Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000469635
• Subject: NM_144512.2
• Aligned Length: 1808
• Identities: 1590
• Gaps: 4

Alignment

Query    1  ATGGATAGCAGGGTCTCAGGAGCAACCAGTAATGGAGAGACAAAACCAGTGTATCCAGTCATGGA-AAAGAAGG  73
            |||||.|.|||||.|||.|||.||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||.|||||| |||| .||
Sbjct    1  ATGGAGAACAGGGCCTCGGGAACAACCAGTAATGGAGAGACAAAGCCAGTGTGTCCAGCCATGGAGAAAG-TGG  73

Query   74  AGGAAGATGGCACCCTGGAGCGGGGGCACTGGAACAACAAGATGGAGTTTGTGCTGTCAGTGGCTGGGGAGATC  147
            ||||||||||.||||||||.||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct   74  AGGAAGATGGTACCCTGGAACGGGAGCACTGGAACAACAAGATGGAGTTTGTGCTGTCTGTGGCTGGGGAGATC  147

Query  148  ATTGGCTTAGGCAACGTCTGGAGGTTTCCCTATCTCTGCTACAAAAATGGGGGAGGTGCCTTCTTCATCCCCTA  221
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  148  ATTGGCTTAGGCAACGTCTGGAGGTTTCCCTATCTCTGCTACAAGAACGGGGGAGGTGCCTTCTTTATCCCCTA  221

Query  222  CCTCGTCTTCCTCTTTACCTGTGGCATTCCTGTCTTCCTTC-TGGAGACAGCACTAGGCCAGTACACTAGCCAG  294
            ||||.|||||||.||||||||||||||.|||||||| |||| ||||||||||.||.|||||||||||.|.||||
Sbjct  222  CCTCATCTTCCTTTTTACCTGTGGCATCCCTGTCTT-CTTCTTGGAGACAGCGCTTGGCCAGTACACCAACCAG  294

Query  295  GGAGGCGTCACAGCCTGGAGGAAGATCTGCCCCATCTTTGAGGGCATTGGCTATGCCTCCCAGATGATCGTCAT  368
            ||||||.|||||||||||||||..|||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||.
Sbjct  295  GGAGGCATCACAGCCTGGAGGAGAATCTGTCCCATCTTTGAAGGCATCGGCTATGCCTCACAGATGATCGTCAG  368

Query  369  CCTCCTCAACGTCTACTACATCATTGTGTTGGCCTGGGCCCTGTTCTACCTCTTCAGCAGCTTCACCATCGACC  442
            |||||||||.||||||||||||.||||..|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||..||||
Sbjct  369  CCTCCTCAATGTCTACTACATCGTTGTCCTGGCCTGGGCCCTCTTCTACCTCTTCAGCAGCTTCACCACTGACC  442

Query  443  TGCCCTGGGGCGGCTGCTACCATGAGTGGAACACAGAACACTGTATGGAGTTCCAGAAGACCAACGGCTCCCTG  516
            |.||||||||..|.|||..||||||||||||.||||||.|||||.||||.|||||||||.||||.|..|||.||
Sbjct  443  TCCCCTGGGGAAGTTGCAGCCATGAGTGGAATACAGAAAACTGTGTGGAATTCCAGAAGGCCAATGATTCCATG  516

Query  517  AATGGTACCTCTGAGAATGCCACCTCTCCTGTCATCGAGTTCTGGGAGCGGCGGGTCTTGAAGATCTCTGATGG  590
            ||||..|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||.|||.|||||.||||.|||||
Sbjct  517  AATGTGACCTCCGAGAATGCCACCTCCCCTGTCATCGAGTTCTGGGAGAGGCGAGTCCTGAAGCTCTCGGATGG  590

Query  591  GATCCAGCACCTGGGGGCCCTGCGCTGGGAGCTGGCTCTGTGCCTCCTGCTGGCCTGGGTCATCTGCTACTTCT  664
            .|||||||||||||||.|||||||||||||.||||..||||||||||||||.||||||.|||||||||||||||
Sbjct  591  CATCCAGCACCTGGGGTCCCTGCGCTGGGAACTGGTCCTGTGCCTCCTGCTCGCCTGGATCATCTGCTACTTCT  664

Query  665  GCATCTGGAAGGGGGTGAAGTCCACAGGCAAGGTGGTGTACTTCACGGCCACATTTCCTTACCTCATGCTGGTG  738
            ||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||
Sbjct  665  GCATCTGGAAGGGGGTCAAGTCCACGGGCAAGGTGGTCTACTTCACAGCCACTTTCCCTTACCTCATGCTGGTG  738

Query  739  GTCCTGTTAATTCGAGGGGTGACGTTGCCTGGGGCAGCCCAAGGAATTCAGTTTTACCTGTACCCAAACCTCAC  812
            ||||||||.||||||||.|||||..||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||
Sbjct  739  GTCCTGTTGATTCGAGGAGTGACACTGCCCGGAGCAGCCCAAGGAATTCAGTTTTACCTGTACCCCAACATCAC  812

Query  813  GCGTCTGTGGGATCCCCAGGTGTGGATGGATGCAGGCACCCAGATATTCTTCTCCTTCGCCATCTGTCTTGGGT  886
            .||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct  813  ACGTCTGTGGGATCCCCAGGTGTGGATGGATGCAGGCACCCAGATCTTCTTCTCCTTTGCCATCTGTCTGGGGT  886

