Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000468049
• Subject: XM_017019416.2
• Aligned Length: 1572
• Identities: 1173
• Gaps: 399

Alignment

Query    1  ATGGCTGACTCAGAAGCACTCCCCTCCCTTGCTGGGGACCCAGTGGCTGTGGAAGCCTTGCTCCGGGCCGTGTT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  TGGGGTTGTTGTGGATGAGGCCATTCAGAAAGGAACCAGTGTCTCCCAGAAGGTCTGTGAGTGGAAGGAGCCTG  148
                          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                      
Sbjct    1  --------------ATGAGGCCATTCAGAAAGGAACCAGTGTCTCCCAGAAG----------------------  38

Query  149  AGGAGCTGAAGCAGCTGCTGGATTTGGAGCTGCGGAGCCAGGGCGAGTCACAGAAGCAGATCCTGGAGCGGTGT  222
                                                                                      
Sbjct   39  --------------------------------------------------------------------------  38

Query  223  CGGGCTGTGATTCGCTACAGTGTCAAGACTGGTCACCCTCGGTTCTTCAACCAGCTCTTCTCTGGGTTGGATCC  296
                                                                                      
Sbjct   39  --------------------------------------------------------------------------  38

Query  297  CCATGCTCTGGCCGGGCGCATTATCACTGAGAGCCTCAACACCAGCCAGTACACATATGAAATCGCCCCCGTGT  370
                                                            ||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   39  ------------------------------------------------GTACACATATGAAATCGCCCCCGTGT  64

Query  371  TTGTGCTCATGGAAGAGGAGGTGCTGAGGAAACTGCGGGCCCTGGTGGGCTGGAGCTCTGGGGACGGAATCTTC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   65  TTGTGCTCATGGAAGAGGAGGTGCTGAGGAAACTGCGGGCCCTGGTGGGCTGGAGCTCTGGGGACGGAATCTTC  138

Query  445  TGCCCTGGTGGCTCCATCTCCAACATGTATGCTGTAAATCTGGCCCGCTATCAGCGCTACCCGGATTGCAAGCA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  139  TGCCCTGGTGGCTCCATCTCCAACATGTATGCTGTAAATCTGGCCCGCTATCAGCGCTACCCGGATTGCAAGCA  212

Query  519  GAGGGGCCTCCGCACACTGCCGCCCCTGGCCCTATTCACATCGAAGGAG-------------------------  567
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                         
Sbjct  213  GAGGGGCCTCCGCACACTGCCGCCCCTGGCCCTATTCACATCGAAGGAGGTGGGGAAGAGGCACAGGCCCAACC  286

Query  568  ----------------------------TGTCACTACTCCATCCAGAAGGGAGCTGCGTTTCTGGGACTTGGCA  613
                                        ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  287  CTGGGCTCCTGATTCTAATCTCCAGCCATGTCACTACTCCATCCAGAAGGGAGCTGCGTTTCTGGGACTTGGCA  360

Query  614  CCGACAGTGTCCGAGTGGTCAAGGCTGATGAGAGAGGGAAAATGGTCCCCGAGGATCTGGAGAGGCAGATTGGT  687
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361  CCGACAGTGTCCGAGTGGTCAAGGCTGATGAGAGAGGGAAAATGGTCCCCGAGGATCTGGAGAGGCAGATTGGT  434

Query  688  ATGGCCGAGGCTGAG----------------------------------------GGTGCTGTGCCGTTCCTGG  721
            |||||||||||||||                                        |||||||||||||||||||
Sbjct  435  ATGGCCGAGGCTGAGGTTGACTTTTCACTTTTTTGAAACTTTTATTTTGGATTCAGGTGCTGTGCCGTTCCTGG  508

Query  722  TCAGTGCCACCTCTGGCACCACTGTGCTAGGGGCCTTTGACCCCCTGGAGGCAATTGCTGATGTGTGCCAGCGT  795
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  509  TCAGTGCCACCTCTGGCACCACTGTGCTAGGGGCCTTTGACCCCCTGGAGGCAATTGCTGATGTGTGCCAGCGT  582

Query  796  CATGGGCTATGGCTGCATGTGGATGCTGCCTGGGGTGGGAGCGTCCTGCTGTCACAGACACACAGGCATCTCCT  869
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  583  CATGGGCTATGGCTGCATGTGGATGCTGCCTGGGGTGGGAGCGTCCTGCTGTCACAGACACACAGGCATCTCCT  656

Query  870  GGATGGGATCCAGAGGGCTGACTCTGTGGCCTGGAATCCCCACAAGCTCCTCGCAGCAGGCCTGCAATGCTCTG  943
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  657  GGATGGGATCCAGAGGGCTGACTCTGTGGCCTGGAATCCCCACAAGCTCCTCGCAGCAGGCCTGCAATGCTCTG  730

Query  944  CACTTCTTCTCCAGGATACCTCGAACCTGCTCAAGCGCTGCCATGGGTCCCAGGCCAGCTACCTTTTCCAGCAG  1017
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  731  CACTTCTTCTCCAGGATACCTCGAACCTGCTCAAGCGCTGCCATGGGTCCCAGGCCAGCTACCTTTTCCAGCAG  804

Query 1018  GACAAGTTCTACGATGTGGCTCTGGACACGGGAGACAAGGTGGTGCAGTGTGGCCGCCGTGTGGACTGTCTGAA  1091
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  805  GACAAGTTCTACGATGTGGCTCTGGACACGGGAGACAAGGTGGTGCAGTGTGGCCGCCGTGTGGACTGTCTGAA  878

Query 1092  GCTGTGGCTCATGTGGAAGGCACAGGGCGATCAAGGGCTGGAGCGGCGCATCGACCAGGCCTTTGTCCTTGCCC  1165
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  879  GCTGTGGCTCATGTGGAAGGCACAGGGCGATCAAGGGCTGGAGCGGCGCATCGACCAGGCCTTTGTCCTTGCCC  952

Query 1166  GGTACCTGGTGGAGGAAATGAAGAAGCGGGAAGGGTTTGAGCTAGTCATGGAGCCTGAGTTTGTCAATGTGTGT  1239
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  953  GGTACCTGGTGGAGGAAATGAAGAAGCGGGAAGGGTTTGAGCTAGTCATGGAGCCTGAGTTTGTCAATGTGTGT  1026

Query 1240  TTCTGGTTCGTACCCCCCAGCCTGCGAGGGAAGCAGGAGAGTCCAGATTACCACGAAAGGCTGTCAAAGGTGGC  1313
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1027  TTCTGGTTCGTACCCCCCAGCCTGCGAGGGAAGCAGGAGAGTCCAGATTACCACGAAAGGCTGTCAAAGGTGGC  1100

Query 1314  CCCCGTGCTCAAGGAGCGCATGGTGAAGGAGGGCTCCATGATGATTGGCTACCAGCCCCACGGGACCCGGGGCA  1387
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1101  CCCCGTGCTCAAGGAGCGCATGGTGAAGGAGGGCTCCATGATGATTGGCTACCAGCCCCACGGGACCCGGGGCA  1174

Query 1388  ACTTCTTCCGTGTGGTTGTGGCCAACTCTGCACTGACCTGTGCTGATATGGACTTCCTCCTCAACGAGCTGGAG  1461
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1175  ACTTCTTCCGTGTGGTTGTGGCCAACTCTGCACTGACCTGTGCTGATATGGACTTCCTCCTCAACGAGCTGGAG  1248

Query 1462  CGGCTAGGCCAGGACCTG  1479
            ||||||||||||||||||
Sbjct 1249  CGGCTAGGCCAGGACCTG  1266