Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000468758
- Subject:
- XM_006514242.3
- Aligned Length:
- 3402
- Identities:
- 2785
- Gaps:
- 270
Alignment
Query 1 ATGATAGCTGTCTCTTTTAAATGCCGTTGTCAAATTCTGAGGC--GACTTACTAAAGATGAGAGTCCCTACACT 72
|||||| ||| | ||||.||
Sbjct 1 --------------------ATGCCG--------------GGCTGG--------AAGAAGA------------- 19
Query 73 AAATCCGCCAGC--CAGACAAAGCCGCCTGATGGAGCGTTGGCTGTGAGGAGACAGAGCATCCCAGAGGAATTC 144
|.|||| |||.| |..|| |||| |..||||| |||||| .||||||||||
Sbjct 20 ACATCC-CCATCTGCTTAC-AAGC-----GGAGGAGC----------AGGAGA----------GAGAGGAATTC 66
Query 145 AAGGGCTCCACAGTCGTCGAGCTGATGAAGAAGGAAGGCACTACCCTGGGTCTGACGGTATCGGGAGGAATTGA 218
||||||||||||||.||.|||.|||||||||||||.||.||.||.||.||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct 67 AAGGGCTCCACAGTGGTGGAGTTGATGAAGAAGGAGGGAACCACTCTTGGCCTGACGGTATCGGGAGGCATTGA 140
Query 219 TAAGGATGGCAAGCCAAGAGTATCTAATCTGCGGCAAGGAGGAATTGCTGCTAGAAGTGACCAGCTGGATGTGG 292
|||.|||||||||||||||||.||.||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 141 TAAAGATGGCAAGCCAAGAGTGTCCAACCTGCGGCAGGGAGGAATCGCTGCCAGAAGTGACCAGCTGGATGTGG 214
Query 293 GTGACTACATCAAAGCAGTGAATGGAATCAACCTGGCCAAATTCCGCCATGACGAGATCATCAGCTTGCTGAAG 366
|.|||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||.|||||||.
Sbjct 215 GCGACTACATCAAGGCGGTGAATGGGATCAACCTGGCCAAGTTCCGCCACGATGAGATCATCAGCCTGCTGAAA 288
Query 367 AATGTGGGAGAAAGAGTGGTTCTTGAAGTAGAGTACGAGCTTCCACCGGTCTCTGTGCAAGGATCAAGTGTTAT 440
|||||.||.|||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct 289 AATGTCGGGGAAAGAGTGGTCCTGGAGGTCGAGTACGAGCTTCCACCGGTCTCTGTACAAGGATCCAGTGTTAT 362
Query 441 TTTCCGAACAGTGGAGGTCACATTACATAAAGAAGGCAATACCTTTGGTTTTGTAATTCGAGGGGGAGCACATG 514
.||||||||.|||||||||||..|.||.|||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||.||||
Sbjct 363 GTTCCGAACTGTGGAGGTCACGCTGCACAAAGAAGGCAACACCTTTGGTTTTGTCATCCGAGGGGGAGCGCATG 436
Query 515 ATGATAGAAATAAATCTCGTCCAGTTGTGATAACATGTGTTCGTCCTGGAGGGCCTGCTGACAGAGAGGGCACG 588
||||.||.||.||.||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 437 ATGACAGGAACAAGTCCCGTCCGGTTGTGATAACCTGTGTTCGTCCTGGAGGGCCTGCTGACAGAGAGGGCACC 510
Query 589 ATCAAACCCGGTGACAGGTTGCTCAGTGTGGATGGAATTCGGCTTCTTGGAACTACGCATGCTGAAGCCATGAG 662
||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||.||.||||||||
Sbjct 511 ATCAAACCTGGAGACAGGTTGCTCAGCGTGGATGGAATTCGGCTCCTGGGAACCACCCATGCCGAGGCCATGAG 584
Query 663 TATTCTTAAACAATGTGGACAAGAAGCAGCACTGCTGATAGAATATGATGTCTCAGTAATGGACTCTGTGGCAA 736
.||.||||||||.||.|||||||||||..|.||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||.|
Sbjct 585 CATCCTTAAACAGTGCGGACAAGAAGCCACGCTGCTGATAGAATACGATGTCTCTGTGATGGATTCTGTGGCGA 658
Query 737 CAGCATCCGGGCCACTACTAGTCGAAGTTGCCAAAACTCCTGGTGCCAGCCTTGGGGTTGCCCTAACTACCTCG 810
