Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000468758
• Subject: NM_001277294.1
• Aligned Length: 3228
• Identities: 2838
• Gaps: 48

Alignment

Query    1  ATGATAGCTGTCTCTTTTAAATGCCGTTGTCAAATTCTGAGGCGACTTACTAAAGATGAGAGTCCCTACACTAA  74
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGATAGCTGTCTCTTTTAAATGCCGCTGTCAAATTCTAAGGCGACTTACCAAAGATGAGAGTCCCTACACTAA  74

Query   75  ATCCGCCAGCCAGACAAAGCCGCCTGATGGAGCGTTGGCTGTGAGGAGACAGAGCATCCCAGAGGAATTCAAGG  148
            |||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  ATCTGCCAGCCAGACAAAGCCGCCCGATGGAGCATTGGCTGTGAGGAGACAGAGCATCCCAGAGGAATTCAAGG  148

Query  149  GCTCCACAGTCGTCGAGCTGATGAAGAAGGAAGGCACTACCCTGGGTCTGACGGTATCGGGAGGAATTGATAAG  222
            ||||||||||.||.|||.|||||||||||||.||.||.||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct  149  GCTCCACAGTGGTGGAGTTGATGAAGAAGGAGGGAACCACTCTTGGCCTGACGGTATCGGGAGGCATTGATAAA  222

Query  223  GATGGCAAGCCAAGAGTATCTAATCTGCGGCAAGGAGGAATTGCTGCTAGAAGTGACCAGCTGGATGTGGGTGA  296
            |||||||||||||||||.||.||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  223  GATGGCAAGCCAAGAGTGTCCAACCTGCGGCAGGGAGGAATCGCTGCCAGAAGTGACCAGCTGGATGTGGGCGA  296

Query  297  CTACATCAAAGCAGTGAATGGAATCAACCTGGCCAAATTCCGCCATGACGAGATCATCAGCTTGCTGAAGAATG  370
            |||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||.|||||||.||||
Sbjct  297  CTACATCAAGGCGGTGAATGGGATCAACCTGGCCAAGTTCCGCCACGATGAGATCATCAGCCTGCTGAAAAATG  370

Query  371  TGGGAGAAAGAGTGGTTCTTGAAGTAGAGTACGAGCTTCCACCGGTCTCTGTGCAAGGATCAAGTGTTATTTTC  444
            |.||.|||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||
Sbjct  371  TCGGGGAAAGAGTGGTCCTGGAGGTCGAGTACGAGCTTCCACCGGTCTCTGTACAAGGATCCAGTGTTATGTTC  444

Query  445  CGAACAGTGGAGGTCACATTACATAAAGAAGGCAATACCTTTGGTTTTGTAATTCGAGGGGGAGCACATGATGA  518
            |||||.|||||||||||..|.||.|||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||
Sbjct  445  CGAACTGTGGAGGTCACGCTGCACAAAGAAGGCAACACCTTTGGTTTTGTCATCCGAGGGGGAGCGCATGATGA  518

Query  519  TAGAAATAAATCTCGTCCAGTTGTGATAACATGTGTTCGTCCTGGAGGGCCTGCTGACAGAGAGGGCACGATCA  592
            .||.||.||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  519  CAGGAACAAGTCCCGTCCGGTTGTGATAACCTGTGTTCGTCCTGGAGGGCCTGCTGACAGAGAGGGCACCATCA  592

Query  593  AACCCGGTGACAGGTTGCTCAGTGTGGATGGAATTCGGCTTCTTGGAACTACGCATGCTGAAGCCATGAGTATT  666
            ||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||.||.||||||||.||.
Sbjct  593  AACCTGGAGACAGGTTGCTCAGCGTGGATGGAATTCGGCTCCTGGGAACCACCCATGCCGAGGCCATGAGCATC  666

Query  667  CTTAAACAATGTGGACAAGAAGCAGCACTGCTGATAGAATATGATGTCTCAGTAATGGACTCTGTGGCAACAGC  740
            ||||||||.||.|||||||||||..|.||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||.|||||
Sbjct  667  CTTAAACAGTGCGGACAAGAAGCCACGCTGCTGATAGAATACGATGTCTCTGTGATGGATTCTGTGGCGACAGC  740

Query  741  ATCCGGGCCACTACTAGTCGAAGTTGCCAAAACTCCTGGTGCCAGCCTTGGGGTTGCCCTAACTACCTCGATGT  814
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||..|||
Sbjct  741  ATCCGGGCCACTACTAGTTGAAGTTGCCAAAACTCCAGGTGCCAGCCTTGGGGTTGCCCTAACTACCTCCGTGT  814

