Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000466745
• Subject: XM_017024449.2
• Aligned Length: 1258
• Identities: 803
• Gaps: 437

Alignment

Query    1  ATGAAGTGTAAGCACTGCACGCGCAAGGAATGTAGTAAGAAAACAAAAACTGATGACCAAGAGAATGTGTCAGC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CGATGCACCGAGTCCAGCCCAGGAAAATGGAGAGAAATGTGATACCTCAAAGCACAAAGTGCTGGTAGTGTCTG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TGTGTCCTCAATCTTTGCCTTATTTTGCTGCTAAATTCAACCTCAGTGTAACTGATGCATCCAGAAGACTCTGT  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GGTTTCCTCAAAAGTCTTGGGGTGCACTATGTATTTGATACGACGATAGCTGCGGATTTTAGTATCCTGGAGAG  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  TCAAAAAGAATTCGTGCGTCGCTATCGCCAGCACAGTGAGGAGGAACGCACCCTGCCCATGCTGACCTCTGCCT  370
                                                     |.|..|.||.|||.|||  |.|    |||.||.
Sbjct    1  -----------------------------------------ATGGGCTCAGCCTTCCC--GGT----TCTTCCA  27

Query  371  G-----TC--CTGGCTGGGTCCGATACGCCGAGCGGG---TGC-------TGGGTCG-CCCCATCACTGCCCAC  426
            |     ||  |||||||||               |||   |||       ||||..| ||.||           
Sbjct   28  GGAGGCTCCACTGGCTGGG---------------GGGCTTTGCAGATGTTTGGGAGGACCACA-----------  75

Query  427  CTCTGCACCGCCAAGTCC------CCCCAGCAG---GTCATGG-------GCTCTTTGGTGAAGGATTATTTCG  484
                      ||.|||||      ...||||||   |.|||||       ||    |||||         .|| 
Sbjct   76  ----------CCCAGTCCTGAGGGAGGCAGCAGACAGACATGGATGGAGTGC----TGGTG---------CTC-  125

Query  485  CCAGACAGCAGAACCTGTCTCCAGAGAAGATTTTCCACGTCATTGTGGCCCCTTGTTATGACAAGAAGCTGGAG  558
                      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  126  ----------GAACCTGTCTCCAGAGAAGATTTTCCACGTCATTGTGGCCCCTTGTTATGACAAGAAGCTGGAG  189

Query  559  GCTCTTCAGGAAAGCCTTCCCCCTGCTTTGCATGGCTCCCGGGGCGCTGACTGCGTGTTAACATCAGGTGAAAT  632
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  190  GCTCTTCAGGAAAGCCTTCCCCCTGCTTTGCATGGCTCCCGGGGCGCTGACTGCGTGTTAACATCAGGTGAAAT  263

Query  633  TGCTCAAATAATGGAGCAAGGTGACCTCTCAGTGAGAGATGCTGCCGTCGACACTCTGTTTGGAGACTTGAAGG  706
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  264  TGCTCAAATAATGGAGCAAGGTGACCTCTCAGTGAGAGATGCTGCCGTCGACACTCTGTTTGGAGACTTGAAGG  337

Query  707  AGGACAAAGTGACGCGTCATGATGGAGCCAGCTCAGACGGGCACCTGGCACACATCTTCAGACATGCGGCCAAG  780
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  338  AGGACAAAGTGACGCGTCATGATGGAGCCAGCTCAGACGGGCACCTGGCACACATCTTCAGACATGCGGCCAAG  411

Query  781  GAGCTGTTCAACGAGGATGTGGAGGAGGTCACTTACCGAGCCCTGAGAAACAAAGACTTCCAAGAGGTCACCCT  854
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  412  GAGCTGTTCAACGAGGATGTGGAGGAGGTCACTTACCGAGCCCTGAGAAACAAAGACTTCCAAGAGGTCACCCT  485

Query  855  TGAGAAGAACGGAGAGGTGGTGTTACGCTTTGCTGCAGCCTATGGCTTTCGAAACATCCAGAACATGATCCTGA  928
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  486  TGAGAAGAACGGAGAGGTGGTGTTACGCTTTGCTGCAGCCTATGGCTTTCGAAACATCCAGAACATGATCCTGA  559

Query  929  AGCTTAAGAAGGGCAAGTTCCCATTCCACTTTGTGGAGGTCCTCGCCTGTGCTGGAGGATGCTTAAATGGCAGA  1002
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  560  AGCTTAAGAAGGGCAAGTTCCCATTCCACTTTGTGGAGGTCCTCGCCTGTGCTGGAGGATGCTTAAATGGCAGA  633

Query 1003  GGCCAAGCCCAGACTCCAGACGGACATGCGGATAAGGCCCTGCTGCGGCAGATGGAAGGCATTTACGCTGACAT  1076
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  634  GGCCAAGCCCAGACTCCAGACGGACATGCGGATAAGGCCCTGCTGCGGCAGATGGAAGGCATTTACGCTGACAT  707

Query 1077  CCCTGTGCGGCGTCCGGAGTCCAGTGCACACGTGCAGGAGCTGTACCAGGAGTGGCTGGAGGGGATCAACTCCC  1150
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  708  CCCTGTGCGGCGTCCGGAGTCCAGTGCACACGTGCAGGAGCTGTACCAGGAGTGGCTGGAGGGGATCAACTCCC  781

Query 1151  CCAAGGCCCGAGAGGTGCTGCATACCACGTACCAGAGCCAGGAGCGTGGCACACACAGCCTGGACATCAAGTGG  1224
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  782  CCAAGGCCCGAGAGGTGCTGCATACCACGTACCAGAGCCAGGAGCGTGGCACACACAGCCTGGACATCAAGTGG  855