Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000466913
• Subject: XM_006522181.3
• Aligned Length: 1333
• Identities: 1025
• Gaps: 212

Alignment

Query    1  ATGCTGGCGTCTCAAGGAGTTCTCCTGCATCCTTATGGCGTGCCTATGATTGTACCGGCAGC-TCCTTACCTTC  73
                                                         ||||  |..|.|.||.| |..|.|||   
Sbjct    1  ---------------------------------------------ATGA--GATCTGACAACGTGATCACC---  24

Query   74  CTGGACTGATTCAGGGTAATCAGGAAGCAGCCGCTGCCCCTGACACAATGGCTCAGCCTTACGCTTCGGCCCAG  147
                |||       ||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.||.|||
Sbjct   25  ----ACT-------GGTAATCAGGAAGCAGCCGCCGCCCCTGACACAATGGCTCAGCCTTATGCCTCAGCGCAG  87

Query  148  TTTGCTCCCCCGCAGAACGGTATCCCCGCGGAATACACGGCCCCTCATCCCCACCCCGCGCCAGAGTACACAGG  221
            ||.||.||.||.|||||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||
Sbjct   88  TTCGCACCACCCCAGAATGGCATCCCTGCAGAATACACGGCCCCTCATCCTCATCCCGCGCCAGAGTACACCGG  161

Query  222  CCAGACCACGGTTCCCGAGCACACATTAAACCTGTACCCTCCCGCCCAGACGCACTCCGAGCAGAGCCCGGCGG  295
            |||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||.|||||..|.|||||||||||.||||||||   .||.|
Sbjct  162  CCAGACCACTGTCCCTGACCACACATTAAACCTGTATCCTCCTACACAGACGCACTCGGAGCAGAG---TGCTG  232

Query  296  ACACGAGCGCTCAGACCGTCTCTGGCACCGCCACACAGACAGATGACGCAGCACCGACGGATGGCCAGCCCCAG  369
            ||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||||||
Sbjct  233  ACACCAGTGCGCAGACCGTCTCCGGCACCGCCACACAGACAGATGATGCAGCCCCGACCGACGGCCAGCCCCAG  306

Query  370  ACACAACCTTCTGAAAACACGGAAAACAAGTCTCAGCCCAAGCGGCTGCATGTCTCCAATATCCCCTTCAGGTT  443
            ||||||||||||||||||||.||||.||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||.||||
Sbjct  307  ACACAACCTTCTGAAAACACAGAAAGCAAGTCCCAGCCCAAGCGGCTGCATGTGTCCAACATCCCTTTCCGGTT  380

Query  444  CCGGGATCCGGACCTCAGACAAATGTTTGGTCAATTTGGTAAAATCTTAGATGTTGAAATTATTTTTAATGAGC  517
            |||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  381  CCGGGATCCAGACCTCCGACAAATGTTTGGTCAATTTGGTAAAATATTAGATGTTGAAATTATTTTTAATGAGC  454

Query  518  GAGGCTCAAAGGGATTTGGTTTCGTAACTTTCGAAAATAGTGCCGATGCGGACAGGGCGAGGGAGAAATTACAC  591
            |||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  455  GAGGCTCCAAGGGATTTGGTTTCGTAACTTTCGAAAATAGTGCGGATGCGGACAGGGCGAGGGAGAAATTGCAC  528

Query  592  GGCACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTAAATAATGCCACAGCACGTGTAATGACAAATAAAAAGACCGT  665
            ||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||.|||||.||
Sbjct  529  GGTACCGTGGTAGAGGGCCGTAAAATCGAGGTTAATAATGCGACAGCACGCGTGATGACAAATAAGAAGACTGT  602

Query  666  CAACCCTTATACAAATGGCTGGAAATTGAATCCAGTTGTGGGTGCAGTCTACAGTCCCGAATTCTATGCAGGCA  739
            ||||||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct  603  CAACCCCTACACCAATGGCTGGAAATTAAATCCAGTTGTGGGCGCGGTCTACAGCCCCGACTTCTATGCAGGCA  676

Query  740  CGGTCCTGTTGTGCCAGGCCAACCAGGAGGGATCTTCCATGTACAGTGCCCCCAGTTCACTTGTATATACTTCT  813
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  677  CGGTGCTGTTGTGCCAGGCCAACCAGGAGGGATCTTCCATGTACAGTGGCCCCAGTTCACTTGTATATACTTCT  750

Query  814  GCAATGCCAGGCTTCCCGTATCCAGCAGCCACCGCCGCGGCCGCCTACCGAGGGGCGCACCTGCGAGGCCGCGG  887
            ||||||||.||||||||.|||||.||.|||||.||.||.||.||.|||||||||||.|||||.||||||||.||
Sbjct  751  GCAATGCCTGGCTTCCCATATCCGGCCGCCACTGCTGCAGCTGCATACCGAGGGGCTCACCTTCGAGGCCGTGG  824

Query  888  TCGCACCGTGTACAACACCTTCAGGGCCGCGGCGCCCCCGCCCCCGATCCCGGCCTACGGCGGAGTAGTGTATC  961
            |||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  825  TCGCACCGTGTACAACACCTTCAGGGCTGCAGCGCCCCCGCCCCCAATCCCGGCCTATGGCGGAGTAGTGTATC  898

Query  962  AAGAGCCTGTGTATGGCAATAAATTGCTGCAGGGTGGTTATGCTGCATACCGCTACGCCCAGCCTACCCCTGCC  1035
            |||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||
Sbjct  899  AAGAGCCAGTGTATGGCAATAAATTGCTACAGGGTGGTTATGCTGCGTACCGCTATGCCCAGCCCACCCCTGCC  972

Query 1036  ACTGCCGCTGCCTACAGTGACAGAAATCAGTTCGTCTTCGTTGCAGCAGATGAAATTTCTTGTAACACCTCTGC  1109
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  973  ACTGCCGCTGCCTACAGTGACAGAAATCAGTTCGTCTTCGTTGCAACAGATGAAATTTCTTGTAACACCTCTGC  1046

Query 1110  AGTTACGGACGAGTTTATGCTGCCGACCCCTACCACCACGCACTTGCTCCAGCCCCCACCTACGGCGTTGGTGC  1183
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1047  AGTTACGGACGAGTTTATGCTGCCGACCCCTACCACCACACACTTGCTCCAGCCCCCACCTACGGCGTTGGTGC  1120

Query 1184  CA------------------------------------------------------------------------  1185
            ||                                                                        
Sbjct 1121  CATGCCCCAAGGTTCCAGCCCCAGCACAGACTTCAGAGGAGCTAAGCTGCAGACTTCCAGGCCTCTGCTGTCAG  1194

Query 1186  --------------------------------------------------------------------------  1185
                                                                                      
Sbjct 1195  GCAGCTGAGCATCTGCCTGCCTCTCCTCCCCTTTTACAATTCATGTTTAAAGTCATAGTCGCCCAGGAGAGAAA  1268

Query 1186  -  1185
             
Sbjct 1269  G  1269