCCCGCCTCTACTACTACCGGGATAGAGATTGGCGGTGGGTGCTCCTC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCAATGTCACCCTGACCATCTCTGCCGCCCGCCTCTACTACTACCGGGATAGAGATTGGCGGTGGGTGCTCCTC  444

Query  445  AGGCTGCATAAGGCAGGGGCCCGTGTGAAGATCATGGACTATGA------------------------------  488
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                              
Sbjct  445  AGGCTGCATAAGGCAGGGGCCCGTGTGAAGATCATGGACTATGAAGGTGAGAGGTGCAGGGGTCAGGGGAGCAT  518

Query  489  --------------------------------------------------------------------------  488
                                                                                      
Sbjct  519  GACGGGGAGGAACAGCCTCAGAGATGGATGGATCTGCAATGCCATGGCTGGGGGTGTTCCAGGGCAGCCTGCAG  592

Query  489  --------------------------------------------------------------------------  488
                                                                                      
Sbjct  593  GGGTGGGGCTGGCACTGATTGCAACTGACAGCCAGGAGACCAGGCCTGGGAGGGCAGGCCCAGGGTCAGGGGAG  666

Query  489  -----------------------------AGACTTTGCATACTGCTGGGAAAACTTTGTGTGCAATGAAGGTCA  533
                                         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AGCCTGAGTGCTTCCCACCTCTTCATCTCAGACTTTGCATACTGCTGGGAAAACTTTGTGTGCAATGAAGGTCA  740

Query  534  GCCATTCATGCCTTGGTACAAATTCGATGACAATTATGCATCCCTGCACCGCACGCTAAAGGAGATTCTCAGAA  607
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GCCATTCATGCCTTGGTACAAATTCGATGACAATTATGCATCCCTGCACCGCACGCTAAAGGAGATTCTCAGAA  814

Query  608  ACCCGATGGAGGCAATGTACCCACACATATTCTACTTCCACTTTAAAAACCTACTGAAAGCCTGTGGTCGGAAC  681
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ACCCGATGGAGGCAATGTACCCACACATATTCTACTTCCACTTTAAAAACCTACTGAAAGCCTGTGGTCGGAAC  888

Query  682  GAAAGCTGGCTGTGCTTCACCATGGAAGTTACAAAGCACCACTCAGCTGTCTTCCGGAAGAGGGGCGTCTTCCG  755
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GAAAGCTGGCTGTGCTTCACCATGGAAGTTACAAAGCACCACTCAGCTGTCTTCCGGAAGAGGGGCGTCTTCCG  962

Query  756  AAACCAGGTGGATCCTGAGACCCATTGTCATGCAGAAAGGTGCTTCCTCTCTTGGTTCTGTGACGACATACTGT  829
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AAACCAGGTGGATCCTGAGACCCATTGTCATGCAGAAAGGTGCTTCCTCTCTTGGTTCTGTGACGACATACTGT  1036

Query  830  CTCCTAACACAAACTACGAGGTCACCTGGTACACATCTTGGAGCCCTTGCCCAGAGTGTGCAGGGGAGGTGGCC  903
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CTCCTAACACAAACTACGAGGTCACCTGGTACACATCTTGGAGCCCTTGCCCAGAGTGTGCAGGGGAGGTGGCC  1110

Query  904  GAGTTCCTGGCCAGGCACAGCAACGTGAATCTCACCATCTTCACCGCCCGCCTCTGCTATTTCTGGGATACAGA  977
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1111  GAGTTCCTGGCCAGGCACAGCAACGTGAATCTCACCATCTTCACCGCCCGCCTCTGCTACTTCTGGGATACAGA  1184

Query  978  TTACCAGGAGGGGCTCTGCAGCCTGAGTCAGGAAGGGGCCTCCGTGAAGATCATGGGCTACAAAGATTTTGTAT  1051
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TTACCAGGAGGGGCTCTGCAGCCTGAGTCAGGAAGGGGCCTCCGTGAAGATCATGGGCTACAAAGATTTTGTAT  1258

Query 1052  CTTGTTGGAAAAACTTTGTGTACAGTGATGATGAGCCATTCAAGCCTTGGAAGGGACTACAAACCAACTTTCGA  1125
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CTTGTTGGAAAAACTTTGTGTACAGTGATGATGAGCCATTCAAGCCTTGGAAGGGACTACAAACCAACTTTCGA  1332

Query 1126  CTTCTGAAAAGAAGGCTACGGGAGATTCTCCAG  1158
            |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CTTCTGAAAAGAAGGCTACGGGAGATTCTCCAG  1365