Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000469771
- Subject:
- XR_001742046.2
- Aligned Length:
- 3124
- Identities:
- 2199
- Gaps:
- 885
Alignment
Query 1 --------------------------------------------------------------------ATGGG- 5
.||||
Sbjct 1 CTTTTGCGTTCAGGGATGGTCGGGAGGTGACCCAGCGCGGGTGGTGCTCTGGGGCAGCGCGGGTGGGCGTGGGC 74
Query 6 --GC--------------TCCCAGC------GCTCGAGTTC--AGCG-ACTGCTGCCTCGATAGTCCGCACTTC 54
|| ||||||| ||..||||.| |||| .|.||.||| ||...|||..||
Sbjct 75 GTGCGCGGCACGCAGGTGTCCCAGCAGTGGGGCCAGAGTGCCGAGCGCGCCGCAGCC-----AGCGGGCAGATC 143
Query 55 CGA--GAGAC----GCTCAAGTCGCAC---GAAGCAGAGCTGGACA--------AGACCAAC-----AAATTCA 106
|.| |.|.| ||||.|| |.|.| |..||||||.||..|| .|.||||| .|||
Sbjct 144 CCATCGTGTCCACAGCTCCAG-CTCCCTTAGGGGCAGAGTTGCTCAGCCTTGAGTGCCCAACCGTGAGAAT--- 213
Query 107 TCAAGGAGCTCATCAAG---------GACGGGAAGTCACTCATAAGCGC--GCTC----------AAGAATTTG 159
||||| | ||.||| |||| .||| ||| |||||
Sbjct 214 ----GGAGC-------GTGCCCTGCCGAGGGG-------------GCGCTGCCTCCCCTTGGGAAAAG-ATTTG 262
Query 160 TCTTCAGCGAAGCGGAAGTTTGCAGATTCCTTAAATGAATTTAAATTTCAGTGCATAGGAGATGCAGAAACAGA 233
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 263 TCTTCAGCGAAGCGGAAGTTTGCAGATTCCTTAAATGAATTTAAATTTCAGTGCATAGGAGATGCAGAAACAGA 336
Query 234 TGATGAGATGTGTATAGCAAGGTCTTTGCAGGAGTTTGCCACTGTCCTCAGGAATCTTGAAGATGAACGGATAC 307
|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 337 TGATGAGATGTGTATAGCAAGATCTTTGCAGGAGTTTGCCACTGTCCTCAGGAATCTTGAAGATGAACGGATAC 410
Query 308 GGATGATTGAGAATGCCAGCGAGGTGCTCATCACTCCCTTGGAGAAGTTTCGAAAGGAACAGATCGGGGCTGCC 381
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 411 GGATGATTGAGAATGCCAGCGAGGTGCTCATCACTCCCTTGGAGAAGTTTCGAAAGGAACAGATCGGGGCTGCC 484
Query 382 AAGGAAGCCAAAAAGAAGTATGACAAAGAGACAGAAAAGTATTGTGGCATCTTAGAAAAACACTTGAATTTGTC 455
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 485 AAGGAAGCCAAAAAGAAGTATGACAAAGAGACAGAAAAGTATTGTGGCATCTTAGAAAAACACTTGAATTTGTC 558
Query 456 TTCCAAAAAGAAAGAATCTCAGCTTCAGGAGGCAGACAGCCAAGTGGACCTGGTCCGGCAGCATTTCTATGAAG 529
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 559 TTCCAAAAAGAAAGAATCTCAGCTTCAGGAGGCAGACAGCCAAGTGGACCTGGTCCGGCAGCATTTCTATGAAG 632
Query 530 TATCCCTGGAATATGTCTTCAAGGTGCAGGAAGTCCAAGAGAGAAAGATGTTTGAGTTTGTGGAGCCTCTGCTG 603
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 633 TATCCCTGGAATATGTCTTCAAGGTGCAGGAAGTCCAAGAGAGAAAGATGTTTGAGTTTGTGGAGCCTCTGCTG 706
Query 604 GCCTTCCTGCAAGGACTCTTCACTTTCTATCACCATGGTTACGAACTGGCCAAGGATTTCGGGGACTTCAAGAC 677
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 707 GCCTTCCTGCAAGGACTCTTCACTTTCTATCACCATGGTTACGAACTGGCCAAGGATTTCGGGGACTTCAAGAC 780
Query 678 ACAGTTAACCATTAGCATACAGAACACAAGAAATCGCTTTGAAGGCACTAGATCAGAAGTGGAATCACTGATGA 751
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 781 ACAGTTAACCATTAGCATACAGAACACAAGAAATCGCTTTGAAGGCACTAGATCAGAAGTGGAATCACTGATGA 854
Query 752 AAAAGATGAAGGAGAATCCCCTTGAGCACAAGACCATCAGTCCCTACACCATGGAGGGATACCTCTACGTGCAG 825
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 855 AAAAGATGAAGGAGAATCCCCTTGAGCACAAGACCATCAGTCCCTACACCATGGAGGGATACCTCTACGTGCAG 928
Query 826 GAGAAACGTCACTTTGGAACTTCTTGGGTGAAGCACTACTGTACATATCAACGGGATTCCAAACAAATCACCAT 899