||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 659 CAGCATCCGGGCCACTACTAGTTGAAGTTGCCAAAACTCCAGGTGCCAGCCTTGGGGTTGCCCTAACTACCTCC 732
Query 811 ATGTGCTGTAACAAACAAGTCATTGTCATAGACAAAATCAAATCTGCAAGTATTGCAGACAGATGTGGCGCATT 884
.|||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||..|
Sbjct 733 GTGTGCTGTAACAAGCAGGTCATTGTCATAGACAAAATCAAATCTGCAAGCATTGCGGACAGATGTGGCGCGCT 806
Query 885 GCATGTGGGAGATCACATCCTCTCCATCGATGGAACCAGCATGGAGTACTGTACACTTGCAGAAGCAACCCAGT 958
.||.||||||||.||||||||||||||.||.||.||.||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||||
Sbjct 807 ACACGTGGGAGACCACATCCTCTCCATTGACGGCACGAGTATGGAGTACTGTACCCTCGCAGAAGCGACCCAGT 880
Query 959 TCCTGGCCAACACCACTGACCAGGTCAAGCTTGAGATCCTTCCCCATCATCAGACCCGGCTGGCCCTAAAGGGG 1032
||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 881 TCCTGGCCAATACCACTGACCAGGTCAAGCTGGAGATTCTCCCACACCATCAGACCCGCCTGGCCCTAAAGGGC 954
Query 1033 CCCGACCATG---------------------------------------------------------------- 1042
||.|||||||
Sbjct 955 CCTGACCATGTGAAAATTCAGAGGAGCGACAGACAACATCCCTGGGATGCCTGGGCCAGCAACCAGTGCGGCGT 1028
Query 1043 -------------------------------------------------------------------------- 1042
Sbjct 1029 TCATACCAACCATCACCATAACACGTACCACCCAGACCATTGCAGAGTGCCAGCCCTGACTTTCCCGAAAGCGC 1102
Query 1043 ------------------CAGCTTTGGTGTCTTCATCCTTCTCTCCTACCTCCATGAGTGCATACAGCCTGAGT 1098
|.|||.|||||.|.||||| .||||||||||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 1103 TTCCTCCAAACAGCCCTCCGGCTATGGTGCCCTCATC---TTCTCCTACCTCCATGAGTGCGTACAGTCTGAGT 1173
Query 1099 TCCCTGAACATGGGGACTCTACCTCGAAGCCTCTACTCCACCAGCCCACGTGGAACCATGATGAGGAGGAGACT 1172
||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1174 TCCCTGAACATGGGGACTTTACCTCGAAGCCTCTACTCCACCAGCCCACGAGGAACCATGATGAGGAGGAGACT 1247
Query 1173 GAAAAAGAAAGACTTCAAAAGCTCATTGTCCTTAGCCTCCAGCACAGTAGGATTGGCTGGGCAGGTTGTTCACA 1246
|||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||.||.||.||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 1248 GAAAAAGAAAGACTTCAAAAGCTCACTGTCTTTAGCCTCCAGCACTGTGGGGTTGGCTGGCCAGGTCGTTCACA 1321
Query 1247 CAGAAACCACAGAGGTTGTGCTGACGGCAGATCCTGTCACAGGATTTGGGATCCAACTGCAGGGCAGTGTGTTT 1320
|.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1322 CTGAAACCACAGAGGTTGTGCTGACGGCTGACCCTGTCACGGGCTTCGGAATCCAACTGCAGGGCAGCGTGTTT 1395
Query 1321 GCCACAGAAACTCTCTCTTCTCCACCTCTGATTTCCTATATCGAAGCTGACAGCCCAGCAGAGAGATGTGGGGT 1394
||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1396 GCCACAGAGACGCTCTCCTCTCCGCCTCTGATTTCCTATATTGAAGCTGACAGCCCAGCAGAGAGATGTGGTGT 1469
Query 1395 GCTACAGATTGGAGACAGAGTGATGGCCATCAATGGAATTCCAACAGAAGACAGCACCTTCGAAGAAGCCAGTC 1468
|||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||.||
