Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000468757
• Subject: XM_006520897.2
• Aligned Length: 3453
• Identities: 2940
• Gaps: 159

Alignment

Query    1  ATGTCCCGGCGAAAGCAAAAGGAACCCCGGCAGATCAAACGGCCGCTTGAAGATGCCATTGAAGATGAGGAAGA  74
            |||||||||||||||||.|...||||||||||||||||||                                  
Sbjct    1  ATGTCCCGGCGAAAGCAGAGTAAACCCCGGCAGATCAAAC----------------------------------  40

Query   75  AGAATGTCCATCAGAGGAAACAGACATCATCTCCAAAGGAGACTTTCCATTGGAGGAAAGCTTTTCCACAGAAT  148
                                                                                      
Sbjct   41  --------------------------------------------------------------------------  40

Query  149  TTGGGCCTGAAAATCTGAGCTGCGAAGAAGTGGAATACTTTTGTAACAAAGGTGATGATGAAGGAATCCAGGAG  222
                                                               |||||||.|||||||||||||||
Sbjct   41  ---------------------------------------------------GTGATGACGAAGGAATCCAGGAG  63

Query  223  ACAGCAGAATCAGATGGGGACACACAGTCAGAGAAACCGGGGCAACCTGGAGTTGAGACAGACGACTGGGATGG  296
            .|||||||||||||||||||||..||.|||||.|||||.||.||.|||||.||.||||||||.|||||||||||
Sbjct   64  CCAGCAGAATCAGATGGGGACAGCCATTCAGACAAACCAGGACAGCCTGGGGTAGAGACAGATGACTGGGATGG  137

Query  297  ACCAGGAGAGCTGGAGGTGTTTCAGAAAGATGGGGAACGAAAAATTCAGAGTCGACAGCAACTTCCAGTGGGAA  370
            ||||||||||||.||.||||||||||.||||||.|||.|.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct  138  ACCAGGAGAGCTAGAAGTGTTTCAGAGAGATGGAGAAAGGAAGATTCAGAGTCGGCAGCAACTTCCGGTGGGAA  211

Query  371  CAACCTGGGGGCCGTTTCCTGGGAAGATGGACTTGAATAATAATTCTTTGAAGACAAAGGCTCAGGTCCCAATG  444
            ||||||||||.||.|||.|||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||
Sbjct  212  CAACCTGGGGCCCTTTTGCTGGGAAGATGGACTTGAACAATAATTCCTTGAAGACGAAGGCTCAGGTCCCCATG  285

Query  445  GTGCTGACTGCTGGTCCCAAGTGGTTGCTGGATGTGACTTGGCAAGGAGTGGAAGACAACAAAAACAACTGCAT  518
            |||||||||||||||||.||.|||.|.|||||||||||.|||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct  286  GTGCTGACTGCTGGTCCTAAATGGCTTCTGGATGTGACATGGCAAGGAGTGGAAGACAGCAAAAACAACTGCAT  359

Query  519  TGTGTACAGCAAAGGGGGTCAGCTTTGGTGTACAACTACGAAGGCCATCTCTGAGGGTGAAGAGCTAATTGCCT  592
            ||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||||..|.||||
Sbjct  360  TGTGTACAGCAAAGGGGGCCAACTTTGGTGCACCACAACGAAGGCCATCTCAGAGGGTGAAGAGCTCGTCGCCT  433

Query  593  TTGTGGTGGATTTTGACTCAAGGCTACAAGCTGCCAGTCAGATGACTCTCACAGAAGGGATGTACCCTGCACGC  666
            ||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct  434  TTGTGGTGGACTTTGACTCAAGGCTACAAGCTGCTAGTCACATGACTCTCACCGAAGGGATGTACCCTGCCCGC  507

Query  667  CTGCTGGACTCAATTCAGCTGCTTCCTCAGCAAGCTGCCATGGCTTCTATTTTGCCCACAGCTATTGTCAATAA  740
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  508  CTGCTGGACTCGATTCAGCTGCTTCCTCAGCAAGCTGCCATGGCTTCTATTTTGCCTACAGCTATTGTCAATAA  581

