Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000470248
• Subject: XM_006722612.3
• Aligned Length: 1197
• Identities: 1112
• Gaps: 84

Alignment

Query    1  ATGTGTGACTCCAAGGAACCAAGGGTGCAGCAGCTGGGCCTCCTGGAAGAAGATCCAACAACCAGTGGCATCAG  74
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGTGACTCCAAGGAACCAAGGGTGCAGCAGCTGGGCCTCCTGGAAGAAGATCCAACAACCAGTGGCATCAG  74

Query   75  ACTTTTTCCAAGAGACTTTCAATTCCAGCAGATACATGGCCACAAGAGCTCTACAGGGTGTCTTGGCCATGGCG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                    
Sbjct   75  ACTTTTTCCAAGAGACTTTCAATTCCAGCAGATACATGGCCACAAGAGCTCTAC--------------------  128

Query  149  CCCTGGTGCTGCAACTCCTCTCCTTCATGCTCTTGGCTGGGGTCCTGGTGGCCATCCTTGTCCAAGTGTCCAAG  222
                                                                            ||||||||||
Sbjct  129  ----------------------------------------------------------------AGTGTCCAAG  138

Query  223  GTCCCCAGCTCCCTAAGTCAGGAACAATCCGAGCAAGACGCAATCTACCAGAACCTGACCCAGCTTAAAGCTGC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  139  GTCCCCAGCTCCCTAAGTCAGGAACAATCCGAGCAAGACGCAATCTACCAGAACCTGACCCAGCTTAAAGCTGC  212

Query  297  AGTGGGTGAGCTCTCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCAGCTGAAGGCTGCAGTGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  213  AGTGGGTGAGCTCTCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCAGCTGAAGGCTGCAGTGG  286

Query  371  GTGAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  287  GTGAGTTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAG  360

Query  445  TTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361  TTGCCAGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCC  434

Query  519  AGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  435  AGAGAAATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCGGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGA  508

Query  593  AATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACGGAGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAATCC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  509  AATCCAAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACGGAGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGAGAAATCC  582

Query  667  AAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCAGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGACCAGTCCAAGCA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  583  AAGCTGCAGGAGATCTACCAGGAGCTGACCCAGCTGAAGGCTGCAGTGGGTGAGTTGCCAGACCAGTCCAAGCA  656

Query  741  GCAGCAAATCTATCAAGAACTGACCGATTTGAAGACTGCATTTGAACGCCTGTGCCGCCACTGTCCCAAGGACT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  657  GCAGCAAATCTATCAAGAACTGACCGATTTGAAGACTGCATTTGAACGCCTGTGCCGCCACTGTCCCAAGGACT  730

Query  815  GGACATTCTTCCAAGGAAACTGTTACTTCATGTCTAACTCCCAGCGGAACTGGCACGACTCCGTCACCGCCTGC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  731  GGACATTCTTCCAAGGAAACTGTTACTTCATGTCTAACTCCCAGCGGAACTGGCACGACTCCGTCACCGCCTGC  804

Query  889  CAGGAAGTGAGGGCCCAGCTCGTCGTAATCAAAACTGCTGAGGAGCAGAACTTCCTACAGCTGCAGACTTCCAG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  805  CAGGAAGTGAGGGCCCAGCTCGTCGTAATCAAAACTGCTGAGGAGCAGAACTTCCTACAGCTGCAGACTTCCAG  878

Query  963  GAGTAACCGCTTCTCCTGGATGGGACTTTCAGACCTAAATCAGGAAGGCACGTGGCAATGGGTGGACGGCTCAC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  879  GAGTAACCGCTTCTCCTGGATGGGACTTTCAGACCTAAATCAGGAAGGCACGTGGCAATGGGTGGACGGCTCAC  952

Query 1037  CTCTGTCACCCAGCTTCCAGCGGTACTGGAACAGTGGAGAACCCAACAATAGCGGGAATGAAGACTGTGCGGAA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  953  CTCTGTCACCCAGCTTCCAGCGGTACTGGAACAGTGGAGAACCCAACAATAGCGGGAATGAAGACTGTGCGGAA  1026

Query 1111  TTTAGTGGCAGTGGCTGGAACGACAATCGATGTGACGTTGACAATTACTGGATCTGCAAAAAGCCCGCAGCCTG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1027  TTTAGTGGCAGTGGCTGGAACGACAATCGATGTGACGTTGACAATTACTGGATCTGCAAAAAGCCCGCAGCCTG  1100

Query 1185  CTTCAGAGACGAA  1197
            |||||||||||||
Sbjct 1101  CTTCAGAGACGAA  1113