Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000467196
• Subject: NM_021196.3
• Aligned Length: 3411
• Identities: 3057
• Gaps: 354

Alignment

Query    1  ATGAAGGTGAAGGAGGAGAAGGCTGGGGTAGGAAAGCTGGACCACACTAACCACAGGAGGAGATTTCCGGATCA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAAGGTGAAGGAGGAGAAGGCTGGGGTAGGAAAGCTGGACCACACTAACCACAGGAGGAGATTTCCGGATCA  74

Query   75  GAAAG---------------------------------------------------------------------  79
            |||||                                                                     
Sbjct   75  GAAAGAATGCCCTCCTATCCACATTGGGCTTCCAGTACCCACTTACCCTCAAAGAAAAACTGACCAGAAGGGAC  148

Query   80  --------------------------------------------------------------------------  79
                                                                                      
Sbjct  149  ATCTTTCAGGCCTGCAAAAAGTCCACTGGGGCCTGCGGCCAGACCAGCCACAGCAGGAACTGACTGGCCCAGGG  222

Query   80  -------------------------------------------------GGTCCCCAGCTGCTGAGCAGCTCCA  104
                                                             |||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGTGGGGCAAGCAGCCAGGACAGCAGCATGGATCTTATCAGCAGGACTCGGTCCCCAGCTGCTGAGCAGCTCCA  296

Query  105  GGACATCCTGGGGGAGGAAGATGAGGCTCCCAACCCCACCCTCTTTACAGAGATGGATACTCTGCAGCATGACG  178
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGACATCCTGGGGGAGGAAGATGAGGCTCCCAACCCCACCCTCTTTACAGAGATGGATACTCTGCAGCATGACG  370

Query  179  GAGACCAGATGGAGTGGAAGGAGTCAGCCAGGTGGATAAAGTTTGAAGAAAAGGTAGAGGAAGGCGGCGAACGC  252
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GAGACCAGATGGAGTGGAAGGAGTCAGCCAGGTGGATAAAGTTTGAAGAAAAGGTAGAGGAAGGCGGCGAACGC  444

Query  253  TGGAGCAAGCCCCACGTGTCCACACTATCCCTGCACAGCCTCTTCGAGCTCCGTACCTGCCTGCAGACGGGGAC  326
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TGGAGCAAGCCCCACGTGTCCACACTATCCCTGCACAGCCTCTTCGAGCTCCGTACCTGCCTGCAGACGGGGAC  518

Query  327  GGTGCTGCTGGATTTGGACAGTGGCTCCTTACCACAGATCATAGATGATGTCATTGAGAAGCAGATTGAGGATG  400
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGTGCTGCTGGATTTGGACAGTGGCTCCTTACCACAGATCATAGATGATGTCATTGAGAAGCAGATTGAGGATG  592

Query  401  GTCTCCTGCGGCCAGAGCTCCGGGAGAGGGTCAGTTACGTCCTCCTGAGGAGGCACCGCCACCAAACCAAGAAG  474
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GTCTCCTGCGGCCAGAGCTCCGGGAGAGGGTCAGTTACGTCCTCCTGAGGAGGCACCGCCACCAAACCAAGAAG  666

Query  475  CCCATCCACCGCTCCTTAGCTGACATTGGGAAGTCAGTCTCCACCACAAATCGCAGTCCTGCCCGGAGCCCTGG  548
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CCCATCCACCGCTCCTTAGCTGACATTGGGAAGTCAGTCTCCACCACAAATCGCAGTCCTGCCCGGAGCCCTGG  740

Query  549  TGCTGGCCCGAGTCTACACCACTCCACGGAAGACCTGCGGATGCGGCAGAGTGCAAATTACGGACGTCTGTGTC  622
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGCTGGCCCGAGTCTACACCACTCCACGGAAGACCTGCGGATGCGGCAGAGTGCAAATTACGGACGTCTGTGTC  814

Query  623  ATGCCCAGAGCAGAAGCATGAATGACATTTCTCTCACCCCAAACACAGACCAGCGGAAAAACAAATTCATGAAG  696
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ATGCCCAGAGCAGAAGCATGAATGACATTTCTCTCACCCCAAACACAGACCAGCGGAAAAACAAATTCATGAAG  888

