Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000469742
• Subject: XM_017027249.2
• Aligned Length: 2133
• Identities: 1968
• Gaps: 165

Alignment

Query    1  ATGCCTGCTGATGTGAATTTATCCCAGAAGCCTCAGGTCCTGGGTCCAGAGAAGCAGGATGGATCTTGCGAGGC  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  ATCAGTGTCATTTGAGGACGTGACCGTGGACTTCAGCAGGGAGGAGTGGCAGCAACTGGACCCTGCCCAGAGAT  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  GCCTGTACCGGGATGTGATGCTGGAGCTCTATAGCCATCTCTTCGCAGTGGGGTATCACATTCCCAACCCAGAG  222
                             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -----------------ATGCTGGAGCTCTATAGCCATCTCTTCGCAGTGGGGTATCACATTCCCAACCCAGAG  57

Query  223  GTCATCTTCAGAATGCTAAAAGAAAAGGAGCCGCGTGTGGAGGAGGCTGAAGTCTCACATCAGAGGTGTCAAGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   58  GTCATCTTCAGAATGCTAAAAGAAAAGGAGCCGCGTGTGGAGGAGGCTGAAGTCTCACATCAGAGGTGTCAAGA  131

Query  297  AAGGGAGTTTGGGCTTGAAATCCCACAAAAGGAGATTTCTAAGAAAGCTTCATTTCAAAAGGATATGGTAGGTG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  132  AAGGGAGTTTGGGCTTGAAATCCCACAAAAGGAGATTTCTAAGAAAGCTTCATTTCAAAAGGATATGGTAGGTG  205

Query  371  AGTTCACAAGAGATGGTTCATGGTGTTCCATTTTAGAAGAACTGAGGCTGGATGCTGACCGCACAAAGAAAGAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  206  AGTTCACAAGAGATGGTTCATGGTGTTCCATTTTAGAAGAACTGAGGCTGGATGCTGACCGCACAAAGAAAGAT  279

Query  445  GAGCAAAATCAAATTCAACCCATGAGTCACAGTGCTTTCTTCAACAAGAAAACATTGAACACAGAAAGCAATTG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  280  GAGCAAAATCAAATTCAACCCATGAGTCACAGTGCTTTCTTCAACAAGAAAACATTGAACACAGAAAGCAATTG  353

Query  519  TGAATATAAGGACCCTGGGAAAATGATTCGCACGAGGCCCCACCTTGCTTCTTCACAGAAACAACCTCAGAAAT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  354  TGAATATAAGGACCCTGGGAAAATGATTCGCACGAGGCCCCACCTTGCTTCTTCACAGAAACAACCTCAGAAAT  427

Query  593  GTTGCTTATTTACAGAAAGTTTGAAGCTGAACCTAGAAGTGAACGGTCAGAATGAAAGCAATGACACAGAACAG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  428  GTTGCTTATTTACAGAAAGTTTGAAGCTGAACCTAGAAGTGAACGGTCAGAATGAAAGCAATGACACAGAACAG  501

Query  667  CTTGATGACGTTGTTGGGTCTGGTCAGCTATTCAGCCATAGCTCTTCTGATGCCTGCAGCAAGAATATTCATAC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  502  CTTGATGACGTTGTTGGGTCTGGTCAGCTATTCAGCCATAGCTCTTCTGATGCCTGCAGCAAGAATATTCATAC  575

Query  741  AGGAGAGACATTTTGCAAAGGTAACCAGTGTAGAAAAGTCTGTGGCCATAAACAGTCACTCAAGCAACATCAAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  576  AGGAGAGACATTTTGCAAAGGTAACCAGTGTAGAAAAGTCTGTGGCCATAAACAGTCACTCAAGCAACATCAAA  649

Query  815  TTCATACTCAGAAGAAACCAGATGGATGTTCTGAATGTGGGGGGAGCTTCACCCAGAAGTCACACCTCTTTGCC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  650  TTCATACTCAGAAGAAACCAGATGGATGTTCTGAATGTGGGGGGAGCTTCACCCAGAAGTCACACCTCTTTGCC  723

Query  889  CAACAGAGAATTCATAGTGTAGGAAACCTCCATGAATGTGGCAAATGTGGAAAAGCCTTCATGCCACAACTAAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  724  CAACAGAGAATTCATAGTGTAGGAAACCTCCATGAATGTGGCAAATGTGGAAAAGCCTTCATGCCACAACTAAA  797

Query  963  ACTCAGTGTATATCTGACAGATCATACAGGTGATATACCCTGTATATGCAAGGAATGTGGGAAGGTCTTTATTC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  798  ACTCAGTGTATATCTGACAGATCATACAGGTGATATACCCTGTATATGCAAGGAATGTGGGAAGGTCTTTATTC  871

Query 1037  AGAGATCAGAATTGCTTACGCACCAGAAAACACACACTAGAAAGAAGCCCTATAAATGCCATGACTGTGGAAAA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  872  AGAGATCAGAATTGCTTACGCACCAGAAAACACACACTAGAAAGAAGCCCTATAAATGCCATGACTGTGGAAAA  945