Query  815  GCTGTAACAAACAAGTCATTGTCATAGACAAAATCAAATCTGCAAGTATTGCAGACAGATGTGGCGCATTGCAT  888
            ||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||..|.||.
Sbjct  815  GCTGTAACAAGCAGGTCATTGTCATAGACAAAATCAAATCTGCAAGCATTGCGGACAGATGTGGCGCGCTACAC  888

Query  889  GTGGGAGATCACATCCTCTCCATCGATGGAACCAGCATGGAGTACTGTACACTTGCAGAAGCAACCCAGTTCCT  962
            ||||||||.||||||||||||||.||.||.||.||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||
Sbjct  889  GTGGGAGACCACATCCTCTCCATTGACGGCACGAGTATGGAGTACTGTACCCTCGCAGAAGCGACCCAGTTCCT  962

Query  963  GGCCAACACCACTGACCAGGTCAAGCTTGAGATCCTTCCCCATCATCAGACCCGGCTGGCCCTAAAGGGGCCCG  1036
            ||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||.||.|
Sbjct  963  GGCCAATACCACTGACCAGGTCAAGCTGGAGATTCTCCCACACCATCAGACCCGCCTGGCCCTAAAGGGCCCTG  1036

Query 1037  ACCATGCAGCTTTGGTGTCTTCATCCTTCTCTCCTACCTCCATGAGTGCATACAGCCTGAGTTCCCTGAACATG  1110
            |||||||.|||.|||||.|.|||||   .||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ACCATGCGGCTATGGTGCCCTCATC---TTCTCCTACCTCCATGAGTGCGTACAGTCTGAGTTCCCTGAACATG  1107

Query 1111  GGGACTCTACCTCGAAGCCTCTACTCCACCAGCCCACGTGGAACCATGATGAGGAGGAGACTGAAAAAGAAAGA  1184
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1108  GGGACTTTACCTCGAAGCCTCTACTCCACCAGCCCACGAGGAACCATGATGAGGAGGAGACTGAAAAAGAAAGA  1181

Query 1185  CTTCAAAAGCTCATTGTCCTTAGCCTCCAGCACAGTAGGATTGGCTGGGCAGGTTGTTCACACAGAAACCACAG  1258
            |||||||||||||.||||.||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||.||||||||.||||||||||
Sbjct 1182  CTTCAAAAGCTCACTGTCTTTAGCCTCCAGCACTGTGGGGTTGGCTGGCCAGGTCGTTCACACTGAAACCACAG  1255

Query 1259  AGGTTGTGCTGACGGCAGATCCTGTCACAGGATTTGGGATCCAACTGCAGGGCAGTGTGTTTGCCACAGAAACT  1332
            ||||||||||||||||.||.||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||.
Sbjct 1256  AGGTTGTGCTGACGGCTGACCCTGTCACGGGCTTCGGAATCCAACTGCAGGGCAGCGTGTTTGCCACAGAGACG  1329

Query 1333  CTCTCTTCTCCACCTCTGATTTCCTATATCGAAGCTGACAGCCCAGCAGAGAGATGTGGGGTGCTACAGATTGG  1406
            |||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1330  CTCTCCTCTCCGCCTCTGATTTCCTATATTGAAGCTGACAGCCCAGCAGAGAGATGTGGTGTGCTACAGATTGG  1403

Query 1407  AGACAGAGTGATGGCCATCAATGGAATTCCAACAGAAGACAGCACCTTCGAAGAAGCCAGTCAGCTCCTCCGAG  1480
            |||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||.|||.|||||..|||
Sbjct 1404  AGACAGAGTCATGGCCATTAATGGAATCCCAACAGAAGACAGCACCTTCGAGGAAGCCAATCAACTCCTGAGAG  1477

Query 1481  ACTCTTCAATCACGAGCAAGGTCACACTGGAAATCGAGTTTGATGTTGCAGAGTCTGTCATCCCAAGTAGTGGA  1554
            |||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1478  ACTCTTCCATCACGAGCAAAGTCACACTAGAAATCGAGTTTGATGTTGCAGAGTCTGTCATCCCAAGTAGTGGA  1551

Query 1555  ACATTTCATGTAAAGCTGCCTAAGAAGCACAATGTGGAACTTGGAATAACCATAAGTTCACCATCCAGTAGAAA  1628
            ||||||||||||||.|||||.||||||||||..||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct 1552  ACATTTCATGTAAAACTGCCCAAGAAGCACAGCGTGGAACTTGGAATAACCATCAGTTCGCCATCCAGTAGAAA  1625

