Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000468616
• Subject: NM_145393.4
• Aligned Length: 1737
• Identities: 1662
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGTCGGCCAGCAGCCTCTTGGAGCAGAGACCAAAAGGTCAAGGAAACAAAGTACAAAATGGATCTGTACATCA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct    1  ATGTCGGCCAGCAGCCTCTTGGAGCAGAGACCAAAAGGTCAAGGAAACAAAGTACAAAATGGTTCTGTGCATCA  74

Query   75  AAAGGATGGATTAAACGATGATGATTTTGAACCTTACTTGAGTCCACAGGCAAGGCCCAATAATGCATATACTG  148
            ||||||||||.||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct   75  AAAGGATGGACTAAATGATGATGATTTCGAACCTTACTTGAGCCCACAGGCAAGGCCGAATAATGCATATACTG  148

Query  149  CCATGTCAGATTCCTACTTACCCAGTTACTACAGTCCCTCCATTGGCTTCTCCTATTCTTTGGGTGAAGCTGCT  222
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCATGTCAGACTCCTACTTACCCAGTTACTACAGCCCCTCCATTGGCTTTTCCTATTCTTTGGGTGAAGCTGCT  222

Query  223  TGGTCTACGGGGGGTGACACAGCCATGCCCTACTTAACTTCTTATGGACAGCTGAGCAACGGAGAGCCCCACTT  296
            ||||||||.||.||||||||||||||||||||..||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TGGTCTACTGGAGGTGACACAGCCATGCCCTATCTAACTTCTTATGGACAACTGAGCAACGGAGAGCCCCACTT  296

Query  297  CCTACCAGATGCAATGTTTGGGCAACCAGGAGCCCTAGGTAGCACTCCATTTCTTGGTCAGCATGGTTTTAATT  370
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCTACCAGATGCAATGTTTGGGCAACCAGGAGCCCTAGGTAGCACTCCATTTCTTGGTCAGCATGGTTTTAATT  370

Query  371  TCTTTCCCAGTGGGATTGACTTCTCAGCATGGGGAAATAACAGTTCTCAGGGACAGTCTACTCAGAGCTCTGGA  444
            |.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  371  TTTTTCCCAGTGGGATTGACTTCTCAGCATGGGGAAATAACAGTTCTCAGGGACAGTCTACTCAAAGCTCTGGA  444

Query  445  TATAGTAGCAATTATGCTTATGCACCTAGCTCCTTAGGTGGAGCCATGATTGATGGACAGTCAGCTTTTGCCAA  518
            ||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TATAGTAGCAATTACGCTTATGCACCCAGCTCCTTAGGTGGAGCCATGATTGATGGACAGTCAGCTTTTGCCAA  518

Query  519  TGAGACCCTCAATAAGGCTCCTGGCATGAATACTATAGACCAAGGGATGGCAGCACTGAAGTTGGGTAGCACAG  592
            |||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|.||||||||||
Sbjct  519  TGAGACCCTCAATAAAGCTCCAGGCATGAATACTATAGACCAAGGGATGGCAGCACTGAAACTAGGTAGCACAG  592

Query  593  AAGTTGCAAGCAATGTTCCAAAAGTTGTAGGTTCTGCTGTTGGTAGCGGGTCCATTACTAGTAACATCGTGGCT  666
            ||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct  593  AAGTTGCAAGCAGTGTTCCAAAAGTTGTAGGCTCTGCTGTTGGTAGTGGGTCCATCACTAGTAACATTGTGGCT  666

Query  667  TCCAATAGTTTGCCTCCAGCCACCATTGCTCCTCCAAAACCAGCATCTTGGGCTGATATTGCTAGCAAGCCTGC  740
            ||.|..||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TCTAGCAGTTTGCCTCCAGCTACTATTGCTCCTCCAAAACCAGCATCTTGGGCTGATATTGCTAGCAAGCCTGC  740

Query  741  AAAACAGCAACCTAAACTGAAGACCAAGAATGGCATTGCAGGGTCAAGTCTTCCGCCACCCCCGATAAAGCATA  814
            ||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct  741  AAAACAACAGCCTAAACTGAAGACCAAGAATGGCATTGCAGGATCAAGTCTTCCACCACCCCCAATAAAGCATA  814

Query  815  ACATGGATATTGGAACTTGGGATAACAAGGGTCCCGTTGCAAAAGCCCCCTCACAGGCTTTGGTTCAGAATATA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  815  ACATGGATATTGGAACTTGGGATAACAAGGGTCCTGTGGCAAAAGCCCCCTCACAGGCTTTGGTTCAAAATATA  888