Query  741  GGATATATTCCCTTGCAAGTCCTGTGGCATCTGGTATCGGAGTGAGCGGAATCTGCAGGCCCATTTGATGTACT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||
Sbjct  582  GGATATATTCCCTTGCAAGTCCTGTGGCATCTGGTACCGGAGCGAGCGGAACCTGCAAGCCCATTTGATGTACT  655

Query  815  ACTGCAGTGGGAGGCAAAGAGAAGCTGCTCCGGTGTCAGAGGAAAATGAAGACAGTGCCCATCAGATTTCCAGC  888
            ||||.||||||||||||.|||||||||||||.||||||||.|||||||||||||...|.||||||.||||||||
Sbjct  656  ACTGTAGTGGGAGGCAACGAGAAGCTGCTCCAGTGTCAGAAGAAAATGAAGACAACTCGCATCAGGTTTCCAGC  729

Query  889  CTGTGCCCCTTCCCACAGTGCACCAAGAGCTTTTCAAATGCTCGAGCTCTAGAAATGCACCTGAATTCACACAG  962
            |||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  730  CTGTGCCCCTTCCCACAATGCACCAAGAGCTTTTCCAATGCCCGAGCTCTAGAAATGCACCTGAATTCACACAG  803

Query  963  TGGAGTGAAAATGGAAGAATTCCTGCCCCCTGGTGCTAGTCTAAAATGCACCGTCTGTAGCTACACTGCTGATT  1036
            |||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.|||.||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  804  TGGTGTGAAAATGGAAGAGTTCCTGCCCCCTGGGGCGAGTTTAAAATGCACGGTCTGTAGCTACACTGCTGATT  877

Query 1037  CCGTGATCAACTTTCACCAACACCTGTTCTCCCATCTCACTCAAGCTGCCTTCCGATGTAATCACTGCCATTTC  1110
            |.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||.
Sbjct  878  CTGTGATCAACTTCCACCAACACCTGTTCTCGCATCTCACTCAAGCCGCCTTCCGATGCAACCACTGCCATTTT  951

Query 1111  GGCTTCCAGACTCAGAGGGAGTTATTGCAGCACCAGGAGCTCCATGTCCCTAGCGGCAAACTTCCCAGAGAAAG  1184
            |||||.|||||.|||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct  952  GGCTTTCAGACCCAGAGGGAGCTACTGCAGCACCAGGAGCTCCATGTCCCCAGTGGCAAACTTCCCAGAGAAAG  1025

Query 1185  TGACATGGAACACTCTCCAAGTGCAACTGAAGACAGCTTACAGCCAGCCACAGACTTATTGACCAGAAGCGAAC  1258
            |||||||||.|||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||.||.|
Sbjct 1026  TGACATGGAGCACTCTCCAAGTGGAACGGAAGACAGCTTACAGCCAGCCACAGACTTGTTGGCCAGAAGTGACC  1099

Query 1259  TTCCCCAGAGCCAAAAGGCCATGCAGACTAAAGATGCGAGCTCTGACACAGAGCTGGACAAGTGTGAGAAAAAG  1332
            |..|||||||||||||||||||||.||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1100  TCTCCCAGAGCCAAAAGGCCATGCCGACTAAGGATGCAAGCTCAGACACAGAGCTGGACAAGTGTGAGAAAAAG  1173

Query 1333  ACTCAGCTCTTTCTCACGAACCAGAGACCAGAGATACAGCCTACAACAAATAAACAAAGCTTTTCTTACACAAA  1406
            |||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||.||||||.||.|.||.||.||||.|||.|||||||||||
Sbjct 1174  ACTCAACTCTTCCTCACCAATCAGAGACCAGAGATCCAGCCTGCAGCCAACAAGCAAAACTTCTCTTACACAAA  1247