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 929 GAGAAACGTCACTTTGGAACTTCTTGGGTGAAGCACTACTGTACATATCAACGGGATTCCAAACAAATCACCAT 1002
Query 900 GGTACCATTTGACCAAAAGTCAGGAGGAAAAGGGGGAGAAGATGAATCAGTTATCCTCAAATCCTGCACACGGC 973
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1003 GGTACCATTTGACCAAAAGTCAGGAGGAAAAGGGGGAGAAGATGAATCAGTTATCCTCAAATCCTGCACACGGC 1076
Query 974 GGAAAACAGACTCCATTGAGAAGAGGTTTTGCTTTGATGTGGAAGCAGTAGACAGGCCAGGGGTTATCACCATG 1047
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1077 GGAAAACAGACTCCATTGAGAAGAGGTTTTGCTTTGATGTGGAAGCAGTAGACAGGCCAGGGGTTATCACCATG 1150
Query 1048 CAAGCTTTGTCGGAAGAGGACCGGAGGCTCTGGATGGAAGCCATGGATGGCCGGGAACCTGTCTACAACTCGAA 1121
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1151 CAAGCTTTGTCGGAAGAGGACCGGAGGCTCTGGATGGAAGCCATGGATGGCCGGGAACCTGTCTACAACTCGAA 1224
Query 1122 CAAAGACAGCCAGAGTGAAGGGACTGCGCAGTTGGACAGCATTGGCTTCAGCATAATCAGGAAATGCATCCATG 1195
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1225 CAAAGACAGCCAGAGTGAAGGGACTGCGCAGTTGGACAGCATTGGCTTCAGCATAATCAGGAAATGCATCCATG 1298
Query 1196 CTGTGGAAACCAGAGGGATCAACGAGCAAGGGCTGTATCGAATTGTGGGGGTCAACTCCAGAGTGCAGAAGTTG 1269
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1299 CTGTGGAAACCAGAGGGATCAACGAGCAAGGGCTGTATCGAATTGTGGGTGTCAACTCCAGAGTGCAGAAGTTG 1372
Query 1270 CTGAGTGTCCTGATGGACCCCAAGACTGCTTCTGAGACAGAAACAGATATCTGTGCTGAATGGGAGATAAAGAC 1343
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1373 CTGAGTGTCCTGATGGACCCCAAGACTGCTTCTGAGACAGAAACAGATATCTGTGCTGAATGGGAGATAAAGAC 1446
Query 1344 CATCACTAGTGCTCTGAAGACCTACCTAAGAATGCTTCCAGGACCACTCATGATGTACCAGTTTCAAAGAAGTT 1417
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1447 CATCACTAGTGCTCTGAAGACCTACCTAAGAATGCTTCCAGGACCACTCATGATGTACCAGTTTCAAAGAAGTT 1520
Query 1418 TCATCAAAGCAGCAAAACTGGAGAACCAGGAGTCTCGGGTCTCTGAAATCCACAGCCTTGTTCATCGGCTCCCA 1491
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1521 TCATCAAAGCAGCAAAACTGGAGAACCAGGAGTCTCGGGTCTCTGAAATCCACAGCCTTGTTCATCGGCTCCCA 1594
Query 1492 GAGAAAAATCGGCAGATGTTACAGCTGCTCATGAACCACTTGGCAAATGTTGCTAACAACCACAAGCAGAATTT 1565
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1595 GAGAAAAATCGGCAGATGTTACAGCTGCTCATGAACCACTTGGCAAATGTTGCTAACAACCACAAGCAGAATTT 1668
Query 1566 GATGACGGTGGCAAACCTTGGTGTGGTGTTTGGACCCACTCTGCTGAGGCCTCAGGAAGAAACAGTAGCAGCCA 1639
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1669 GATGACGGTGGCAAACCTTGGTGTGGTGTTTGGACCCACTCTGCTGAGGCCTCAGGAAGAAACAGTAGCAGCCA 1742
Query 1640 TCATGGACATCAAATTTCAGAACATTGTCATTGAGATCCTAATAGAAAACCACGAAAAGATATTTAACACCGTG 1713
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1743 TCATGGACATCAAATTTCAGAACATTGTCATTGAGATCCTAATAGAAAACCACGAAAAGATATTTAACACCGTG 1816
Query 1714 CCCGATATGCCTCTCACCAATGCCCAGCTGCACCTGTCTCGGAAGAAGAGCAGTGACTCCAAGCCCCCGTCCTG 1787
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1817 CCCGATATGCCTCTCACCAATGCCCAGCTGCACCTGTCTCGGAAGAAGAGCAGTGACTCCAAGCCCCCGTCCTG 1890
Query 1788 CAGCGAGAGGCCCCTGACGCTCTTCCACACCGTTCAGTCAACAGAGAAACAGGAACAAAGGAACAGCATCATCA 1861
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1891 CAGCGAGAGGCCCCTGACGCTCTTCCACACCGTTCAGTCAACAGAGAAACAGGAACAAAGGAACAGCATCATCA 1964