Query  889  GGTCAGCCAACCCAGGGGTCTCCTCAGCCTGTAGGTCAGCAGGCTAACAATAGCCCACCAGTGGCTCAGGCATC  962
            |||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GGTCAGCCAACCCAGGGATCTCCTCAGCCTGTTGGACAGCAGGCCAATAATAGCCCACCAGTGGCTCAGGCATC  962

Query  963  AGTAGGGCAACAGACACAGCCATTGCCTCCACCTCCACCACAGCCTGCCCAGCTTTCAGTCCAGCAACAGGCAG  1036
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGTAGGGCAACAGACGCAGCCATTGCCTCCACCTCCACCACAGCCTGCTCAGCTCTCAGTCCAGCAACAGGCAG  1036

Query 1037  CTCAGCCAACCCGCTGGGTAGCACCTCGGAACCGTGGCAGTGGGTTCGGTCATAATGGGGTGGATGGTAATGGA  1110
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CTCAGCCAACTCGCTGGGTAGCACCTCGGAACCGTGGCAGTGGGTTCGGTCATAATGGGGTGGATGGTAATGGA  1110

Query 1111  GTAGGACAGTCTCAGGCTGGTTCTGGATCTACTCCTTCAGAACCCCACCCAGTGTTGGAGAAGCTTCGGTCCAT  1184
            |||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1111  GTAGGACAGTCTCAGGCGGGTTCTGGATCTACTCCTTCAGAGCCTCACCCGGTGTTGGAGAAACTTCGGTCCAT  1184

Query 1185  TAATAACTATAACCCCAAAGATTTTGACTGGAATCTGAAACATGGCCGGGTTTTCATCATTAAGAGCTACTCTG  1258
            |||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TAATAACTATAACCCTAAAGATTTCGACTGGAATCTGAAACATGGCCGGGTTTTCATCATTAAGAGCTACTCTG  1258

Query 1259  AGGACGATATTCACCGTTCCATTAAGTATAATATTTGGTGCAGCACAGAGCATGGTAACAAGAGACTGGATGCT  1332
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1259  AGGACGATATCCACCGTTCCATTAAGTATAATATCTGGTGCAGCACAGAGCATGGTAACAAGAGACTGGATGCC  1332

Query 1333  GCTTATCGTTCCATGAACGGGAAAGGCCCCGTTTACTTACTTTTCAGTGTCAACGGCAGTGGACACTTCTGTGG  1406
            ||.||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GCCTATCGTTCCATGAATGGGAAGGGTCCCGTGTACTTACTTTTCAGTGTCAACGGCAGTGGACACTTCTGTGG  1406

Query 1407  CGTGGCAGAAATGAAATCTGCTGTGGACTACAACACATGTGCAGGTGTGTGGTCCCAGGACAAATGGAAGGGTC  1480
            .||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  AGTTGCAGAGATGAAATCTGCTGTGGACTACAACACATGTGCAGGTGTGTGGTCCCAGGACAAATGGAAGGGTC  1480

Query 1481  GTTTTGATGTCAGGTGGATTTTTGTGAAGGACGTTCCCAATAGCCAACTGCGACACATTCGCCTAGAGAACAAC  1554
            ||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1481  GTTTCGATGTCAGATGGATTTTTGTGAAGGACGTTCCCAATAGCCAACTGCGACACATTCGTCTAGAGAACAAC  1554

Query 1555  GAGAATAAACCAGTGACCAACTCTAGGGACACTCAGGAAGTGCCTCTGGAAAAGGCTAAGCAGGTGTTGAAAAT  1628
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GAGAATAAACCAGTGACCAACTCTAGGGACACTCAGGAAGTGCCTCTGGAAAAAGCTAAGCAGGTGTTGAAAAT  1628

Query 1629  TATAGCCAGCTACAAGCACACCACTTCCATTTTTGATGACTTCTCACACTATGAGAAACGCCAAGAGGAAGAAG  1702
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CATAGCCAGCTACAAGCACACCACTTCCATTTTTGATGACTTCTCACACTATGAGAAACGCCAAGAGGAAGAAG  1702

Query 1703  AAAGTGTTAAAAAGGAACGTCAAGGTCGTGGGAAA  1737
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  AAAGTGTTAAAAAGGAACGTCAAGGTCGTGGGAAA  1737