Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000468140
• Subject: NM_001177759.1
• Aligned Length: 594
• Identities: 484
• Gaps: 30

Alignment

Query   1  ATGCACTCCGAAGCAGAAGAATCCAAGGAAGTGGCCACAGATGTCTTTAATTCCAAAAACCTGGCCGTTCAGGC  74
                                         .||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ------------------------------ATGGCTACAGATGTCTTCAATTCCAAAAACCTGGCCGTTCAGGC  44

Query  75  ACAAAAGAAGATCTTGGGTAAAATGGTGTCCAAATCCATCGCCACCACCTTAATAGACGACACAAGTAGTGAGG  148
           |||||||||||||.||||.||||||||.||||||||||||||||||||..|.||.||||||||.||.||.||||
Sbjct  45  ACAAAAGAAGATCCTGGGCAAAATGGTATCCAAATCCATCGCCACCACGCTGATCGACGACACCAGCAGCGAGG  118

Query 149  TGCTGGACGAGCTCTACAGAGTGACCAGGGAGTACACCCAAAACAAGAAGGAGGCAGAGAAGATCATCAAGAAC  222
           ||||.||.|||||.|||||.|||||||.||||||||||||.||||||||||||||.||||.|.|||||||||||
Sbjct 119  TGCTAGATGAGCTGTACAGGGTGACCAAGGAGTACACCCAGAACAAGAAGGAGGCGGAGAGGGTCATCAAGAAC  192

Query 223  CTCGTCAAGACAGTCATCAAGCTGGCCATTCTTTATAGGAATAATCAGTTTAATCAAGATGAGCTAGCATTGAT  296
           |||.|||||||.|||||||||||||||.|.||..|.|||||.||||||||.||||||||.|||||.||..|.||
Sbjct 193  CTCATCAAGACGGTCATCAAGCTGGCCGTCCTCCACAGGAACAATCAGTTCAATCAAGACGAGCTGGCGCTCAT  266

Query 297  GGAGAAATTTAAGAAGAAAGTTCATCAGCTTGCTATGACCGTGGTCAGTTTCCATCAGGTGGATTATACCTTTG  370
           ||||||.||.||||||||.||.||.||||||||.|||||.||.|||||.|||||.|||||.||.||.|||||.|
Sbjct 267  GGAGAAGTTCAAGAAGAAGGTGCACCAGCTTGCCATGACGGTCGTCAGCTTCCACCAGGTAGAGTACACCTTCG  340

Query 371  ACCGGAATGTGTTATCCAGGCTGTTAAATGAATGCAGAGAGATGCTGCACCAAATCATTCAGCGCCACCTCACT  444
           ||||.||||||.|.|||||||||.|.||.||.|||.|||||.|.||.|||.|.|||||||||||||||||.||.
Sbjct 341  ACCGCAATGTGCTGTCCAGGCTGCTGAACGAGTGCCGAGAGCTCCTACACGAGATCATTCAGCGCCACCTTACC  414

Query 445  GCCAAGTCACATGGACGGGTTAATAATGTCTTTGATCATTTTTCAGATTGTGAATTTTTGGCTGCCTTGTATAA  518
           ||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 415  GCCAAGTCTCACGGACGGGTTAATAATGTCTTTGACCATTTTTCAGATTGTGATTTTTTGGCTGCCTTGTACAA  488

Query 519  TCCTTTTGGGAATTTTAAACCCCACTTACAAAAACTATGTGATGGTATCAACAAAATGTTGGATGAAGAGAACA  592
           |||.|||||.||.||||||||.||||||||.|||||.||.||.||.||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 489  TCCCTTTGGAAAGTTTAAACCTCACTTACAGAAACTTTGCGACGGCATCAACAAAATGTTAGATGAAGAGAACA  562

Query 593  TA  594
           ||
Sbjct 563  TA  564