Query 1407  AATAAAGTCTGAGCCCTCTAGCCCAAGACTTGCCTCATCTCCAGTTCAGCCTAATATTGGGCCTTCTTTCCCTG  1480
            ||||||||||||||||||.||.||.|||||.||||||||||||||.||.||.||.||.|||||.||||||||||
Sbjct 1248  AATAAAGTCTGAGCCCTCCAGTCCCAGACTCGCCTCATCTCCAGTGCAACCCAACATCGGGCCCTCTTTCCCTG  1321

Query 1481  TGGGCCCTTTCCTATCTCAGTTTTCTTTCCCCCAAGATATCACCATGGTCCCTCAAGCTTCAGAGATCTTAGCT  1554
            ||||.||||||||.|||||||||.||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.
Sbjct 1322  TGGGACCTTTCCTGTCTCAGTTTGCTTTTCCCCAAGATATCACGATGGTCCCTCAGGCTTCAGAGATCTTGGCG  1395

Query 1555  AAGATGTCTGAACTGGTGCATCGGCGACTGAGGCATGGCAGTAGTAGCTACCCTCCCGTCATTTACAGCCCTTT  1628
            ||||||||.||.||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 1396  AAGATGTCCGAGCTGGTGCACCGTCGACTGAGGCATGGGAGTAGTAGCTACCCTCCTGTGATTTACAGCCCTTT  1469

Query 1629  GATGCCCAAGGGGGCTACTTGTTTTGAGTGTAACATAACATTCAATAATTTGGATAATTATCTAGTGCACAAAA  1702
            |||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||
Sbjct 1470  GATGCCCAAAGGGGCTACGTGCTTTGAGTGTAACATAACATTCAATAATTTGGATAACTATCTAGTTCATAAAA  1543

Query 1703  AGCATTATTGCAGCAGCCGATGGCAGCAGATGGCTAAGTCCCCAGAGTTCCCTAGTGTGTCAGAAAAGATGCCT  1776
            ||||.||.|||||||||.||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||.|||||.||.|||||.||||||
Sbjct 1544  AGCACTACTGCAGCAGCAGATGGCAGCAGATGGCCAAATCCCCTGAGTTTCCAAGTGTTTCTGAAAAAATGCCT  1617

Query 1777  GAAGCTTTGAGTCCCAACACTGGCCAAACCTCCATAAACCTTCTCAACCCAGCTGCTCATTCTGCTGATCCTGA  1850
            ||.|||.|||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.||||||||..|.||.||.||
Sbjct 1618  GAGGCTGTGAGTCCTAACACTGGCCAGACTTCCATAAACCTTCTTAACCCAGCCGCTCATTCATCGGACCCAGA  1691

Query 1851  GAATCCACTTCTTCAAACATCTTGCATCAATTCTTCCACTGTCTTAGATTTAATTGGGCCAAATGGGAAGGGCC  1924
            |||.|||||.|||||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||.|||||.||||
Sbjct 1692  GAACCCACTCCTTCAAACATCCTGCATCAACTCTTCCACCGTTTTAGATTTGATTGGGCCAAACGGGAAAGGCC  1765

Query 1925  ATGACAAGGACTTTTCCACTCAAACTAAGAAGCTCTCCACCTCCAGTAACAATGATGACAAAATTAATGGAAAA  1998
            ||||.||||||||||||||||||...||.|||.|..|||||||||..|..|.|||.||||||||.||.|||||.
Sbjct 1766  ATGAGAAGGACTTTTCCACTCAAGTCAAAAAGTTGCCCACCTCCAACAGTAGTGACGACAAAATAAACGGAAAG  1839

Query 1999  CCTGTTGATGTGAAAAATCCCAGTGTCCCCTTAGTGGATGGGGAAAGTGACCCAAATAAGACTACCTGTGAAGC  2072
            |||||||||||||||||||||||.|..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1840  CCTGTTGATGTGAAAAATCCCAGCGGTCCCTTAGTGGATGGGGAAAGTGACCCAAATAAGACTACCTGTGAAGC  1913