Query  697  AAGATCCCCAAGGACTCAGAAGCGTCCAACGTGCTCGTGGGCGAGGTGGACTTCCTAGACCAGCCATTCATCGC  770
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAGATCCCCAAGGACTCAGAAGCGTCCAACGTGCTCGTGGGCGAGGTGGACTTCCTAGACCAGCCATTCATCGC  962

Query  771  GTTCGTGCGCCTCATCCAGTCGGCCATGCTGGGAGGAGTGACCGAGGTGCCTGTCCCCACCAGATTTCTGTTTA  844
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GTTCGTGCGCCTCATCCAGTCGGCCATGCTGGGAGGAGTGACCGAGGTGCCTGTCCCCACCAGATTTCTGTTTA  1036

Query  845  TACTACTGGGACCTTCTGGGAGAGCAAAATCCTACAATGAAATTGGCCGTGCCATTGCAACCCTCATGGTAGAT  918
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TACTACTGGGACCTTCTGGGAGAGCAAAATCCTACAATGAAATTGGCCGTGCCATTGCAACCCTCATGGTAGAT  1110

Query  919  GATCTCTTCAGTGACGTGGCCTACAAAGCCCGCAATCGGGAAGATCTGATCGCAGGAATTGATGAATTTCTGGA  992
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GATCTCTTCAGTGACGTGGCCTACAAAGCCCGCAATCGGGAAGATCTGATCGCAGGAATTGATGAATTTCTGGA  1184

Query  993  TGAGGTCATCGTCCTTCCTCCTGGAGAATGGGACCCAAATATCCGGATTGAGCCCCCCAAGAAGGTGCCCTCTG  1066
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGAGGTCATCGTCCTTCCTCCTGGAGAATGGGACCCAAATATCCGGATTGAGCCCCCCAAGAAGGTGCCCTCTG  1258

Query 1067  CTGACAAGAGGAAATCTGTGTTCTCCCTAGCAGAGCTGGGCCAGATGAATGGCTCTGTGGGAGGAGGCGGCGGA  1140
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CTGACAAGAGGAAATCTGTGTTCTCCCTAGCAGAGCTGGGCCAGATGAATGGCTCTGTGGGAGGAGGCGGCGGA  1332

Query 1141  GCTCCTGGAGGAGGCAATGGAGGTGGTGGTGGTGGTGGCAGTGGCGGCGGGGCTGGCAGTGGCGGGGCCGGCGG  1214
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GCTCCTGGAGGAGGCAATGGAGGTGGTGGTGGTGGTGGCAGTGGCGGCGGGGCTGGCAGTGGCGGGGCCGGCGG  1406

Query 1215  AACAAGCAGCGGGGATGATGGAGAGATGCCAGCCATGCATGAAATCGGGGAGGAACTTATCTGGACAGGAAGGT  1288
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AACAAGCAGCGGGGATGATGGAGAGATGCCAGCCATGCATGAAATCGGGGAGGAACTTATCTGGACAGGAAGGT  1480

Query 1289  TCTTCGGTGGCCTGTGTCTGGATATCAAGAGGAAGTTGCCCTGGTTCCCAAGTGACTTCTATGATGGCTTCCAC  1362
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TCTTCGGTGGCCTGTGTCTGGATATCAAGAGGAAGTTGCCCTGGTTCCCAAGTGACTTCTATGATGGCTTCCAC  1554

Query 1363  ATTCAGTCCATCTCTGCCATCCTATTCATCTACCTCGGCTGTATCACCAACGCGATCACCTTTGGTGGGCTTCT  1436
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  ATTCAGTCCATCTCTGCCATCCTATTCATCTACCTCGGCTGTATCACCAACGCGATCACCTTTGGTGGGCTTCT  1628

Query 1437  GGGGGATGCCACCGACAATTATCAGGGAGTGATGGAGAGCTTCCTGGGCACTGCCATGGCTGGCTCCTTGTTCT  1510
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  GGGGGATGCCACCGACAATTATCAGGGAGTGATGGAGAGCTTCCTGGGCACTGCCATGGCTGGCTCCTTGTTCT  1702

