Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000467712
- Subject:
- XM_006516544.3
- Aligned Length:
- 2226
- Identities:
- 1982
- Gaps:
- 45
Alignment
Query 1 ATGCCGCCACCCGCGGACATCGTCAAGGTGGCCATAGAATGGCCGGGCGCCTACCCCAAACTCATGGAAATTGA 74
||||||||.||..||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 1 ATGCCGCCGCCTTCGGACATCGTGAAGGTGGCCATAGAATGGCCTGGCGCCTACCCTAAACTCATGGAGATTGA 74
Query 75 TCAGAAAAAACCACTGTCTGCAATAATAAAGGAAGTCTGTGATGGGTGGTCTCTTGCCAACCATGAATATTTTG 148
.||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CCAGAAAAAGCCACTGTCTGCCATTATAAAGGAAGTCTGTGATGGGTGGTCTCTTGCCAACCATGAATATTTTG 148
Query 149 CACTCCAGCATGCCGATAGTTCAAACTTCTATATCACAGAAAAGAACCGCAATGAGATAAAAAATGGCACTATC 222
||||.|||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.|||
Sbjct 149 CACTGCAGCACGCTGATAGTTCAAACTTCTACATCACAGAAAAGAATCGCAACGAAATAAAAAATGGCACGATC 222
Query 223 CTTCGATTAACCACATCTCCAGCTCAGAACGCCCAGCAGCTCCATGAACGAATCCAGTCCTCGAGTATGGATGC 296
|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||
Sbjct 223 CTTCGATTAACCACATCTCCAGCTCAGAATGCCCAGCAGCTCCATGAACGAATACAGTCATCAAGTATGGATGC 296
Query 297 CAAGCTGGAAGCCCTGAAGGACTTGGCCAGCCTCTCCCGGGATGTCACGTTTGCCCAGGAGTTTATAAACCTGG 370
||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||||||||||
Sbjct 297 CAAGTTGGAAGCCCTGAAGGACTTGGCCAGCCTCTCCCGGGATGTTACCTTTGCTCAGGAGTTCATAAACCTGG 370
Query 371 ACGGTATCTCTCTCCTCACGCAGATGGTAGAGAGCGGCACTGAGCGATACCAGAAATTGCAGAAGATCATGAAG 444
|.||.|||||.||.|||||.||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct 371 ATGGCATCTCACTTCTCACTCAGATGGTGGAAAGTGGCACTGAACGATACCAGAAGTTGCAGAAGATTATGAAG 444
Query 445 CCTTGCTTTGGAGACATGCTGTCCTTCACCCTGACGGCCTTCGTTGAGCTGATGGACCATGGCATAGTGTCCTG 518
||.||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||.|||.||||||||||.|||||.||.||.||
Sbjct 445 CCCTGCTTTGGAGACATGCTGTCCTTCACTCTCACAGCCTTTGTGGAGTTGATGGACCACGGCATTGTATCATG 518
Query 519 GGATACATTTTCGGTGGCGTTCATTAAGAAGATAGCAAGTTTTGTGAACAAGTCAGCCATAGACATCTCGATCC 592
|||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct 519 GGATACATTCTCAGTGGCCTTCATTAAGAAGATAGCCAGCTTTGTGAACAAGTCTGCCATAGACATCTCAATCC 592
Query 593 TGCAGCGGTCCTTGGCCATTTTGGAGTCGATGGTGCTCAATAGCCATGACCTCTACCAGAAAGTGGCGCAGGAG 666
|.||||||||||||||||||.|||||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.||.||.||.||||||
Sbjct 593 TCCAGCGGTCCTTGGCCATTCTGGAGTCAATGGTTCTCAACAGTCATGACCTCTACCAAAAGGTAGCCCAGGAG 666
Query 667 ATCACCATCGGCCAGCTCATTCCACACCTGCAAGGGTCAGATCAAGAAATCCAAACCTATACTATTGCAGTGAT 740
