Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: TRCN0000470264
• Subject: XM_024446000.1
• Aligned Length: 1446
• Identities: 1281
• Gaps: 147

Alignment

Query    1  ATGAGAGATGTTACCATTGTGAAAGAAGGTTGGGTTCAGAAGAGGGGAGAATATATAAAAAACTGGAGGCCAAG  74
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGCGATGTTACCATTGTGAAAGAAGGTTGGGTTCAGAAGAGGGGAGAATATATAAAAAACTGGAGGCCAAG  74

Query   75  ATACTTCCTTTTGAAGACAGATGGCTCATTCATAGGATATAAAGAGAAACCTCAAGATGTGGATTTACCTTATC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  ATACTTCCTTTTGAAGACAGATGGCTCATTCATAGGATATAAAGAGAAACCTCAAGATGTGGATTTACCTTATC  148

Query  149  CCCTCAACAACTTTTCAGTGGCAAAATGCCAGTTAATGAAAACAGAACGACCAAAGCCAAACACATTTATAATC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCCTCAACAACTTTTCAGTGGCAAAATGCCAGTTAATGAAAACAGAACGACCAAAGCCAAACACATTTATAATC  222

Query  223  AGATGTCTCCAGTGGACTACTGTTATAGAGAGAACATTTCATGTAGATACTCCAGAGGAAAGGGAAGAATGGAC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGATGTCTCCAGTGGACTACTGTTATAGAGAGAACATTTCATGTAGATACTCCAGAGGAAAGGGAAGAATGGAC  296

Query  297  AGAAGCTATCCAGGCTGTAGCAGACAGACTGCAGAGGCAAGAAGAGGAGAGAATGAATTGTAGTCCAACTTCAC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AGAAGCTATCCAGGCTGTAGCAGACAGACTGCAGAGGCAAGAAGAGGAGAGAATGAATTGTAGTCCAACTTCAC  370

Query  371  AAATTGATAATATAGGAGAGGAAGAGATGGATGCCTCTACAACCCATCATAAAAGAAAGACAATGAATGATTTT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AAATTGATAATATAGGAGAGGAAGAGATGGATGCCTCTACAACCCATCATAAAAGAAAGACAATGAATGATTTT  444

Query  445  GACTATTTGAAACTACTAGGTAAAGGCACTTTTGGGAAAGTTATTTTGGTTCGAGAGAAGGCAAGTGGAAAATA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GACTATTTGAAACTACTAGGTAAAGGCACTTTTGGGAAAGTTATTTTGGTTCGAGAGAAGGCAAGTGGAAAATA  518

Query  519  CTATGCTATGAAGATTCTGAAGAAAGAAGTCATTATTGCAAAGGATGAAGTGGCACACACTCTAACTGAAAGCA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CTATGCTATGAAGATTCTGAAGAAAGAAGTCATTATTGCAAAGGATGAAGTGGCACACACTCTAACTGAAAGCA  592

Query  593  GAGTATTAAAGAACACTAGACATCCCTTTTTAACATCCTTGAANTATNCNTNCCAGANAAAAGACNGTTTGTGT  666
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|.|.|||||.|||||||.||||||||
Sbjct  593  GAGTATTAAAGAACACTAGACATCCCTTTTTAACATCCTTGAAATATTCCTTCCAGACAAAAGACCGTTTGTGT  666

Query  667  TTTGTGATGGAATATGTTANNGGGGGCGAGCTGTTTTTCCATTTGTCGAGAGAGCGGGTGTTCTCTGAGGACCG  740
            |||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TTTGTGATGGAATATGTTAATGGGGGCGAGCTGTTTTTCCATTTGTCGAGAGAGCGGGTGTTCTCTGAGGACCG  740

Query  741  CACACGTTTCTATGGTGCAGAAATTGTCTCTGCCTTGGACTATCTACATTCCCGGNAAGATTTGTGGTACCGTG  814
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||.|||| |||| ||||||||
Sbjct  741  CACACGTTTCTATGGTGCAGAAATTGTCTCTGCCTTGGACTATCTACATT-CCGGAAAGA-TTGT-GTACCGTG  811

Query  815  ATCTCAAGTTGGAGAATCTAATGCTGGACAAAGATGGCCACATAAAAATTACAGATTTTGGACTTTGCAAAGAA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  812  ATCTCAAGTTGGAGAATCTAATGCTGGACAAAGATGGCCACATAAAAATTACAGATTTTGGACTTTGCAAAGAA  885

Query  889  GGGATCACAGATGCAGCCACCATGAAGACATTCTGTGGCACTCCAGAATATCTGGCACCAGAGGTGTTAGAAGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  886  GGGATCACAGATGCAGCCACCATGAAGACATTCTGTGGCACTCCAGAATATCTGGCACCAGAGGTGTTAGAAGA  959

Query  963  TAATGACTATGGCCGAGCAGTAGACTGGTGGGGCCTAGGGGTTGTCATGTATGAAATGATGTGTGGGAGGTTAC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  960  TAATGACTATGGCCGAGCAGTAGACTGGTGGGGCCTAGGGGTTGTCATGTATGAAATGATGTGTGGGAGGTTAC  1033

Query 1037  CTTTCTACAACCAGGACCATGAGAAACTTTTTGAATTAATATTAATGGAAGACATTAAATTTCCTCGAACACTC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1034  CTTTCTACAACCAGGACCATGAGAAACTTTTTGAATTAATATTAATGGAAGACATTAAATTTCCTCGAACACTC  1107

Query 1111  TCTTCAGATGCAAAATCATTGCTTTCAGGGCTCTTGATAAAGGATCCAAATAAACGCCTTGGTGGAGGACCAGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1108  TCTTCAGATGCAAAATCATTGCTTTCAGGGCTCTTGATAAAGGATCCAAATAAACGCCTTGGTGGAGGACCAGA  1181

Query 1185  TGATGCAAAAGAAATTATGAGACACAGTTTCTTCTCTGGAGTAAACTGGCAAGATGTATATGATAAAAAGCTTG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1182  TGATGCAAAAGAAATTATGAGACACAGTTTCTTCTCTGGAGTAAACTGGCAAGATGTATATGATAAAAAGCTTG  1255

Query 1259  TACCTCCTTTTA---AACCTCAAGTAA---CATCTGAGACAGATACTAGATATTTTGATGAAGAATTTACAGCT  1326
            ||||||.|||||   |||.|   ||||   |||          |||     .||||||..|.|..|||      
Sbjct 1256  TACCTCTTTTTAGAGAACGT---GTAATTTCAT----------TAC-----CTTTTGACAATGCCTTT------  1305

Query 1327  CAGACTATTACAATAACACCACCTGAAAAATATGATGAGGATGGTATGGACTGCATGGACAATGAGAGGCGGCC  1400
                                                                                      
Sbjct 1306  --------------------------------------------------------------------------  1305

Query 1401  GCATTTCCCTCAATTTTCCTACTCTGCAAGTGGACGAGAA  1440
                                                    
Sbjct 1306  ----------------------------------------  1305