Sbjct 1470 GCTACAGATTGGAGACAGAGTCATGGCCATTAATGGAATCCCAACAGAAGACAGCACCTTCGAGGAAGCCAATC 1543
Query 1469 AGCTCCTCCGAGACTCTTCAATCACGAGCAAGGTCACACTGGAAATCGAGTTTGATGTTGCAGAGTCTGTCATC 1542
|.|||||..||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1544 AACTCCTGAGAGACTCTTCCATCACGAGCAAAGTCACACTAGAAATCGAGTTTGATGTTGCAGAGTCTGTCATC 1617
Query 1543 CCAAGTAGTGGAACATTTCATGTAAAGCTGCCTAAGAAGCACAATGTGGAACTTGGAATAACCATAAGTTCACC 1616
||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||..||||||||||||||||||||.|||||.||
Sbjct 1618 CCAAGTAGTGGAACATTTCATGTAAAACTGCCCAAGAAGCACAGCGTGGAACTTGGAATAACCATCAGTTCGCC 1691
Query 1617 ATCCAGTAGAAAACCAGGAGACCCCCTCGTCATTTCAGATATCAAGAAAGGGAGTGTGGCACACAGAACTGGGA 1690
|||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|
Sbjct 1692 ATCCAGTAGAAAACCGGGGGACCCCCTTGTCATTTCAGATATCAAGAAAGGCAGTGTGGCACACAGAACCGGAA 1765
Query 1691 CCCTGGAACTTGGGGATAAATTGCTCGCAATAGATAATATCCGGCTGGACAACTGTTCCATGGAAGATGCAGTT 1764
|.||||||||.||.||.|||.||||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 1766 CTCTGGAACTGGGAGACAAACTGCTTGCGATAGATAACATCCGGCTGGATAACTGTTCCATGGAAGATGCGGTC 1839
Query 1765 CAGATCCTCCAGCAATGTGAAGACCTGGTGAAGCTCAAAATCCGCAAAGATGAAGATAATTCAGATGAGCAAGA 1838
||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 1840 CAGATCCTCCAGCAGTGTGAAGACCTGGTGAAGCTCAAAATCCGCAAAGATGAAGATAACTCAGACGAGCAAGA 1913
Query 1839 AAGTTCCGGAGCAATTATTTACACCGTGGAGCTTAAACGCTACGGGGGGCCCCTTGGCATCACAATTTCAGGAA 1912
.|||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1914 GAGTTCCGGAGCGATTATTTACACGGTGGAGCTGAAGCGCTATGGGGGGCCCCTTGGCATCACAATTTCTGGAA 1987
Query 1913 CTGAAGAGCCGTTTGATCCTATAATCATTTCAAGCCTCACTAAAGGGGGATTAGCTGAAAGAACTGGCGCAATC 1986
||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||
Sbjct 1988 CTGAAGAGCCGTTTGATCCTATTATCATCTCGAGCCTCACTAAAGGGGGATTAGCTGAAAGGACTGGAGCGATC 2061
Query 1987 CACATAGGAGACCGAATCCTAGCCATCAATAGCAGCAGCTTGAAAGGGAAGCCTCTGAGTGAAGCCATCCATTT 2060
|||||.|||||..|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 2062 CACATCGGAGATAGAATCCTAGCCATCAATAGCAGCAGCTTGAAGGGGAAGCCTCTGAGTGAAGCCATCCACTT 2135
Query 2061 GTTACAGATGGCAGGAGAGACTGTCACCTTGAAAATTAAGAAACAGACAGATGCCCAGTCAGCATCGAGCCCCA 2134
|.|.||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||||
Sbjct 2136 GCTCCAGATGGCAGGAGAGACTGTCACCCTGAAAATTAAGAAACAGACAGATGCCCAATCTGCATCAAGTCCCA 2209
Query 2135 AGAAGTTCCCTATTTCTAGCCATTTGAGTGACCTGGGGGATGTGGAGGAGGACTCCTCACCAGCACAGAAGCCA 2208
||||||||||.||..||.||||.|.|.|.|||||.||.||||..|||||||||.||||.|||..||||||.||.
Sbjct 2210 AGAAGTTCCCCATCCCTGGCCACTCGGGGGACCTAGGAGATGGTGAGGAGGACCCCTCCCCAATACAGAAACCT 2283
Query 2209 GGCAAGCTCTCCGACATGTACCCCTCCACGGTGCCCAGTGTGGACAGTGCTGTGGATTCATGGGATGGGTCTGC 2282
||||||||||||||...|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||.
