Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000466913
• Subject: XM_006522155.3
• Aligned Length: 1340
• Identities: 1025
• Gaps: 226

Alignment

Query    1  ATGCTGGCGTCTCAAGGAGTTCTCCTGCATCCTTATGGCGTGCCTATG-ATTGTACCG-------GCAGCTCCT  66
                                                         ||| |||||   |       ||||||   
Sbjct    1  ---------------------------------------------ATGAATTGT---GAAAGAGAGCAGCT---  23

Query   67  TACCTTCCTGGACTGATTCAGGGTAATCAGGAAGCAGCCGCTGCCCCTGACACAATGGCTCAGCCTTACGCTTC  140
                      ||       .|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct   24  ----------GA-------GGGGTAATCAGGAAGCAGCCGCCGCCCCTGACACAATGGCTCAGCCTTATGCCTC  80

Query  141  GGCCCAGTTTGCTCCCCCGCAGAACGGTATCCCCGCGGAATACACGGCCCCTCATCCCCACCCCGCGCCAGAGT  214
            .||.|||||.||.||.||.|||||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||
Sbjct   81  AGCGCAGTTCGCACCACCCCAGAATGGCATCCCTGCAGAATACACGGCCCCTCATCCTCATCCCGCGCCAGAGT  154

Query  215  ACACAGGCCAGACCACGGTTCCCGAGCACACATTAAACCTGTACCCTCCCGCCCAGACGCACTCCGAGCAGAGC  288
            ||||.|||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||.|||||..|.|||||||||||.|||||||| 
Sbjct  155  ACACCGGCCAGACCACTGTCCCTGACCACACATTAAACCTGTATCCTCCTACACAGACGCACTCGGAGCAGAG-  227

Query  289  CCGGCGGACACGAGCGCTCAGACCGTCTCTGGCACCGCCACACAGACAGATGACGCAGCACCGACGGATGGCCA  362
              .||.|||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||
Sbjct  228  --TGCTGACACCAGTGCGCAGACCGTCTCCGGCACCGCCACACAGACAGATGATGCAGCCCCGACCGACGGCCA  299

Query  363  GCCCCAGACACAACCTTCTGAAAACACGGAAAACAAGTCTCAGCCCAAGCGGCTGCATGTCTCCAATATCCCCT  436
            |||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|
Sbjct  300  GCCCCAGACACAACCTTCTGAAAACACAGAAAGCAAGTCCCAGCCCAAGCGGCTGCATGTGTCCAACATCCCTT  373

Query  437  TCAGGTTCCGGGATCCGGACCTCAGACAAATGTTTGGTCAATTTGGTAAAATCTTAGATGTTGAAATTATTTTT  510
            ||.|||||||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  374  TCCGGTTCCGGGATCCAGACCTCCGACAAATGTTTGGTCAATTTGGTAAAATATTAGATGTTGAAATTATTTTT  447

Query  511  AATGAGCGAGGCTCAAAGGGATTTGGTTTCGTAACTTTCGAAAATAGTGCCGATGCGGACAGGGCGAGGGAGAA  584
            ||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  448  AATGAGCGAGGCTCCAAGGGATTTGGTTTCGTAACTTTCGAAAATAGTGCGGATGCGGACAGGGCGAGGGAGAA  521

Query  585  ATTACACGGCACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTAAATAATGCCACAGCACGTGTAATGACAAATAAAA  658
            |||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||.|
Sbjct  522  ATTGCACGGTACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTTAATAATGCGACAGCACGCGTGATGACAAATAAGA  595

Query  659  AGACCGTCAACCCTTATACAAATGGCTGGAAATTGAATCCAGTTGTGGGTGCAGTCTACAGTCCCGAATTCTAT  732
            ||||.||||||||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||.||||||
Sbjct  596  AGACTGTCAACCCCTACACCAATGGCTGGAAATTAAATCCAGTTGTGGGCGCGGTCTACAGCCCCGACTTCTAT  669

Query  733  GCAGGCACGGTCCTGTTGTGCCAGGCCAACCAGGAGGGATCTTCCATGTACAGTGCCCCCAGTTCACTTGTATA  806
            |||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  670  GCAGGCACGGTGCTGTTGTGCCAGGCCAACCAGGAGGGATCTTCCATGTACAGTGGCCCCAGTTCACTTGTATA  743

Query  807  TACTTCTGCAATGCCAGGCTTCCCGTATCCAGCAGCCACCGCCGCGGCCGCCTACCGAGGGGCGCACCTGCGAG  880
            |||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||.||.||.||.||.|||||||||||.|||||.||||
Sbjct  744  TACTTCTGCAATGCCTGGCTTCCCATATCCGGCCGCCACTGCTGCAGCTGCATACCGAGGGGCTCACCTTCGAG  817

Query  881  GCCGCGGTCGCACCGTGTACAACACCTTCAGGGCCGCGGCGCCCCCGCCCCCGATCCCGGCCTACGGCGGAGTA  954
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||
Sbjct  818  GCCGTGGTCGCACCGTGTACAACACCTTCAGGGCTGCAGCGCCCCCGCCCCCAATCCCGGCCTATGGCGGAGTA  891

Query  955  GTGTATCAAGAGCCTGTGTATGGCAATAAATTGCTGCAGGGTGGTTATGCTGCATACCGCTACGCCCAGCCTAC  1028
            ||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||
Sbjct  892  GTGTATCAAGAGCCAGTGTATGGCAATAAATTGCTACAGGGTGGTTATGCTGCGTACCGCTATGCCCAGCCCAC  965

Query 1029  CCCTGCCACTGCCGCTGCCTACAGTGACAGAAATCAGTTCGTCTTCGTTGCAGCAGATGAAATTTCTTGTAACA  1102
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  966  CCCTGCCACTGCCGCTGCCTACAGTGACAGAAATCAGTTCGTCTTCGTTGCAACAGATGAAATTTCTTGTAACA  1039

Query 1103  CCTCTGCAGTTACGGACGAGTTTATGCTGCCGACCCCTACCACCACGCACTTGCTCCAGCCCCCACCTACGGCG  1176
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1040  CCTCTGCAGTTACGGACGAGTTTATGCTGCCGACCCCTACCACCACACACTTGCTCCAGCCCCCACCTACGGCG  1113

Query 1177  TTGGTGCCA-----------------------------------------------------------------  1185
            |||||||||                                                                 
Sbjct 1114  TTGGTGCCATGCCCCAAGGTTCCAGCCCCAGCACAGACTTCAGAGGAGCTAAGCTGCAGACTTCCAGGCCTCTG  1187

Query 1186  --------------------------------------------------------------------------  1185
                                                                                      
Sbjct 1188  CTGTCAGGCAGCTGAGCATCTGCCTGCCTCTCCTCCCCTTTTACAATTCATGTTTAAAGTCATAGTCGCCCAGG  1261

Query 1186  --------  1185
                    
Sbjct 1262  AGAGAAAG  1269