Query 1511  GCCTCTTCTCGGGACAGCCTCTCATCATTCTCAGCAGCACGGGGCCCATCCTCATCTTTGAGAAGCTCCTCTTC  1584
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GCCTCTTCTCGGGACAGCCTCTCATCATTCTCAGCAGCACGGGGCCCATCCTCATCTTTGAGAAGCTCCTCTTC  1776

Query 1585  GACTTCAGCAAAGGCAATGGCCTGGACTACATGGAGTTCCGCCTCTGGATTGGCCTACACTCAGCTGTCCAGTG  1658
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GACTTCAGCAAAGGCAATGGCCTGGACTACATGGAGTTCCGCCTCTGGATTGGCCTACACTCAGCTGTCCAGTG  1850

Query 1659  CCTTATCCTAGTGGCCACAGATGCCAGCTTTATCATCAAATATATCACCCGCTTCACCGAGGAGGGCTTCTCCA  1732
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  CCTTATCCTAGTGGCCACAGATGCCAGCTTTATCATCAAATATATCACCCGCTTCACCGAGGAGGGCTTCTCCA  1924

Query 1733  CCCTTATCAGCTTCATCTTCATCTACGATGCCATCAAGAAGATGATCGGTGCCTTCAAGTACTACCCTATCAAT  1806
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CCCTTATCAGCTTCATCTTCATCTACGATGCCATCAAGAAGATGATCGGTGCCTTCAAGTACTACCCTATCAAT  1998

Query 1807  ATGGACTTCAAGCCAAACTTCATCACTACCTACAAGTGCGAGTGTGTCGCCCCTGACACAGTGAATACAACCGT  1880
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  ATGGACTTCAAGCCAAACTTCATCACTACCTACAAGTGCGAGTGTGTCGCCCCTGACACAGTGAATACAACCGT  2072

Query 1881  GTTCAATGCTTCAGCCCCATTGGCACCAGACACCAACGCTTCTCTGTACAACCTCCTTAACCTCACAGCGTTGG  1954
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  GTTCAATGCTTCAGCCCCATTGGCACCAGACACCAACGCTTCTCTGTACAACCTCCTTAACCTCACAGCGTTGG  2146

Query 1955  ACTGGTCCCTGCTGAGCAAGAAGGAGTGTCTGAGCTACGGCGGGCGCCTGCTTGGGAATTCCTGCAAGTTTATC  2028
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  ACTGGTCCCTGCTGAGCAAGAAGGAGTGTCTGAGCTACGGCGGGCGCCTGCTTGGGAATTCCTGCAAGTTTATC  2220

Query 2029  CCAGACCTGGCGCTCATGTCCTTCATCCTTTTCTTTGGGACATACTCCATGACCCTGACCCTGAAGAAGTTCAA  2102
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  CCAGACCTGGCGCTCATGTCCTTCATCCTTTTCTTTGGGACATACTCCATGACCCTGACCCTGAAGAAGTTCAA  2294

Query 2103  ATTCAGCCGCTATTTTCCTAC-----------------------------------------------------  2123
            |||||||||||||||||||||                                                     
Sbjct 2295  ATTCAGCCGCTATTTTCCTACCAAGGTCCGGGCCCTGGTGGCTGACTTTTCCATTGTTTTCTCCATCCTGATGT  2368

Query 2124  -------------------------------------------------------------CAAGCCAACGCGG  2136
                                                                         |||||||||||||
Sbjct 2369  TCTGTGGAATCGATGCCTGTTTTGGCCTAGAAACTCCCAAGCTGCATGTGCCCAGTGTCATCAAGCCAACGCGG  2442

Query 2137  CCTGACCGAGGCTGGTTCGTGGCCCCCTTTGGGAAGAACCCGTGGTGGGTATACCCAGCAAGCATCCTGCCCGC  2210
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  CCTGACCGAGGCTGGTTCGTGGCCCCCTTTGGGAAGAACCCGTGGTGGGTATACCCAGCAAGCATCCTGCCCGC  2516

Query 2211  CCTGCTGGTGACCATCCTGATCTTCATGGACCAGCAGATCACTGCCGTCATTGTCAACCGGAAGGAGAACAAAC  2284
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517  CCTGCTGGTGACCATCCTGATCTTCATGGACCAGCAGATCACTGCCGTCATTGTCAACCGGAAGGAGAACAAAC  2590

