Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000470248
• Subject: NM_001144896.2
• Aligned Length: 1249
• Identities: 985
• Gaps: 161

Alignment

Query    1  ATGTGTGACTCCAAGGAACCAAGGGTGCAGCAGCTGGGCCTCCTGGAAGAAGATCCAACAAC-CAGTGGCATCA  73
            |||.|||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||.||.|    ||||.| .||.|||.|..
Sbjct    1  ATGAGTGACTCCAAGGAACCAAGACTGCAGCAGCTGGGCCTCCTGGAGGAGG----AACAGCTGAGAGGCCTTG  70

Query   74  GACTTTTTCCAAGAGACTTTCAATTCCAGCAGATACATGGCCACAAGAGCTCTACAGGGTGTCTTGGCCATGGC  147
            ||    ||||.|.||||       ||.||  |||        |||||||             |||.||      
Sbjct   71  GA----TTCCGACAGAC-------TCGAG--GAT--------ACAAGAG-------------CTTAGC------  104

Query  148  GCCCTGGTGCTGCAACTCCTCTCCTTCATGCTCTTGGCTGGGGTCCTGGTGGCCATCCTTGTCCAAGTGTCCAA  221
                                                                             |||||||||
Sbjct  105  -----------------------------------------------------------------AGTGTCCAA  113

Query  222  GGTCCCCAGCTCCCTAAGTCAGGAACAATCCGAGCAAGACGCAATCTACCAGAACCTGACCCAGCTTAAAGCTG  295
            |||||||||||||.|||||||||||||||||..|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  114  GGTCCCCAGCTCCATAAGTCAGGAACAATCCAGGCAAGACGCGATCTACCAGAACCTGACCCAGCTTAAAGCTG  187

Query  296  CAGTGGGTGAGCTCTCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCAGCTGAAGGCTGCAGTG  369
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  188  CAGTGGGTGAGCTCTCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCAGCTGAAGGCTGCAGTG  261

Query  370  GGTGAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGA  443
            ||||||.|.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  262  GGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGA  335

Query  444  GTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGC  517
            |.|.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|.|
Sbjct  336  GCTTCCAGAGAAATCTAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCTGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTC  409

Query  518  CAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAG  591
            ||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|.||||||
Sbjct  410  CAGAGAAATCTAAGATGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACTCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAG  483

Query  592  AAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACGGAGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAATC  665
            |||||.||||.||||||||||||||||||||||||...||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||
Sbjct  484  AAATCTAAGCAGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATC  557

Query  666  CAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCAGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGACCAGTCCAAGC  739
            .||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.|.|||||..|.||.||||
Sbjct  558  TAAGCAGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGCTTCCAGAGAAATCTAAGC  631

Query  740  AGCAGCAAATCTATCAAGAACTGACCGATTTGAAGACTGCATTTGAACGCCTGTGCCGCCACTGTCCCAAGGAC  813
            |||||.|.|||||.||.||.||||||.|..|||||.|||||.|.|||||||||||||.||.|||||||..|||.
Sbjct  632  AGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCAGCTGAAGGCTGCAGTGGAACGCCTGTGCCACCCCTGTCCCTGGGAA  705

Query  814  TGGACATTCTTCCAAGGAAACTGTTACTTCATGTCTAACTCCCAGCGGAACTGGCACGACTCCGTCACCGCCTG  887
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  706  TGGACATTCTTCCAAGGAAACTGTTACTTCATGTCTAACTCCCAGCGGAACTGGCACGACTCCATCACCGCCTG  779

Query  888  CCAGGAAGTGAGGGCCCAGCTCGTCGTAATCAAAACTGCTGAGGAGCAGAACTTCCTACAGCTGCAGACTTCCA  961
            |.|.||||||.||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  780  CAAAGAAGTGGGGGCCCAGCTCGTCGTAATCAAAAGTGCTGAGGAGCAGAACTTCCTACAGCTGCAGTCTTCCA  853

Query  962  GGAGTAACCGCTTCTCCTGGATGGGACTTTCAGACCTAAATCAGGAAGGCACGTGGCAATGGGTGGACGGCTCA  1035
            |.||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  854  GAAGTAACCGCTTCACCTGGATGGGACTTTCAGATCTAAATCAGGAAGGCACGTGGCAATGGGTGGACGGCTCA  927

Query 1036  CCTCTGTCACCCAGCTTCCAGCGGTACTGGAACAGTGGAGAACCCAACAATAGCGGGAATGAAGACTGTGCGGA  1109
            |||||||..|||||||||.|||.|||.||||||||.|||||.||||||||....|||.|.||||||||.|||||
Sbjct  928  CCTCTGTTGCCCAGCTTCAAGCAGTATTGGAACAGAGGAGAGCCCAACAACGTTGGGGAGGAAGACTGCGCGGA  1001

Query 1110  ATTTAGTGGCAGTGGCTGGAACGACAATCGATGTGACGTTGACAATTACTGGATCTGCAAAAAGCCCGCAG---  1180
            |||||||||||.|||||||||||||.|...||||.|..|||.|||.|.||||||||||||||||.||||||   
Sbjct 1002  ATTTAGTGGCAATGGCTGGAACGACGACAAATGTAATCTTGCCAAATTCTGGATCTGCAAAAAGTCCGCAGCCT  1075

Query 1181  CCTGCTTCAGAGACGAA------------------------------------------------  1197
            ||||||.|||.||.|||                                                
Sbjct 1076  CCTGCTCCAGGGATGAAGAACAGTTTCTTTCTCCAGCCCCTGCCACCCCAAACCCCCCTCCTGCG  1140