Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000466980
- Subject:
- NR_135607.2
- Aligned Length:
- 1969
- Identities:
- 1394
- Gaps:
- 574
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------ATGGCAGAAGCTGTTTTCC 19
|||||||||||.|||||||
Sbjct 1 GTTGCCGGGGTAACGGCGAGCGCGTGGGGCCAAGAAAGAATACCTCCTCTGAAAAATGGCAGAAGCAGTTTTCC 74
Query 20 ATGCCCCAAAGAGGAAAAGAAGAGTGTATGAGACTTACGAGTCTCCATTGCCAATCCCTTTTGGTCAGGACCAT 93
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 ATGCCCCAAAGAGGAAAAGAAGAGTGTATGAGACTTACGAGTCTCCATTGCCAATCCCTTTTGGTCAGGACCAT 148
Query 94 GGTCCTCTGAAAGAATTCAAGATATTCCGTGCTGAAATGATTAACAACAATGTGATTGTGAGGAATGCGGAGGA 167
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GGTCCTCTGAAAGAATTCAAGATATTCCGTGCTGAAATGATTAACAACAATGTGATTGTGAGGAATGCGGAGGA 222
Query 168 CATTGAGCAGCTCTATGGGAAAGGTTATTTTGGAAAAGGTATTCTTTCAAGAAGCCGTCCAAGCTTCACAATTT 241
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CATTGAGCAGCTCTATGGGAAAGGTTATTTTGGAAAAGGTATTCTTTCAAGAAGCCGTCCAAGCTTCACAATTT 296
Query 242 CAGATCCTAAACTGGTTGCTAAATGGAAAGATATGAAGACAAACATGCCTATCATCACATCAAAGAGGTATCAG 315
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CAGATCCTAAACTGGTTGCTAAATGGAAAGATATGAAGACAAACATGCCTATCATCACATCAAAGAGGTATCAG 370
Query 316 CATAGTGTTGAGTGGGCAGCAGAGCTGATGCGTAGACAGGGGCAGGATGAGAGTACAGTGCGCAGAATCCTCAA 389
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CATAGTGTTGAGTGGGCAGCAGAGCTGATGCGTAGACAGGGGCAGGATGAGAGTACAGTGCGCAGAATCCTCAA 444
Query 390 GGATTACACGAAACCGCTTGAGCATCCTCCTGTGAAAAGGAATGAAGAGGCTCAAGTGCATGACAAGCTTAACT 463
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GGATTACACGAAACCGCTTGAGCATCCTCCTGTGAAAAGGAATGAAGAGGCTCAAGTGCATGACAAGCTTAACT 518
Query 464 CTGGAATGGTTTCCAACATGGAAGGCACAGCAGGGGGAGAGAGACCTTCTGTGGTAAACGGGGACTCTGGAAAG 537
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CTGGAATGGTTTCCAACATGGAAGGCACAGCAGGGGGAGAGAGACCTTCTGTGGTAAACGGGGACTCTGGAAAG 592
Query 538 TCAGGTGGTGTGGGTGATCCCCGTGAGCCATTAGGCTGCCTGCAGGAGGGCTCTGGCTGCCACCCAACAACAGA 611
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TCAGGTGGTGTGGGTGATCCCCGTGAGCCATTAGGCTGCCTGCAGGAGGGCTCTGGCTGCCACCCAACAACAGA 666
Query 612 GAGCTTTGAGAAAAGCGTGCGAGAGGATGCCTCACCTCTGCCCCATGTCTGTTGCTGCAAACAAGATGCTCTCA 685
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GAGCTTTGAGAAAAGCGTGCGAGAGGATGCCTCACCTCTGCCCCATGTCTGTTGCTGCAAACAAGATGCTCTCA 740
Query 686 TCCTCCAGCGTGGCCTTCATCATGAAGACGGCAGCCAGCACATCGGCCTCCTGCATCCTGGGGACAGAGGGCCT 759
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TCCTCCAGCGTGGCCTTCATCATGAAGACGGCAGCCAGCACATCGGCCTCCTGCATCCTGGGGACAGAGGGCCT 814
Query 760 GACCATGAGTACGTGCTGGTCGAGGAAGCGGAGTGTGCCATGAGCGAGAGGGAGGCTGCCCCAAATGAGGAATT 833
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GACCATGAGTACGTGCTGGTCGAGGAAGCGGAGTGTGCCATGAGCGAGAGGGAGGCTGCCCCAAATGAGGAATT 888
Query 834 GGTGCAAAGAAACAGGTTAATATGCAGAAGAAATCCATATAGGATCTTTGAGTATTTGCAACTCAGCCTAGAAG 907
