Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000468220
- Subject:
- XM_011249450.3
- Aligned Length:
- 1170
- Identities:
- 869
- Gaps:
- 213
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGAACACCTGGAGTGCTGCGTACGACGCTGTCCTTGACAGAAATGTGGCCATTAAGAAGCTCAGCAGACCCTT 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 CCAGAACCAAACTCACGCCAAGAGGGCTTACCGGGAGCTGGTCCTCATGAAGTGTGTGAACCATAAAAACATTA 148
Query 1 -----------------------------------------------------------------ATGGAACTG 9
|||||||||
Sbjct 149 TTAGCTTATTAAATGTTTTTACACCCCAGAAAACACTGGAGGAGTTCCAAGATGTCTACTTAGTGATGGAACTG 222
Query 10 ATGGATGCCAACTTATGTCAAGTGATTCAGATGGAATTAGACCATGAGCGAATGTCTTACCTGCTGTACCAAAT 83
|||||.||||||.|.|||||.||||||||||||||..|.|||||.|||||.|||||||||.||||||||||.||
Sbjct 223 ATGGACGCCAACCTGTGTCAGGTGATTCAGATGGAGCTGGACCACGAGCGGATGTCTTACTTGCTGTACCAGAT 296
Query 84 GTTGTGTGGCATTAAGCACCTCCATTCTGCTGGAATTATTCACAGGGATTTAAAACCAAGTAACATTGTAGTCA 157
|.||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 297 GCTGTGTGGCATCAAGCACCTCCACTCCGCTGGGATCATCCACAGGGACTTAAAACCCAGTAACATTGTAGTCA 370
Query 158 AGTCTGATTGCACATTGAAAATCCTGGACTTTGGACTGGCCAGGACAGCAGGCACAAGCTTCATGATGACTCCA 231
||||||||||||||.||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.
Sbjct 371 AGTCTGATTGCACACTGAAAATCCTCGACTTCGGACTGGCCAGGACAGCGGGTACAAGCTTCATGATGACTCCG 444
Query 232 TATGTGGTGACACGTTATTACAGAGCCCCTGAGGTCATCCTGGGGATGGGCTACAAGGAGAACGTGGATATATG 305
|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 445 TATGTGGTGACGCGATATTACAGAGCCCCTGAGGTCATCCTGGGCATGGGCTACAAGGAGAACGTGGACATATG 518
Query 306 GTCTGTGGGATGCATTATGGGAGAAATGGTTCGCCACAAAATCCTCTTTCCAGGAAGGGACTATATTGACCAGT 379
|||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GTCTGTGGGATGCATCATGGGAGAAATGGTTCGCCACAAAATCCTCTTTCCCGGAAGGGACTATATTGACCAGT 592
Query 380 GGAATAAGGTAATTGAACAACTAGGAACACCATGTCCAGAATTCATGAAGAAATTGCAACCCACAGTAAGAAAC 453
||||.||.||.||.||.||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||
Sbjct 593 GGAACAAAGTCATCGAGCAGCTAGGAACTCCGTGTCCAGAGTTCATGAAGAAATTGCAGCCCACAGTCAGAAAC 666
Query 454 TATGTGGAGAATCGGCCCAAGTATGCGGGACTCACCTTCCCCAAACTCTTCCCAGATTCCCTCTTCCCAGCGGA 527
||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TACGTGGAGAATCGGCCCAAGTACGCAGGACTCACCTTCCCCAAGCTCTTTCCAGATTCCCTCTTCCCAGCGGA 740
Query 528 CTCCGAGCACAATAAACTCAAAGCCAGCCAAGCCAGGGACTTGTTGTCAAAGATGCTAGTGATTGACCCAGCAA 601
.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||.||||||||||||||||.|
Sbjct 741 TTCTGAGCACAATAAACTTAAAGCCAGCCAAGCCAGGGATTTGTTGTCTAAGATGTTAGTGATTGACCCAGCGA 814
Query 602 AAAGAATATCAGTGGACGACGCCTTACAGCATCCCTACATCAACGTCTGGTATGACCCAGCCGAAGTGGAGGCG 675
|.||.|||||.|||||||||||..|.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||||||
Sbjct 815 AGAGGATATCGGTGGACGACGCACTGCAGCATCCGTACATCAACGTTTGGTACGACCCGGCTGAAGTGGAGGCG 888
Query 676 CCTCCACCTCAGATATATGACAAGCAGTTGGATGAAAGAGAACACACAATTGAAGAATGGAAAGAACTTATCTA 749
|||||.||||||||||||||.||||||.||||||||||.||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CCTCCGCCTCAGATATATGATAAGCAGCTGGATGAAAGGGAGCACACCATCGAAGAATGGAAAGAACTTATCTA 962
Query 750 CAAGGAAGTAATGAATTCAGAAGAAAAGACTAAAAATGGTGTAGTAAAAGGACAGCCTTCTCCTTCAGGTGCAG 823
||||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||
Sbjct 963 CAAGGAGGTAATGAACTCAGAAGAGAAGACTAAGAATGGCGTAGTCAAAGGCCAGCCCTCGCCTTCAGGTGCAG 1036
Query 824 CAGTGAACAGCAGTGAGAGTCTCCCTCCATCCTCGTCTGTCAATGACATCTCCTCCATGTCCACCGACCAGACC 897
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CAGTGAACAGCAGTGAGAGTCTCCCTCCATCCTCGTCTGTCAACGACATCTCCTCCATGTCCACCGACCAGACC 1110
Query 898 CTGGCATCTGACACTGACAGCAGCCTGGAAGCCTCGGCAGGACCCCTGGGTTGTTGCAGG 957
||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||..||||||||||||||
Sbjct 1111 CTCGCATCTGACACTGACAGCAGCCTGGAGGCCTCGGCGGGACCGTTGGGTTGTTGCAGG 1170