Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000466919
- Subject:
- NM_133237.3
- Aligned Length:
- 1551
- Identities:
- 1327
- Gaps:
- 18
Alignment
Query 1 ATGTCCTGGCCGCGCCGCCTCCTGCTCAGATACCTGTTCCCGGCCCTCCTGCTTCACGGGCTGGGAGAGGGTTC 74
||||||.|...|||||||||.|||||..|||||||||||||.|||||||||.|.||.||||||||||||||.||
Sbjct 1 ATGTCCCGTGTGCGCCGCCTTCTGCTTGGATACCTGTTCCCAGCCCTCCTGTTGCATGGGCTGGGAGAGGGCTC 74
Query 75 TGCCCTCCTTCATCCAGACAGCAGGTCTCATCCTAGGTCCTTAGAGAAAAGTGCCTGGAGGGCTTTTAAGGAGT 148
||||||||||||||||||||||||.||.||.|||.||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||
Sbjct 75 TGCCCTCCTTCATCCAGACAGCAGATCGCACCCTCGGTCCTTAGAGAAAAGCGCCTGGAGGGCTTTCAAGGAGT 148
Query 149 CACAGTGCCATCACATGCTCAAACATCTCCACAATGGTGCAAGGATCACAGTGCAGATGCCACCTACAATCGAG 222
|||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||..|||||||||||||||||||.||.||.||||||
Sbjct 149 CACAGTGTCATCACATGCTGAAGCATCTCCACAACGGTGCGCGGATCACAGTGCAGATGCCCCCGACCATCGAG 222
Query 223 GGCCACTGGGTCTCCACAGGCTGTGAAGTAAGGTCAGGCCCAGAGTTCATCACAAGGTCCTACAGATTCTACCA 296
|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||.||||||||.|||||.||||||.|
Sbjct 223 GGCCACTGGGTGTCCACAGGCTGTGAAGTAAGGTCGGGTCCGGAGTTCATGACAAGGTCTTACAGGTTCTACAA 296
Query 297 CAATAACACCTTCAAGGCCTACCAATTTTATTATGGCAGCAACCGGTGCACAAATCCCACTTATACTCTCATCA 370
||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.||.||.|||||||
Sbjct 297 CAATAATACCTTCAAGGCCTACCAGTTTTACTATGGCAGCAACCGCTGTACAAACCCCACCTACACCCTCATCA 370
Query 371 TCCGGGGCAAGATCCGCCTCCGCCAGGCCTCCTGGATCATCCGAGGGGGCACGGAAGCCGACTACCAGCTGCAC 444
||||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||
Sbjct 371 TCCGAGGCAAGATCCGGCTTCGCCAGGCGTCCTGGATCATCCGTGGGGGCACCGAAGCTGACTACCAGCTTCAC 444
Query 445 AACGTCCAGGTGATCTGCCACACAGAGGCGGTGGCCGAGAAGCTCGGCCAGCAGGTGAACCGCACATGCCCGGG 518
..||||||.||.|||||||||||||||||.||.||.||..|||||.|||..|.|||||||||.||.|||||.||
Sbjct 445 GGCGTCCAAGTCATCTGCCACACAGAGGCAGTCGCTGAACAGCTCAGCCGACTGGTGAACCGAACTTGCCCAGG 518
Query 519 CTTCCTCGCAGACGGGGGTCCCTGGGTGCAGGACGTGGCCTATGACCTCTGGCGAGAGGAGAACGGCTGT---- 588
||||||.||....||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||..||||||| ||
Sbjct 519 CTTCCTGGCTCCTGGTGGTCCCTGGGTACAGGACGTAGCCTATGACCTGTGGCAGGAGGAGA------GTAACC 586
Query 589 --GAGTGCACCAAGGCCGTGAACTTTGCCATGCATGAACTTCAGCTCATCCGGGTGGAGAAGCAGTACCTTCAC 660
||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||.|..|||
Sbjct 587 ACGAGTGCACCAAGGCTGTGAACTTTGCCATGCACGAGCTGCAGCTCATCCGTGTGGAGAAGCAGTATCCCCAC 660
Query 661 CACAACCTCGACCACCTGGTCGAGGAGCTCTTCCTTGGTGACATTCACACTGATGCCACCCAGAGGATGTTCTA 734
||||.|||.|||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.||.||.|||||||||.|||||||
Sbjct 661 CACAGCCTGGACCACCTGGTGGAGGAGCTCTTCCTGGGCGACATCCACACGGACGCTACCCAGAGGGTGTTCTA 734
Query 735 CCGGCCCTCCAGTTACCAGCCCCCTCTGCAGAATGCCAAGAACCACGACCATGCCTGCATCGCCTGTCGGATCA 808
||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||.|||||||.|||||.|||||.||.||||
Sbjct 735 CCGGCCGTCCAGTTACCAGCCGCCCCTGCAGAATGCCAAGAACCACAACCATGCGTGCATAGCCTGCCGCATCA 808
Query 809 TCTATCGGTCAGACGAGCACCACCCTCCCATCCTGCCCCCAAAGGCAGACCTGACCATCGGCCTGCACGGGGAG 882
|.|..||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||.