Query 2073  TTGCAACATTACCTTCAGCCGGCACGAAACATACATGGTCCACAAACAGTATTACTGTGCTACACGCCACGACC  2146
            |||.|||||.|||||.|||.||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||
Sbjct 1914  TTGTAACATCACCTTTAGCAGGCATGAAACCTATATGGTCCACAAACAGTATTACTGTGCAACACGCCATGACC  1987

Query 2147  CTCCACTGAAGAGGTCTGCTTCCAACAAAGTGCCTGCCATGCAGAGAACCATGCGCACACGCAAGCGCAGAAAG  2220
            ||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1988  CTCCGCTAAAGAGGTCTGCTTCCAACAAAGTGCCGGCCATGCAGAGAACCATGCGCACACGCAAGCGAAGAAAG  2061

Query 2221  ATGTATGAGATGTGCCTACCTGAGCAGGAACAAAGGCCTCCACTGGTTCAGCAGAGATTTCTTGACGTAGCCAA  2294
            |||||.||.|||||||||||||||||||||||..||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 2062  ATGTACGAAATGTGCCTACCTGAGCAGGAACAGCGGCCGCCCCTGGTCCAGCAGAGATTTCTTGATGTAGCCAA  2135

Query 2295  CCTCAATAATCCTTGTACCTCCACTCAAGAACCCACAGAAGGGCTAGGAGAGTGCTACCACCCAAGATGTGATA  2368
            |||.|..||||||||||.||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|
Sbjct 2136  CCTAAGCAATCCTTGTAGCTCCACTCAAGAGCCCACCGAAGGGCTAGGAGAATGCTACCACCCAAGATGCGACA  2209

Query 2369  TCTTTCCAGGAATTGTCTCTAAACACTTGGAAACTTCTCTGACGATCAACAAGTGTGTTCCAGTTTCCAAATGT  2442
            ||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||..||.|.||.|||||.||||||||.|||.||||.|||
Sbjct 2210  TCTTCCCAGGAATTGTCTCTAAGCACTTGGAAACATCATTGGCCATGAACAAATGTGTTCCGGTTCCCAAGTGT  2283

Query 2443  GATACTACTCATTCCAGTGTTTCCTGCCTAGAGATGGACGTGCCCATAGATCTCAGCAAAAAGTGTTTATCTCA  2516
            ||.||.||.|||||||.||||||||||.|.||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 2284  GACACGACCCATTCCAATGTTTCCTGCTTGGAGATGGATGTCCCTATAGATCTCAGCAAAAAGTGTTTATCGCA  2357

Query 2517  GTCTGAGCGGACGACCACGTCTCCCAAAAGGCTGCTGGACTATCACGAGTGCACTGTGTGCAAGATCAGTTTCA  2590
            |||||||||||||||..|.|||||.||.|||||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct 2358  GTCTGAGCGGACGACAGCATCTCCTAAGAGGCTACTAGACTACCACGAGTGCACAGTGTGCAAGATCAGCTTCA  2431

Query 2591  ATAAGGTAGAAAACTATCTGGCCCACAAGCAGAATTTCTGCCCGGTTACTGCACATCAGCGTAATGACCTGGGT  2664
            |||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2432  ATAAGGTCGAGAACTATCTGGCGCACAAGCAGAATTTCTGCCCTGTCACTGCACATCAGCGTAATGACCTGGGT  2505

Query 2665  CAACTGGACGGCAAAGTGTTTCCGAATCCAGAAAGCGAACGAAACAGCCCTGATGTCAGCTACGAAAGAAGCAT  2738
            ||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|.|||||||||.|||||||..|||||||.|||
Sbjct 2506  CAGCTTGATGGTAAAGTGTTTCCGAATCCAGAAAGTGAACGGAGCAGCCCTGAAGTCAGCTTTGAAAGAAACAT  2579

Query 2739  AATAAAATGTGAGAAAAATGGGAATTTGAAGCAGCCTTCCCCCAATGGAAACTTATTTTCATCCCACCTAGCAA  2812
            .||.|||||||||||.|||||||||...|||||.||.||.|||||.|||||.||.||||||||||||.|.||||
Sbjct 2580  GATCAAATGTGAGAAGAATGGGAATCCAAAGCAACCATCTCCCAACGGAAATTTGTTTTCATCCCACTTGGCAA  2653

