Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000468698
• Subject: XM_017005177.1
• Aligned Length: 1436
• Identities: 1246
• Gaps: 172

Alignment

Query    1  ATGACAGGGCTCGTGTCCCTGTCATATTTTCCACTCTCCACGAGGTCCTGCGCGCTTCAATCCTGCAGCCCGGT  74
                                                                       ||          || 
Sbjct    1  -----------------------------------------------------------AT----------GG-  4

Query   75  TTGGGGATGTGGTCCTTGCTGCTCTGCGGGTTGTCCATCGCCCTTCCACTGTCTGTCACAGCAGGACTGTAACG  148
              |||||              |||.| |.||           ||.|||.||  |||.|.|  |.||||||||||
Sbjct    5  --GGGGA--------------CTCAG-GAGT-----------CTACCAATG--TGTTATA--AAGACTGTAACG  46

Query  149  AGATTAAAGGGGAGCGGTTCACTGTTTTGGAAACCAGGCTTTTGGTGAGCAATGTCTCGGCAGAGGACAGAGGG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   47  AGATTAAAGGGGAGCGGTTCACTGTTTTGGAAACCAGGCTTTTGGTGAGCAATGTCTCGGCAGAGGACAGAGGG  120

Query  223  AACTACGCGTGTCAAGCCATACTGACACACTCAGGGAAGCAGTACGAGGTTTTAAATGGCATCACTGTGAGCAT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  121  AACTACGCGTGTCAAGCCATACTGACACACTCAGGGAAGCAGTACGAGGTTTTAAATGGCATCACTGTGAGCAT  194

Query  297  TAAAAGAGCTGGATATGGAGGAAGTGTCCCTAAAATCATTTATCCAAAAAATCATTCAATTGAAGTACAGCTTG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  195  TAAAAGAGCTGGATATGGAGGAAGTGTCCCTAAAATCATTTATCCAAAAAATCATTCAATTGAAGTACAGCTTG  268

Query  371  GTACCACTCTGATTGTGGACTGCAATGTAACAGACACCAAGGATAATACAAATCTACGATGCTGGAGAGTCAAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  269  GTACCACTCTGATTGTGGACTGCAATGTAACAGACACCAAGGATAATACAAATCTACGATGCTGGAGAGTCAAT  342

Query  445  AACACTTTGGTGGATGATTACTATGATGAATCCAAACGAATCAGAGAAGGGGTGGAAACCCATGTCTCTTTTCG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  343  AACACTTTGGTGGATGATTACTATGATGAATCCAAACGAATCAGAGAAGGGGTGGAAACCCATGTCTCTTTTCG  416

Query  519  GGAACATAATTTGTACACAGTAAACATCACCTTCTTGGAAGTGAAAATGGAAGATTATGGCCTTCCTTTCATGT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  417  GGAACATAATTTGTACACAGTAAACATCACCTTCTTGGAAGTGAAAATGGAAGATTATGGCCTTCCTTTCATGT  490

Query  593  GCCACGCTGGAGTGTCCACAGCATACATTATATTACAGCTCCCAGCTCCGGATTTTCGAGCTTACTTGATAGGA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  491  GCCACGCTGGAGTGTCCACAGCATACATTATATTACAGCTCCCAGCTCCGGATTTTCGAGCTTACTTGATAGGA  564

Query  667  GGGCTTATCGCCTTGGTGGCTGTGGCTGTGTCTGTTGTGTACATATACAACATTTTTAAGATCGACATTGTTCT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  565  GGGCTTATCGCCTTGGTGGCTGTGGCTGTGTCTGTTGTGTACATATACAACATTTTTAAGATCGACATTGTTCT  638

Query  741  TTGGTATCGAAGTGCCTTCCATTCTACAGAGACCATAGTAGATGGGAAGCTGTATGACGCCTATGTCTTATACC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  639  TTGGTATCGAAGTGCCTTCCATTCTACAGAGACCATAGTAGATGGGAAGCTGTATGACGCCTATGTCTTATACC  712

Query  815  CCAAGCCCCACAAGGAAAGCCAGAGGCATGCCGTGGATGCCCTGGTGTTGAATATCCTGCCCGAGGTGTTGGAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  713  CCAAGCCCCACAAGGAAAGCCAGAGGCATGCCGTGGATGCCCTGGTGTTGAATATCCTGCCCGAGGTGTTGGAG  786

Query  889  AGACAATGTGGATATAAGTTGTTTATATTCGGCAGAGATGAATTCCCTGGACAAGCCGTGGCCAATGTCATCGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  787  AGACAATGTGGATATAAGTTGTTTATATTCGGCAGAGATGAATTCCCTGGACAAGCCGTGGCCAATGTCATCGA  860

Query  963  TGAAAACGTTAAGCTGTGCAGGAGGCTGATTGTCATTGTGGTCCCCGAATCGCTGGGCTTTGGCCTGTTGAAGA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  861  TGAAAACGTTAAGCTGTGCAGGAGGCTGATTGTCATTGTGGTCCCCGAATCGCTGGGCTTTGGCCTGTTGAAGA  934

Query 1037  ACCTGTCAGAAGAACAAATCGCGGTCTACAGTGCCCTGATCCAGGACGGGATGAAGGTTATTCTCATTGAGCTG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  935  ACCTGTCAGAAGAACAAATCGCGGTCTACAGTGCCCTGATCCAGGACGGGATGAAGGTTATTCTCATTGAGCTG  1008

Query 1111  GAGAAAATCGAGGACTACACAGTCATGCCAGAGTCAATTCAGTACATCAAACAGAAGCATGGTGCCATCCGGTG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1009  GAGAAAATCGAGGACTACACAGTCATGCCAGAGTCAATTCAGTACATCAAACAGAAGCATGGTGCCATCCGGTG  1082

Query 1185  GCATGGGGACTTCACGGAGCAGTCACAGTGTATGAAGACCAAGTTTTGGAAGACAGTGAGATACCACATGCCGC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1083  GCATGGGGACTTCACGGAGCAGTCACAGTGTATGAAGACCAAGTTTTGGAAGACAGTGAGATACCACATGCCGC  1156

Query 1259  CCAGAAGGTGTCGGCCGTTTCCTCCGGTCCAGCTGCTGCAGCACACACCTTGCTACCGCACCGCAGGCCCAGA-  1331
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   .|| 
Sbjct 1157  CCAGAAGGTGTCGGCCGTTTCCTCCGGTCCAGCTGCTGCAGCACACACCTTGCTACCGCACCGCAGG---TGAG  1227

Query 1332  -------------ACTAGG---CTCAAGAA--GAAAGAAGTGTACT---------------CTCACGACTGGC-  1371
                         ||.|||   .|||.|.|  | |.|.||.|| ||               |||||..||||. 
Sbjct 1228  CGGGTGGGAGGACACGAGGTTTGTCACGCACTG-ATGGAGGGT-CTATCATTGCGTGGTGGCTCACAGCTGGAG  1299

Query 1372  ------------------------------  1371
                                          
Sbjct 1300  GAGGACACGTTTCATCGGGGCCGTCTGCTC  1329