Sbjct 809 TTTTCCGGTCAGATGAACACCACCCTCCCATACTGCCCCCCAAGGCTGACCTGACCATTGGCCTCCACGGGGAA 882
Query 883 TGGGTGAGCCAGCGCTGTGAGGTGCGCCCCGAAGTCCTCTTCCTCACCCGCCACTTCATCTTCCATGACAACAA 956
|||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 883 TGGGTGAGCCAGCGCTGCGAGGTACGCCCCGAGGTCCTCTTCCTCACCCGCCACTTCATCTTCCACGACAACAA 956
Query 957 CAACACCTGGGAGGGCCACTACTACCACTACTCAGACCCGGTGTGCAAGCACCCCACCTTCTCCATCTACGCCC 1030
||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.|||.||||||||||.|
Sbjct 957 CAACACCTGGGAAGGGCATTACTACCACTACTCAGACCCTGTCTGCAAGCACCCCACATTCACCATCTACGCTC 1030
Query 1031 GGGGCCGCTACAGCCGCGGCGTCCTCTCGTCCAGGGTCATGGGAGGCACCGAGTTCGTGTTCAAAGTGAATCAC 1104
|.|||||||||||||||||.||.|||||.||.|.|||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1031 GAGGCCGCTACAGCCGCGGTGTGCTCTCATCTAAGGTCATGGGTGGCACGGAGTTTGTGTTCAAAGTGAATCAC 1104
Query 1105 ATGAAGGTCACCCCCATGGATGCGGCCACAGCCTCACTGCTCAACGTCTTCAACGGGAATGAGTGCGGGGCCGA 1178
||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||.||.|||||.|||||||..|||||||||||.|||||.||
Sbjct 1105 ATGAAGGTTACTCCCATGGACGCAGCCACAGCCTCCCTCCTCAATGTCTTCAGTGGGAATGAGTGTGGGGCTGA 1178
Query 1179 GGGCTCCTGGCAGGTGGGCATCCAGCAGGATGTGACCCACACCAATGGCTGCGTGGCCCTGGGCATCAAACTAC 1252
||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1179 GGGCTCCTGGCAGGTGGGTATCCAACAGGATGTGACACATACCAATGGCTGCGTGGCTCTGGGCATCAAACTAC 1252
Query 1253 CTCACACGGAGTACGAGATCTTCAAAATGGAACAGGATGCCCGGGGGCGCTATCTGCTGTTCAACGGTCAGAGG 1326
|||||||.||.||.|||||||||||||||||.||.||..||||.||.|||||.|||||||||||.||.||||||
Sbjct 1253 CTCACACAGAATATGAGATCTTCAAAATGGAGCAAGACACCCGAGGCCGCTACCTGCTGTTCAATGGCCAGAGG 1326
Query 1327 CCCAGCGACGGGTCCAGCCCAGACAGGCCAGAGAAGAGAGCCACGTCCTACCAGATGCCCTTGGTCCAGTGTGC 1400
||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1327 CCCAGCGATGGCTCCAGCCCAGACAGACCAGAGAAGAGAGCCACATCCTACCAGATGCCCTTGGTCCAGTGTGC 1400
Query 1401 CTCCTCTTCGCCGAGGGCAGAGGACCTCGCAGAAGACAGTGGAAG--CAGCCTGTATGGCCGGGCCCCTGGGAG 1472
|||.||.||.||.||.||.||.||..|....||||||||| .||| || .|||||||||.||||..|.|||||
Sbjct 1401 CTCTTCCTCACCAAGAGCTGAAGAGTTGTTGGAAGACAGT-CAAGGTCA-TCTGTATGGCAGGGCAGCAGGGAG 1472
Query 1473 GCACACCT-GGTCCCTGCTGCTGGCTGCACTTGCCTGCCTTGTCCCTCTGCTGCATTGGAACATCCGCAGA 1542
| |||.|| ||||||||.||||..||||..|||.|.|||||....||||.|..||||||..|||||.||||
Sbjct 1473 G-ACAGCTGGGTCCCTGTTGCTTCCTGCCTTTGTCAGCCTTTGGACTCTCCCACATTGGCGCATCCTCAGA 1542