||||||||.|||||.||||||||.||.||.||.|||.||||.||||||||.|||||.||.||.|||||.||.||
Sbjct 667 ATCACCATTGGCCAACTCATTCCTCATCTTCAGGGGACAGACCAAGAAATACAAACTTACACCATTGCTGTAAT 740
Query 741 TAATGCGCTTTTCCTGAAGGCTCCTGATGAGAGGAGGCAG---------------------------------- 780
.||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct 741 CAACGCACTTTTCCTCAAAGCTCCTGATGAGAGGAGACAGGTTGATGTAGAGAGCAATGTTGACATCCTTGATT 814
Query 781 -----------GAGATGGCGAATATTTTGGCTCAGAAGCAACTGCGTTCCATCATTTTAACACATGTCATCCGA 843
|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GCCCTCTGACTGAGATGGCGAATATTTTGGCTCAGAAGCAGCTGCGCTACATCATTTTAACACATGTCATCCGA 888
Query 844 GCCCAGCGGGCCATCAACAATGAGATGGCGCACCAGCTGTATGTTCTACAAGTGCTCACCTTTAACCTCCTGGA 917
||.||||||||||||||||||||||||||.||||||.|.||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 889 GCACAGCGGGCCATCAACAATGAGATGGCACACCAGTTATATGTTCTCCAAGTGCTGACCTTTAACCTTCTGGA 962
Query 918 AGACAGGATGATGACCAAAATGGACCCCCAGGACCAGGCTCAGAGGGACATCATATTTGAACTTCGAAGAATTG 991
|||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 AGACAGGATGATGACTAAGATGGACCCCCAGGACCAGGCCCAAAGGGACATCATATTTGAACTTCGAAGAATTG 1036
Query 992 CTTTTGATGCTGAGTCTGAACCTAACAACAGCAGTGGCAGCATGGAGAAACGCAAGTCCATGTACACGCGAGAT 1065
||||.|||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 1037 CTTTCGATGCAGAGTCAGAACCTAATAACAGCAGTGGCAGCATGGAGAAACGCAAGTCCATGTACACTCGGGAT 1110
Query 1066 TATAAGAAGCTTGGGTTCATTAATCATGTCAACCCTGCCATGGACTTCACGCAGACTCCACCTGGGATGTTGGC 1139
|||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||.||||
Sbjct 1111 TATAAAAAACTTGGCTTCATTAATCACGTCAATCCTGCCATGGACTTCACACAGACCCCTCCTGGGATGCTGGC 1184
Query 1140 TCTGGACAACATGCTGTACTTTGCCAAGCACCACCAAGATGCCTACATCCGGATTGTGCTTGAGAACAGTAGTC 1213
||||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||.|
Sbjct 1185 TCTGGACAACATGCTGTATTTCGCTAAGCACCACCAGGATGCATACATCCGGATCGTGCTAGAGAACAGCAGCC 1258
Query 1214 GAGAAGACAAGCATGAATGTCCCTTTGGCCGCAGTAGTATAGAGCTGACCAAGATGCTATGTGAGATCTTGAAA 1287
|||||||.||.|||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||.|.|||
Sbjct 1259 GAGAAGATAAACATGAGTGCCCCTTCGGCCGCAGCAGTATAGAGCTGACCAAGATGCTGTGTGAGATCCTCAAA 1332
Query 1288 GTGGGCGAGTTGCCTAGTGAGACCTGCAACGACTTCCACCCGATGTTCTTCACCCACGACAGATCCTTTGAGGA 1361
|||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct 1333 GTGGGCGAGCTGCCTAGTGAGACCTGCAACGACTTTCACCCGATGTTCTTCACCCATGACAGATCTTTTGAGGA 1406
Query 1362 GTTTTTCTGCATCTGTATCCAGCTCCTGAACAAGACATGGAAGGAAATGAGGGCAACTTCTGAAGACTTCAACA 1435
.||.||||||||.||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1407 ATTCTTCTGCATTTGCATTCAACTCCTGAACAAAACATGGAAGGAAATGAGGGCAACATCTGAAGACTTCAACA 1480
