Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000467617
- Subject:
- NM_181279.1
- Aligned Length:
- 1265
- Identities:
- 1032
- Gaps:
- 121
Alignment
Query 1 ATGTCCCCAGAAGTGGCCTTGAACCGAATATCTCCAATGCTCTCCCCTTTCATATCTAGCGTGGTCCGGAATG- 73
|||||.||||||.|.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct 1 ATGTCTCCAGAAATTGCCTTGAACCGAATTTCTCCAATGCTCTCCCCATTCATATCAAGCGTGGTCCGAAATGG 74
Query 74 ----------GAAAA---------------------------------------------------GTGGGACT 86
||||| |||.|.||
Sbjct 75 GAAGATCCATGAAAAAGGGCCGTCACAGAAGCTTTCATTCAAGTCCTGCTCTTATCATCTGCCGATGTGTGCCT 148
Query 87 G----------------------GATGCTACA-----------AACTGTTTGAG-------GATAA----CTG- 115
| ||| |||.| |.|| ||.||| ||.|| |||
Sbjct 149 GTAATGAATGGTATGGTGTGCCAGAT-CTAGAGAAAGCATCGTACCT-TTGGAGAAAGAAAGAAAACCATCTGC 220
Query 116 -ACT--TAAAATCTGG------CTGCACATCATTGACTCCTGGGCCCAACTGTGACCGATTTAAACTGCACATA 180
||| .|||| || |||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.
Sbjct 221 CACTAGAAAAA---GGCCAAAACTGTACATCATTGACTCCTGGACCCAACTGTGACCGCTTCAAACTGCACATC 291
Query 181 CCATATGCTGGAGAGACATTAAAGTGGGATATCATTTTCAATGCCCAATACCCAGAACTGCCTCCCGATTTTAT 254
||.||.|||||.|||||.|||||.|||||.||.|||||||||||.||.||||||||.||||||||.|||||.||
Sbjct 292 CCGTACGCTGGGGAGACGTTAAAATGGGACATAATTTTCAATGCTCAGTACCCAGAGCTGCCTCCTGATTTCAT 365
Query 255 CTTTGGAGAAGATGCTGAATTCCTGCCAGACCCCTCAGCTTTGCAGAATCTTGCCTCCTGGAATCCTTCAAATC 328
|||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.||..||||.||.||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct 366 CTTTGGAGAGGATGCTGAGTTTCTGCCAGACCCCTCTGCGCTGCACAACCTTGCCTCCTGGAACCCTTCAAACC 439
Query 329 CTGAATGTCTCTTACTTGTGGTGAAGGAACTTGTGCAACAATATCACCAATTCCAATGTAGCCGCCTCCGGGAG 402
||||.||.||.||.||.|||||||||||.||.|||||.||.||.|||||.|||||.||..||||||||||.|||
Sbjct 440 CTGAGTGCCTGTTGCTCGTGGTGAAGGAGCTGGTGCAGCAGTACCACCAGTTCCAGTGCGGCCGCCTCCGTGAG 513
Query 403 AGCTCCCGCCTCATGTTTGAATACCAGACATTACTGGAGGAGCCACAGTATGGAGAGAACATGGAAATTTATGC 476
|||||.||||||||||||||.||||||||..|.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 514 AGCTCGCGCCTCATGTTTGAGTACCAGACGCTCCTGGAAGAGCCTCAGTATGGAGAGAACATGGAAATTTATGC 587
Query 477 TGGGAAAAAAAACAACTGGACTGGTGAATTTTCAGCTCGTTTCCTTTTGAAGCTGCCCGTAGATTTCAGCAATA 550
|||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||.|.||.||||||||||||||.|
Sbjct 588 TGGAAAGAAAAACAACTGGACTGGTGAATTTTCAGCTCGTTTTCTATTGAAGTTACCAGTAGATTTCAGCAACA 661
Query 551 TCCCCACATACCTTCTCAAGGATGTAAATGAAGACCCTGGAGAAGATGTGGCCCTCCTCTCTGTTAGTTTTGAG 624
|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||
Sbjct 662 TTCCCACATACCTTCTCAAGGATGTAAATGAAGACCCTGGAGAAGATGTGGCCCTTCTTTCTGTCAGTTTTGAG 735
Query 625 GACACTGAAGCCACCCAGGTGTACCCCAAGCTGTACTTGTCACCTCGAATTGAGCATGCACTTGGAGGCTCCTC 698
||.||||||||.||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 736 GATACTGAAGCTACCCAGGTGTACCCCAAGTTGTACTTGTCACCCCGAATTGAGCATGCACTCGGAGGCTCCTC 809
Query 699 AGCTCTTCATATCCCAGCTTTTCCAGGAGGAGGATGTCTCATTGATTACGTTCCTCAAGTATGCCACCTGCTCA 772
.||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct 810 TGCTCTTCACATCCCTGCTTTCCCCGGAGGAGGATGTCTCATTGATTATGTGCCTCAAGTGTGCCACCTGCTCA 883
Query 773 CCAACAAGGTGCAGTACGTGATTCAAGGGTATCACAAAAGAAGAGAGTATATTGCTGCTTTTCTCAGTCACTTT 846
||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||||||||||||
Sbjct 884 CCAACAAGGTACAGTATGTGATTCAAGGCTATCACAAAAGAAGAGAGTACATCGCAGCTTTCCTCAGTCACTTT 957
Query 847 GGCACAGGTGTCGTGGAATATGATGCAGAAGGCTTTACAAAACTCACTCTGCTGCTGATGTGGAAAGATTTTTG 920
|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 958 GGCACAGGTGTCGTGGAATATGATGCAGAAGGCTTCACAAAACTTACTCTGCTGCTGATGTGGAAAGACTTTTG 1031
Query 921 TTTTCTTGTACACATTGACCTGCCTCTGTTTTTCCCTCGAGACCAGCCAACTCTCACATTTCAGTCCGTTTATC 994
|||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.||.||||
Sbjct 1032 TTTTCTTGTCCACATTGACCTGCCCCTGTTTTTCCCTCGAGATCAGCCTACGCTCACATTTCAGTCAGTCTATC 1105
Query 995 ACTTTACCAACAGTGGACAGCTTTACTCCCAGGCCCAAAAAAATTATCCGTACAGCCCCAGATGGGATGGAAAT 1068
|||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1106 ACTTTACCAACAGTGGACAGCTTTACTCCCAAGCACAAAAAAACTACCCATACAGCCCCAGATGGGATGGAAAT 1179
Query 1069 GAAATGGCCAAAAGAGCAAAGGCTTATTTCAAAACCTTTGTCCCTCAGTTCCAGGAGGCAGCATTTGCCAATGG 1142
|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1180 GAAATGGCCAAGAGAGCAAAGGCTTATTTCAAAACCTTTGTCCCTCAGTTCCAGGAGGCCGCATTTGCCAATGG 1253
Query 1143 AAAGCTC 1149
|||||||
Sbjct 1254 AAAGCTC 1260