Query 1862 ACTCCAGTTTGGAATCTGTCTCATCAAATCCAAACAGCATCCTTAATTCCAGCAGCAGCTTACAGCCCAACATG 1935
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1965 ACTCCAGTTTGGAATCTGTCTCATCAAATCCAAACAGCATCCTTAATTCCAGCAGCAGCTTACAGCCCAACATG 2038
Query 1936 AACTCCAGTGACCCAGACCTGGCTGTGGTCAAACCCACCCGGCCCAACTCAC---------------------- 1987
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2039 AACTCCAGTGACCCAGACCTGGCTGTGGTCAAACCCACCCGGCCCAACTCACTGGTTCATGCGAGTTCAGCAAG 2112
Query 1988 ----------------------------------------------------TCCCCCCGAATCCAAGCCCAAC 2009
||||||||||||||||||||||
Sbjct 2113 CAGTTACCATGTCTACGGCATGCCAGGATACTGTTGGGAAGGTAGTATTCCGTCCCCCCGAATCCAAGCCCAAC 2186
Query 2010 TTCACCCCTCTCGCCATCTTGGCCCATGTTCTCGGCGCCATCCAGCCCTATGCCCACCTCATCCACGTCCAGCG 2083
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2187 TTCACCCCTCTCGCCATCTTGGCCCATGTTCTCGGCGCCATCCAGCCCTATGCCCACCTCATCCACGTCCAGCG 2260
Query 2084 ACTCATCCCCCGTCAGCACACCGTTCCGGAAGGCAAAAGCCTTGTATGCCTGCAAAGCTGAACATGACTCAGAA 2157
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2261 ACTCATCCCCCGTCAGCACACCGTTCCGGAAGGCAAAAGCCTTGTATGCCTGCAAAGCTGAACATGACTCAGAA 2334
Query 2158 CTTTCGTTCACAGCAGGCACGGTCTTCGATA-----------------------------ATGTTCAC--CCA- 2199
||||||||||||||||||||||||||||||| ||.||||| |||
Sbjct 2335 CTTTCGTTCACAGCAGGCACGGTCTTCGATAACGCAGAGTGTCCTTCAGCTTCCACAGCCATCTTCACTGCCAC 2408
Query 2200 ------------------------TCTCAGGAGCCTGG---------CTGG----------------------- 2217
||||| ||||| ||||
Sbjct 2409 ACCGAAGCTCCGGGCACCTCCACCTCTCA----CCTGGGCACTTCCACTGGCCGCCTGACACATCTTCTCACAT 2478
Query 2218 ------TTG-------------------------------GAGGGGACTCTG---AACGGAAA----------- 2240
||| |||.|..||.|| ||||||||
Sbjct 2479 CTGCTCTTGCTGCCATAACCCCCTCTTTACAGAGCAGCGAGAGTGATCTTTGAAAAACGGAAATGGCATTAAAG 2552
Query 2241 -----GACTGGCCT--CAT--CCCTGAGAATTACGT----GG-------------AGTTCCTC----------- 2277
.|.|||||| ||| |.|||||||||||.| || |||||||.
Sbjct 2553 CCCTTCAGTGGCCTCCCATTGCTCTGAGAATTACTTACAAGGCCCTCCAGGGCCCAGTTCCTGCCCCTCTGACC 2626
Query 2278 -------------------------------------------------------------------------- 2277
Sbjct 2627 TCACGCCCTCACTTGACATACTACAGCCTCATGCCTTCTTCATGTTCTCAAGCAAGGTCGGCAAACTATGACCT 2700
Query 2278 -------------------------------------------------------------------------- 2277
Sbjct 2701 GCCCGTCAAATCCAACCTGCCACCTGTCACCTAACAATTCTGTAACTGCTCCCACATACAACATGGTCGTCATC 2774
Query 2278 -------------------------------------------------------------------------- 2277
Sbjct 2775 ATAAATCCTATAGGTATTGTTGAGAGCAGGAGGAAAGTTTGGTTGAGTGAGTGAGAGACCTTACCCAAGCCTTC 2848
Query 2278 -------------------------------------------------------------------------- 2277
Sbjct 2849 CTGTGGTCTCTAGGAGTCATGGCAGAGTTCGCTGACACTGGTCTGCTTTTAACCAGCCTTGCCAGTGACCTTTC 2922
Query 2278 -------------------------------------------------------------------------- 2277
Sbjct 2923 AAATTCCCTGAGGAGCAAAAGGCCAAATTGAACCTGAAAGAAAACACCTCTCAGTGTTGACTGAGTTGCAGTAG 2996
Query 2278 -------------------------------------------------------------------------- 2277
Sbjct 2997 AAAATGGACCTGACAAAACTTCACCCATCTCAGGAGCCTGGCTGGTTGGAGGGGACTCTGAACGGAAAGACTGG 3070
Query 2278 ---------------- 2277
Sbjct 3071 CCTCATCCCTGAGAAT 3086