Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000468489
• Subject: NM_001288752.2
• Aligned Length: 1380
• Identities: 1056
• Gaps: 321

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGAGCCTGATGCTGGATGACCAACCCCCTATGGAGGCCCAGTATGCAGAGGAGGGCCCAGGACCTGGGATCTT  74

Query    1  -------------------------------ATGATTGATGTTTCTCAGGCGGTGTGCTGGCGTTCCATGCGAC  43
                                           |         ||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CAGAGCAGAGCCTGGAGACCAGCAGCATCCCA---------TTTCTCAGGCAGTGTGCTGGCGTTCCATGCGAC  139

Query   44  GTGGCTGTGCAGTGCTGGGAGCCCTGGGGCTGCTGGCCGGTGCAGGTGTTGGCTCATGGCTCCTAGTGCTGTAT  117
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  140  GTGGCTGTGCAGTGCTGGGAGCCCTGGGGCTGCTGGCCGGTGCAGGTGTTGGCTCATGGCTCCTAGTGCTGTAT  213

Query  118  CTGTGTCCTGCTGCCTCTCAGCCCATTTCCGGGACCTTGCAGGATGAGGAGATAACTTTGAGCTGCTCAGAGGC  191
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  214  CTGTGTCCTGCTGCCTCTCAGCCCATTTCCGGGACCTTGCAGGATGAGGAGATAACTTTGAGCTGCTCAGAGGC  287

Query  192  CAGCGCTGAGGAAGCTCTGCTCCCTGCACTTCCCAAAACAGTATCTTTCAGAATAAACAGCGAAGACTTCTTGC  265
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  288  CAGCGCTGAGGAAGCTCTGCTCCCTGCACTTCCCAAAACAGTATCTTTCAGAATAAACAGCGAAGACTTCTTGC  361

Query  266  TGGAAGCGCAAGTGAGGGATCAGCCACGCTGGCTCCTGGTCTGCCATGAGGGCTGGAGCCCCGCCCTGGGGCTG  339
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  362  TGGAAGCGCAAGTGAGGGATCAGCCACGCTGGCTCCTGGTCTGCCATGAGGGCTGGAGCCCCGCCCTGGGGCTG  435

Query  340  CAGATCTGCTGGAGCCTTGGGCATCTCAGACTCACTCACCACAAGGGAGTAAACCTCACTGACATCAAACTCAA  413
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  436  CAGATCTGCTGGAGCCTTGGGCATCTCAGACTCACTCACCACAAGGGAGTAAACCTCACTGACATCAAACTCAA  509

Query  414  CAGTTCCCAGGAGTTTGCTCAGCTCTCTCCTAGACTGGGAGGCTTCCTGGAGGAGGCGTGGCAGCCCAGGAACA  487
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
Sbjct  510  CAGTTCCCAGGAGTTTGCTCAGCTCTCTCCTAGACTGGGAGGCTTCCTGGAGGAGGCGTGGCAGCC--------  575

Query  488  ACTGCACTTCTGGTCAAGTTGTTTCCCTCAGATGCTCTGAGTGTGGAGCGAGGCCCCTGGCTTCCCGGATAGTT  561
                                                                                      
Sbjct  576  --------------------------------------------------------------------------  575

Query  562  GGTGGGCAGTCTGTGGCTCCTGGGCGCTGGCCGTGGCAGGCCAGCGTGGCCCTGGGCTTCCGGCACACGTGTGG  635
                                                                                      
Sbjct  576  --------------------------------------------------------------------------  575

Query  636  GGGCTCTGTGCTAGCGCCACGCTGGGTGGTGACTGCTGCACATTGTATGCACAGTTTCAGGCTGGCCCGCCTGT  709
                                                               |||||||||||||||||||||||
Sbjct  576  ---------------------------------------------------CAGTTTCAGGCTGGCCCGCCTGT  598

Query  710  CCAGCTGGCGGGTTCATGCGGGGCTGGTCAGCCACAGTGCCGTCAGGCCCCACCAAGGGGCTCTGGTGGAGAGG  783
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  599  CCAGCTGGCGGGTTCATGCGGGGCTGGTCAGCCACAGTGCCGTCAGGCCCCACCAAGGGGCTCTGGTGGAGAGG  672

Query  784  ATTATCCCACACCCCCTCTACAGTGCCCAGAATCATGACTACGACGTCGCCCTCCTGAGGCTCCAGACCGCTCT  857
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  673  ATTATCCCACACCCCCTCTACAGTGCCCAGAATCATGACTACGACGTCGCCCTCCTGAGGCTCCAGACCGCTCT  746

Query  858  CAACTTCTCAGACACTGTGGGCGCTGTGTGCCTGCCGGCCAAGGAACAGCATTTTCCGAAGGGCTCGCGGTGCT  931
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  747  CAACTTCTCAGACACTGTGGGCGCTGTGTGCCTGCCGGCCAAGGAACAGCATTTTCCGAAGGGCTCGCGGTGCT  820

Query  932  GGGTGTCTGGCTGGGGCCACACCCACCCTAGCCATACTTACAGCTCGGATATGCTCCAGGACACGGTGGTGCCC  1005
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  821  GGGTGTCTGGCTGGGGCCACACCCACCCTAGCCATACTTACAGCTCGGATATGCTCCAGGACACGGTGGTGCCC  894

Query 1006  CTGCTCAGCACTCAGCTCTGCAACAGCTCTTGCGTGTACAGCGGAGCCCTCACCCCCCGCATGCTTTGCGCTGG  1079
            .||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  895  TTGTTCAGCACTCAGCTCTGCAACAGCTCTTGCGTGTACAGCGGAGCCCTCACCCCCCGCATGCTTTGCGCTGG  968

Query 1080  CTACCTGGACGGAAGGGCTGATGCATGCCAGGGAGATAGCGGGGGCCCCCTAGTGTGCCCAGATGGGGACACAT  1153
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  969  CTACCTGGACGGAAGGGCTGATGCATGCCAGGGAGATAGCGGGGGCCCCCTAGTGTGCCCAGATGGGGACACAT  1042

Query 1154  GGCGCCTAGTGGGGGTGGTCAGCTGGGGGCGTGGCTGCGCAGAGCCCAATCACCCAGGTGTCTACGCCAAGGTA  1227
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1043  GGCGCCTAGTGGGGGTGGTCAGCTGGGGGCGTGGCTGCGCAGAGCCCAATCACCCAGGTGTCTACGCCAAGGTA  1116

Query 1228  GCTGAGTTTCTGGACTGGATCCATGACACTGCTCAGGACTCCCTCCTC  1275
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1117  GCTGAGTTTCTGGACTGGATCCATGACACTGCTCAGGACTCCCTCCTC  1164