Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- TRCN0000469808
- Subject:
- XM_017318187.1
- Aligned Length:
- 1709
- Identities:
- 1383
- Gaps:
- 208
Alignment
Query 1 ATGGCGACCGGAGCGAACGCCACGCCGTTGGACTTCCCAAGTAAGAAGCGGAAGAGGAGCCGCTGGAACCAAGA 74
.|||||||||||
Sbjct 1 --------------------------------------------------------------ATGGAACCAAGA 12
Query 75 CACAATGGAACAGAAGACAGTGATTCCAGGAATGCCTACAGTTATTCCCCCTGGACTTACTCGAGAACAAGAAA 148
|||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.||||
Sbjct 13 CACAATGGAGCAGAAGACAGTGATTCCAGGCATGCCTACAGTTATACCCCCTGGACTGACTCGGGAACAGGAAA 86
Query 149 GAGCTTATATAGTGCAACTGCAGATAGAAGACCTGACTCGTAAACTGCGCACAGGAGACCTGGGCATCCCCCCT 222
|||||||.||
Sbjct 87 GAGCTTACAT---------------------------------------------------------------- 96
Query 223 AACCCTGAGGACAGGTCCCCTTCCCCTGAGCCCATCTACAATAGCGAGGGGAAGCGGCTTAACACCCGAGAGTT 296
|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 97 ------------AGGTCCCCTTCCCCTGAACCAATCTACAACAGCGAGGGGAAGCGGCTTAACACTCGAGAGTT 158
Query 297 CCGCACCCGCAAAAAGCTGGAAGAGGAGCGGCACAACCTCATCACAGAGATGGTTGCACTCAATCCGGATTTCA 370
|||.||||||||||||||.||||||||||||||||.|||.||.||||||||||||||.|||||.||.||.||.|
Sbjct 159 CCGTACCCGCAAAAAGCTTGAAGAGGAGCGGCACACCCTTATTACAGAGATGGTTGCTCTCAACCCAGACTTTA 232
Query 371 AGCCACCTGCAGATTACAAACCTCCAGCAACACGTGTGAGTGATAAAGTCATGATTCCACAAGATGAGTACCCA 444
|.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||.||.||.|||
Sbjct 233 AACCACCTGCAGATTACAAGCCTCCAGCAACACGTGTGAGCGATAAAGTAATGATCCCCCAAGACGAATATCCA 306
Query 445 GAAATCAACTTTGTGGGGCTGCTCATCGGGCCCAGAGGGAACACCCTGAAGAACATAGAGAAGGAGTGCAATGC 518
||||||||.|||||||||||.||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||
Sbjct 307 GAAATCAATTTTGTGGGGCTCCTAATTGGACCCAGAGGGAACACCCTGAAGAACATTGAGAAGGAATGCAACGC 380
Query 519 CAAGATTATGATCCGGGGGAAAGGGTCTGTGAAAGAAGGGAAGGTTGGGCGCAAAGATGGCCAGATGTTGCCAG 592
||||||.|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct 381 CAAGATCATGATTCGGGGGAAAGGATCAGTGAAAGAAGGGAAAGTTGGGCGTAAAGATGGTCAGATGTTGCCAG 454
Query 593 GAGAAGATGAGCCACTTCATGCCCTGGTTACTGCCAATACAATGGAGAACGTCAAAAAGGCAGTGGAACAGATA 666
|.|||||||||||.||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 455 GCGAAGATGAGCCTCTTCATGCTCTAGTCACTGCCAATACGATGGAGAATGTCAAAAAGGCAGTAGAACAGATC 528
Query 667 AGAAACATCCTGAAGCAGGGTATCGAGACTCCAGAGGACCAGAATGATCTACGGAAGATGCAGCTTCGGGAGTT 740
|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||
Sbjct 529 AGAAACATCCTGAAGCAGGGTATTGAGACCCCAGAGGACCAGAACGATCTACGGAAAATGCAGCTTCGAGAGTT 602
Query 741 GGCTCGCTTAAATGGGACCCTTCGGGAAGACGATAACAGGATCTTAAGACCCTGGCAGAGCTCAGAGACCCGCA 814
|||||||||.|||||.||.||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 603 GGCTCGCTTGAATGGCACTCTACGGGAAGATGATAATAGGATCTTAAGGCCCTGGCAGAGCTCAGAGACGCGCA 676
Query 815 GCATTACCAACACCACAGTGTGTACCAAGTGTGGAGGGGCTGGCCACATTGCTTCAGACTGTAAATTCCAAAGG 888