Query 1629  ACCAGGAGACCCCCTCGTCATTTCAGATATCAAGAAAGGGAGTGTGGCACACAGAACTGGGACCCTGGAACTTG  1702
            |||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||.|
Sbjct 1626  ACCGGGGGACCCCCTTGTCATTTCAGATATCAAGAAAGGCAGTGTGGCACACAGAACCGGAACTCTGGAACTGG  1699

Query 1703  GGGATAAATTGCTCGCAATAGATAATATCCGGCTGGACAACTGTTCCATGGAAGATGCAGTTCAGATCCTCCAG  1776
            |.||.|||.||||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 1700  GAGACAAACTGCTTGCGATAGATAACATCCGGCTGGATAACTGTTCCATGGAAGATGCGGTCCAGATCCTCCAG  1773

Query 1777  CAATGTGAAGACCTGGTGAAGCTCAAAATCCGCAAAGATGAAGATAATTCAGATGAGCAAGAAAGTTCCGGAGC  1850
            ||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 1774  CAGTGTGAAGACCTGGTGAAGCTCAAAATCCGCAAAGATGAAGATAACTCAGACGAGCAAGAGAGTTCCGGAGC  1847

Query 1851  AATTATTTACACCGTGGAGCTTAAACGCTACGGGGGGCCCCTTGGCATCACAATTTCAGGAACTGAAGAGCCGT  1924
            .|||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 1848  GATTATTTACACGGTGGAGCTGAAGCGCTATGGGGGGCCCCTTGGCATCACAATTTCTGGAACTGAAGAGCCGT  1921

Query 1925  TTGATCCTATAATCATTTCAAGCCTCACTAAAGGGGGATTAGCTGAAAGAACTGGCGCAATCCACATAGGAGAC  1998
            ||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.|||||.
Sbjct 1922  TTGATCCTATTATCATCTCGAGCCTCACTAAAGGGGGATTAGCTGAAAGGACTGGAGCGATCCACATCGGAGAT  1995

Query 1999  CGAATCCTAGCCATCAATAGCAGCAGCTTGAAAGGGAAGCCTCTGAGTGAAGCCATCCATTTGTTACAGATGGC  2072
            .|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||.|.||||||||
Sbjct 1996  AGAATCCTAGCCATCAATAGCAGCAGCTTGAAGGGGAAGCCTCTGAGTGAAGCCATCCACTTGCTCCAGATGGC  2069

Query 2073  AGGAGAGACTGTCACCTTGAAAATTAAGAAACAGACAGATGCCCAGTCAGCATCGAGCCCCAAGAAGTTCCCTA  2146
            ||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||||||||||||||.|
Sbjct 2070  AGGAGAGACTGTCACCCTGAAAATTAAGAAACAGACAGATGCCCAATCTGCATCAAGTCCCAAGAAGTTCCCCA  2143

Query 2147  TTTCTAGCCATTTGAGTGACCTGGGGGATGTGGAGGAGGACTCCTCACCAGCACAGAAGCCAGGCAAGCTCTCC  2220
            |..||.||||.|.|.|.|||||.||.||||..|||||||||.||||.|||..||||||.||.||||||||||||
Sbjct 2144  TCCCTGGCCACTCGGGGGACCTAGGAGATGGTGAGGAGGACCCCTCCCCAATACAGAAACCTGGCAAGCTCTCC  2217

Query 2221  GACATGTACCCCTCCACGGTGCCCAGTGTGGACAGTGCTGTGGATTCATGGGATGGGTCTGCAATAGACACCAG  2294
            ||...|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||.||||||..||||
Sbjct 2218  GATGCGTACCCCTCCACGGTGCCCAGCGTGGACAGTGCTGTGGACTCCTGGGATGGGTCTGGAATAGATGCCAG  2291

Query 2295  CTATGGAACTGAAGGCACTAGTTTTCAGGCCTCAGGATACAATTTCAACACCTATGACTGGAGGAGTCCAAAAC  2368
            ||||||.|.|.|||||.|.|.|||||||.|.|||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 2292  CTATGGGAGTCAAGGCTCAACTTTTCAGACTTCAGGATACAATTACAACACCTATGATTGGAGGAGTCCAAAGC  2365

Query 2369  AGAGAGGCAGCTTGTCCCCAGTCACTAAGCCTCGAAGCCAGACTTACCCAGATGTGGGGCTGAGTTATGAAGAC  2442
            |.|||..||||.|||||||||||.|.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||.||||||||
Sbjct 2366  AAAGAACCAGCCTGTCCCCAGTCCCCAAGCCTCGAAGCCAGACGTACCCAGATGTGGGCCTGAGTAATGAAGAC  2439

