Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000466992
- Subject:
- NM_001355506.1
- Aligned Length:
- 1418
- Identities:
- 1023
- Gaps:
- 262
Alignment
Query 1 ATGGCGGCCATGGAGACCGAGACGGCGCCGCTGACCCTAGAGTCGCTGCCCACCGATCCCCTGCTCCTCATCTT 74
|||||.|||.|.|||.|||||||||.||.|||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||
Sbjct 1 ATGGCTGCCGTAGAGGCCGAGACGGGGCTGCTGACCCTGGAGTCGCTGCCCACCGACCCTCTGCTGCTCATCTT 74
Query 75 ATCCTTTTTGGACTATCGGGATCTAATCAACTGTTGTTATGTCAGTCGAAGACTTAGCCAGCTATCAAGTCATG 148
||||||..|||||||..||||.|||||||
Sbjct 75 ATCCTTCGTGGACTACAGGGACCTAATCA--------------------------------------------- 103
Query 149 ATCCGCTGTGGAGAAGACATTGCAAAAAATACTGGCTGATATCTGAGGAAGAGAAAACACAGAAGAATCAGTGT 222
|||||||.|||.|...|||||.||||||.
Sbjct 104 ---------------------------------------------AGGAAGAAAAAGCCGGGAAGAGTCAGTGC 132
Query 223 TGGAAATCTCTCTTCATAGATACTTACTCTGATGTAGGAAGATACATTGACCATTATGCTGCTATTAAAAAGGC 296
||||.|||.|||||||||||.||.|||||.||.||.||.||.|||||.||||||||.||.||.|||||||||||
Sbjct 133 TGGAGATCCCTCTTCATAGAGACCTACTCAGACGTGGGGAGGTACATCGACCATTACGCCGCCATTAAAAAGGC 206
Query 297 CTGGGATGATCTCAAGAAATATTTGGAGCCCAGGTGTCCTCGGATGGTTTTATCTCTGAAAGAGGGTGCTCGAG 370
||||..|||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|
Sbjct 207 CTGGCGTGACCTCAAGAAGTACTTGGAGCCCAGGTGTCCTCGGATGGTTTTATCTCTGAAAGAGGGCGCACGTG 280
Query 371 AGGAAGACCTCGATGCTGTGGAAGCGCAGATTGGCTGCAAGCTTCCTGACGATTATCGATGTTCATACCGAATT 444
||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||.||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||.||.
Sbjct 281 AGGAAGACCTGGATGCTGTCGAAGCTCAGATCGGTTGCAAGCTCCCGGATGATTATCGCTGTTCATACCGGATC 354
Query 445 CACAATGGACAGAAGTTAGTGGTTCCTGGGTTATTGGGAAGCATGGCACTGTCTAATCACTATCGTTCTGAAGA 518
|||||.||.||.|||||||||||.||.|||||..|||||||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||
Sbjct 355 CACAACGGGCAAAAGTTAGTGGTGCCGGGGTTGCTGGGAAGTATGGCACTGTCCAATCACTACCGCTCTGAAGA 428
Query 519 TTTGTTAGACGTCGATACAGCTGCCGGAGGATTCCAGCAGAGACAGGGACTGAAATACTGTCTCCCTTTAACTT 592
|.|..||||.||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 429 TCTACTAGATGTTGATACTGCTGCAGGAGGATTTCAGCAGAGACAGGGACTGAAATACTGTCTCCCTTTAACCT 502
Query 593 TTTGCATACATACTGGTTTGAGTCAGTACATAGCAGTGGAAGCTGCAGAGGGCCGAAACAAAAATGAAGTTTTC 666
||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||.||.||.|||||.|||
Sbjct 503 TTTGCATACACACCGGCTTGAGTCAGTACATAGCTGTGGAGGCTGCAGAGGGGCGGAATAAGAACGAAGTGTTC 576
Query 667 TACCAATGTCCAGACCAAATGGCTCGAAATCCAGCTGCTATTGACATGTTTATTATAGGTGCTACTTTTACTGA 740
||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 577 TACCAATGTCCAGACCAAATGGCTCGGAATCCTGCTGCTATTGACATGTTTATCATAGGTGCTACTTTTACCGA 650
Query 741 CTGGTTTACCTCTTATGTCAAAAATGTTGTATCAGGTGGCTTCCCCATCATCAGAGACCAAATTTTCAGATATG 814
|||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||.
Sbjct 651 CTGGTTTACATCCTATGTCAACAATGTTGTATCAGGTGGTTTCCCCATCATCAGAGACCAGATTTTCAGATATA 724
Query 815 TTCACGATCCAGAATGTGTAGCAACAACTGGGGATATTACTGTGTCAGTTTCCACATCGTTTCTGCCAGAACTT 888
||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.
Sbjct 725 TTCATGATCCAGAATGTGTGGCAACAACTGGAGATATTACAGTTTCAGTGTCCACATCGTTTCTGCCAGAACTC 798
Query 889 AGCTCTGTACATCCACCCCACTATTTCTTCACATACCGAATCAGGATTGAAATGTCAAAAGATGCACTTCCTGA 962
||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||.||||||||
Sbjct 799 AGCTCTGTGCATCCGCCACACTATTTCTTCACATACCGAATCAGGATTGAAATGTCAAGGGATGCTCTTCCTGA 872
Query 963 GAAGGCCTGTCAGTTGGACAGTCGCTATTGGAGAATAACAAATGCTAAGGGTGACGTGGAAGAAGTTCAAGGAC 1036
|||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||.||.|||||||||||.||.||||
Sbjct 873 GAAGGCCTGTCAGTTGGACAGTCGCTACTGGAGGATAACAAACGCTAAAGGGGATGTGGAAGAAGTCCAGGGAC 946
Query 1037 CTGGAGTAGTTGGTGAATTTCCAATCATCAGCCCAGGTCGGGTATATGAATACACAAGCTGTACCACATTCTCT 1110
||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 947 CTGGAGTAGTCGGTGAATTTCCAATTATTAGCCCAGGTCGGATATATGAATACACAAGCTGTACCACATTTTCT 1020
Query 1111 ACAACATCAGGATACATGGAAGGATATTATACCTTCCATTTTCTTTACTTTAAAGACAAGATCTTTAATGTTGC 1184
|||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.||||||.|||||||||||||
Sbjct 1021 ACAACATCAGGCTACATGGAAGGGTATTACACCTTCCATTTTCTGTACTTTAAGGACAAGGTCTTTAATGTTGC 1094
Query 1185 CATTCCCCGATTCCATATGGCATGTCCAACATTCAGGGTGTCTATAGCCCGATTG-----GAAATGGGTCCTGA 1253
|||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||| .||.||.
Sbjct 1095 CATCCCCCGATTCCACATGGCATGTCCAACATTCAGGGTGTCTATAGCTCGATTGCCTCCCAAGTGC------- 1161
Query 1254 TGAATATGAAGAGATGGAAGAAGAGGAGGAGGAGGAAGAGGAGGAAGACGAGGATGATGATTCAGCAGATATGG 1327
Sbjct 1162 -------------------------------------------------------------------------- 1161
Query 1328 ATGAATCAGATGAAGATGATGAAGAGGAGAGACGGAGGAGAGTCTTTGATGTTCCCATTCGCAGACGCCGCTGC 1401
Sbjct 1162 -------------------------------------------------------------------------- 1161
Query 1402 TCACGCCTTTTT 1413
Sbjct 1162 ------------ 1161