||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||.||.|||
Sbjct 677 GCATTACCAATACTACTGTGTGTACCAAGTGTGGAGGGGCTGGTCACATTGCTTCTGATTGCAAATTTCAGAGG 750
Query 889 CCTGGTGATCCTCAGTCAGCTCAGGATAAAGCACGGATGGATAAAGAATATTTGTCCCTCATGGCTGAACTGGG 962
|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||
Sbjct 751 CCTGGCGACCCTCAGTCAGCTCAGGATAAAGCACGGATGGATAAAGAATATTTGTCCCTTATGGCTGAGCTAGG 824
Query 963 TGAAGCACCTGTCCCAGCATCTGTGGGCTCCACCTCTGGGCCTGCCACCACACCCCTGGCCAGCGCACCTCGTC 1036
.|||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||..|.|
Sbjct 825 GGAAGCTCCTGTCCCTGCATCTGTGGGCTCTACCTCTGGGCCTGCCACCACGCCCCTGGCTAGTGCACCAAGAC 898
Query 1037 CTGCTGCTCCCGCCAACAACCCACCTCCACCGTCTCTCATGTCTACCACCCAGAGCCGCCCACCCTGGATGAAT 1110
||||||||||.||||.|||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 899 CTGCTGCTCCTGCCAGCAACCCACCACCACCGTCTCTCATGTCTACAACTCAGAGCCGCCCACCCTGGATGAAT 972
Query 1111 TCTGGCCCTTCAGAGAGTCGGCCCTACCACGGCATGCATGGAGGTGGTCCTGGTGGGCCCGGAGGTGGCCCCCA 1184
|||||.||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 973 TCTGGTCCTTCAGAGAATCGGCCCTACCATGGCATGCATGGAGGTGGTCCTGGTGGTCCTGGAGGTGGCCCCCA 1046
Query 1185 CAGCTTCCCACACCCATTACCCAGCCTGACAGGTGGGCATGGTGGACATCCCATGCAGCACAACCCCAATGGAC 1258
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1047 CAGCTTCCCACACCCATTACCCAGCCTGACAGGTGGGCATGGTGGGCATCCCATGCAGCACAACCCAAATGGAC 1120
Query 1259 CCCCACCCCCTTGGATGCAGCCACCACCACCACCGATGAACCAGGGCCCCCACCCTCCTGGGCACCATGGCCCT 1332
|.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1121 CACCACCACCTTGGATGCAGCCACCACCACCACCGATGAACCAGGGCCCCCACCCACCTGGGCACCATGGCCCT 1194
Query 1333 CCTCCAATGGATCAGTACCTGGGAAGTACGCCTGTGGGCTCTGGGGTCTATCGCCTGCATCAAGGAAAAGGTAT 1406
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1195 CCTCCAATG-----GTACCTGGGAAGTACGCCTGTGGGCTCTGGGGTCTATCGCCTGCATCAAGGAAAAGGTAT 1263
Query 1407 GATGCCGCCACCACCTATGGGCATGATGCCGCCGCCGCCGCCGCCTCCCAGTGGGCAGCCCCCACCCCCTCCCT 1480
|||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct 1264 GATGCCGCCGCCGCCTATGGGCATGATGCCGCCGCCTCCGCCACCTCCCAGTGGGCAGCCCCCGCCTCCTCCCT 1337
Query 1481 CTGGTCCTCTTCCCCCATGGCAACAACAGCAGCAGCAGCCTCCGCCACCCCCTCCGCCCAGCAGCAGTATGGCT 1554
|||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1338 CTGGTCCTCTTCCTCCATGGCAGCAGCAGCAGCAGCAGCCTCCGCCACCCCCTCCGCCCAGCAGCAGTATGGCT 1411
Query 1555 TCCAGTACCCCCTTGCCATGGCAGCAAAGATCCCTCCCCGCGGCGGCGATGGCCCGAGCCATGAGAGTGAGGAC 1628
|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1412 TCCAGCACCCCCTTGCCATGGCAGCAAAGATCCCTCCCCGCGGCAGCGATGGCCCGAGCCATGAGAGTGAGGAC 1485
Query 1629 TTTCCGCGCCCATTGG---------------------------------------------------------- 1644
||||||||||||||||
Sbjct 1486 TTTCCGCGCCCATTGGTGACCCTTCCAGGCAGACAGCCTCAGCAGCGCCCCTGGTGGACAGGATGGTTCGGCAA 1559
Query 1645 ------- 1644
Sbjct 1560 AGCAGCC 1566