Query 2285  TGAAGAAGGCTGCCGGCTACCATCTGGACCTGTTCTGGGTGGGCATCCTCATGGCTTTGTGCTCCTTTATGGGG  2358
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591  TGAAGAAGGCTGCCGGCTACCATCTGGACCTGTTCTGGGTGGGCATCCTCATGGCTTTGTGCTCCTTTATGGGG  2664

Query 2359  CTCCCCTGGTACGTGGCTGCCACGGTCATCTCCATCGCCCACATCGACAGCCTCAAGATGGAGACAGAGACCAG  2432
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665  CTCCCCTGGTACGTGGCTGCCACGGTCATCTCCATCGCCCACATCGACAGCCTCAAGATGGAGACAGAGACCAG  2738

Query 2433  TGCCCCTGGGGAGCAGCCCCAGTTTCTGGGAGTCAGGGAACAGAGAGTAACCGGCATCATCGTCTTCATCCTGA  2506
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739  TGCCCCTGGGGAGCAGCCCCAGTTTCTGGGAGTCAGGGAACAGAGAGTAACCGGCATCATCGTCTTCATCCTGA  2812

Query 2507  CGGGAATCTCTGTCTTCCTGGCTCCCATCCTAAAGTGTATCCCCCTGCCGGTGCTGTACGGAGTCTTCCTCTAC  2580
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813  CGGGAATCTCTGTCTTCCTGGCTCCCATCCTAAAGTGTATCCCCCTGCCGGTGCTGTACGGAGTCTTCCTCTAC  2886

Query 2581  ATGGGCGTGGCCTCCCTGAATGGCATCCAG--------------------------------------------  2610
            ||||||||||||||||||||||||||||||                                            
Sbjct 2887  ATGGGCGTGGCCTCCCTGAATGGCATCCAGATGGGGACCGGAGGGTCAGAATTCAAAATCCAGAAGAAGCTGAC  2960

Query 2611  ----TTCTGGGAACGCTGCAAGCTCTTCCTGATGCCAGCCAAGCACCAGCCGGACCATGCCTTCCTGCGGCACG  2680
                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961  TCCATTCTGGGAACGCTGCAAGCTCTTCCTGATGCCAGCCAAGCACCAGCCGGACCATGCCTTCCTGCGGCACG  3034

Query 2681  TGCCGCTGCGCCGGATCCACCTCTTCACCCTGGTGCAGATCCTCTGCCTGGCGGTGCTCTGGATCCTCAAATCC  2754
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035  TGCCGCTGCGCCGGATCCACCTCTTCACCCTGGTGCAGATCCTCTGCCTGGCGGTGCTCTGGATCCTCAAATCC  3108

Query 2755  ACGGTGGCTGCCATCATCTTCCCGGTCATGATCCTGGGCCTCATCATCGTTCGAAGGCTTCTGGATTTCATCTT  2828
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109  ACGGTGGCTGCCATCATCTTCCCGGTCATGATCCTGGGCCTCATCATCGTTCGAAGGCTTCTGGATTTCATCTT  3182

Query 2829  TTCCCAGCACGACCTGGCCTGGATTGACAACATCCTCCCAGAGAAGGAAAAAAAGGAGACAGACAAGAAGAGGA  2902
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183  TTCCCAGCACGACCTGGCCTGGATTGACAACATCCTCCCAGAGAAGGAAAAAAAGGAGACAGACAAGAAGAGGA  3256

Query 2903  AGAGAAAAAAAGGGGCCCACGAGGACTGTGATGAGGAGCCCCAGTTCCCTCCTCCCTCGGTTATAAAGATTCCC  2976
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3257  AGAGAAAAAAAGGGGCCCACGAGGACTGTGATGAGGAGCCCCAGTTCCCTCCTCCCTCGGTTATAAAGATTCCC  3330

Query 2977  ATGGAAAGTGTCCAATCAGATCCCCAAAACGGTATCCACTGCATTGCCAGAAAAAGATCTTCCAGTTGGAGTTA  3050
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3331  ATGGAAAGTGTCCAATCAGATCCCCAAAACGGTATCCACTGCATTGCCAGAAAAAGATCTTCCAGTTGGAGTTA  3404

Query 3051  CTCACTC  3057
            |||||||
Sbjct 3405  CTCACTC  3411