Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000470199
• Subject: NM_001305935.1
• Aligned Length: 1186
• Identities: 1008
• Gaps: 26

Alignment

Query    1  ATGGCGGTTGTAGCGGCGGCTGC-----CGGCT-GGCTACTCAGGCTCAGGGCGGCAGGGGCTGAGGGGCACTG  68
            ||||||      ||||.||||||     |||.| ||||.||..|||||.||||.||.||.||.|||.|||   |
Sbjct    1  ATGGCG------GCGGTGGCTGCGCGCGCGGGTGGGCTGCTGTGGCTCCGGGCTGCGGGAGCAGAGCGGC---G  65

Query   69  GCG--TCGG-CTTC-CTGGCGCGGGGCTGGCGCGGGGCTTTTTGCACCCCGCCGCGACTGTCGAGGATGCGGCC  138
            |||  .||| ||.| || ||||.|.|||||.||..|||||..||||.||||      ..|.||||||..|||||
Sbjct   66  GCGGTGCGGACTGCGCT-GCGCTGCGCTGGTGCAAGGCTTCCTGCAACCCG------GGGGCGAGGACACGGCC  132

Query  139  CAGAGGCGGCAGGTGGCTCATTTTACTTTCCAGCCAGATCCGGAGCCCCGGGAGTACGGGCAAACTCAGAAAAT  212
            ||||.|||||.||||||.||.||.||||||||.||.||.||.|||.|||.|.||||.||||||||||||||.||
Sbjct  133  CAGAAGCGGCGGGTGGCCCACTTCACTTTCCATCCGGACCCAGAGTCCCTGCAGTATGGGCAAACTCAGAAGAT  206

Query  213  GAATCTTTTCCAGTCTGTAACAAGTGCCTTGGATAACTCATTGGCCAAAGATCCTACTGCAGTAATATTTGGTG  286
            |||.||.||||||||..|||||||||||.|||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct  207  GAACCTCTTCCAGTCAATAACAAGTGCCCTGGATAACTCATTAGCCAAAGACCCCACTGCAGTAATATTTGGTG  280

Query  287  AAGATGTTGCCTTTGGTGGAGTCTTTAGATGCACTGTTGGCTTGCGAGACAAATATGGAAAAGATAGAGTTTTT  360
            |||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||.|||
Sbjct  281  AAGATGTTGCCTTTGGTGGAGTCTTCCGATGCACTGTTGGTTTACGAGACAAATACGGAAAAGATAGAGTGTTT  354

Query  361  AATACCCCATTGTGTGAACAAGGAATTGTTGGATTTGGAATCGGAATTGCGGTCACTGGAGCTACTGCCATTGC  434
            ||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||.||.|||||.||.|||||
Sbjct  355  AACACCCCGTTGTGTGAACAAGGAATAGTTGGATTTGGCATTGGAATCGCGGTCACCGGTGCTACAGCTATTGC  428

Query  435  GGAAATTCAGTTTGCAGATTATATTTTCCCTGCATTTGATCAGATTGTTAATGAAGCTGCCAAGTATCGCTATC  508
            ||||||.||||||||.||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct  429  GGAAATCCAGTTTGCCGACTATATTTTCCCTGCCTTTGATCAGATTGTCAACGAAGCTGCCAAGTATCGCTACC  502

Query  509  GCTCTGGGGATCTTTTTAACTGTGGAAGCCTCACTATCCGGTCCCCTTGGGGCTGTGTTGGTCATGGGGCTCTC  582
            ||||.||.||||||||.||||||||.||||||||.||||||.||||.|||||.|||||.||.||||||||||||
Sbjct  503  GCTCAGGTGATCTTTTCAACTGTGGGAGCCTCACCATCCGGGCCCCGTGGGGTTGTGTGGGCCATGGGGCTCTC  576

Query  583  TATCATTCTCAGAGTCCTGAAGCATTTTTTGCCCATTGCCCAGGAATCAAGGTGGTTATACCCAGAAGCCCTTT  656
            ||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||.||||||||||
Sbjct  577  TACCATTCTCAGAGTCCTGAAGCCTTTTTTGCCCATTGCCCAGGGATCAAGGTGGTAATACCCCGAAGCCCTTT  650

Query  657  CCAGGCCAAAGGACTTCTTTTGTCATGCATAGAGGATAAAAATCCTTGTATATTTTTTGAACCTAAAATACTTT  730
            |||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  651  CCAGGCCAAGGGACTTCTGTTGTCATGCATAGAAGATAAAAATCCATGTATATTTTTTGAACCTAAAATACTTT  724

Query  731  ACAGGGCAGCAGCGGAAGAAGTCCCTATAGAACCATACAACATCCCACTGTCCCAGGCCGAAGTCATACAGGAA  804
            ||.|||||||||.||||.|.|||||..|||||||.|||||.|||||..||||.|||||.||||||||.|||||.
Sbjct  725  ACCGGGCAGCAGTGGAACAGGTCCCAGTAGAACCCTACAAGATCCCCTTGTCTCAGGCTGAAGTCATCCAGGAG  798

Query  805  GGGAGTGATGTTACTCTAGTTGCCTGGGGCACTCAGGTTCATGTGATCCGAGAGGTAGCTTCCATGGCAAAAGA  878
            ||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||..||||
Sbjct  799  GGCAGCGATGTGACTCTGGTTGCCTGGGGCACTCAGGTTCATGTCATCCGGGAGGTGGCTTCCATGGCCCAAGA  872

Query  879  AAAGCTTGGAGTGTCTTGTGAAGTCATTGATCTGAGGACTATAATACCTTGGGATGTGGACACAATTTGTAAGT  952
            ||||||||||||.||||||||||||||.||||||.||||.||..|.||||||||||||||.|||.||||.||||
Sbjct  873  AAAGCTTGGAGTATCTTGTGAAGTCATCGATCTGCGGACAATTGTGCCTTGGGATGTGGATACAGTTTGCAAGT  946

Query  953  CTGTGATCAAAACAGGGCGACTGCTAATCAGTCACGAGGCTCCCTTGACAGGCGGCTTTGCATCGGAAATCAGC  1026
            |||||||||||||.|||||||||.|.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.||||||
Sbjct  947  CTGTGATCAAAACCGGGCGACTGTTGATCAGCCACGAGGCTCCCTTAACAGGCGGCTTTGCCTCTGAGATCAGC  1020

Query 1027  TCTACAGTTCAGGAGGAATGTTTCTTGAACCTAGAGGCTCCTATATCAAGAGTATGTGGTTATGACACACCATT  1100
            ||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||..||||.||.||.||||||||.||.||
Sbjct 1021  TCCACGGTCCAGGAAGAATGTTTCTTGAACCTAGAGGCTCCAATATCTCGAGTTTGCGGATATGACACCCCGTT  1094

Query 1101  TCCTCACATTTTTGAACCATTCTACATCCCAGACAAATGGAAGTGTTATGATGCCCTTCGAAAAATGATCAACT  1174
            |||||||||.|||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.||.||||||||||
Sbjct 1095  TCCTCACATCTTTGAGCCCTTTTATATCCCAGACAAATGGAAGTGCTACGATGCCCTTCGCAAGATGATCAACT  1168

Query 1175  AT  1176
            ||
Sbjct 1169  AT  1170