Query 2813  CCCTGCAAGGCTTGAAGGTCTTTAGTGAAGCTGCTCAGCTCATTGCTACAAAAGAAGAAAACAGACATTTGTTT  2886
            ||.||||||||.||||.|||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 2654  CCTTGCAAGGCCTGAAAGTCTTCAGCGAAGCAGCTCAGCTCATTGCTACAAAAGAAGAAAACAAACATTTGTTT  2727

Query 2887  CTTCCACAATGCCTTTACCCTGGAGCAATAGCGAAAGCAAAAGGAGCCGACCAGCTTTCTCCATATTATGGAAT  2960
            |||||.||||||||||||||||||||||||..|||..||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||
Sbjct 2728  CTTCCCCAATGCCTTTACCCTGGAGCAATAAAGAAGACAAAAGGAGCTGACCAACTTTCTCCATACTATGGGAT  2801

Query 2961  CAAGCCAAGTGATTATATTTCTGGTTCTCTTGTCATCCATAACACTGACATCGAGCAAAGCAGAAATGCAGAAA  3034
            .||||||||.||||||||..|..||||||||||||||||.|||||||||.||||.|||||||.||||.||||||
Sbjct 2802  AAAGCCAAGCGATTATATCGCCAGTTCTCTTGTCATCCACAACACTGACGTCGAACAAAGCACAAATACAGAAA  2875

Query 3035  ATGAATCTCCTAAAGGCCAGGCTTCCTCAAATGGGTGTGCTGCGCTGAAGAAAGATTCTCTGCCATTGTTGCCC  3108
            ||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|..|..|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2876  ATGAATCTCCTAAAGGCCAGGCCTCCTCAAATGGGTGTGCCGTACCCAAGAAAGATTCTCTGCCATTGTTGCCC  2949

Query 3109  AAAAATCGAGGAATGGTAATAGTGAATGGTGGACTGAAACAAGATGAGAGACCTGCTGCCAACCCACAGCAAGA  3182
            |||||..||||.|||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.||||||.|.|||||||||||||||||
Sbjct 2950  AAAAACAGAGGCATGGTCATAGTGAATGGTGGACTCAAGCAAGATGAAAGACCTACGGCCAACCCACAGCAAGA  3023

Query 3183  GAACATTTCCCAGAATCCTCAGCACGAAGACGACCACAAATCTCCCTCGTGGATCTCTGAGAACCCATTAGCTG  3256
            ||||||||||||||||.|.|||||||||||.|.|||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3024  GAACATTTCCCAGAATACCCAGCACGAAGATGGCCACAAATCCCCTTCGTGGATCTCTGAGAACCCATTAGCTG  3097

Query 3257  CCAATGAGAATGTCTCACCAGGAATTCCCTCAGCAGAGGAACAGTTGTCTAGTATAGCAAAAGGTGTGAATGGT  3330
            |.||||||||||||||.|||||||||||||..|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.
Sbjct 3098  CAAATGAGAATGTCTCCCCAGGAATTCCCTGCGCAGAAGAACAGTTGTCTAGCATAGCAAAAGGTGTGAATGGC  3171

Query 3331  TCCAGCCAGGCTCCAACCAGTGGGAAATATTGCCGGCTATGTGATATCCAGTTCAACAACCTTTCAAACTTTAT  3404
            .|||||||||||||.|.||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||.|||||.||||||||
Sbjct 3172  GCCAGCCAGGCTCCCAGCAGTGGAAAATACTGCCGGCTATGCGATATTCAGTTCAATAATCTTTCGAACTTTAT  3245

Query 3405  AACTCACAAGAAGTTTTATTGCTCATCACATGCAGCAGAACATGTCAAA  3453
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3246  AACTCACAAGAAGTTTTATTGCTCATCACATGCAGCAGAACATGTCAAA  3294