Sbjct 2284 GGCAAGCTCTCCGATGCGTACCCCTCCACGGTGCCCAGCGTGGACAGTGCTGTGGACTCCTGGGATGGGTCTGG 2357
Query 2283 AATAGACACCAGCTATGGAACTGAAGGCACTAGTTTTCAGGCCTCAGGATACAATTTCAACACCTATGACTGGA 2356
||||||..||||||||||.|.|.|||||.|.|.|||||||.|.|||||||||||||.||||||||||||.||||
Sbjct 2358 AATAGATGCCAGCTATGGGAGTCAAGGCTCAACTTTTCAGACTTCAGGATACAATTACAACACCTATGATTGGA 2431
Query 2357 GGAGTCCAAAACAGAGAGGCAGCTTGTCCCCAGTCACTAAGCCTCGAAGCCAGACTTACCCAGATGTGGGGCTG 2430
||||||||||.||.|||..||||.|||||||||||.|.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||
Sbjct 2432 GGAGTCCAAAGCAAAGAACCAGCCTGTCCCCAGTCCCCAAGCCTCGAAGCCAGACGTACCCAGATGTGGGCCTG 2505
Query 2431 AGTTATGAAGACTGGGACCGGTCCACAGCCAGTGGTTTTGCAGGGGCTGCCGATAGTGCAGAGACAGAACAAGA 2504
|||.|||||||||||||.||.||||||||||||||.||||.|||||||.|.||.||||||||..|.||||||||
Sbjct 2506 AGTAATGAAGACTGGGATCGATCCACAGCCAGTGGCTTTGTAGGGGCTTCTGACAGTGCAGATGCTGAACAAGA 2579
Query 2505 GGAGAACTTCTGGTCTCAAGCGCTGGAGGATTTGGAAACCTGCGGACAGTCAGGAATTCTGAGAGAACTGGAGG 2578
|||.|||||||||||||||||..|||||||..||||.||||||||.|||||.||.||.||||||||.||.||||
Sbjct 2580 GGAAAACTTCTGGTCTCAAGCATTGGAGGACCTGGAGACCTGCGGCCAGTCGGGGATCCTGAGAGAGCTTGAGG 2653
Query 2579 AGAAAGCTGACAGGCGTGTGTCTTTGAGAAACATGACTCTCTTGGCAACAATCATGTCGGGGAGCACGATGAGT 2652
||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 2654 AGAAAGCTGACAGGCGTGTGTCATTGAGAAACATGACCCTCTTGGCAACAATCATGTCGGGGAGTACTATGAGT 2727
Query 2653 TTGAATCATGAGGCTCCAACACCTCGCAGTCAGCTGGGGCGACAGGCCAGCTTCCAGGAGCGCAGCAGCTCGCG 2726
|||||||||||||||||||...|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||.||
Sbjct 2728 TTGAATCATGAGGCTCCAATGGCTCGCAGTCAGCTGGGGCGACAGGCCAGCTTCCAGGAACGGAGCAGTTCACG 2801
Query 2727 GCCGCACTACAGCCAAACAACTCGGAGCAACACCCTGCCTTCAGATGTGGGTAGGAAGTCAGTAACCCTGAGAA 2800
|||.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||.|||||||||.|.|
Sbjct 2802 GCCACACTATAGCCAAACAACTCGCAGCAACACCCTGCCCTCAGACGTGGGCAGAAAGTCTGTAACCCTGCGGA 2875
Query 2801 AAATGAAACAAGAAATAAAGGAGATCATGTCTCCAACTCCTGTGGAGCTGCACAAGGTGACCTTGTACAAGGAC 2874
|||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 2876 AAATGAAGCAAGAAATAAAGGAGATCATGTCCCCAACTCCGGTGGAGCTACACAAGGTGACCTTATACAAGGAC 2949
Query 2875 TCTGACATGGAGGACTTTGGGTTCAGTGTAGCAGATGGCTTACTGGAGAAAGGAGTGTATGTCAAAAATATTCG 2948
||||.||||||||||||.|||||||||||.|||||||||.|.|||||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct 2950 TCTGGCATGGAGGACTTCGGGTTCAGTGTGGCAGATGGCCTGCTGGAGAAAGGCGTGTATGTCAAAAATATCCG 3023
Query 2949 CCCAGCTGGGCCAGGAGATCTTGGTGGCTTAAAGCCCTATGACAGGCTCTTACAGGTGAATCATGTCCGAACCA 3022
|||||||||||||||.|||.||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||.||.|
Sbjct 3024 CCCAGCTGGGCCAGGTGATGTTGGGGGCTTGAAGCCCTACGACAGGCTCTTACAGGTAAATCACGTGCGGACGA 3097
Query 3023 GAGACTTTGACTGCTGCCTTGTTGTGCCCCTCATAGCAGAATCCGGGAATAAGCTGGACCTGGTTATTAGTAGA 3096
|||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.||.||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 3098 GAGACTTTGACTGCTGCCTGGTGGTGCCTCTCATAGCTGAATCTGGCAACAAGCTGGACCTGGTTATTAGCAGA 3171
Query 3097 AACCCACTGGCTTCACAGAAGTCTATAGACCAACAGAGTCTACCAGGAGATTGGAGTGAACAGAACAGTGCTTT 3170
||.||||||||.||.||||||||.|||||.||.|.|..|||.||..|.||.|||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 3172 AATCCACTGGCCTCCCAGAAGTCGATAGAACAGCCGGCTCTGCCCAGCGACTGGAGCGAACAGAACAGCGCTTT 3245
Query 3171 TTTCCAGCAGCCTAGCCACGGTGGTAATT--TGGAGACACGAGAACCCACT-AATACATTA----------- 3228
.||||||||.||.||||||||||| .||| |||||| .||| .||||.||.
Sbjct 3246 CTTCCAGCAACCCAGCCACGGTGG-GATTCCTGGAGA----------TACTGTATACTTTTGGCAAAGCCTC 3306