Query 2443  TGGGACCGGTCCACAGCCAGTGGTTTTGCAGGGGCTGCCGATAGTGCAGAGACAGAACAAGAGGAGAACTTCTG  2516
            |||||.||.||||||||||||||.||||.|||||||.|.||.||||||||..|.|||||||||||.||||||||
Sbjct 2440  TGGGATCGATCCACAGCCAGTGGCTTTGTAGGGGCTTCTGACAGTGCAGATGCTGAACAAGAGGAAAACTTCTG  2513

Query 2517  GTCTCAAGCGCTGGAGGATTTGGAAACCTGCGGACAGTCAGGAATTCTGAGAGAACTGGAGGAGAAAGCTGACA  2590
            |||||||||..|||||||..||||.||||||||.|||||.||.||.||||||||.||.||              
Sbjct 2514  GTCTCAAGCATTGGAGGACCTGGAGACCTGCGGCCAGTCGGGGATCCTGAGAGAGCTTGA--------------  2573

Query 2591  GGCGTGTGTCTTTGAGAAACATGACTCTCTTGGCAACAATCATGTCGGGGAGCACGATGAGTTTGAATCATGAG  2664
                                           |||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||
Sbjct 2574  -------------------------------GGCAACAATCATGTCGGGGAGTACTATGAGTTTGAATCATGAG  2616

Query 2665  GCTCCAACACCTCGCAGTCAGCTGGGGCGACAGGCCAGCTTCCAGGAGCGCAGCAGCTCGCGGCCGCACTACAG  2738
            |||||||...|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||.|||||.||
Sbjct 2617  GCTCCAATGGCTCGCAGTCAGCTGGGGCGACAGGCCAGCTTCCAGGAACGGAGCAGTTCACGGCCACACTATAG  2690

Query 2739  CCAAACAACTCGGAGCAACACCCTGCCTTCAGATGTGGGTAGGAAGTCAGTAACCCTGAGAAAAATGAAACAAG  2812
            ||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.|||||||||.|.||||||||.||||
Sbjct 2691  CCAAACAACTCGCAGCAACACCCTGCCCTCAGACGTGGGCAGAAAGTCTGTAACCCTGCGGAAAATGAAGCAAG  2764

Query 2813  AAATAAAGGAGATCATGTCTCCAACTCCTGTGGAGCTGCACAAGGTGACCTTGTACAAGGACTCTGACATGGAG  2886
            |||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||
Sbjct 2765  AAATAAAGGAGATCATGTCCCCAACTCCGGTGGAGCTACACAAGGTGACCTTATACAAGGACTCTGGCATGGAG  2838

Query 2887  GACTTTGGGTTCAGTGTAGCAGATGGCTTACTGGAGAAAGGAGTGTATGTCAAAAATATTCGCCCAGCTGGGCC  2960
            |||||.|||||||||||.|||||||||.|.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 2839  GACTTCGGGTTCAGTGTGGCAGATGGCCTGCTGGAGAAAGGCGTGTATGTCAAAAATATCCGCCCAGCTGGGCC  2912

Query 2961  AGGAGATCTTGGTGGCTTAAAGCCCTATGACAGGCTCTTACAGGTGAATCATGTCCGAACCAGAGACTTTGACT  3034
            |||.|||.||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.||.|||||||||||||
Sbjct 2913  AGGTGATGTTGGGGGCTTGAAGCCCTACGACAGGCTCTTACAGGTAAATCACGTGCGGACGAGAGACTTTGACT  2986

Query 3035  GCTGCCTTGTTGTGCCCCTCATAGCAGAATCCGGGAATAAGCTGGACCTGGTTATTAGTAGAAACCCACTGGCT  3108
            |||||||.||.|||||.||||||||.|||||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.
Sbjct 2987  GCTGCCTGGTGGTGCCTCTCATAGCTGAATCTGGCAACAAGCTGGACCTGGTTATTAGCAGAAATCCACTGGCC  3060

Query 3109  TCACAGAAGTCTATAGACCAACAGAGTCTACCAGGAGATTGGAGTGAACAGAACAGTGCTTTTTTCCAGCAGCC  3182
            ||.||||||||.|||||.||.|.|..|||.||..|.||.|||||.|||||||||||.|||||.||||||||.||
Sbjct 3061  TCCCAGAAGTCGATAGAACAGCCGGCTCTGCCCAGCGACTGGAGCGAACAGAACAGCGCTTTCTTCCAGCAACC  3134

Query 3183  TAGCCACGGTGGTAATTTGGAGACACGAGAACCCACTAATACATTA  3228
            .|||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||.|||.||
Sbjct 3135  CAGCCACGGTGGTAATCTAGAGACACGAGAACCCACTAACACACTA  3180