Query 1436 AGGTAATGCAGGTGGTGAAGGAGCAGGTTATGAGAGCACTTACAACCAAGCCTAGCTCCCTGGACCAGTTCAAG 1509
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 1481 AGGTAATGCAGGTGGTGAAGGAGCAGGTTATGAGAGCGCTTACAACCAAGCCTAGTTCCCTGGACCAGTTCAAA 1554
Query 1510 AGCAAACTGCAGAACCTGAGCTACACTGAGATCCTGAAAATCCGCCAGTCCGAGAGGATGAACCAGGAAGATTT 1583
|||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 AGCAAGCTGCAAAACCTGAGCTACACCGAGATCCTGAAAATCCGCCAGTCTGAGAGGATGAACCAGGAAGATTT 1628
Query 1584 CCAGTCCCGCCCGATTTTGGAACTAAAGGAGAAGATTCAGCCAGAAATCTTAGAGCTGATCAAACAGCAACGCC 1657
||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||
Sbjct 1629 CCAGTCTCGCCCGATTTTGGAACTAAAGGAGAAGATCCAGCCAGAAATCTTAGAGCTGATTAAACAGCAGCGCC 1702
Query 1658 TGAACCGCCTTGTGGAAGGGACCTGCTTTAGGAAACTCAATGCCCGGCGGAGGCAAGACAAGTTTTGGTATTGT 1731
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 TGAACCGCCTTGTGGAAGGGACCTGCTTTAGGAAACTCAATGCTCGCCGGAGACAAGACAAGTTTTGGTATTGT 1776
Query 1732 CGGCTTTCGCCAAATCACAAAGTCCTGCATTACGGAGACTTAGAAGAGAGTCCTCAGGGAGAAGTGCCCCACGA 1805
||||||||.|||||||||||.|||.|.|||||.||.|||||.||||||||.||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 1777 CGGCTTTCACCAAATCACAAGGTCTTACATTATGGCGACTTGGAAGAGAGCCCCCAAGGAGAAGTGCCCCACGA 1850
Query 1806 TTCCTTGCAGGACAAACTGCCGGTGGCAGATATCAAAGCCGTGGTGACGGGAAAGGACTGCCCTCATATGAAAG 1879
||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 TTCCCTGCAGGACAAATTGCCGGTGGCAGATATCAAAGCAGTGGTGACGGGAAAGGACTGCCCTCATATGAAAG 1924
Query 1880 AGAAAGGTGCCCTTAAACAAAACAAGGAGGTGCTTGAACTCGCTTTCTCCATCTTGTATGACTCAAACTGCCAA 1953
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||
Sbjct 1925 AGAAAGGTGCCCTTAAACAAAACAAGGAGGTGCTTGAACTTGCTTTCTCCATCTTATACGACTCAAATTGCCAA 1998
Query 1954 CTGAACTTCATCGCTCCTGACAAGCATGAGTACTGTATCTGGACGGATGGACTGAATGCGCTACTCGGGAAGGA 2027
|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||.||.||||||||
Sbjct 1999 CTGAACTTCATTGCTCCTGATAAGCATGAGTACTGCATCTGGACAGATGGGCTGAATGCACTGCTTGGGAAGGA 2072
Query 2028 CATGATGAGCGACCTGACGCGGAATGACCTGGACACCCTGCTCAGCATGGAAATCAAGCTCCGCCTCCTGGACC 2101
|||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 2073 CATGATGAGTGACCTGACACGCAATGACCTGGACACCCTGCTGAGCATGGAGATCAAGCTTCGCCTGCTGGACC 2146
Query 2102 TGGAAAACATCCAGATCCCTGACGCACCTCCGCCGATTCCCAAGGAGCCCAGCAACTATGACTTCGTCTATGAC 2175
|||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 2147 TGGAAAACATCCAGATCCCGGATGCACCTCCGCCTATCCCCAAGGAACCTAGCAACTATGACTTTGTCTATGAC 2220
Query 2176 TGTAAC 2181
||||||
Sbjct 2221 TGTAAC 2226