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 GGTGCAAAGAAACAGGTTAATATGCAGAAGAAATCCATATAGGATCTTTGAGTATTTGCAACTCAGCCTAGAAG 962
Query 908 AGGCCTTTTTCTTGGTCTATGCTCTGGGATGTTTAAGTATTTACTATGAGAAGGAGCCTTTAACGATAGTGAAG 981
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 AGGCCTTTTTCTTGGTCTATGCTCTGGGATGTTTAAGTATTTACTATGAGAAGGAGCCTTTAACGATAGTGAAG 1036
Query 982 CTCTGGAAAGCTTTCACTGTAGTTCAGCCCACGTTCAGAACCACCTACATGGCCTACCATTACTTTCGAAGCAA 1055
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CTCTGGAAAGCTTTCACTGTAGTTCAGCCCACGTTCAGAACCACCTACATGGCCTACCATTACTTTCGAAGCAA 1110
Query 1056 GGGCTGGGTGCCCAAAGTGGGACTCAAGTACGGGACAGATTTACTGCTATATCGGAAAGGCCCTCCATTTTACC 1129
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GGGCTGGGTGCCCAAAGTGGGACTCAAGTACGGGACAGATTTACTGCTATATCGGAAAGGCCCTCCATTTTACC 1184
Query 1130 ATGCAAGTTATTCTGTCATTATCGAGCTAGTTGATGACCATTTTGAAGGCTCTCTCCGCAGGCCTCTCAGTTGG 1203
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 ATGCAAGTTATTCTGTCATTATCGAGCTAGTTGATGACCATTTTGAAGGCTCTCTCCGCAGGCCTCTCAGTTGG 1258
Query 1204 AAGTCCCTGGCTGCCTTGAGCAGAGTTTCCGTTAATGTCTCTAAGGAACTTATGCTGTGCTATTTGATTAAACC 1277
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AAGTCCCTGGCTGCCTTGAGCAGAGTTTCCGTTAATGTCTCTAAGGAACTTATGCTGTGCTATTTGATTAAACC 1332
Query 1278 CTCTACTATGACTGACAAGGAAATGGAGTCACCAGAATGTATGAAAAGGATTAAAGTTCAGGAGGTGATTCTGA 1351
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CTCTACTATGACTGACAAGGAAATGGAGTCACCAGAATGTATGAAAAGGATTAAAGTTCAGGAGGTGATTCTGA 1406
Query 1352 GTCGATGGGTTTCTTCACGAGAGAGGAGTGACCAAGACGATCTT------------------------------ 1395
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 GTCGATGGGTTTCTTCACGAGAGAGGAGTGACCAAGACGATCTTTAACAATTCAACCTCAAATTTCTAATTTCA 1480
Query 1396 -------------------------------------------------------------------------- 1395
Sbjct 1481 CCAACAACTATTTATTGAGGGCTAGTCTCGCTCTGTCGTCCAGGCTGGAGTCCAATGCTGCGATCTTGGATCAC 1554
Query 1396 -------------------------------------------------------------------------- 1395
Sbjct 1555 TGCAACCTCTGCCTGCTGGGTTTAAGCGATTCTCATGCCTCAGCCTCCTGAGTAGCTGGGATTACAGGCACGCA 1628
Query 1396 -------------------------------------------------------------------------- 1395
Sbjct 1629 CCACCACACACGGCTAATTTTTGTATTTTTAGTAGAGACGGGGTTTCACTATGTTGGCCAGGCTGGTCTGGAAC 1702
Query 1396 -------------------------------------------------------------------------- 1395
Sbjct 1703 TCCTGACCTCAAGTGATCTGCCCGCCTTGGCCTCCCAAAGTGCTGAGAGTACAGGCGTGAGCCACTGCATCCAG 1776
Query 1396 -------------------------------------------------------------------------- 1395
Sbjct 1777 CTCTTAGCATGTGCTTTTAAAGTAAAAACCACGAGGAGAAGGTACTCATTACTTCATAACTTGTGTCTCACCCA 1850
Query 1396 -------------------------------------------------------------------------- 1395
Sbjct 1851 CCTTGCTGTCTTCACATCCCCACTTTCTGTATGCACATTGGAAGGTGAATTTGTTCAGCTCACATTAATTTATA 1924
Query 1396 --------------------------------------------- 1395
Sbjct 1925 GGAATAATTTTCATTGCTCTGTGAATAAAATGTGCTACCACTTTA 1969