Query 1111  GCCTTTTTCCAGATGTTATCTCTCTTCAGACATCAGAGAACTCACAGTAGAGAAAAACTCTATGAATGCAGTGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  946  GCCTTTTTCCAGATGTTATCTCTCTTCAGACATCAGAGAACTCACAGTAGAGAAAAACTCTATGAATGCAGTGA  1019

Query 1185  ATGTGGCAAAGGCTTCTCCCAAAACTCAACCCTCATTATACATCAGAAAATTCATACTGGTGAGAGACAGTATG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1020  ATGTGGCAAAGGCTTCTCCCAAAACTCAACCCTCATTATACATCAGAAAATTCATACTGGTGAGAGACAGTATG  1093

Query 1259  CATGCAGTGAATGTGGGAAAGCCTTTACCCAGAAGTCAACACTCAGCTTGCACCAGAGAATCCACTCAGGGCAG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1094  CATGCAGTGAATGTGGGAAAGCCTTTACCCAGAAGTCAACACTCAGCTTGCACCAGAGAATCCACTCAGGGCAG  1167

Query 1333  AAGTCCTATGTGTGTATCGAATGCGGGCAGGCCTTCATCCAGAAGGCACACCTGATTGTCCATCAAAGAAGCCA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1168  AAGTCCTATGTGTGTATCGAATGCGGGCAGGCCTTCATCCAGAAGGCACACCTGATTGTCCATCAAAGAAGCCA  1241

Query 1407  CACAGGAGAAAAACCTTATCAGTGCCACAACTGTGGGAAATCCTTCATTTCCAAGTCACAGCTTGATATACATC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1242  CACAGGAGAAAAACCTTATCAGTGCCACAACTGTGGGAAATCCTTCATTTCCAAGTCACAGCTTGATATACATC  1315

Query 1481  ATCGAATTCATACAGGGGAGAAACCTTATGAATGCAGTGACTGTGGAAAAACCTTCACCCAAAAGTCACACCTG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1316  ATCGAATTCATACAGGGGAGAAACCTTATGAATGCAGTGACTGTGGAAAAACCTTCACCCAAAAGTCACACCTG  1389

Query 1555  AATATACACCAGAAAATTCATACTGGAGAAAGACACCATGTATGCAGTGAATGCGGGAAAGCCTTCAACCAGAA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1390  AATATACACCAGAAAATTCATACTGGAGAAAGACACCATGTATGCAGTGAATGCGGGAAAGCCTTCAACCAGAA  1463

Query 1629  GTCAATACTCAGCATGCATCAGAGAATTCACACCGGAGAGAAGCCTTACAAATGCAGTGAATGTGGGAAAGCCT  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1464  GTCAATACTCAGCATGCATCAGAGAATTCACACCGGAGAGAAGCCTTACAAATGCAGTGAATGTGGGAAAGCCT  1537

Query 1703  TCACTTCTAAGTCTCAATTCAAAGAGCATCAGCGAATTCACACGGGTGAGAAACCCTATGTGTGCACTGAATGT  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1538  TCACTTCTAAGTCTCAATTCAAAGAGCATCAGCGAATTCACACGGGTGAGAAACCCTATGTGTGCACTGAATGT  1611

Query 1777  GGGAAGGCCTTCAACGGCAGGTCAAATTTCCATAAACATCAAATAACTCACACTAGAGAGAGGCCTTTTGTCTG  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1612  GGGAAGGCCTTCAACGGCAGGTCAAATTTCCATAAACATCAAATAACTCACACTAGAGAGAGGCCTTTTGTCTG  1685

Query 1851  TTACAAATGTGGGAAGGCTTTTGTCCAGAAATCAGAGTTGATTACCCATCAAAGAACTCACATGGGAGAGAAAC  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1686  TTACAAATGTGGGAAGGCTTTTGTCCAGAAATCAGAGTTGATTACCCATCAAAGAACTCACATGGGAGAGAAAC  1759

Query 1925  CCTATGAATGCCTTGACTGTGGGAAATCGTTCAGTAAGAAACCACAACTCAAGGTGCATCAGCGAATTCACACG  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1760  CCTATGAATGCCTTGACTGTGGGAAATCGTTCAGTAAGAAACCACAACTCAAGGTGCATCAGCGAATTCACACG  1833

Query 1999  GGAGAAAGACCTTATGTGTGTTCTGAATGTGGAAAGGCCTTCAACAACAGGTCAAACTTCAATAAACACCAAAC  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1834  GGAGAAAGACCTTATGTGTGTTCTGAATGTGGAAAGGCCTTCAACAACAGGTCAAACTTCAATAAACACCAAAC  1907

Query 2073  AACTCATACCAGAGACAAATCTTACAAATGCAGTTATTCTGTGAAAGGCTTTACCAAGCAA  2133
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1908  AACTCATACCAGAGACAAATCTTACAAATGCAGTTATTCTGTGAAAGGCTTTACCAAGCAA  1968