Query  887  GCCTGACAGCCCTGGGCAGCTACAACAAGTACCACAACAACTGCTACAGGGACTGCATCGCCCTCTGCTTCCTC  960
            ||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||.|||||
Sbjct  887  GCCTCACGGCCCTGGGAAGCTACAACAAGTACCACAACAATTGCTACAGGGACTGCATCGCCCTTTGCATCCTC  960

Query  961  AACAGCGGCACCAGCTTTGTGGCCGGCTTTGCCATCTTCTCCATCCTGGGCTTAGGGTCTCAGGAGCAGGGGGT  1034
            ||||||.||||||||||..|||||||.|||||.||||||||||||||||||||...|||||||||||||||.||
Sbjct  961  AACAGCAGCACCAGCTTCATGGCCGGGTTTGCTATCTTCTCCATCCTGGGCTTCATGTCTCAGGAGCAGGGTGT  1034

Query 1035  GCCCATTTCTGAGGTGGCCGAGTCAGGCCCTGGCCTGGCTTTCATCGCTTACCCGCGGGCTGTGGTGATGCTGC  1108
            ||||||.||||||||.||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||||||.|.|
Sbjct 1035  GCCCATATCTGAGGTTGCTGAATCAGGCCCTGGCCTGGCATTCATCGCCTACCCTCGAGCTGTGGTGATGTTAC  1108

Query 1109  CCTTCTCTCCTCTCTGGGCCTGCTGTTTCTTCTTCATGGTCGTTCTCCTGGGACTGGATAGCCAGTTTGTGTGT  1182
            |||||||.||..|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1109  CCTTCTCACCGTTGTGGGCCTGCTGTTTCTTCTTCATGGTCGTTCTCCTGGGACTAGATAGCCAGTTTGTGTGT  1182

Query 1183  GTAGAAAGCCTGGTGACAGCGCTGGTGGACATGTACCCTCACGTGTTCCGCAAGAAGAACCGGAGGGAAGTCCT  1256
            |||||||||||.||||||||..|.|||||||||||.||.|..||||||||.||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 1183  GTAGAAAGCCTTGTGACAGCATTAGTGGACATGTATCCCCGGGTGTTCCGTAAGAAGAATCGGAGGGAGGTCCT  1256

Query 1257  CATCCTTGGAGTATCTGTCGTCTCCTTCCTTGTGGGGCTGATCATGCTCACAGAGGGCGGAATGTACGTGTTCC  1330
            |||||||...||.||.|||.||||.|||.|..|.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1257  CATCCTTATTGTGTCCGTCATCTCGTTCTTCATCGGGCTCATCATGCTCACAGAGGGCGGCATGTACGTGTTCC  1330

Query 1331  AGCTCTTTGACTACTATGCGGCCAGTGGCATGTGCCTCCTGTTCGTGGCCATCTTCGAGTCCCTCTGTGTGGCT  1404
            |||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1331  AGCTCTTTGACTACTATGCAGCCAGTGGCATGTGTCTTCTCTTCGTGGCCATCTTTGAGTCCCTCTGTGTGGCT  1404

Query 1405  TGGGTTTACGGAGCCAAGCGCTTCTACGACAACATCGAAGACATGATTGGGTACAGGCCATGGCCTCTTATCAA  1478
            ||||||||.||||||...|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|.||||||||||||||||||
Sbjct 1405  TGGGTTTATGGAGCCGGCCGCTTCTACGACAACATTGAGGATATGATTGGGTATAAGCCATGGCCTCTTATCAA  1478

Query 1479  ATACTGTTGGCTCTTCCTCACACCAGCTGTGTGCACAGCCACCTTTCTCTTCTCCCTGATAAAGTACACTCCGC  1552
            |||.|||||||||||..||||.||||||||||||...||.|||||.||.|||||||||||.||.|||||.||.|
Sbjct 1479  ATATTGTTGGCTCTTTTTCACGCCAGCTGTGTGCCTGGCGACCTTCCTGTTCTCCCTGATCAAATACACGCCAC  1552

Query 1553  TGACCTACAACAAGAAGTACACGTACCCGTGGTGGGGCGATGCCCTGGGCTGGCTCCTGGCTCTGTCCTCCATG  1626
            ||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1553  TGACCTACAACAAGAAGTACACGTACCCATGGTGGGGGGATGCCCTAGGGTGGCTCCTAGCTCTGTCCTCCATG  1626

Query 1627  GTCTGCATTCCTGCCTGGAGCCTCTACAGACTCGGAACCCTCAAGGGCCCCTTCAGAGAGAGAATCCGTCAGCT  1700
            .||||||||||||||||||||.||||||..||..|.||.|||||||||||..|||||||||||.|.||.|||||
Sbjct 1627  ATCTGCATTCCTGCCTGGAGCATCTACAAGCTGAGGACTCTCAAGGGCCCACTCAGAGAGAGACTTCGCCAGCT  1700

Query 1701  CATGTGCCCAGCCGAGGACTTGCCCCAGCGGAACCCAGCAGGACCCTCGGCTCCCGCCACCCCCAGGACCTCAC  1774
            |.|||||||.||.||.|||.|.||||||..|||||.|.|||..||..|.|||||.||.||.||.|.|||.||.|
Sbjct 1701  CGTGTGCCCGGCTGAAGACCTTCCCCAGAAGAACCAACCAGAGCCAACTGCTCCTGCGACACCGATGACATCCC  1774

Query 1775  TGCTCAGACTCACAGAGCTAGAGTCTCACTGC  1806
            |.|||||.||||||||.||.||||||.|||||
Sbjct 1775  TTCTCAGGCTCACAGAACTGGAGTCTAACTGC  1806